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L a merluza peruana Merluccius gayi peruanus Ginsburg evaluada en el otoñ o del 2003 INSTITU TO DEL MAR DEL PERÚ Abril - Junio 2011 Callao, Perú INFORME ISSN 0378-7702 Volumen 38, Número 2

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Page 1: Volumen 38, Número 2. Abril – Junio 2011 Inf Inst Mar Perú … gonadal y fecundidad de la merluza peruana en otoño 2003. Crucero BIC Olaya 0305-06 Gonadal maturity and fecundity

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L a merluza peruana Merluccius gayi peruanus Ginsburg

evaluada en el otoñ o del 2003

INSTITU TO DEL MAR DEL PERÚ

Abril - Junio 2011Callao, Perú

INFORMEISSN 0378-7702

Volumen 38, Número 2

Instituto del Mar del Perú

INFORMEVolumen 38, Número 2. Abril – Junio 2011

Inf Inst Mar Perú 38 (2)

1. Características generales del Crucero de Investigación de Recursos Demersalesy Estudios Paleoceanográfi cos en otoño 2003. BIC Olaya 0305-06.General characteristics of the Demersal Resources and Paleoceanographic studies in autumn 2003. Cruise RV Olaya 0305-06Carlos Benites Rodríguez ................................ ................................................................................................ ................................... 171

2. Condiciones hidroquímicas del mar peruano en otoño 2003. Crucero BIC Olaya 0305-06Peruvian sea hydrochemical conditions in autumn 2003.Cruise RV Olaya 0305-06Jesús Ledesma, Georgina Flores ................................ ......................................................................................................................... 177

3. Población y abundancia de la merluza peruana estudiada por el método de área barrida en otoño 2003: Crucero BIC Olaya 0305-06.Population and abundance of Peruvian hake studied by swept area method in autumn 2003: Cruise RV Olaya 0305-06Carlos Benites Rodríguez, Flor Fernández Ramírez ................................................................................................................... 185

4. Distribución y concentración de la merluza peruana y su fauna acompañante en otoño 2003: Crucero BIC Olaya 0305-06Distribution and concentration of Peruvian hake and its accompanying fauna in autumn 2003: Cruise RV Olaya 0305-06Aníbal J. Aliaga, Carlos M. Salazar ................................ ................................................................................................................ 193

5. Estructura del subsistema demersal en otoño 2003. Crucero BIC Olaya 0305-06Demersal subsystem structure in autumn 2003. Cruise RV Olaya 0305-06Walter Elliott R, Luis Caccha A, Carlos Benites R .................................................................................................................... 197

6. Peces acompañ antes de la merluza peruana en otoñ o 2003:Crucero BIC Olaya 0305-06Fishes accompanying the Peruvian hake in autumn 2003. Cruise RV Olaya 0305-06Jesús Rujel Mena, Javier Castañeda Condori ................................ ................................................................................................ 203

7. Madurez gonadal y fecundidad de la merluza peruana en otoño 2002. Crucero BIC Olaya 0205Gonadal maturity and fecundity of Peruvian hake in autumn 2002. Cruise RV Olaya 0205.Ángel Perea de la Matta, Betsy Buitrón D, Javier Sánchez E, Jorge Mostacero .................................................................. 211

8. Madurez gonadal y fecundidad de la merluza peruana en verano 2003. Crucero BIC Olaya 0301-02.Gonadal maturity and fecundity of Peruvian hake in summer 2003. Cruise RV Olaya 0301-02.Ángel Perea de la Matta, Betsy Buitrón Díaz, Javier Sánchez Espinoza ................................................................................ 217

9. Madurez gonadal y fecundidad de la merluza peruana en otoño 2003. Crucero BIC Olaya 0305-06Gonadal maturity and fecundity of Peruvian hake in autumn 2003. Cruise RV Olaya 0305-06Ángel Perea de la matta, Betsy Buitrón Díaz ................................ ............................................................................................... 221

10. Aspectos biológicos de tres invertebrados marinos de valor comercial. Crucero BIC Olaya 0305-06Biological aspects of three marine invertebrates of commercial value. Cruise RV Olaya 0305-06Silvia Aguilar Luna................................. ................................................................................................ ............................................. 225

