ชีท biochemistry ii สําหรัับวี่นทพย อ...
TRANSCRIPT
1
ชท Biochemistry II (01402313) สาหรบวนท 6-8 พ.ย. 56
อ.พทธพร สองศร
ภาพรวมเมแทบอลซม
คาวา metabolism มาจากภาษากรกแปลวา การเปลยนแปลง
เมแทบอลซมหมายถง การเปลยนแปลงทางเคมทเปลยนสารอาหารใหกลายเปนพลงงานและเปนสารประกอบทม
ความซบซอน เมแทบอลซมประกอบดวยปฏกรยาทตองการเอนไซม และมลาดบขนตอนการทางานเปน pathway
สารทอยระหวางทางใน pathway เรยกวา intermediate
• เมแทบอลซมเหมอนกนหรอไมในสงมชวตแตละชนด
สงมชวตตางชนดกน แตมลกษณะของเมแทบอลซมคลายคลงกน อาจแสดงวาววฒนาการมาจาก
บรรพบรษรวมกน glycolysis ซงเปน pathway ทมการปลอยพลงงานออกมาจาก glucose แลวเกบไวในรปของ
ATP ในสภาวะทไมใชออกซเจนนน พบไดในสงมชวตแทบทกชนด จงเชอกนวาเปน pathway ทเกาแกทสด มมา
กอนทบรรยากาศโลกจะมออกซเจนมากแบบในปจจบน
สงมชวตมความหลากหลายทางเมแทบอลซม
แมจะม pathway ทคลาย ๆ กน แตสงมชวตแตละประเภทหรอแตละเซลลกมความแตกตางกนทางดาน
เมแทบอลซม ถาแบงตามวธการใชคารบอนกแบงออกไดเปน autotrophs ซงหมายถงสงมชวตทใช
คารบอนไดออกไซดเปนแหลงคารบอนเพยงชนดเดยว กบ heterothrops ซงตองการคารบอนอนทรย เชน กลโคส
เพอใชในการสงเคราะหสารประกอบคารบอนอน ๆ ทจาเปนตอไป
ถาแบงตามแหลงพลงงานกแบงเปน 2 พวกคอ phototrophs ซงเปนสงมชวตทสงเคราะหแสง ใชแสง
เปนแหลงพลงงาน กบ chemotrophs ซงใชสารประกอบอนทรยเชน กลโคส หรอบางกรณกเปนสารอนนทรยทถก
ออกซไดซไดเชน Fe2+, NO2-, NH4
+ หรอกามะถนเปนแหลงพลงงาน โดยทวไปแลวพลงงานจะไดมาโดยปฏกรยา
ออกซเดชน-รดกชน
ถายดตามเกณฑทกลาวมาน กแบงสงมชวตออกไดเปน 4 ประเภทดวยกนดงตารางท 1
ออกซเจนจาเปนสาหรบสงมชวตพวก aerobes
สามารถจาแนกสงมชวตตามความแตกตางในการใชออกซเจนเปนตวรบอเลกตรอนได พวก aerobes คอ
พวกทใชออกซเจน ถาขาดออกซเจนไมไดเลย เรยกวา obligate aerobes ซงรวมทงมนษยดวย สาหรบบางพวกเชน
Escherichia coli นนไมใชออกซเจนกได เรยกวา facultative anaerobes สวนพวกทไมใชออกซเจนเลย หรอบาง
ทโดนออกซเจนไมได เปนพษ เรยกวา obligate anaerobes เชน Clostridium botulinum
การไหลของพลงงานในไบโอสเฟยรและวฏจกรของคารบอนกบออกซเจนมความสมพนธกน
แหลงพลงงานเบองตนของสงมชวตคอดวงอาทตย พวก photoautotrophs ใชพลงงานแสงเพอขบเคลอน
การสงเคราะหสารประกอบอนทรย เชน คารโบไฮเดรต จาก
CO2 ในบรรยากาศและนา (ดงภาพขวามอ) จากนนเซลลชนด
heterotrophic กใชผลตภณฑอนทรยนในรปของ “เชอเพลง”
และในรปของสารตงตนเพอการสงเคราะหสารชวโมเลกลของ
ตวเองตอไป ทายทสด CO2 กจะเปน end product ของเม
แทบอลซมของคารบอนแบบ heterotrophic และ CO2 นก
จะกลบคนสบรรยากาศสาหรบใหพวก photoautotrophs ใช
2
ตอไป ผลทไดกคอ พลงงานแสงอาทตยถกเปลยนใหเปนพลงงานเคมในรปของโมเลกลอนทรยโดยพวก
photoautotrophs จากนนพวก heterotrophs กเอาพลงงานนไปใช จงสรปไดวาการไหลของพลงงานในไบโอส
เฟยรนเกดขนในวฏจกรของคารบอน และขบเคลอนวฏจกรดวยพลงงานแสง
ตารางท 1 การจาแนกสงมชวตตามลกษณะเมแทบอลซม โดยดจากความตองการคารบอนและพลงงาน
ประเภท แหลง
คารบอน แหลงพลงงาน ตวใหอเลกตรอน ตวอยาง
Photoautotrophs CO2 แสง นา, H2S, S หรอ
สารประกอบอนน-
ทรยอน ๆ
พช, สาหราย,
ไซยาโนแบคทเรย,
แบคทเรย-
สงเคราะหแสง,
Photoheterotrophs สารประกอบ
อนทรย
แสง สารประกอบ
อนทรย
Nonsulfur
purple bacteria Chemoautotrophs CO2 ปฏกรยาออกซเดชน-
รดกชน
สารประกอบอนนท
รย เชน H2, H2S,
NH4+, NO2
-, Fe2+,
Mn2+
Nitrifying
bacteria;
hydrogen,
sulfur, iron
bacteria Chemoheterotrophs สารประกอบ
อนทรย
ปฏกรยาออกซเดชน-
รดกชน
สารประกอบ
อนทรย (เชน
กลโคส)
สตวทกชนด,
จลนทรยสวนใหญ,
เนอเยอพชทไม
สงเคราะหแสง
เชน ราก หรอ
เซลลสงเคราะห
แสงทอยในทมด
• กระบวนการ anabolic และ catabolic
เมแทบอลซมมวตถประสงคหลก 2 ประการ คอ การสรางพลงงานเพอขบเคลอนงานทจาเปนตอการ
ดารงชวตและการสงเคราะหโมเลกลชวภาพ เมแทบอลซมจงแบงออกเปน 2 ดานททางานตรงขามกน คอ
catabolism กบ anabolism
catabolism เกยวของกบการยอยสลายสารอาหารโมเลกลใหญ (คารโบไฮเดรต ลพดและโปรตน) ทได
จากสงแวดลอมหรอจากทสะสมไวในเซลล ยอยแลวกจะไดสารโมเลกลเลก เชน กรดแลกตก เอทานอล
คารบอนไดออกไซด ยเรยหรอแอมโนเนย ปฏกรยาแคตาบอลกมกจะใหพลงงานออกมา เรยกวาเปนปฏกรยาชนด
exergonic และดกจบพลงงานนใหอยในรปของ ATP
เนองจากปฏกรยา catabolism นเปนปฏกรยา oxidative (ใหอเลกตรอน) พลงงานบางสวนจงเกบไวใน
3
รปอเลกตรอนพลงงานสง แลวสงตอใหโคเอนไซม NAD+ และ NADP+ ซงใชงานตางกน โดย NAD+ มบทบาทใน
กระบวนการ catabolism สวน NADP+ ใชในกระบวนการสงเคราะหสารทเรยกวา anabolism
Anabolism คอ Biosynthesis
Anabolism คอ กระบวนการสงเคราะหสารชวโมเลกลทมความหลากหลายและซบซอน (โปรตน กรด
นวคลอก โพลแซคคาไรดและลพด) โดยใชสารตงตน (precursors) ทเลกกวา การสงเคราะหเชนนตองมการสราง
พนธะโควาเลนตขนใหม ซงเปนปฏกรยาทตองใชพลงงาน (endergonic)
พลงงานไดจาก ATP ทมาจากกระบวนการ catabolism นอกจากน NADPH กเปนตวใหอเลกตรอน
พลงงานสงสาหรบใชในกระบวนการรดกชนของ anabolism ดงภาพขางลางน
Anabolism กบ catabolism เกยวของสมพนธกน แตอาจอยคนละท
