Úvod do obecné genetiky

175
2008

Upload: iden

Post on 06-Jan-2016

105 views

Category:

Documents


20 download

DESCRIPTION

2008. Úvod do obecné genetiky. termín „genetika“ se poprvé objevuje v r. 1905 1909: pojem „gen“ 1911 termín „gen“ proniká do kontinentální Evropy. Johann Gregor Mendel 1822-1884. narozen 22. června 1822 v Hynčicích ve Slezsku 1843 vstup do augustiniánského kláštera na Starém Brně - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: Úvod do obecné genetiky

2008

Page 2: Úvod do obecné genetiky

termín „genetika“ se poprvé objevuje v r. 1905

1909: pojem „gen“ 1911 termín „gen“ proniká do kontinentální

Evropy

Page 3: Úvod do obecné genetiky

Johann Gregor Mendel1822-1884

narozen 22. června 1822

v Hynčicích ve Slezsku 1843 vstup do augustiniánského kláštera na Starém Brně 1851 – 1853 studia ve Vídni 1856 počátek experimentů s hrachem, celkem okolo 28

000 rostlin 1865 Versuche über Pflanzen-Hybride 1868 zvolen opatem 6. ledna 1884 umírá 1900 Mendelova práce znovuobjevena: Hugo de Vries

(Nizozemí), Erich von Tschermak (Rakousko), Carl Correns (Německo)

Page 4: Úvod do obecné genetiky

Genetické křížení

J.G. Mendel1862

J.G. Mendel1880

Page 5: Úvod do obecné genetiky

zatímco Mendelovi předchůdci se snažili zkoumat velký počet znaků u jedněch rodičů a zkoumali, jak se v potomstvu mísí…

Mendel naopak zkoumal velmi malý počet znaků na velké populaci potomstva

Page 6: Úvod do obecné genetiky

Důležité termíny

každá „dědičná vlastnost“ je u diploidního organismu řízena dvěma geny; jeden jsme zdědili od otce, druhý od matky

výjimkou jsou u muže geny na chromozómu X a na chromozómu Y. (Pozn. genů na chromozómu Y je velmi málo)

Page 7: Úvod do obecné genetiky

Důležité termíny

Alely = různé varianty téhož genu. Pro jeden gen máme v našem těle dvě alely; jednu jsme zdědili od otce, druhou od matky. Hovoříme např. o genu pro barvu květů, a o alele způsobující fialovou barvu a o alele způsobující bílou barvu květu.

To ale neznamená, že v populaci jsou vždy jen dvě alely. Známe např. tři alely pro dědičnost krevních skupin, IA, IB, i. V konkrétním člověku jsou vždy pouze dvě z nich. V populaci kolují všechny tři.

Page 8: Úvod do obecné genetiky

Alely

lokus = konkrétní místo na chromozómu, na kterém se nachází určitý gen

Page 9: Úvod do obecné genetiky

Homologní chromosomy

Žluté tečky označují jistý gen – a jeho lokus – na homologních chromosomech. Tyto chromosomy jsou již zreplikované po S fázi – což je poznat z toho, že na každém z obou homologních chromosomů jsou žluté tečky dvě.

Page 10: Úvod do obecné genetiky

Důležité termíny

genom = kompletní genetický materiál daného organismu

genotyp = soubor alel, které má organismus k dispozici

fenotyp = fyzické a fyziologické rysy daného organismu (=to, jak organismus aktuálně vypadá)

čistá linie = rostliny, které při samoopylení vykazují opakovaně stejnou variantu sledovaného znaku (jsou homozygotní)

Page 11: Úvod do obecné genetiky

Základní Mendelův pokus

P generace = parentální, rodičovská

F1 generace = první filiální generace (filius = syn)

F2 generace = druhá filiální generace

Page 12: Úvod do obecné genetiky

Mendelovy úvahy

dědičný faktor pro bílou barvu květů v F1 generaci nezmizel, jen ustoupil znaku pro fialovou barvu.

