zoeken in pubmed marianne van der heijden bureau andromeda 5 november 2002
TRANSCRIPT
Zoeken in Pubmed
Marianne van der Heijden
Bureau Andromeda
5 november 2002
Andromeda
Adviesbureau voor bibliotheek en informatieInternetcursussen voor medisch
bibliothecarissenPubmedcursussen voor (para) medici Advisering bij samenwerking op Internet op
Europese en internationale schaal http://www.bureau-andromeda.nl
Internet == Bibliotheek
A good description of the World Wide Web ...
"It's as if the Library of Congress had exploded in midair. There's all kinds of information strewn over the countryside, approximately laid out according to its logical relationship. If you want a particular piece of information, it's probably not there, although some corpuses of data have landed intact. And the professional librarians haven't arrived yet to sort out the mess..." From: David Brooks on the WWW.
Internet =/= Bibliotheek
Waarom is Internet niet om te zoeken?
de selectie de meta-informatiehet opsporen van informatie
Zoeken naar
Known item exact antwoord te geven b.v. adres, exacte naam van een geneesmiddel
Onderwerpsgericht geen exact antwoord mogelijk b.v. nieuwste data over toepassing van een
middel
Zoeken via
Webgids een internet directory, handmatig ingedeeld via boomstructuur, doorwandelen via
hyperlinks ook verzameling links
Zoekmachine een database ingericht door robotje woord matching, ranking van resultaat
Webgidsen
Yahoo http://www.yahoo.com
WWW Virtual Library http://vlib.org/Medicine.html
Startpagina http://start.pagina.nl + dochters
NL-menu http://www.nl-menu.nl
GG -paginahttp://geestelijke-gezondheidszorg.pagina.nl/
Zoekmachines
Alta Vista http://www.altavista.nl
Google http://www.google.com
Vindex http://www.vindex.nl
Ilse http://www.ilse.nl
Conclusies werkgroep Information Retrieval Tools
Internet search engines: conclusions of our research
Search engines differ in depth of indexing. Search engines make mistakes:
They are subject to changes in indexing policy. (“indexing fluctuations”) They forget documents completely (“document fluctuations”) They miss documents in their result sets (“element fluctuations”).
Internet search engines: recommendations related to fluctuations
Fluctuations are “normal”; do not be surprised; do not worry. Do not try to find a simple explanation to fully understand what happens. Known item searchers should repeat the search
when using an engine with many element fluctuations; use other search terms when using an engine with many document fluctuations: repeat later.
http://www.cwi.nl/cwi/projects/IRT/
Problemen met zoekmachines
alle zoekmachines omvatten slechts een fractie van het totale WWW
binnen het door de zoekmachine geïndexeerde deel wordt ongeveer eenderde van de te vinden sites ook daadwerkelijk gevonden
de zoekresultaten van een zoekmachine zijn over langere tijd genomen inconsistent
het duurt meestal maanden voordat een nieuwe site wordt geïndexeerd en nog langer voordat zogenoemde "dode" links verwijderd zijn
Medische gidsen en zoekmachines
MedHunt http://www.hon.ch/MedHunt/
Medical World Search http://www.mwsearch.com/
OMNI http://www.omni.ac.uk - browse -meshDutchess http://www.kb.nl/dutchess.ned/ bladeren
- 44 e.v.