Anabolism กบ catabolism เกดขนพรอม ๆ กนไปภายในเซลล ดงนนเซลลตองมวธจดการไมได
กระบวนการสองกระบวนการนทางานสบสนหรอขดแยงกน ซงม 2 วธคอ หนง เซลลตองรกษาและควบคม
กระบวนการทงสองอยางนอยางรดกม เปนไปตามความตองการของเซลล และ สอง กระบวนการเมแทบอลซมท
แขงขนกนนมกจะอยกนคนละทในเซลล เชน อาจจะอยคนละออรแกเนลล เพอไมใหรบกวนซงกนและกน
ตวอยางเชน ปฏกรยาการออกซเดชนของกรดไขมน อยในไมโตคอนเดรย แตปฏกรยาการสงเคราะหกรดไขมน
เกดขนในไซโตซอล
Pathway ของกระบวนการ catabolism จะ “ลเขา”หาผลตภณฑสดทายไมกชนด
ถาลองสารวจกระบวนการ catabolism ของสารอาหารหลกทใหพลงงาน (คารโบไฮเดรต ลพดและ
โปรตน) ในเซลล heterotrophic ทว ๆ ไป จะพบวากระบวนการยอยสลายสารเหลานตองใชเอนไซมเปนตวเรง
ปฏกรยา ในกระบวนการทใชออกซเจน (aerobic catabolism) โมเลกลเหลานจะถกยอยจนสดทายไดเปน
คารบอนไดออกไซด นาและแอมโนเนย กระบวนการ aerobic catabolism ประกอบดวย 3 ระยะคอ
ระยะท 1 สารอาหารโมเลกลใหญจะถกยอยลงกลายเปนหนวยองคประกอบ (building blocks) แมจะม
สารโมเลกลใหญหลากชนดเพยงใด แตสดทายแลวหนวยองคประกอบกจะมอยไมกชนด โปรตนหลากหลายชนด
4
แตกตางกนมากมาย แตกประกอบดวยกรดอะมโนเพยง 20 ชนด โพลแซกคาไรดทเปนองคประกอบของ
คารโบไฮเดรต พอยอยแลวกไดกลโคส ลพดพอยอยแลวกเปนกลเซอรอลกบกรดไขมน ดงภาพ
ในระยะท 2 หนวยองคประกอบทไดจากระยะท 1 จะถกยอยสลายตอไปทาใหไดสารตวกลางของเมแทบอ
ลซมทมโมเลกลเลกและมความหลากหลายนอยลงไปอก การ deamination (เอาหมอะมโนออก) ของกรดอะมโนทา
ใหเหลอโครงคารบอนในรป α-keto acid
α-keto acid หลาย ๆ ชนดเปนสารตวกลางในวฏจกรกรดซตรก และจะถกปอนโดยตรงเขาระยะท 3
ผานวฏจกรน สวนสารชนดอน ๆ จะถกเปลยนเปน α-keto acid ชนด 3 คารบอนทชอวา pyruvate หรอเปนหม
acetyl ของ acetyl-coenzyme A (acetyl CoA)
กลโคสและกลเซอรอลจากลพดทาใหเกดไพรเวท ขณะทกรดไขมนจะถกยอยจนกลายเปนหนวยสอง
คารบอน คอ อะซตลโคเอ แตเนองจากไพรเวทกทาใหเกดอะซตลโคเอดวย เราจงเหนวาการยอยสารอาหารโมเลกล
ใหญสดทายแลวก “ลเขา”หาผลตภณฑรวมอยางเดยวกนคอ acetyl-CoA
5
การเผาผลาญหมอะซตลของอะซตลโคเอโดยวฏจกรกรดซตรกและ oxidative phosphorylation ทาให
เกด CO2 กบ H2O ในระยะท 3 ของ catabolism
ผลตภณฑสดทายของวฏจกรกรดซตรกคอ CO2 กบ H2O จะเปนของเสยในกระบวนการ catabolism
แบบใชออกซเจน การออกซเดชนของอะซตลโคเอระหวางระยะท 3 นถอเปนระยะทสรางพลงงานใหกบเซลลมาก
ทสด
Pathway ชนด anabolic จะ “บานออก” สามารถสงเคราะหสารชวโมเลกลทหลากหลายจากหนวย
องคประกอบทมอยจากดไมกชนด
แมโมเลกลของสารตงตนจะมอยจากดไมกชนด แตกเพยงพอทจะใชสาหรบการสงเคราะหองคประกอบ
ของเซลลใด ๆ กได ไมวาจะเปนโปรตน กรดนวคลอก ลพดหรอโพลแซกคาไรด สารตาง ๆ เหลานถกสรางขนจาก
หนวยองคประกอบทเหมาะสม ผานทาง pathways ของ anabolism
ในทางกลบกน หนวยองคประกอบ (กรดอะมโน นวคลโอไทด นาตาลและกรดไขมน) สามารถสรางขนจาก
metabolites ในเซลล ตวอยางเชน กรดอะมโนสามารถสรางไดดวยวธเตมหมอะมโน (amination) เขาไปยงโครง
คารบอนของกรดอลฟาคโต (α-keto acid) และไพรเวทสามารถเปลยนเปนนาตาลเฮกโซสเพอใชในกระบวนการ
สงเคราะหโพลแซกคาไรดได
สารตวกลางชนด amphibolic มสองบทบาท
Pathways ของเมแทบอลซมหลกบาง pathway เชน วฏจกรกรดซตรก ตลอดจนสาร metabolite
หลาย ๆ ชนดของ pathway อน ๆ มบทบาทหนาทสองประการ กลาวคอทาหนาททง catabolism และ
anabolism ไปพรอม ๆ กน ซงเราจะเรยก pathway แบบนวาเปน amphibolic แทนทจะเรยกวา catabolic
หรอ anabolic อยางใดอยางหนง
Pathway ของ catabolism กบ anabolism แตกตางกนในเสนทางทสาคญ
Pathway แบบ anabolic สาหรบสงเคราะหสารผลตภณฑทกาหนดมกจะไมเหมอนกบ pathway ทใช
สาหรบกระบวนการ catabolism ของสารชนดเดยวกน สารตวกลางบางชนดอาจจะมเหมอนกนในขนตอนของทง
สอง pathway แตในขนตอนอน ๆ อาจจะใชเอนไซมและปฏกรยาทเปนของแตละ pathway โดยเฉพาะ
ตวอยางทเหนไดชด เชน กรณการเปรยบเทยบกระบวนการ catabolism ของกลโคส ยอยสลายเปนไพร
เวท ดวยกระบวนการ glycolysis กบ กระบวนการสงเคราะหกลโคสจากไพรเวทดวยกระบวนการ
gluconeogenesis
Pathway ของ glycolysis จากกลโคสเปนไพรเวทประกอบดวยเอนไซม 10 ชนด ถงแมวาจะดม
ประสทธภาพดถาสงเคราะหกลโคสจากไพรเวทโดยการกลบทศของกระบวนการทง 10 ขนตอน แตกระบวนการ
gluconeogenesis ใชวธกลบทศการทางานของเอนไซมจาก glycolysis เพยงแค 7 ชนด ทเหลอใชเอนไซมอก 4
ชนดทจาเพาะกบกระบวนการสงเคราะหกลโคส
ในทานองเดยวกน pathway ทใชสาหรบการยอยโปรตนเปนกรดอะมโนกแตกตางจากระบบการ
สงเคราะหโปรตน และการยอยกรดไขมนแบบ oxidative เปน acetyl-CoA กไมไดดาเนนไปทางเดยวกนกบ
ปฏกรยาการสงเคราะหกรดไขมนจาก acetyl-CoA
ATP ทาหนาทในวฏจกรพลงงานของเซลล
ATP เปนแหลงพลงงานของเซลล ในพวก phototrophs นน ATP เปนผลตภณฑเบองตนทมพลงงานสง
1 ใน 2 ชนดทเปนผลมาจากการเปลยนรปพลงงานแสงเปนพลงงานเคม (อกชนดคอ NADPH) ในพวก
heterotrophs ใช pathway แบบ catabolism เปนหลกในการจบพลงงานใหอยในรปของ ATP
6
ในทางกลบกน ATP กใหพลงงานสาหรบขบเคลอนกจกรรมตาง ๆ ในเซลลสงมชวต เชน การสงเคราะห