11. El macrobentos y las condiciones ambientales en otoñ o 2003:¿Hay evidencias de variación interanual signifi cativa desde el 2000?Macrobenthos and environmental conditions during autumn 2003:is there any signifi cant evidence of interannual variation since 2000?Dimitri Gutiérrez, Luis Quipúzcoa, Edgardo Enríquez, Robert Marquina ............................................................................. 229

12. Comportamiento de la red de arrastre de fondo 300/160 Poliamida. Crucero BIC Olaya 0305-06The bott om ott er trawl net 300/160 polyamida performance. Cruise RV Olaya 0305-06Julio Alarcón V, Carlos M. Salazar C, Francisco Ganoza C. ................................................................................................... 237

13. Rastreo acústico de recursos pesq ueros y comportamiento de red pelágica en otoñ o 2003.Acoustic tracking of fi shery resources and behavior of net pelagic in autumn 2003Francisco Ganoza Chozo ................................. ............................................................................................... ................................. .. 245

14. Cambios en el ictioplancton durante el otoño 2003. Crucero BIC Olaya 0305-06Changes in the ichthyoplankton during autumn 2003. Cruise RV Olaya 0305-06.Patricia Ayón ................................ ................................................................................................ ........................................................ 253

15. Distribución a mesoescala de comunidades bentónicas y clorofi la-a en sedimentos superfi ciales de áreas potenciales para reconstrucción paleoceanográfi ca. Otoño 2003.Distribution mesoscale benthic and chlorophyll-a in surface sediments potential areas forreconstruction paleoceanographers. Autumn 2003.Dimitri Gutiérrez, Luis Quipúzcoa,Edgardo Enríquez, Robert Marquina ................................ .............................................................................................................. 257

16. Manual de uso del software Ocean Data View (ODV).Handbook for use of Ocean Data View software (ODV).Sara Purca, Jorge Ramos ................................ ................................................................................................ .................................... 267

Ins tru c c iones p ara los au tores ......................................................................................................................................................................... 273

L a merluza peruana Merluccius gayi peruanus Ginsburg

evaluada en el otoñ o del 2003

CONTENIDO

CARATULA IMARPE 38-2. VALEindd.indd 1 23/01/2013 08:33:24 a.m.

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MANUAL DE USO DEL SOFTWARE OCEAN DATA VIEW (ODV)

HANDBOOK FOR USE OF OCEAN DATA VIEW SOFTWARE (ODV)

Sara Purca1 Jorge Ramos2

RESUMENPurca S, Ramos J. 2011. Manual de uso del software Ocean Data View (ODV). Inf Inst Mar Perú 38(2): 267-271.- El presente manual de uso del software de visualización de datos “Ocean Data View” (ODV) describe la exploración, análisis y visualización de datos oceanográficos según el formato de la colección mundial de base de datos del océano “World Ocean Database” (WOD). El manual comprende 6 ejercicios prácticos donde se describe paso a paso la creación de las metavariables, la importación de los datos y su visualización mediante mapas de latitud, longitud y gráficos de dispersión, secciones verticales y series de tiempo. Se sugiere el uso extensivo del ODV para la visualización de datos oceanográficos por el personal científico del IMARPE.Palabras clave: WOD, ODV, visualización de datos oceánicos, base de datos, metavariables.

ABSTRACTPurca S, Ramos J. 2011. Handbook for use of Ocean Data view software (OVD). Inf Inst Mar Perú 38(2): 267-271.- This handbook for use of data visualization software “Ocean Data View” (ODV) describes the exploration, analysis and visualization of oceanographic data according to the World Ocean Database (WOD). The handbook comprises 6 practical exercises which describe step by step the creation of metavariables, importing and viewing with maps of latitude, longitude, and scatter plots, vertical sections and time series. We suggest that the extensive use of ODV for visualization of oceanographic data by the scientific staff of IMARPE.Keywords: WOD, ODV, ocean data, visualization of ocean data, database, metavariables.

1 Dirección Investigaciones en Recursos Demersales y Litorales (DIRDL), Unidad de Investigaciones Biodiversidad (UIB)2 Centro de Investigaciones en Modelado Oceanográfico y Biológico Pesquero-CIMBOP IMARPE, Apdo. 22, Callao, Perú, E-mail: [email protected]; [email protected]

INTRODUCCIÓN

El software de visualización de da-tos oceanográficos “Ocean Data View” (ODV) (Schlitzer 2010) es un software recomendado por su versatilidad para obtener, analizar y visualizar los datos oceanográficos en plataforma Linux, Mac OS o Win-dows. La guía práctica del software ODV en inglés, se puede obtener libremente de la página web: http://odv.awi.de (Schlitzer op.cit).