Zoekstrategie
Stap 1: soort (bibliografisch, statistisch, opinie)
Stap 2: medium (handboek,, Medline, Internet)
Stap 3: bron (WWW, FAQ, nieuwsgroep)
Stap 4: formulering (synoniemen, spelling)
Stap 5: klaar voor start (download, kladblok)
Stap 6: evaluatie (waardering, opslaan strategie)
Zoekwijzer
begin een puur medische vraag in Medline, ga pas het Net op als u daar niets vinden kunt
zoek eerst in een 'portal' - site of medische zoekmachine voor u naar algemene zoekmachines gaat
begin een onderwerpsgerichte zoekvraag bij de website van een gerenommeerde instelling en kijk wat voor links zij aanbieden
PUBMED
www.Pubmed.org
PUBMED - MEDLINE - MEDLARS - INDEX MEDICUS
bibliografisch bestandverwijst naar tijdschriftartikelen
PUBMED onderdeel ENTREZ
Entrez databases van de NCBINLM en NIH onderdeel NCBIAmerikaanse overheid
[zwarte balk]
Zoeken in Pubmed
Direct intikken in zoekbalkGebruik van diverse browsersGebruik van opgeslagen zoekactiesInperking zoekactie door limitsZoeken via indexen op veldenCombineren van zoekresultaten
Zoekbalk
Databases op zwarte balkZoekvensterGrijze balk voor nadere informatie
Zijbalk
Blauwe balk aan zijkant
Toegang tot browsersBowsers =
zoekmachines van Pubmed
Hulp en Tutorial
Depressie
Details
Zoekvraag wordt automatisch gemapped
Kijk in Details tussen vierkante haken
gezocht als MeSH Terms en als Text Word
MeSH
Medical Subject HeadingsTrefwoordensysteem van de NLMTrefwoorden = MeSH terms worden
afzonderlijk en handmatig aan ieder artikel toegekend
MeSH terms zijn hiërarchisch gerangschikt in een boomstructuur
Depression
als Behavioral symptom
Lees Scope note, ev. Datum en let op boom
Let op! MeSH heeft aparte boom voor fysiologie en aparte voor pathologie
Depressive disorder
Onder Mental Disorders - Mood disorders
Heeft zelf ook onderverdelingen
zoals Depression, postpartum
Zoek op Depression + Depressive Disorder
Kies Depression in MeSH BrowserKies ADDKies Depressive Disorder in MeSH
BrowserKies ADD and ANDSearch PUBMEDKijk naar Details, Sla URL op in Favorieten
Explode
Zoek in MeSH browser naar Depressive disorder
Kies voor Detailed DisplayKlik op Do not explode
Aspect
Via de MeSH browser kunt u ook aangeven welk aspect u belicht wilt zien
Zoek op Depression, postpartumKies voor Detailed Display en dan voor de
behandelingsaspecten (drug therapy, therapy)
Kies voor ADD en Search Pubmed
Alzheimer in MESH
Brain in MESH
Brain valt in de MESH onder de Anatomy Category
Brain diseases valt onder de Diseases category
History
Grijze balk kies voor HistoryOverzicht van zoekvragen genummerd #1, #2Combineren van zoekresultaten is mogelijk Booleaanse operatoren AND, OR, NOT
Combineer
Limits
Beperk uw zoekvraagDierproeven uitsluitenLeeftijdcategorie aangevenDatum limiet, bijv. laatste jaarPublicatietype[NB gebruik voor meta-analyses liever geen
limit, maar de clinical queries]
Indexen
Bijvoorbeeld zoeken op auteursnaamKlik op Preview/Index in grijze balkHelemaal onderaan kiest u het veld Author
Zoek in veld Author met index
Journal browser / databases
Journals openen
Klik onder LINKSKies PUBMEDEn alle artikelen uit dat tijdschrift worden
gezocht.
Bijvoorbeeld ook alles uit Cochrane Systematic Reviews
Clinical Queries
Zoekvraag kopiëren en via Clincal queries scherm invullen om systematic reviews, meta-analyses en clinical trials op te sporen
……. AND systematic[sb])
Zoekvraag bewaren
Via Details - URL Zoekvraag komt volledig in de locatiebalk van
uw browser Opslaan in een mapje onder Favorieten Alleen handig op dezelfde computer
Via Cubby Registreren (= gratis, maar je moet inloggen) Op iedere plek en tijd is de zoekvraag te herhalen
Cubby
Uitvoer/presentatie resultaat
Sort - Kies Sort by Date - Kies daarna DISPLAY
In plaats van Summary kunt u bijv. kiezen voor uitvoer in Medline formaat (tbv invoer in Reference manager)
Save als TEXTVink titels - Clip ADD - ook uit andere
resultaten toevoegen aan clipboard
Balk met uitvoer opties
Uitvoer = literatuurverwijzing
Bij sommige documenten is een link aanwezig naar het full text artikel
Niet altijd heeft u toegang tot full textTekst van sommige artikelen zijn niet full
text aanwezig
Dan artikel aanvragen
Tutorial