สารชวโมเลกลทซบซอน งานออสโมตกทเกยวของกบการขนสงสารเขาสเซลล งานทเกยวของกบการเคลอนทของ
เซลล และงานทเกยวของกบการหดตวของกลามเนอ กจกรรมหลากหลายเหลานทงหมดไดพลงงานมาจากการ
hydrolysis ของ ATP เปน ADP กบ Pi
ดงนนจงเกดวฏจกรของพลงงานในเซลล ซง ATP ทาหนาทเปน “พาหนะ” นาพลงงานจากการสงเคราะห
แสงหรอจากการ catabolism ไปใชในกระบวนการทตองการพลงงานตาง ๆ ในเซลลสงมชวต
NAD+ จบอเลกตรอนทปลอยออกมาจากกระบวนการ catabolism
สารตงตนของกระบวนการ catabolism ไดแก โปรตน คารโบไฮเดรตและลพด เปนแหลงทดของพลงงาน
เคม เพราะวาอะตอมคารบอนในโมเลกลเหลานอยในสถานะถกรดวซ ดงภาพ
ในปฏกรยา catabolism ซงเปนแบบ oxidative นน reducing equivalents จะถกปลอยออกมาจาก
สารตงตน โดยมกจะอยในรปของ hydride ions (โปรตอนทมอเลกตรอนจบอย H:- ) hydride ions จะถกขนสงใน
ปฏกรยาของเอนไซม dehydrogenase จากสารตงตนไปยงโมเลกลของ NAD+ และรดวซกลายเปน NADH
NADPH ใหพลงงานในการรดวซสาหรบกระบวนการ anabolic
ขณะท catabolism เปนกระบวนการ oxidative นน ในทางตรงกนขาม anabolism เปนปฏกรยา
reductive เชน การสงเคราะหกลโคสจากคารบอนไดออกไซดในกระบวนการสงเคราะหแสงของพช พลงงานทใชใน
การรดวซกมาจาก NADPH โดยพลงงานแสงอาทตยถกใชในการดงอเลกตรอนจากนาแลวสงให NADP+ และได O2
เปนผลพลอยไดในกระบวนการ
7
ชท Biochemistry II (01402313) สาหรบวนท 11-13 พ.ย. 56
อ.พทธพร สองศร
โคเอนไซมและวตามนทาใหเกดปฏกรยาทจาเพาะและเปนสารอาหารทจาเปนสาหรบ pathways
นอกเหนอจาก NAD+ และ NADPH แลว ยงมโมเลกลขนาดเลกอกมากมายหลายชนดทจาเปนสาหรบเม
แทบอลซม เชนพวกวตามน ซงจดวาเปนสารอาหารทจาเปน (ตงชอ vitamin โดย Kazimierz Funk ซงเปนผคน
พบวา thiamine สามารถรกษาโรคเหนบชาไดในป 1912 แลวตงชอวา “vital amine” ตอมากเสนอวาโรคอน ๆ
กอาจจะรกษาไดดวย “vitamins”
วตามนตองไดมาจากอาหาร แตตองการในปรมาณเพยงเลกนอย สวนมากแลวสงมชวตพวกนไมสามารถ
สงเคราะหวตามนไดเอง ความตองการวตามนใด ๆ ขนอยกบชนดของสงมชวตนน ๆ และไมจาเปนวาวตามน
ทงหมดจะจาเปนสาหรบสงมชวตทกชนด สาหรบวตามนทจาเปนสาหรบมนษยนนใหดในตารางตอไปน
วตามน รปโคเอนไซม หนาท
วตามนทละลายนา
Thiamine (B1)
Thiamine
pyrophosphate
Decarboxylation of α-keto acids และสรางหรอ
ตด α-hydroxyketones
Niacin (nicotinic
acid)
Nicotinamide adenine
dinucleotide (NAD+)
Nicotinamide adenine
dinucleotide (NADP+)
Hydride transfer (ยายหม H)
Hydride transfer (ยายหม H)
Riboflavin (B2) Flavin adenine
dinucleotide (FAD)
Flavin mononucleotide
(FMN)
ยายอเลกตรอน 1 หรอ 2 อเลกตรอน
ยายอเลกตรอน 1 หรอ 2 อเลกตรอน
Pantothenic acid Coenzyme A ทาใหหม acyl อยในรปแอคทฟ เกดปฏกรยาได
Pyridoxal,
pyridoxine,
pyridoxamine (B6)
Pyridoxal phosphate เปนแหลงของอเลกตรอนเพอทาใหสารตวกลางใน
ปฏกรยาเกดความเสถยร
Cobalamin (B12) 5’-Deoxyadenosyl-
cobalamin
รดวซไรโบนวคลโอไทดใหเปนดออกซไรโบนวคลโอไทด
และยายหมเมทล
Biotin Biotin-lysine
complexes (biocytin)
นาหมคารบอกซลเขาสปฏกรยา carboxylation
Lipoic acid Lipoyl-lysine
complexes (lipoamide)
ควบคปฏกรยาการยายหมเอซลกบการยายอเลกตรอน
ระหวางการออกซเดชนและ decarboxylation ของ
α-keto acids
Folic acid Tetrahydrofolate เปนตวใหและตวรบ 1-C สาหรบปฏกรยาออกซเดชน
ของคารบอนทกระดบ ยกเวน CO2
8
วตามน รปโคเอนไซม หนาท
วตามนทละลายในไขมน
Retinol (วตามน A)
Retinal (วตามน A)
Retinoic acid (วตามน
A)
Ergocalciferol (D2)
Cholecalciferol (D3)
α-Tocopherol (E)
Menaquinone (K)
-
-
ยกเวนวตามน C (ascorbic acid) วตามนทละลายนาทกชนดเปนองคประกอบหรอเปนสารตงตนในการ
สงเคราะหโคเอนไซม ซงเปนโมเลกลขนาดเลกททาหนาทในปฏกรยาทจาเพาะรวมกบเอนไซม
โคเอนไซมยงทาหนาทเปน “ตวพา” หรอ carriers ของหมฟงกชนทจาเพาะ เชน หมเมทลและหมเอซล
วตามนทละลายในไขมนไมไดเกยวของกบโคเอนไซมโดยตรง แตทาหนาททจาเปนในกระบวนการทาง
ชวภาพหลาย ๆ กระบวนการ เชน การมองเหน การบารงรกษาโครงสรางของกระดก และการแขงตวของเลอด
กลไกการทางานของวตามนทละลายในไขมนยงไมคอยเขาใจกนเทาวตามนทละลายในนา ตองรองานวจยสมยใหม
ตอไป
• สารอาหารกบโภชนาการพนฐานของมนษย
โภชนาการ (nutrition) หมายถง การใชอาหารโดยสงมชวต ความสามารถของสงมชวตทจะใช
สารอาหารใด ๆ นนขนอยกบองคประกอบทางเคมของอาหารนนและขนอยกบ pathway ของเมแทบอลซมทมอย
ในสงมชวต นอกเหนอจากเสนใยทจาเปน อาหารยงประกอบดวย macronutrient คอ โปรตน คารโบไฮเดรตและ
ลพด กบ micronutrient คอ วตามนและเกลอแร
มนษยตองการโปรตน
มนษยจะตองบรโภคโปรตนเพอสรางโปรตนใหม โปรตนในอาหารเปนแหลงทอดมไปดวยไนโตรเจนและ
กรดอะมโนบางชนด ทเรยกวา กรดอะมโนทจาเปน (essential amino acids) ซงมนษย (และสตวสวนใหญ)
สงเคราะหไมได ตองไดจากอาหารเทานน ถามการบรโภคโปรตนมากเกนกวาทตองการในการสงเคราะหโปรตนท
จาเปน โปรตนในอาหารกจะนาไปใชเปนแหลงพลงงาน
กรดอะมโนบางชนด เรยกวา glucogenic สามารถเปลยนเปนกลโคสได ขณะทกลม ketogenic
สามารถเปลยนเปนกรดไขมนและ/หรอ กรดคโต ถาไขมนและคารโบไฮเดรตมปรมาณเพยงพอสาหรบความ