Como extensión del curso de Manejo y Visualización de Datos Oceanográ-ficos del ODINCARSA (IOC 2005) se realizó en el IMARPE un curso de ODV, del 9 al 18 de marzo 2006, dictado por la Dra. Sara Purca y el Bach. Carlos Quispe, del Centro de Investigaciones en Modelado Ocea-nográfico y Biológico Pesquero (CI-MOBP). En vista de la gran acogida e interés por el uso de este software, se consideró necesario elaborar el presente manual introductorio de ODV en español y orientado a la visualización de datos oceanográfi-cos, con el fin de lograr una mayor difusión del uso del ODV en la co-munidad científica nacional y tener

un material pedagógico para futuros cursos de ODV.

El manual comprende 6 ejercicios prácticos: El ejercicio 1 trata de la importación de archivos de datos (importación múltiple) para graficar promedios mensuales de cualquier variable oceanográfica. El ejercicio 2 calcula promedios estacionales. El ejercicio 3 describe el promedio anual y promedio anual a diferentes profundidades. El ejercicio 4 trata del promedio espacial. El ejercicio 5 comprende los perfiles verticales en función de latitud-tiempo. En el ejer-cicio 6 se grafican perfiles verticales en función de la longitud-tiempo.

MATERIAL Y MÉTODOS

Datos usados en los ejercicios.- Los ejercicios del presente manual usan como ejemplo datos de temperatu-ra del mar obtenidos con el mode-lo ROMS (Regional Oceanic Model System) aplicado al mar peruano (Penven et al. 2005). La resolución espacial de los datos fue de 1/9°. Los datos fueron extraídos del área limi-tada por las siguientes coordenadas: 11°S-13°S, 77°W-80°W.

Software.- El software “Ocean Data View” (ODV) (Schlitzer 2010) es un paquete de aplicacio-nes para la exploración interactiva, análisis y visualización de datos oceanográficos, y perfiles geo-re-ferenciados o datos en secuencias temporales. El ODV opera en los sistemas operativos Windows (7, Vista, XP, 9x, Me, NT, 2000), Mac OS X, Linux y UNIX (Solaris, Irix, AIX). Los archivos de datos de ODV son independientes de las plataformas y pueden ser inter-cambiables entre los diferentes sis-temas (Schlitzer 2010).

RESULTADOS Y DISCUSIÓN

Instalando el Ocean Data View

El primer paso para instalar el ODV será registrarse y descargar los instaladores de la página Web del Ocean Data View: http://odv.awi.de. Así mismo en paquetes op-cionales, seleccionar la última ver-sión del software y descargarlos. Instalar ODV aceptando las ubi-caciones de los directorios destino por defecto.

Purca, Ramos Manual de uso del software ocean data view (ODV)

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Informe IMARPE Vol. 38 (2): Abril-Junio 2011 ISSN 0378-7702

Ejercicio 1. Importación de archivos de datos (Importación Múltiple)

Para importar archivos de datos, cam-biar a formato texto los archivos de da-tos en formato Excel: roms_Enero.xls, roms_Febrero.xls, roms_Marzo.xls, etc. y guardarlos en una carpeta. Crear una nueva colección de datos en ODV, en el menú elegir File, new, e ingresar el nombre de la colección. Luego, crear un archivo plantilla roms10_templa-te (Anexo 1) que contiene los meta-datos (nombres de las metavariables y variables). A continuación en la definición de variables de colección elegir la opción: Use .txt, .odv, .var or other file as template, seleccio-nar el archivo plantilla, Abrir y OK. La colección está creada. Seleccio-nar la opción importar, luego ODV Spreadsheet, abrir los archivos de texto, (Abrir y OK), las estaciones deberían haber sido importadas por cada archivo de datos (Anexo 2).