fialová barva květu je tedy dominantní znak bílá barva květu je recesívní znak bílá barva květu se znovu objevuje u F2

generace. Znak pro bílou barvu tedy nebyl v F1 generaci ztracen, jen koexistoval spolu se znakem pro fialovou barvu

Page 13: Úvod do obecné genetiky

Mendel zkoumal u hrachu celkem 7 znaků

barva květů fialová x bílá 705:224 3,15:1

pozice květů axiální x terminální 651:207 3,14:1

barva semen žlutá x zelená 6022:2001 3,01:1

tvar semen kulatý x svraštělý 5474:1850 2,96:1

tvar lusku nafouklý x obtažený 882:299 2,95:1

barva lusků zelená x žlutá 428:152 2,82:1

výška stonku vysoký x nízký 787:277 2,84:1

Page 14: Úvod do obecné genetiky
Page 15: Úvod do obecné genetiky

„Mendelovy zákony“(Mendel žádné zákony nikdy neformuloval)

Alternativní verze genů (odlišné alely) odpovídají za rozdílnosti ve zděděných rysech

gen pro barvu květů existuje ve dvou verzích, jeden odpovídá za fialovou barvu, druhý za bílou barvu. tyto alternativní verze genu se nazývají alely

Page 16: Úvod do obecné genetiky

„Mendelovy zákony“(Mendel žádné zákony nikdy neformuloval)

pro každou „dědičnou vlastnost“ má organismus dvě alely, jednu získanou od otce, druhou od matky

diploidní organismus má páry homologních chromozómů, jeden chromozóm z každého páru pochází od otce, druhý od matky. Genový lokus je tak v diploidní buňce přítomen dvakrát. Tyto homologní loci mohou obsahovat stejné alely, jako např. u čistých linií P generace hrachu z Mendelova pokusu, nebo se mohou lišit, jako v F1 generaci z tohoto pokusu

Page 17: Úvod do obecné genetiky
Page 18: Úvod do obecné genetiky

„Mendelovy zákony“(Mendel žádné zákony nikdy neformuloval)

Pokud se obě alely liší, pak jedna, zvaná dominantní alela, se plně vyjádří ve vzhledu organismu, druhá, zvaná recesívní alela, nebude mít žádný pozorovatelný efekt na vzhledu organismu

v Mendelově pokusu mají rostliny v F1 generaci fialové květy, přestože je v každé z nich krom alely pro fialovou barvu květu i alela pro bílou barvu květu

Page 19: Úvod do obecné genetiky

„Mendelovy zákony“(Mendel žádné zákony nikdy neformuloval)

Dvě alely pro každou dědičnou vlastnost segregují (oddělují se od sebe) během vzniku gamet

vajíčko i spermie obsahují pouze polovinu genetického materiálu, přítomného v somatické diploidní buňce. Homologní chromozómy se od sebe v průběhu meiózy oddělují. Pokud jsou obě alely na homologních chromozomech stejné, pak ve všech gametách se bude nacházet tatáž alela pro daný znak. Pokud se budou alely lišit, pak polovina gamet bude obsahovat dominantní alelu a polovina gamet recesívní alelu. Tento „zákon“ se nazývá „zákon o segregaci alel“

Page 20: Úvod do obecné genetiky

Zákon o segregaci alel

Čisté linie obsahují totožné alely, PP nebo pp. Gameta obsahuje jen jednu alelu pro barvu květu, buď P nebo p.Spojením rodičovských gamet vznikne hybrid s kombinací Pp. Protože P alela je dominantní, budou mít všichni hybridi z F1 generace fialové květy. Nyní necháme hybridy z F1 zkřížit mezi sebou. V F2 generaci získáme ¾ potomků fialových a ¼ bílých.