ตองการพลงงานของแตละคนอยแลว กรดอะมโนทงสองประเภทจะถกเปลยนเปนไตรเอซลกลเซอรอลและเกบไว
ในเนอเยออะดโพส
โปรตนของแตละคนจะผานกระบวนการยอยสลายและสงเคราะหใหมดวยอตราคงท ทาใหเกดสมดล
ไนโตรเจน โดยสมดลไนโตรเจนเชงบวกจะเกดขนเมอมการเพมขนสทธของปรมาณโปรตนในรางกาย เชน ระหวาง
การเจรญเตบโต สมดลไนโตรเจนเชงลบเกดขนเมออาหารมไนโตรเจนไมเพยงพอตอความตองการในการ
สงเคราะหโปรตนใหม
9
คารโบไฮเดรตใหพลงงานสาหรบเมแทบอลซม
วตถประสงคหลกของคารโบไฮเดรตในอาหารกเพอสรางพลงงานสาหรบเมแทบอลซม นาตาลอยางงาย
จะถกเผาผลาญใน glycolytic pathway สวนคารโบไฮเดรตเชงซอนจะถกยอยเปนนาตาลอยางงายกอนจงจะเขา
ส glycolytic pathway
คารโบไฮเดรตยงเปนองคประกอบทจาเปนสาหรบนวคลโอไทด กรดนวคลอก ไกลโคโปรตนและไกลโค
ลพด เมแทบอลซมของมนษยสามารถปรบตวใหเขากบชวงกวางของระดบคารโบไฮเดรตในอาหารได แตสมอง
ตองการกลโคสเปนแหลงพลงงาน เมอบรโภคคารโบไฮเดรตเกนกวาความตองการพลงงานของรางกาย จะถก
เปลยนเปนไตรเอซลกลเซอรอลและไกลโคเจนเพอสะสมเปนแหลงพลงงานระยะยาว ในทางตรงกนขาม เมอการ
บรโภคคารโบไฮเดรตตา จะสราง ketone bodies จากหนวยอะซเตตเพอใชเปนแหลงพลงงานสาหรบสมองและ
อวยวะอน ๆ
ลพดจาเปน แตปรมาณตองพอด
กรดไขมนและไตรเอซลกลเซอรอลสามารถใชเปนแหลงพลงงานไดในเนอเยอหลายสวนของรางกาย
มนษย ฟอสโฟลพดเปนองคประกอบทจาเปนสาหรบเมมเบรนทางชวภาพทกชนด แมวารางกายมนษยจะทนตอ
การบรโภคไขมนไดในระดบทกวาง แตถามากหรอนอยเกนไปกไมมประโยชน ไขมนในอาหารทมากเกนไปจะสะสม
เปนไตรเอซลกลเซอรอลในเนอเยออะดโพส แตไขมนระดบสงสามารถเพมความเสยงตอโรคหลอดเลอดแขง
(atherosclerosis) และโรคหวใจ นอกจากนยงพบความสมพนธระหวางระดบไขมนในอาหารทสงกบการเพม
ความเสยงโรคมะเรงลาไส เตานมและตอมลกหมาก
เมอไขมนในอาหารตา กมความเสยงทจะขาดกรดไขมนทจาเปน รางกายมนษยไมสามารถสงเคราะห
กรด linoleic และ linolenic ได ตองไดจากอาหาร อกประการหนง กรด arachidonic สามารถสงเคราะหใน
มนษยไดจากกรด linoleic เทานน ดงนนจงจดวาเปนกรดไขมนทจาเปนดวย กรดไขมนทจาเปนนบเปน
องคประกอบสาคญของเมมเบรนทางชวภาพ และกรด arachidonic เปนสารตงตนของ prostaglandins ท
จาเปนในกระบวนตาง ๆ ภายในรางกาย
เสนใยมทงแบบละลายนาและไมละลายนา
องคประกอบของอาหารทไมสามารถยอยไดดวยเอนไซมในระบบยอยอาหารของมนษยคอ เสนใย
อาหาร (dietary fiber) ซงมหลายชนด แตละชนดกมสมบตทางเคมและชวภาพเปนของตวเอง
เซลลโลสกบเฮมเซลลโลสเปนเสนใยทไมละลายนา และกระตนการทางานของลาไสใหญใหเปนปกต
ชวยลดความเสยงของมะเรงลาไสใหญ ลกนน เปนเสนใยทไมละลายนาอกกลม ชวยดดซบโมเลกลอนทรยในระบบ
ทางเดนอาหาร ลกนนจะจบกบคอเลสเตอรอลและขบออกจากระบบยอยอาหาร ลดความเสยงของโรคหวใจ
เพกตนและกม เปนเสนใยละลายนาไดทาใหเกดสารแขวนลอยเหนยวคลายเจลในระบบทางเดนอาหาร ลดอตรา
การดดซมสารอาหารหลายชนด รวมทงคารโบไฮเดรตและลดคอเลสเตอรอลในซรม เสนใยทไมละลายนาพบได
มากในผก เมลดพช เสนใยละลายนาไดเปนองคประกอบของผลไม ถวและขาวโอต
10
• เอนไซม
ปฏกรยาเคมนบพน ๆ ปฏกรยาในสงชวตดาเนนไปไดรวดเรว เพราะมเอนไซมเปนตวเรงปฏกรยา
สารเคมทเกดการเปลยนแปลงดวยการเรงปฏกรยาของเอนไซมนมกจะเปนสารอนทรยทไมมแนวโนมวาจะเกดการ
เปลยนแปลงไดเลยถาอยนอกเซลลสงมชวต ตวอยางทดกไดแกกลโคส ซงเปนนาตาลทสามารถเกบไวบนชนได
ตลอดไปโดยไมมการเสอมสภาพเลย แตเซลลสวนใหญจะออกซไดซกลโคสอยางรวดเรว ไดคารบอนไดออกไซดกบ
นาและปลอยพลงงานออกมาปรมาณมาก
C6H12O6 + 6 O2 → 6 CO2 + 6 H2O + พลงงาน 2870 kJ
( - 2870 /mol คอ การเปลยนแปลงพลงงานอสระทสภาวะมาตรฐาน [ΔGo’] สาหรบการออกซไดซกลโคส
ในทางเคม 2870 kJ เปนปรมาณพลงงานทมาก และสามารถมองกลโคสเปนสารประกอบพลงงานสง แมวาท
อณหภมปกต ไมสามารถทาปฏกรยากบออกซเจนนอกเซลลได หรอจะพดอกอยางวา กลโคสแสดง “ศกยภาพทาง
เทอรโมไดนามกส” ถาทาปฏกรยากบออกซเจนแลวจะปลอยพลงงานออกมามาก (exergonic) แตไมเกด
เหตการณนในสภาพปกต ในทางตรงกนขาม เอนไซมสามารถเรงปฏกรยาทมแนวโนมเกดขนไดทางเทอรโม
ไดนามกสแบบนได ทาใหปฏกรยาดาเนนไปไดดวยอตราเรวสงมาก
กระบวนการออกซไดซกลโคสและกระบวนการอน ๆ อกนบไมถวน เอนไซมทาใหเซลลมความสามารถท
จะแสดงศกยภาพออกมาได นนคอระบบสงมชวตใชเอนไซมเพอเรงและควบคมอตราของปฏกรยาชวเคมทสาคญ
ตอการดารงชวต
11
หนาทของเอนไซมในเมแทบอลซม
เอนไซมทางานตามลาดบกอนหลง ทาใหเกด pathway ของเมแทบอลซมทโมเลกลของสารอาหารถก
ยอย ปลอยพลงงานออกมาและเปลยนไปอยในรปทมประโยชนสาหรบเมแทบอลซม กอใหเกดสารตงตน
(precursors) และเปลยนรปไปเปนสารชวโมเลกลมากมาย
ลกษณะของเอนไซม
เอนไซมมลกษณะ 3 ประการททาใหเรง
ปฏกรยาทางชวเคมไดอยางเหมาะสม คอ
(1) มพลงในการเรงปฏกรยา
(2) มความจาเพาะตอปฏกรยา
(3) ควบคมได
พลงในการเรงปฏกรยา นยามไดเปนสดสวนของ
อตราเรวทเรงโดยเอนไซมในปฏกรยาตออตราเรว
ทไมมตวเรง
เอนไซมมพลงอยางมากในการเรงปฏกรยา
อาจจะสามารถเรงปฏกรยาใหเรวขนไดถง 1021 เทา
เมอเทยบกบระดบทไมไดเรงปฏกรยา ซงสงกวา
ตวเรงใด ๆ ทสงเคราะหขนมา และเอนไซมสามารถ
ทางานไดในสารละลายทเจอจางภายใตสภาวะ
อณหภมและ pH ทไมรนแรง ตวอยางเชน เอนไซม