Ejercicio 2. Mapas Latitud-Longitud

2.1. Mapa latitud – longitud prome-dio mensual (ejemplo: septiembre)Hacer clic derecho sobre el mapa y elegir Full Domain, luego en el menú elegir View, Layout Templates, SURFACE Window o simplemente hacer F12. Hacer clic derecho sobre el mapa y elegir (Z variable = tem-perature). Luego presionando el clic derecho elegir Set ranges (Z: 15 °C a 26 °C). Hacer clic derecho y elegir Properties, en la ventana emergente elegir la pestaña Display Style y ahí activar Gridded field e indicar 50 y 50. En el menú principal View ele-gir Station Selection Criteria, y ahí el pestaña Date/Time e indicar el mes de septiembre. Luego en View, Sample Selection Criteria en el pes-taña Range elegir la variable Depth e indicar un rango entre 0 - 100 y ha-cer OK. Salvar eligiendo en el menú View, Save View As. Luego hacer clic derecho en el texto superior y elegir Delete All Objects, luego clic derecho en la figura, elegir Extras, luego Add Graphics Object, luego elegir Annotation, el cursor aparece-rá como una cruz, poner la cruz en la parte superior derecha dentro de la figura, luego escribir en mayúsculas SEPTIEMBRE verificar en propieda-des si el texto está orientado en 0°, elegir en Text color el blanco y en Font size 14 pt, luego OK. Repetir todos los pasos para aumentar las anotaciones y aumentar: T= 0-100 m. Finalmente, Salvar la imagen ha-

Figura 1.- Mapa de promedio de 0 a 100 m en latitud – longitud de la temperatura del mar. Rango de colores a la derecha en °C para septiembre.

Figura 2.- Mapa del promedio de temperatura (Tȳ) de invierno, en colores el rango en °C.

Figura 3.- Mapa de temperatura (Tȳ) entre los 11-12°S anual entre 0 a 100 m

Figura 4.- Latitud – longitud (promedio anual a 100 metros de profundidad)

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ciendo clic derecho sobre la figura y eligiendo Save Plot As del Menú contextual, ingresar el nombre y tipo con el que se desea guardar la ima-gen.

2.2 Mapa latitud – longitud prome-dio estacional (ejemplo: invierno)

En el menú View, elegir Station Se-lection Criteria y en la pestaña Date/time hacer clic en Relax Criteria y en Season indicar el rango (día, mes) para el cual se desea generar la sali-da y hacer OK. Para el ejemplo toma-remos desde del 01 de Julio al 30 de Septiembre. Proceder a agregar los objetos gráficos (anotaciones) como en el paso anterior. Finalmente hacer clic derecho sobre la imagen y elegir Save Plot As e indicar nombre y tipo de archivo con el que se guardará la imagen.

Ejercicio 3. Mapas Latitud-Longitud

3.1. Mapa latitud – longitud prome-dio anual (ejemplo: zona norte)

En el menú View, elegir Station Se-lection Criteria y en la pestaña Date/time hacer clic en Relax Criteria y luego OK. Salvar con View, Save View As. Luego haciendo clic dere-cho fuera del área donde se encuen-tran los mapas en el menú contex-tual elegir Layout Templates, Full Screen Map (F8). En el menú View elegir nuevamente Station Selection Criteria y ubicándose en la pestaña Domain hacer clic sobre Define Po-lygon con lo que el cursor se mostra-rá como una cruz y procederemos a definir con el ratón un polígono para el área correspondiente a la zona Norte (11°-12°S), Ok. Es importante en el procedimiento anterior cerrar el polígono, haciendo doble clic en el punto donde se empezó a crear el polígono. Volver a SURFACE (F12). Hacer clic derecho y en el menú con-textual elegir Properties y en la pes-taña Display Style activar Gridded field e indicar 50 y 50. Finalmente eliminar el texto superior haciendo clic derecho y elegir Delete All Ob-jects y luego agregar la anotación como en pasos anteriores.

3.2. Mapa latitud – longitud promedio anual a diferentes profundidadesEn el menú View, elegir Sample Se-lection criteria y en la pestaña Ran-ge elegir la variable Depth [m]. Para graficar el rango de 100 m, en la opción Accepted ranges se digitará:

87.5-112.5 m, OK. Clic derecho en la figura y se elegirá Set ranges cam-biando el eje Z a valores entre14-26. Clic derecho en la figura y elegir Pro-perties y ahí ubicarse en la pestaña Color Mapping y modificar el ancho de colores, OK. Borrar y escribir las anotaciones. Salvar en View, Save View As.