Page 21: Úvod do obecné genetiky

Fenotypový a genotypový štěpný poměr Fenotypový štěpný poměr pro F2 generaci

je 3:1 (tři fialové : jeden bílý) Genotypový štěpný poměr pro F2 generaci

je 1:2:1 (1PP:2Pp:1pp)

Page 22: Úvod do obecné genetiky

Genotypový a fenotypový štěpný poměr v F2 generaci

Page 23: Úvod do obecné genetiky

Užitečné termíny

homozygot = organismus, který má pro daný znak obě alely identické (např. PP nebo pp). Pokud má organismus obě alely dominantní pro sledovaný znak, užíváme termín dominantní homozygot (PP), pokud jsou obě alely recesívní, užíváme termín recesívní homozygot

heterozygot = organismus, který má obě alely pro sledovaný znak odlišné (Pp)

Page 24: Úvod do obecné genetiky

Analytické zpětné křížení(testcross)

pokud máme hrách s fialovými květy, nevíme, zda se jedná o homozygota (PP) nebo o heterozygota (Pp)

pomůžeme si křížením této rostliny s bělokvětým hrachem

jednalo-li se o heterozygota (Pp), potom polovina potomstva bude fialová a polovina bílá

jednalo-li se o dominantního homozygota, pak bude potomstvo uniformě fialové

křížení organismu s neznámým genotypem s recesívním homozygotem nazýváme analytické zpětné křížení. Je užitečné zejména u živočichů, kde nelze provést samoopylení

Page 25: Úvod do obecné genetiky

Analytické zpětné křížení

= u živočichů = křížení s recesívním rodičem

Page 26: Úvod do obecné genetiky

Monohybridismus a dihybridismus Doposud jsme sledovali pouze jediný

znak - fialovou nebo bílou barvu květů. Hovoříme o monohybridismu

co kdybychom si všímali zároveň dvou znaků? Mendel v jedné variantě pokusu sledoval zároveň barvu semen (žlutá x zelená) a tvar semen (kulatý x svraštělý). Hovoříme zde o dihybridismu.

Page 27: Úvod do obecné genetiky

Dihybridismus s dominancí Y - žlutá barva semen (yellow) y - zelená barva semen R - kulatá semena (round) r - svraštělá semena Fenotypový štěpný poměr: 9:3:3:1 Genotypový štěpný poměr: 1:2:1:2:4:2:1:2:1 tyto výsledky jsou známy jako „zákon o nezávislé

kombinovatelnosti alel“ Pokud bychom zkoumali tyto znaky odděleně, dostali bychom obvyklý poměr 3:1 (resp.1:2:1)

Page 28: Úvod do obecné genetiky

Dihybridismus s dominancí

Page 29: Úvod do obecné genetiky

„Mendelovy zákony“

Zákon o uniformitě F1 (1. filiální = první generace potomků) generace.

Zákon o náhodné segregaci genů do gamet. Při křížení 2 heterozygotů může být potomkovi předána každá ze dvou alel (dominantní i recesivní) se stejnou pravděpodobností.

Zákon o nezávislé kombinovatelnosti alel. Při zkoumání 2 alel současně dochází k téže pravidelné segregaci. Máme-li 2 polyhybridy AaBb může každý tvořit 4 různé gamety (AB, Ab, aB, ab).

Page 30: Úvod do obecné genetiky

Rozšíření Mendelových výzkumů

Mendel díky své genialitě (nebo štěstí či spíše dokonalé znalosti hrachu) si vybral 7 znaků, u nichž je kompletní dominance - fialová či bílá, nula nebo jednička

každý z těchto sedmi znaků je kódován jen jedním genem, pro který existují jen dvě alely (s výjimkou postavení květu - tento znak kódují dva geny)

vztah mezi genotypem a fenotypem je v přírodě málokdy tak jednoduchý...

Page 31: Úvod do obecné genetiky

Nekompletní dominance

U tohoto typu dědičnosti vypadá hybrid z F1 jako průměr obou rodičů

zde u hledíku má hybrid méně červeného pigmentu než dominantní rodič

v F2 generaci je genotypový i fenotypový štěpný poměr totožný: 1:2:1

Page 32: Úvod do obecné genetiky

Neúplná dominance

Page 33: Úvod do obecné genetiky

Kodominance

Zde ovlivní dvě alely heterozygota fenotyp nejedná se ale o neúplnou dominanci, heterozygot

má svou zvláštní kombinaci, kde se uplatní vedle sebe obě alely

příkladem je dědičnost krevních skupin M,N a MN.