urease จากถวพรา (jack bean) เรงปฏกรยายอยย
เรย
ท 20O C คาคงทอตราสาหรบปฏกรยาท
เรงดวยเอนไซมคอ 3 x 104 /วนาท คาคงทอตรา
สาหรบการยอยยเรยทไมมตวเรงปฏกรยาคอ 3 x
10-10 /วนาท ดงนน 1014 คอสดสวนของอตราเรวท
มการเรงตออตราเรวทไมมการเรง สดสวนนคอ catalytic power ของเอนไซม นนคอ catalytic power ของยร
เอสเทากบ 1014
ความจาเพาะ (specificity) เปนคาศพททใชนยามความสามารถในการเลอก substrate ของเอนไซม
เอนไซมมความจาเพาะเจาะจงสงมาก ทงในแงของสารทจะเขาทาปฏกรยาและในแงปฏกรยาทจะเรง
สารทเอนไซมจะเขาทาปฏกรยาเรยกวา substrate ในปฏกรยาทเรงโดยเอนไซม จะไมม substrate ถกพาไปเขา
ปฏกรยาขางเคยงทไมใหผลผลต ดงนนจงไมเกด by-products ทสญเปลา
ทเปนเชนนกเพราะ เอนไซมม active site ซงเปนบรเวณทเขากนไดกบ substrate
การควบคมกจกรรมของเอนไซม เพอใหมนใจวาอตราของเมแทบอลซมจะเหมาะสมกบความตองการของ
เซลล
12
การควบคม (regulation) กจกรรมของเอนไซมมความจาเปนตอการควบคมเมแทบอลซม ซงอาจทาได
หลายวธ เชน ควบคมปรมาณการสงเคราะหโปรตนของเอนไซม หรอควบคมอตราปฏกรยาโดยใชตวยบยงหรอ
ตวกระตนเมแทบอลซม
การตงชอเอนไซมทาใหเกดวธทเปนระบบในการตงชอปฏกรยาของเมแทบอลซม
โดยทวไปแลว จะตงชอเอนไซมโดยการเตม suffix –ase ทายชอของ substrate ทเอนไซมเขาทา
ปฏกรยา เชน urease สาหรบเอนไซมทยอยยเรย หรอ phosphatase สาหรบเอนไซมทยอยหม phosphoryl
ออกจากสารประกอบฟอสเฟตอนทรย
ชอเอนไซมบางชนดอาจจะทาใหสบสนหรอหาทมาของกจกรรมของเอนไซมไมได เชน catalase หรอ
trypsin และ pepsin ดงนนคณะกรรมาธการเอนไซมนานาชาต (International Commission on Enzymes)
จงไดสรางระบบในการตงชอเอนไซมขน แมวาชอ common name สาหรบเอนไซมหลาย ๆ ชนดกยงใชอย
แบงเอนไซมออกเปน 6 class แตละ class กจะม subclass และแตละ subclass กจะม sub-
subclass และเอนไซมแตละชนดจะมตวเลขทงหมด 4 ชด ตวอยางเชน เอนไซมทเรงปฏกรยาน
ATP + D-glucose → ADP + D-glucose-6-phosphate
หมฟอสเฟตถกยายจาก ATP ไปยงหม C-6-OH ของกลโคส ดงนนเอนไซมจงเปน transferase
(class 2) สวน subclass 7 ของ transferase คอ เอนไซมททาหนาทยายหมทมฟอสฟอรสเปนองคประกอบ และ
sub-subclass 1 จะครอบคลม phosphotransferase ทมหมแอลกอฮอลเปนตวรบ เอนไซมตวท 2 ใน sub-
subclass นคอ ATP:D-glucose-6-phosphotransferase และใชชอตามระบบวา E.C.2.7.1.2
เนองจากชอตามระบบนยงยากในการใชงานทวไปและจดจา ในชวตประจาวนจงยงนยมใชชอสามญ
(trivial name) กนอย จะใชชอ E.C. ในกรณทตองการจดหมวดหมเอนไซมตามกจกรรมเทานน
13
ชท Biochemistry II (01402313) สาหรบวนท 15-18 พ.ย. 56
อ.พทธพร สองศร
ดงนนการเรยกชอเอนไซม E.C.2.7.1.2 จงยงนยมเรยกวา glucokinase ซงเปนชอ trivial name และ
อกชนดทเปนเอนไซมททางานคลาย ๆ กน แตไมจาเพาะกบกลโคส สามารถเรงปฏกรยากบเฮกโซสชนดอนได ก
นยมเรยกวา hexokinase มากกวา E.C.2.7.1.1
kinase เปน trivial name สาหรบเอนไซมทเปน ATP-dependent phosphotransferases
โคเอนไซมและโคแฟกเตอรเปนองคประกอบทไมใชโปรตน ทมความจาเปนสาหรบกจกรรมของ
เอนไซม
เอนไซมหลายชนดสามารถทางานเปนตวเรงปฏกรยาไดโดยอาศยเพยงแคโครงสรางทเปนโปรตน แตม
เอนไซมอกหลายชนดเชนกนทตองการองคประกอบทไมใชโปรตนในการทางาน เรยกองคประกอบนวา โคแฟก
เตอร (ดตาราง)
โคแฟกเตอรอาจจะเปนไอออนโลหะหรอโมเลกลอนทรย (โคเอนไซม) โคเอนไซมและโคแฟกเตอรชวยให
โปรตนสามารถทางานบางอยางทสายโซกรดอะมโนไมสามารถทางานได โคเอนไซมหลายชนดเปนวตามนหรอม
องคประกอบบางสวนเปนวตามน
โคเอนไซมมกจะยดเกาะตดกบเอนไซมอยางเหนยวแนน บางครงกเปนพนธะโควาเลนต ทาใหยากทจะ
แยกสวนของโคเอนไซมออกจากสวนของโปรตน กรณนจะเรยกสวนของโคเอนไซมวา prosthetic groups
(พรอสเทตก กรป) ของเอนไซม
สารเชงซอนทมโปรตนและหมพรอสเทตกอยครบ ทางานได เรยกวา holoenzymes สวนโปรตนทขาด
หมพรอสเทตกไป เรยกวา apoenzymes ซงเรงปฏกรยาไมได
โคแฟกเตอรทควรรจก
ไอออนโลหะ เอนไซม
Fe2+ หรอ Fe3+ Cytochrome oxidase, Catalase, Peroxidase
Cu2+ Cytochrome oxidase
Zn2+ DNA polymerase, Carbonic anhydrase, Alcohol dehydrogenase
Mg2+ Hexokinase, Glucose-6-phosphatase
Mn2+ Arginase
K+ Pyruvate kinase (ตองการ Mg2+ ดวย)
Ni2+ Urease
Mo Nitrate reductase
Se Glutathione peroxidase
การทดลองอะไรบางทใชพสจน metabolic pathways
เมแทบอลซม ประกอบดวย pathway ทมปฏกรยาตาง ๆ เรยงกนตามลาดบ เทคนคทใชในการหา
ลาดบของ pathway นพฒนามาเรอย ๆ ตงแตยคศตวรรษท 19 โดย Eduard Buchner ไดแสดงใหเหนวาการ
14
หมกกลโคสซงทาใหไดเอทานอลกบคารบอนไดออกไซดนนสามารถเกดขนไดในสารจากเซลลยสตทแตกแลว กอน
หนานเชอกนวาเมแทบอลซมเปนสมบตทพบในเซลลทยงมชวตอยเทานน
หลงจากการคนพบของ Buchner นกชวเคมกไดคนหาสารตวกลางทอยระหวางทางในการเปลยน
กลโคส และคนพบวาฟอสเฟตอนนทรย (Pi) มความจาเปนในการยอยกลโคส การสงเกตครงนไดนาไปสการคนพบ
สารประกอบอนทรยทอยในรป phosphorylated (มหมฟอสเฟตเตมอย) อกมากมายหลายชนดททาหนาทเปน
สารตวกลางระหวาง pathway ของการหมก
เครองมอทสาคญทใชในการหาขนตอนตาง ๆ ของ pathway คอการใชสารยบยงเมแทบอลซม
