web2.0 & bioinformatics
TRANSCRIPT
Ruby on Rails 로 쾌속 웹 개발
Ruby on Rails
루비 온 레일스 (Ruby on Rails) : 웹 애플리케이션 프레임워크(Framework) 로 루비 언어로 작성된 MVC 기반의
오픈소스 웹 애플리케이션 프레임워크
MVC(Model View Controller) 기반의 프레임워크 : 모델과 뷰 , 컨트롤러로 각각 역할이 구분된 구성요소들이 결합하여 어떤
일을 처리하는 아키텍처 패턴
프레임워크 : 웹 개발 및 유지보수를 신속하고 효과적으로 할 수 있게 도와주는 웹 애플리케이션 프레임워크가 존재
1 분안에 만들기
QuickTime™ and aAnimation decompressor
are needed to see this picture.
Web2.0 시대의 Bioinformatics Mash-
up
왜 ?
데이터가 실험실에 존재하는 것이 아니라 웹에 존재대용량의 컴퓨터 자원을 공유할 수 있다 .
대용량의 데이터를 다루는 로직을 자신의 프로그램에 손쉽게 넣을 수 있다 .
웹을 통해서 자신이 원하는 서비스를 호출하고 그 결과를 활용할 수 있다 .
Bioinformatics OpenAPI
EBIhttp://www.ebi.ac.uk/Tools/webservice/
NCBIhttp://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/
entrez/query/static/eutils_help.htmlDDBJ
http://xml.ddbj.nig.ac.jp/soapp.html
공공 생물정보 데이터베이스 활용
수많은 생물정보 데이터베이스( 서열정보 데이터베이스 , 유전자 데이터베이스생물종 데이터베이스 , 논문 정보 데이터베이스 )
+OpenAPI
=새로운 Mash-up 서비스
생물정보 도구 활용
수많은 생물정보 도구
+OpenAPI
=새로운 Mash-up 서비스
초파리 (Drosophila melanogaster)
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eyless
aniridia
Score = 252 bits (644), Expect = 1e-64 Identities = 124/132 (93%), Positives = 128/132 (96%), Gaps = 0/132 (0%)
Query 38 HSGVNQLGGVFVGGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETG 97 HSGVNQLGGVFV GRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETGSbjct 5 HSGVNQLGGVFVNGRPLPDSTRQKIVELAHSGARPCDISRILQVSNGCVSKILGRYYETG 64
Query 98 SIRPRAIGGSKPRVATAEVVSKISQYKRECPSIFAWEIRDRLLQENVCTNDNIPSVSSIN 157 SIRPRAIGGSKPRVAT EVVSKI+QYKRECPSIFAWEIRDRLL E VCTNDNIPSVSSINSbjct 65 SIRPRAIGGSKPRVATPEVVSKIAQYKRECPSIFAWEIRDRLLSEGVCTNDNIPSVSSIN 124
Query 158 RVLRNLAAQKEQ 169 RVLRNLA++K+QSbjct 125 RVLRNLASEKQQ 136
Thank u ^^