Jedná se o určité molekuly na povrchu erytrocytů. Jedinci MM budou mít jeden typ molekuly, zatímco lidé NN budou mít druhý. Heterozygoti MN budou mít na povrchu erytrocytů oba typy těchto molekul

MN není průměrem mezi M a N - vyjádří se jen obě alely nezávisle na sobě.

Page 34: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivita Tay-Sachsova nemoc je autozomální dědičná

choroba, postihující recesívní homozygoty. Mozkové buňky takovéhoto dítěte nejsou schopny metabolizovat jeden typ mozkových lipidů, zvaný gangliosidy, protože enzym, který tuto reakci katalyzuje nefunguje správně. Lipidy se tak hromadí v buňkách, znemožňují jim pracovat a výsledkem je smrt dítěte.

Nemoc postihuje pouze děti, které zdědily obě alely pro Tay-Sachsovu nemoc.

Page 35: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivita Na úrovni organismu se tedy alela chová jako

recesívní a je možno hovořit o úplné dominanci na biochemické úrovni se však jedná a neúplnou

dominanci - v buňkách heterozygotů je snížená hladina funkčního enzymu. I tato snížená hladina enzymu však „utáhne“ všechny potřebné reakce, proto jsou heterozygoti zdrávi

na molekulární úrovni se ale jedná o kodominanci - v buňkách je syntetizován jak funkční, tak nefunkční varianta enzymu v poměru 1:1, vyjadřují se tak obě alely.

Page 36: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivita Dominance rovněž neznamená, že by

dominantní alela nějak přímo potlačovala recesívní alelu; rozdíly mezi oběma alelami jsou v nukleotidových sekvencích daného genu

v příkladu semen hrachu kulatá x svraštělá je kulatost dominantní nad svraštělostí

dominantní alela kóduje enzym, který je schopen přeměnit cukr na škrob; recesívní alela kóduje nefunkční formu tohoto enzymu

Page 37: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivita U recesívního homozygota se tedy cukr nemůže

přeměnit na škrob. Jak se semeno vyvíjí, vysoká koncentrace cukru způsobuje, že osmotickými silami do semena vniká voda.

Když je semeno dospělé, vysouší se a svraskává

je-li přítomna dominantní alela, cukr je proměněn na škrob a dospělé semeno zůstává kulaté.

Jedna varianta zdravé alely stačí, aby se cukr přeměnil na škrob, heterozygoti jsou proto rovněž kulatí

Page 38: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivita Vztah dominace - recesivita rovněž

neznamená, že by dominantích alel bylo v populaci nutně více

v USA se rodí jedno dítě z 400, které má navíc prst u nohy či ruky

tato alela pro polydaktylii je dominantní. 399 z 400 dětí jsou proto recesívní

homozygoti

Page 39: Úvod do obecné genetiky

Problémy ve vztahu dominance-recesivitashrnutí

Vztah dominance-recesivita:1. jde od úplné dominance přes různé formy

neúplné dominace až ke kodominanci

2. Vyjadřuje mechanismus, jakým jsou specifické alely vyjádřeny ve fenotypu, nikoli to, že by se alely potlačovaly na úrovni DNA

3. Nemá nic společného s frekvencí výskytu alel v populaci

Page 40: Úvod do obecné genetiky

Možné porušení Mendelových zákonů?Do popředí se dostává mRNA

Gen Kit způsobuje u černých myší skvrnité ocásky a bílé tlapky Dominantní

homozygoti AA jsou celí černí

Recesívní homozygoti aa umírají

Heterozygoti Aa jsou skvrnití

Page 41: Úvod do obecné genetiky

Možné porušení Mendelových zákonů?