(metabolic inhibitors) การเตมสารยบยงเอนไซมลงไปในสารสกดทไมมเซลล (cell-free extract) ทาใหเกดการ
สะสมของสารตวกลางใน pathway กอนหนาจดทยบยง (ดภาพ) สารยบยงแตละชนดกจาเพาะกบจดตาง ๆ ใน
ลาดบของเมแทบอลซม
Mutations ทาใหเกดการขดขวางเมแทบอลซมทตาแหนงจาเพาะ
พนธศาสตรชวยใหการคนหาขนตอนของเมแทบอลซมทาไดงายขนในทานองเดยวกบการใชสารยบยง
การกลายพนธทยนของเอนไซมชนดหนง กจะสงผลใหไมสามารถสงเคราะหเอนไซมในรปแอคทฟได ทาใหเกดการ
ขดขวาง pathway ทจดทเอนไซมชนดนนตองเขาเรงปฏกรยา และทาใหสบสเตรตของเอนไซมนนเกดการสะสม
ความบกพรองทางพนธกรรมอาจทาใหตายไดถาผลตภณฑสดทายของ pathway นนจาเปนหรอถาสารตวกลางท
สะสมมพษ
อยางไรกตาม ในจลนทรย สามารถเตรยมอาหารเลยงเชอใหมสารผลตภณฑสดทายทจาเปน และ
สามารถสงเกต ศกษาผลทางชวเคมของการกลายพนธได การศกษาการกลายพนธของยนในเชอรา Neurospora
crassa ทาให G.W.Beadle และ E.L.Tatum สรางสมมตฐานในป 1941 (พ.ศ. 2484) วายนเปนหนวยพนธกรรม
ทถอดรหสไดเปนเอนไซม (one gene-one enzyme hypothesis)
สารไอโซโทปสามารถใชตรวจสอบเมแทบอลซมได
อกวธทนยมใชกนอยางกวางขวางเพอหาลาดบของเมแทบอลซมคอการ “เลยง” เซลลดวยสบสเตรตหรอ
สารตวกลางในเมแทบอลซมท “ตดฉลาก” ดวยรปไอโซโทปของธาตทสามารถตดตามได มไอโซโทปสองประเภทท
มประโยชนในการใชงาน คอ ไอโซโทปกมมนตรงส เชน 14C และไอโซโทป “หนก” ทเสถยร เชน 18O หรอ 15N
เนองจากพฤตกรรมทางเคมของสารประกอบทตดฉลากดวยไอโซโทปไมคอยตางจากสารทไมตดฉลาก
ดงนนไอโซโทปจงเปน “ปาย = tag” ทเชอถอไดสาหรบสงเกตการเปลยนแปลงทางเมแทบอลซม ดงตวอยางการ
ทดลองใช CO2 ทตดฉลากดวย 14C กบเซลลของสาหรายสเขยว Chlorella แลวนาสารไปแยกดวยโครมาโตกราฟ
แบบกระดาษชนด 2 มต
15
Heavy Isotopes
ไอโซโทปหนกทาใหสารประกอบมมวลมากกวาเดมเลกนอย สารประกอบทไดจะสามารถแยกไดโดยใช
mass spectrometry (หรอใชวธ density gradient centrifugation ในกรณทเปนสารโมเลกลใหญ)
ตวอยางเชน ใช 18O ในการทดลองตรวจสอบวาอะตอมออกซเจนในนาและคารบอนไดออกไซดมวถทางอยางไร
ออกซเจนในบรรยากาศทสรางขนระหวางกระบวนการสงเคราะหแสงมาจากไหน จาก H2O, CO2 หรอทงสอง
CO2 + H2O → (CH2O) + O2
ถาให CO2 ทตดฉลากดวย 18O แกพชทสงเคราะหแสง ปรากฏวาไมพบ 18O ใน O2 เลย แตนาแปลกใจท
ไปอยในรปของ H218O
ในทางตรงกนขาม เมอพชทกาลงตรง CO2 อย มการให H218O เขาไป จะได 18O2 ออกมา ซงทาใหได
สมการของการสงเคราะหแสงเปนดงน
C16O2 + 2 H218O → (CH2
16O) + 18O2 + H216O
นนคอ ในกระบวนการสงเคราะหแสง อะตอมออกซเจนสองอะตอมใน O2 มาจากโมเลกล H2O สอง
โมเลกล และม O อะตอมหนงหลดมาจาก CO2 ไปปรากฏอยในโมเลกลของ H2O สวนอก O หนงของ CO2 อยใน
ผลตภณฑคารโบไฮเดรต สองในสของอะตอม H เขาไปอยใน (CH2O) และอกสอง H ไปรดวซ O ทหลดมาจาก
CO2 เปน H2O
NMR spectroscopy เปนตวตรวจสอบเมแทบอลซมโดยไมทาลายเซลล
เทคโนโลยทมรปแบบเดยวกนกบการตามรอยโดยใชไอโซโทปคอ nuclear magnetic resonance
(NMR) spectroscopy โดยนวเคลยสของอะตอมของไอโซโทปบางชนด เชน ไอโซโทปของฟอสฟอรสทพบใน
ธรรมชาต 31P มโมเมนตแมเหลก ความถเรโซแนนซของโมเมนตแมเหลกจะไดรบอทธพลจากสงแวดลอมทางเคม
บรเวณนน ๆ กลาวคอ สญญาณ NMR ของนวเคลยสจะไดรบอทธพลในรปแบบทตรวจสอบได โดยธรรมชาตทาง
เคมของอะตอมทอยบรเวณขางเคยงในสารประกอบ ในปจจบนโรงพยาบาลไดใชวธนในการตรวจสอบเมแทบอล
ซมของรางกาย
16
วธ NMR spectroscopy ทาใหสามารถสงเกตเมแทบอลซมของสงมชวตไดแบบเรยลไทม จากภาพ
ขางลางนจะเหนสเปกตรม NMR ทแสดงใหเหนการเปลยนแปลงระดบของ ATP, creatine-P
(phosphocreatine) และ Pi ในกลามเนอแขนของมนษยทออกกาลงกายไป 19 นาท โปรดสงเกตวาอะตอมของ
P 3 อะตอมใน ATP (α, β และ γ ) ม chemical shifts แตกตางกน ซงเปนผลมาจากสงแวดลอมทางเคมท
แตกตางกน
Metabolic pathways มการแยกสวนกนทาหนาทภายในเซลล
แมวาภายในเซลล prokaryote จะไมมการแบงสวนโดยเมมเบรน แตเซลลกยงแสดงใหเหนวามการ
กระจายของเมแทบอลซมไมเหมอนกน ใน pathways บาง pathways เชน การสงเคราะหฟอสโฟลพดและออกซ
เดทฟ ฟอสโฟรเลชน จะอยภายในพลาสมาเมมเบรน สวนการสงเคราะหโปรตนจะเกดขนในไรโบโซม
ในทางตรงกนขาม เซลล eukaryote จะมการแบงสวนอยางชดเจนโดย endomembrane เซลลแตละ
เซลลจะมนวเคลยสทแทจรงหมดวยเมมเบรนสองชน เรยกวา nuclear envelope
Nuclear envelope จะเชอมตอไปยงระบบ endomembrane ซงประกอบดวยบรเวณตาง ๆ เชน
endoplasmic reticulum, Golgi complex, lysosome, vacuole และไปถง plasma membrane
เซลล eukaryote ยงมไมโตคอนเดรย และคลอโรพลาสตดวยถาเปนเซลลสงเคราะหแสง
การทาใหเซลลแตกและแยกสวนตาง ๆ (fractionation) ขององคประกอบเซลลชวยในการวเคราะห
หนาทการทางานของแตละสวน ทาใหทราบวาสารตาง ๆ ตลอดจนเอนไซมในเมแทบอลซมของ pathway ใดอยท
ไหน ตวอยางเชน เอนไซม 10 ชนดของไกลโคไลซสจะพบอยใน cytosol แต pyruvate ซงเปนผลตภณฑของไกล
โคไลซสจะถกปอนเขาสไมโตคอนเดรย ซงเปนออรแกเนลลทมเอนไซมใน citric acid cycle และจะออกซไดซไพร
เวตไปเปน CO2
พลงงานทปลดปลอยออกมาจานวนมากจะถกดกจบโดยกระบวนการ oxidative phosphorylation ใน
เมมเบรนของไมโตคอนเดรย และใชในการสราง ATP
17