Elegir del menú View, Sample Selec-tion Criteria y en el Pestaña Range seleccionar la variable Depth e indi-car un rango para los 500 m, luego haciendo clic derecho sobre la figu-ra, elegir Set Ranges e indicar una temperatura entre 5 °C y 15 °C. Se puede hacer también para 1000 m (Set range= 0 -15 °C).

Ejercicio 4. Figura variable - tiempo (Promedio espacial)

Hacer clic derecho fuera de los ma-pas y en el menú contextual selec-cionar la opción Layout Templates, 1 SCATTER Window. Luego clic de-recho fuera de las ventanas y selec-cionar Window Layout (Alt+W). Clic derecho sobre el recuadro de la dere-cha, seleccionar Move/Resize y pro-ceder a redimensionarlo de tal ma-nera que un recuadro quede encima del otro, para salir del modo Move/Resize manteniendo las modificacio-nes hacer doble clic. Finalmente para grabar las modificaciones a los re-cuadros hacer clic derecho fuera de estos y en el menú contextual selec-cionar accept.

En el menú View elegir Derived Va-riables y en la ventana emergente seleccionar Month of Year (station date) [months], add, OK. Luego clic derecho en el gráfico y elegir X va-riable, cambiar el eje por Month of Year (station date) [months], OK. Del mismo modo cambiar el eje Y por la variable Temperatura [C], OK.

Figura 5.- Mapa de la temperatura del mar (promedio anual) a). 500 m y b). 1000 m

Ejercicio 5. Perfiles verticales

5.1. Figura variable – profundidad (promedio espacial temporal)Como en el ejercicio 1, crear una nueva colección de datos en ODV, en el menú elegir File, new e ingresar el nombre de la colección. A continua-ción en la definición de variables de colección elegir la opción: Use .txt, .odv, .var or other file as template, seleccionar el file roms10_template, Abrir y OK. La colección está crea-da. A continuación en el menú Co-llection elegir Properties, Collection Variables, en la ventana emergente hacer clic sobre el botón New, en La-bel escribir mean, en la caja de texto Units eliminar todo, en el dropdown Data Type elegir Double y hacer OK, de regreso a la ventana Collec-tion Variables seleccionar la variable mean recién creada y hacer clic en el botón Up hasta ubicarla sobre la va-riable Depth, hacer OK.

Para importar el archivo boxavering.txt, el cual contiene la nueva variable mean, en el menú Import elegir la op-ción ODV Spreadsheet y ubicar boxa-vering.txt, Abrir, OK, nuevamente OK y en la ventana Import Options seleccionar la variable mean y aso-ciarla con su contraparte, OK y listo.

Hacer F12, clic derecho fuera de las figura y en el menú contextual elegir Window Layout, proceder como en los ejemplos anteriores para modifi-car la posición y tamaño de los grá-ficos.

Verificar que la variable mean recién creada esté ubicada en el eje de las X y la variable Depth en el eje de las Y. Hacer clic sobre la figura y elegir Set Ranges e indicar valores adecua-dos (mean entre 0-20 y Depth entre 0 -5000). Salvar haciendo clic derecho Save Plot As.

Purca, Ramos Manual de uso del software ocean data view (ODV)

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Informe IMARPE Vol. 38 (2): Abril-Junio 2011 ISSN 0378-7702

5.2. Figura variable – profundidad (promedio temporal a una latitud)Hacer clic derecho fuera de los ma-pas y en el menú contextual selec-cionar la opción Layout Templates, 1 SCATTER Window. Luego clic derecho fuera de las ventanas y se-leccionar Window Layout (Alt+W), para redimensionar los gráficos como en el ejercicio 4. Una vez ter-minado el redimensionamiento, ha-cer clic derecho sobre el gráfico y ahí seleccionar X-Variable, que corres-ponderá a la variable Temperatura [C], Y-Variable a la variable Depth [m], en Z-Variable indicar (none). En el menú View, Station Selection Criteria y en la pestaña Domain, se indicarán valores de -11.75 para el Norte y -12.25 para el Sur es decir graficar a lo largo de los 12°S, OK. En el menú View nuevamente ele-gir Station Selection criteria y en la pestaña Date/time, en Season, in-dicar valores entre el 1 de Enero y el 31 de Marzo y hacer OK. Editar los rangos para cada variable, ha-ciendo clic derecho en la figura y elegir Set Ranges, e indicar valores adecuados, finalizar con OK. Salvar haciendo clic derecho Save Plot As, y View, Save View As.