Pokud zkřížíme dva heterozygoty Aa a vznikne kombinace AA, mělo by teoreticky jít o zcela černou myš

Myš je ale skvrnitá Jediné možné

vysvětlení je, že by spolu s dominantní alelou šla do gamety i již připravená mRNA získaná přepsáním recesivní alely

Možná jsme na stopě fundamentálnímu pravidlu, které je možná v živé přírodě včetně člověka značně rozšířeno

Page 42: Úvod do obecné genetiky

Vícealelové systémy

Většina genů je v populaci zastoupena ve více než dvou alelách

příkladem jsou alely pro dědičnost krevních skupin IA, IB a i

alely IA a IB odpovídají za přítomnost dvou cukrů - A substance a B substance na povrchu erytrocytů

člověk může mít na erytrocytech přítomnu jednu z nich (A nebo B), obě (AB), nebo žádnou (O)

Page 43: Úvod do obecné genetiky

Dědičnost krevních skupin

Existují tedy 4 typy fenotypů, A,B,AB,O protože každá osoba má dvě alely, je

možných 6 genotypů (IAIA, IB IB,IAIB ,IAi, IB i, ii) recesívní homozygoti mají skupinu 0, protože

žádná substance není na povrchu erytrocytů přítomna

IA a IB jsou k sobě kodominantní IA a IB jsou ve vztahu k alele i dominantní

Page 44: Úvod do obecné genetiky

Dědičnost krevních skupin

Page 45: Úvod do obecné genetiky

Dědičnost krevních skupin

Znalost krevních skupin je kritickým faktorem pro transfúzi krve. Imunitní systém příjemce reaguje na jakoukoli cizorodou látku

pokud má krev donora substanci, která je příjemci cizí, nastane imunitní reakce vedoucí ke krevním sraženinám ústící ve smrt příjemce

Page 46: Úvod do obecné genetiky

Pleiotropie

Doposud jsme se zabývali případy, kdy jeden gen má jeden účinek na fenotyp organismu. Většina genů se ovšem projeví na fenotypu vícero způsoby

jev, kdy jeden gen ovlivní organismus mnoha způsoby se nazývá pleiotropie

typickým případem u člověka je gen způsobující srpkovitou anémii

Page 47: Úvod do obecné genetiky

Srpkovitá anémie – případ pleiotropie

Page 48: Úvod do obecné genetiky

Sickle cell disease

The disease results from an altered hemoglobin, in which the aminoacid valin substitutes for glutamic acid at position 6 in the β-globin chain.

Page 49: Úvod do obecné genetiky
Page 50: Úvod do obecné genetiky
Page 51: Úvod do obecné genetiky

Epistáze = gen na jednom lokusu ovlivní expresi jiného

genu na jiném lokusu (epistáze = řecky „zastavení“)

Příklad: u myší je černá barva srsti dominantní nad hnědou barvou srsti

B … alela pro černou barvu b …. alela pro hnědou barvu jiný gen, zvaný epistatický, rozhoduje o tom, zda barvivo

bude „umístěno“ do srsti. Nazvěme tento gen písmenem C. bude-li přítomna alela C, pak bude srst podle situace

hnědá či černá bude-li mít myš genotyp cc, pak se neuloží do srsti

žádné barvivo a myš bude bílá

Page 52: Úvod do obecné genetiky

Epistáze

Fenotypový štěpný poměr je9:3:4

Page 53: Úvod do obecné genetiky

KomplementaceFenotypový štěpný poměr je

9:7Hrachor (Lathyrus odoratus).Křížením dvou bělokvětých rostlin vznikají červenokvěté i bělokvěté rostliny.Pro tvorbu červeného anthokyanu je nutná přítomnost jak alely C, tak alely R.Alela C řídí tvorbu enzymu, kterým vzniká bezbarvý prekurzor anthokyanu, alela R řídí tvorbu enzymu, který mění tento prekurzor na anthokyan.

