8/18/2019 Zaka-Udah Diedit

1/2

1. Tanaman Herbal di Indonesia

Indonesia memiliki beraneka ragam tanaman herbal. Di dunia

diperkirakan terdapat sekitar 40.000 spesies tumbuhan, yang mana

30.000 spesies hidup di Indonesia. Di antara 30.000 spesies tumbuhan

yang ada, diperkirakan sekitar 9.600 spesies berkhasiat sebagai obat dan

kurang lebih 300 spesies telah digunakan sebagai bahan untuk membuat

obat !enteri "esehatan Indonesia, #00$%.

&truktur senya'a akti( dari tanaman herbal dapat diperoleh dari

database yang telah tersedia. Database senya'a akti( tanaman herbal

dapat diperoleh se)ara online  dan gratis di 'ebsite seperti *I+http-/in).do)king.org%, ubhem http-pub)hem.n)bi.nlm.nih.go%

2anuar, #01#%, +I

)a)tus.n)i.nih.gon)idb3do'nloadn)idb3.html%, h5I

'''.ebi.a).uk)hebi%, hem5ank )hembank.broad.harard.edu%, dan

hemID )hem.sis.nlm.nih.go)hemidplus% 7llbe)k et al., #006%.

2. Molecular Docking 

a. 8ambaran mum

 Molecular docking adalah salah satu metode virtual 

 screening   yang digunakan untuk memprediksi orientasi yang

diinginkan antara dua molekul yang saling berikatan untuk 

membentuk kompleks stabil !ukesh dan :akesh, #011%.

 Molecular docking  merupakan suatu prosedur komputasi structure-

based drug discovery yang digunakan untuk mengidenti(ikasi

kon(ormasi yang benar dari suatu ligan, serta untuk mengestimasi

kekuatan interaksi antara protein dan ligan.

roses molecular docking   dia'ali dengan penerapan

docking algorithm yang memposisikan ligan pada sisi akti( dengan

kon(ormasi dan urutan pen)arian kon(ormasi tertentu. &elan;utnya

akan diterapkan  scoring function  yang bertu;uan untuk 

memprediksi energi ikatan pada kompleks ligan dan reseptor.

nergi ikatan diprediksi dengan mengealuasi si(at (isikokimia

yang terlibat dalam ikatan antara ligan dan reseptor erreira et al.,

#01

8/18/2019 Zaka-Udah Diedit

2/2

 

2