Ejercicio 6. Perfiles verticales

6.1. Figura longitud – profundidad (distribución espacial temporal)

Hacer clic derecho fuera de los ma-pas y en el menú contextual selec-cionar la opción Layout Templates, 1 SCATTER Window. Luego clic dere-cho fuera de las ventanas y seleccio-nar Window Layout (Alt+W), para redimensionar los gráficos como en los ejercicios anteriores. En el menú View elegir la opción Station Selec-tion Criteria y en las pestañas Name/Range y Date/Time hacer clic sobre Relax Criteria, en la pestaña Domain hacer clic en Map Domain y final-mente hacer OK. Nuevamente en el menú View elegir Sample Selection Criteria y ahí hacer clic sobre Re-lax all range filters de ahí OK. En el menú View elegir Derived Variables y en la ventana emergente en Choi-ces seleccionar Longitude [degrees_East], luego Add y OK. Clic derecho sobre el gráfico y en el menú contex-tual elegir la opción X-Variable y en la ventana emergente seleccionar la variable Longitude [degrees_East], de la misma manera proceder con Y_Variable, pero esta debe corres-ponder a la variable Depth [m] y Z-Variable a la variable a estudiar Temperature [°C]. Clic derecho en la

Figura 7. Promedio anual de la Temperatura del mar entre 0 y 5000 m en el área 11-13°S frente a la costa peruana

Figura 8.- Promedio de Verano de la temperatura frente a la costa peruana, 12°S.

Figura 9.- Distribución longitudinal de la temperatura para el área comprendida entre los 11-12°S.

Figura 6.- Ciclo anual de la temperatura superficial del mar.

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figura y elegir Properties y en la pes-taña Display Style activar la opción Gridded fields y con VG gridding se-leccionado introducir los valores 50, 50 y hacer OK. Nuevamente clic de-recho sobre la figura, elegir Set Ran-ges y en la ventana emergente edi-tar los rangos para cada variable así para Depth entre 0-500 metros, para Temperature entre los 12-25 °C, OK. Salvar la página haciendo clic dere-cho fuera de las figuras eligiendo en el menú contextual la opción Save canvas As. Así mismo en el menú View elegir Save View As.

AGRADECIMIENTOS

Al bachiller Carlos Quispe por su colaboración durante el dictado del curso de ODV en el IMARPE, y a los usuarios del software ODV del área de oceanografía química, quienes nos alentaron a publicar este manual introductorio.

REFERENCIAS

Schlitzer R. 2010. Ocean Data View. http://odv.awi.de Use’s Guide. Version 4.01, 80 pp

IOC. 2005. Intergovernmental Ocea-nographic Commission. Training Course Report. First ODINCAR-SA II. Data Management Training Workshop. Ostend, Belgium. No-vember 7-18,2005. Report 81. 26 pp.

Penven P, Echevin V, Pasapera J, Co-las F, Tam J. 2005. Average circula-tion, seasonal cycle, and mesoscale dynamics of the Peru Current Sys-tem: A modeling approach. Journal of Geophysical Research, Vol. 110, C10021, doi:10.1029/2005JC002945, 21 pp.

ANEXO 1

Formato del archivo plantilla (e.g. roms10_template.txt) con las metavariables (e.g. las primeras 8 columnas) y las variables de la colección (e.g. profundidad, temperatura, salinidad, etc.):

Cruise Station Type Mon/day/yr hh:mm Lon(°E)

Lat(°N)

Bot. Depth[m]

Depth[m] QF Temperature

[°C] QF Salinity[psu] QF

ANEXO 2

Formato del archivo de datos con las metavariables y los datos de las variables de la colección (e.g. roms_Enero.txt):

Cruise Station Type Mon/day/yr hh:mm Lon(°E)

Lat(°N)

Bot. Depth[m]

Depth[m] QF Temperature

[°C] QF Salinity[psu] QF

enero 1 C 1/29/2002 00:00 -80 -12.91 6000 4222.92 1 1.35 1 34.69 1

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