ภาพแสดงขนตอนการแยกสารภายในเซลลดวยวธปนแยก (differential centrifugation) โดยอาศย
หลกทวาออรแกเนลลและอนภาคตาง ๆ ภายในเซลลมขนาดรปรางและความหนาแนนแตกตางกน ทาใหมอตรา
การตกตะกอนไมเทากน นวเคลยสมกจะตกตะกอนไดงาย ไมโตคอนเดรยตองใชแรงเหวยงทมากขน แตถาจะ
ตกตะกอนไรโบโซมหรอชนสวนของระบบ endomembrane กตองใชแรงเหวยงสงมาก
18
ภาพแสดงบรเวณทเกดไกลโคไลซส citric acid cycle และ oxidative phosphorylation
Metabolome บอกอะไรเราไดเกยวกบระบบชวภาพ
ความกาวหนาอยางรวดเรวในการวเคราะหทางเคมทาใหเปนไปไดทจะศกษาทาความเขาใจสาร
metabolites ตาง ๆ ในสงมชวต
metabolome คอ ชดทสมบรณของโมเลกลทมนาหนกโมเลกลตาทพบในสงมชวตหรอขบออกมาจาก
สงมชวตภายใตสภาวะทางสรรวทยาทกาหนด
metabolomics คอ การวนจฉย พสจน วเคราะหเชงปรมาณของสาร metabolites ทงหมดใน
สงมชวตหรอตวอยางทกาหนด
การศกษาชวเคมจงเปนพนฐานทจะนาไปสวชา “ชววทยาระบบ” (systems biology)
ชววทยาระบบ (Systems biology) เปนศาสตรทอาศยความรทางชวสารสนเทศศาสตร คณตศาสตร
ชนสง วทยาการคอมพวเตอร และ ชวเคม เพอทาแบบจาลองของปรากฏการณภายในเซลล หรอในสงมชวต บน
คอมพวเตอร โดยอาศยการคานวณ จดมงหมายกเพอทานายปรากฏการณของชวตในเรองตาง ๆ อาท การ
ตอบสนองของเซลลตอยา หรอ ตอสภาวะตางๆ เปนตน กอนการทาการทดลองจรงในหองปฏบตการ (wet lab)
The Human Metabolomics Database มฐานขอมลของ metabolites มากกวา 2,500 ชนดทพบ
ในเซลลของมนษย ตลอดจนของเหลวภายในรางกายมนษย (เลอด ปสสาวะ ฯลฯ) สามารถเขาใชงานไดท
www.hmdb.ca
การวดและวเคราะหเชงปรมาณสาร metabolite นน ตองมการประยกตหลาย ๆ เทคนคเขาดวยกน
เชน mass spectrometry (MS) และ NMR ตลอดจนโครมาโตกราฟ เพอความรวดเรวและลดคาใชจาย
19
ชท Biochemistry II (01402313) สาหรบวนท 20-22 พ.ย. 56
อ.พทธพร สองศร
การสรางพลงงานในสงมชวต (Bioenergetics)
หลงจากนไป นสตจะไดเรยนเกยวกบเมแทบอลซมทสรางและใชพลงงาน ซงในสงมชวตนน ปฏกรยา
endergonic (เกดขนเองไมไดทางเทอรโมไดนามก = unfavorable) จะสามารถ “ไปขางหนา” ได ถาไปควบคกบ
ปฏกรยาทเปน exergonic (thermodynamically favorable)
พลงงานทใชในการขบเคลอนปฏกรยาการสงเคราะหทางชวภาพนน สวนมากจะไดมาจากการออกซเดชน
ของสารอนทรย ออกซเจนเปนตวรบอเลกตรอนตวสดทายสาหรบสงมชวตชนดแอโรบก ออกซเจนเปนตวออกซไดซ
ทแรง มแนวโนมทจะดงดดอเลกตรอนเขาหาตวเอง และถกรดวซในกระบวนการ โลกของเรามออกซเจนเปนปรมาณ
มาก จงไมนาแปลกใจทระบบสงมชวตตองมความสามารถในการไดพลงงานจากการออกซไดซสารอนทรย
การออกซไดซทางชวภาพ ปลดปลอยพลงงานออกมาทละนอย
เมอมองในมมของเทอรโมไดนามกส การออกซไดซทางชวภาพของสารอนทรยกเปรยบไดกบการออกซไดซ
ทไมใชชวภาพ เชน การเผาไหมของไม พลงงานอสระทออกมากเทากน ไมวาเราจะพดถงการออกซไดซโพลเมอรของ
กลโคสทอยในเซลลโลสของไมฟน การเผาผลาญกลโคสในแคลอรมเตอร หรอการออกซไดซกลโคสในเมแทบอลซมก
ตาม
C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 +6H2O ΔG°′ = -2870 kJ/mol
สมการนแสดงใหเหน stoichiometry (ปรมาณสมพนธ) ทเปนแบบอนรกษและเปนปรมาณสมพนธของ
ปฏกรยาอยางงายในการเผาผลาญกลโคส แตการออกซไดซทางชวภาพ ตองผานกระบวนการทสลบซบซอนกวาการ
เผาไหมมาก เมอไมถกเผา พลงงานทงหมดถกปลอยออกมาในรปความรอน (heat) ไมเกดงาน (work) ทเปน
ประโยชน ยกเวนวาจะเอาไปผานเครองจกรเชน เครองจกรไอนา ในการออกซไดซทางชวภาพจะเกดขนโดยไมมการ
เพมอณหภมมากและมการดกจบพลงงานอสระบางสวนไวในรปของพลงงานเคม ในรปของ ATP และการยอยสลาย
ATP จะไปควบคกบกระบวนการตาง ๆ มากมากเพอเปนตวใหพลงงานสาหรบงานทางชวภาพ
ในกระบวนการ catabolism ของกลโคส ประมาณ 40% ของพลงงานทปลอยออกมาจะถกใชไปในการ
ขบเคลอนการสงเคราะห ATP จาก ADP และ Pi
ไมเหมอนกบการออกซไดซกลโคสโดยใชออกซเจนในสมการกอนหนาน การออกซไดซทางชวภาพจะไม
เกยวกบการถายโอนอเลกตรอนโดยตรง จากสบสเตรตทอยในรปรดวซไปยงออกซเจน แตจะมชดของปฏกรยา
ออกซเดชน-รดกชนทเกดขนเปนลาดบ โดยอเลกตรอนจะผานตวกลางขนสงอเลกตรอน เชน NAD+ และ FAD และ
ทายทสดกไปยงออกซเจน
ดงนน กระบวนการออกซไดซกลโคสทางชวภาพอาจจะแสดงใหละเอยดมากขน และถกตองมากขนดวย
กระบวนการควบคตอไปน
C6H12O6 + 10NAD+ + 2FAD + 6H2O → 6CO2 + 10NADH + 10H+ + 2FADH2
10NADH + 10H+ + 2FADH2 + 6O2 → 10NAD+ + 2FAD + 12H2O
----------------------------------------------------------------------------------------------------
Net: C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O
ปฏกรยาสทธของกระบวนการออกซไดซทางชวภาพน เหมอนกนกบการเผาไหมโดยตรง การออกซไดซ
กลโคสอยางสมบรณตองการการถายโอนอเลกตรอน 12 คจากกลโคสไปยงออกซเจนโมเลกล ไมวาจะเปน
กระบวนการโดยตรงอยางในการเผาไหม หรอผานตวกลางขนสงอเลกตรอน (NAD+ และ FAD)
20
การถายโอนอเลกตรอนจากตวกลางขนสงอเลกตรอนนไปยงออกซเจนจะถกเรงดวยสายโซการขนสง
อเลกตรอน (electron transport chain) หรอการหายใจ respiratory chain และเรยกออกซเจนวา ตวรบ
อเลกตรอนปลายสด (terminal electron acceptor)
เนองจากพลงงานศกยทเกบอยในสารอนทรยจะถกปลอยออกมาทละนอย จงงายทจะควบคมการ
ออกซไดซและการดกจบพลงงานขณะทปลอยออกมา กลาวคอการถายโอนพลงงานทละนอยจะมการสญเสย
พลงงานนอยกวาการถายโอนทละมาก ๆ
ไมใชวาพลงงานจากเมแทบอลซมจะมาจากการออกซไดซกลโคสเสมอไป สารอน ๆ นอกจากออกซเจนก
เปนตวรบอเลกตรอนปลายสดได จลนทรยหลายชนดสามารถดารงชวต(หรอจะตองดารงชวต) แบบ anaerobic (ไม
มออกซเจน) ตวอยางเชน Desulfovibrio มการหายใจแบบแอนแอโรบกโดยใชซลเฟตเปนตวรบอเลกตรอนปลายสด
SO42- + 8e- + 8H+ → S2- + 4H2O
อยางไรกด จลนทรยแอนแอโรบกสวนมากจะไดพลงงานมาจากกระบวนการหมก (fermentation) ซง
เปน catabolic pathway ทใหพลงงานโดยไมมการเปลยนแปลงสทธของสถานะออกซเดชนของผลตภณฑเมอเทยบ
กบของสารตงตน ตวอยางทดคอการผลตเอทานอลและ CO2 จากกลโคส
pathway แบบแอนแอโรบกทใหพลงงานนอกเหนอจากนกเชนแบคทเรยทอาศยอยในปลองไฮโดรเทอร
มอลใตทะเลลก (รอยแยกบนเปลอกผวโลกทมนารอนไหลออกมา) ซงรดวซซลเฟอรเปนซลไฟดในปฏกรยาถายโอน
อเลกตรอนขนสดทาย และในแบคทเรยทรดวซไนไตรทเปนแอมโมเนย
การคานวณพลงงานทได (Energy yields)
ถาพลงงานในเมแทบอลซมเรมตนมาจากปฏกรยาออกซเดชน กหมายความวายงสบสเตรตมสภาพรดวซ
มาก กยงมศกยภาพมากในการใหพลงงานทางชวภาพ เราสามารถใชแคลอรมเตอรวดความรอน (enthalpy) ท
ออกมาจากการออกซไดซไขมน คารโบไฮเดรตหรอโปรตน การเผาไหมไขมนทาใหไดความรอนมากกวาคารโบโฮ
เดรตทมวลเทากน หรอกลาวไดวา ไขมนมปรมาณแคลอรมากกวาคารโบไฮเดรต เพอใหเหนภาพชด จะเปรยบเทยบ
การออกซไดซกลโคสกบการออกซไดซกรดไขมนอมตวทพบบอย คอ กรดปาลมมตก
C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O ΔG°′ = -3.74 kcal/g
C16H32O2 + 23O2 → 16CO2 + 16H2O ΔG°′ = -9.30 kcal/g
เปลยนแคลอร (หนวยทางโภชนาการ) เปนจล (หนวยปจจบนของเทอรโมไดนามกส) เรากจะพบวาการ
ออกซไดซกลโคส ได 15.64 kJ/g และการออกซไดซกรดปาลมมตกได 38.90 kJ/g
คารบอนในไขมนโดยทวไปอยในรปรดวซมากกวาคารโบไฮเดรต ดงนนไขมนจงมโปรตอนและอเลกตรอน
มากกวานาตาล ในการทจะรวมกบออกซเจนในระหวางทางทจะไปเปน CO2 โดยดจากการนบอะตอมออกซเจนกได
กลโคสมออกซเจนตอคารบอนมากกวากรดปาลมมตก แตละคารบอนในกลโคสกเชอมตอกบอะตอมออกซเจนอยาง
นอยหนงอะตอม
เราสามารถบอกไดดวยวา กลโคสเปนสารทอยในรปออกซไดซสงกวา เพราะวาการออกซไดซกลโคสทาให
ไดจานวนโมลของ CO2 ตอจานวนโมลของ O2 มากกวา อตราสวนนเรยกวา RQ (respiratory quotient)
จากสมการขางตน คานวณไดคา RQ ของกลโคส คอ 1.0 (6CO2/6O2) ขณะทของกรดปาลมมตกได 0.70
(16CO2/23O2) โดยทวไปแลว ยงสบสเตรตมคา RQ ตา ยงตองใชออกซเจนมาก(ตอคารบอนทถกออกซไดซ) และยง
เปนสบสเตรตทมศกยภาพตอโมลมากในการสราง ATP
21
ATP ทาหนาทเปน Free energy currency
หมายความวา ATP ทาหนาทเปน “เงนตรา” สาหรบแลกเปลยนพลงงานอสระ ธนบตร 100 บาท
สามารถนาไปใชแลกสนคาหรอบรการตาง ๆ ได ในทานองเดยวกน เซลลแลกเปลยนพลงงานทปลอยออกมาจากการ
ยอย ATP เพอทาหนาทตาง ๆ ทจาเปน โดยมกจะเปลยนพลงงานเคมทปลอยออกมาจากการยอย ATP ไปเปน
พลงงานรปแบบอน คอ พลงงานกล ตวอยางเชน การหดตวของกลามเนอ หรอพลงงานไฟฟาในการสอกระแส
ประสาท หรอพลงงานออสโมซสในการขนสงสารผานเมมเบรนตานความตางของความเขมขน ดงนน ATP จงเปน
ตวกลางทใหพลงงานอสระ โดยจะมการสรางและใช ATP อยอยางตอเนองตลอดเวลา
ประมาณกนวามนษยทพกผอนอยจะเปลยนรป ATP มากถง 65 kg ในเวลา 24 ชวโมง พอ ๆ กบนาหนก
ตว ! (25% ของ ATP ทใชไปน สาหรบ Na+/K+ -ATPase) ยงถามการออกกาลงกายหนก ๆ จะใช ATP ไปถง 0.5
kg/นาท
การสราง ATP จะควบคกบกระบวนการ fermentative หรอ oxidative
การออกซไดซ 1 โมลของกลโคสระหวางการหายใจ จะควบคกบการ phosphorylation ของ ADP
ประมาณ 32 โมล ดงสมการ
C6H12O6 + 6O2 + 32ADP + 32Pi → 6CO2 + 38H2O + 32ATP
22
สารประกอบฟอสเฟตพลงงานสงอน ๆ
ATP สามารถใชขบเคลอนการสงเคราะหสารประกอบทมพลงงานสงกวา เชน creatine phosphate
ซงทาหนาทเปนตวกลางในการขนสงพลงงานของพนธะฟอสเฟตจาก ATP ในไมโตคอนเดรยไปยงไมโอไฟบรล ซง
จะกลายเปนพลงงานกลในการหดตวของกลามเนอ
creatine phosphate (phosphocreatine) สรางจาก creatine โดยใชเอนไซม creatine kinase
เซลลของสตวเลยงลกดวยนมม creatine kinase isozymes หลายชนดตาง ๆ กน มชนดหนงอยท
intermembrane space ของไมโตคอนเดรย (MtCK)
แมดจากตารางขางบน ปฏกรยาการสราง creatine phosphate จะเปน endergonic ทสภาวะ
มาตรฐาน (ΔG°′ = +12.5 kJ/mol) แตเนองจากระดบของ ATP ในไมโตคอนเดรยสง และระดบ creatine
phosphate ในไมโตคอนเดรยตา ปฏกรยาจงเปน exergonic ไปขางหนาได
จากนน creatine phosphate จงแพรจากไมโตคอนเดรยไปยงไมโอไฟบรล เพอใหพลงงานในการหดตว
ของกลามเนอ อยางไรกตาม แหลงพลงงานโดยตรงสาหรบการหดตวของกลามเนอกเปนการยอย ATP อกครง
23
การหดตวของกลามเนอ (muscle contraction)
Phosphocreatine (PCr) circuit showing the rephosphorylation of creatine (Cr) in
mitochondria using ATP derived from oxidative phosphorylation (oxid phos) and subsequent use
of mitochondrial PCr by cytosolic creatine kinase (CK) to resupply ATP for muscle activity
24
กรณศกษา: การใชหงหอยเปนตวรายงานปรมาณของ ATP