Page 54: Úvod do obecné genetiky

Polygenní dědičnost

mnoho znaků, jako je např. tělesná výška člověka, odstín barvy kůže, inteligence apod. není v populaci diskrétních (fialové květy x bílé), ale plynule se mění

hovoříme o dědičnosti kvantitativních znaků polygenní dědičnost je jev, kdy mnoho genů

ovlivňuje jeden znak (jedná se o opak pleiotropie, kdy jeden gen ovlivňuje mnoho znaků)

Page 55: Úvod do obecné genetiky

Polygenní dědičnostodstín barvy kůže u člověka

řekněme, že u člověka je odstín barvy kůže kódován minimálně třemi geny (ve skutečnosti více)

nazvěme tyto geny A,B,C každé velké písmeno tak přidává

výslednému znaku jednu „jednotku“ osoba AABBCC bude mít velmi tmavou kůži,

zatímco osoba aabbcc bude mít velmi světlou kůži

protože se jedná o kumulativní efekt, osoby AaBbCc a AABbcc budou mít tutéž barvu kůže

Page 56: Úvod do obecné genetiky

Polygenní dědičnostodstín barvy kůže u člověka

Výsledná křivka je typická tzv. Gaussova křivka.Její konečný spojitý tvar je ovlivněn environmentálními faktory, jako je slunění apod.

Page 57: Úvod do obecné genetiky

Gaussova křivka

Page 58: Úvod do obecné genetiky

Gaussova křivka

Page 59: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp u člověka ovlivňuje výživa tělesnou výšku,

opalování barvu kůže, posilování svalovou hmotu atd.

i u jednovaječných dvojčat existují rozdíly díky odlišnému vlivu prostředí

bonsaje, větší výnosy na pohnojených polích genotyp tedy není něco pevně daného, spíše

se jedná o mantinely.

Page 60: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp

inteligence = geny + trénink, studium barva kůže = geny + opalování tělesná výška = geny + výživa alkoholismus = geny + prostředí filosofie – u člověka je třeba ještě

započítat vliv svobody

Page 61: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp norma reakce = mnoho různých fenotypů,

které mohou vzniknout z jediného genotypu

genotyp je klaviatura, na kterou může prostředí zahrát mnoho různých skladeb

schizofrenie = geneticky podmíněná, ale zpravidla je pro vypuknutí zapotřebí environmentální stimul, stres (příprava na maturitu apod.)

Page 62: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp

v některých případech prostředí nehraje žádnou roli a norma reakce je nulová: dědičnost krevních skupin, fialová/bílá barva květu hrachu, srpkovitá anémie atd.

norma reakce bývá nejširší pro polygenní znaky, jak jsme viděli u barvy kůže.

tyto znaky nazýváme multifaktoriální, neboť za ně odpovídá mnoho faktorů, a to genetických i faktory prostředí

Page 63: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp

Norma reakce. Barva květu záleží u této rostliny na kyselosti půdy

Page 64: Úvod do obecné genetiky

Nature versus Nurtureenvironmentální dopad na fenotyp

Plicník lékařský (Pulmonaria officinalis) má květy nejprve červené, později modré, při odkvétání až do fialova

Page 65: Úvod do obecné genetiky

Mendelovská dědičnost u lidí

Nevýhoda člověka příliš dlouhá generační doba (stejná jako u

výzkumníka) málo dětí bylo by neetické jej křížit

provádí se analýza rodokmenů Příklad: alela W způsobuje „widow´s

peak“, alela F volný ušní lalůček

Page 66: Úvod do obecné genetiky

Analýza rodokmenů

Page 67: Úvod do obecné genetiky

Recesívně děděné choroby

mnohem častější než dominantně děděné choroby

heterozygoti jsou zdrávi, jsou zváni přenašeči postižený člověk se většinou narodí zdravým

rodičům (Aa x Aa) u člověka od velmi lehkých (albinismus) po

závažné (cystická fibrosa, fenylketonurie, Tay-Sachsova nemoc, srpkovitá anémie, různé thalassemie atd.)

jsou v lidstvu nerovnoměrně rozloženy (Tay-Sachsova nemoc – aškenázští židé v USA, srpkovitá anémie – Afroameričané)

Page 68: Úvod do obecné genetiky

Recesívně děděné choroby

každý z nás jsme heterozygotní pro asi 30 genetických chorob

odtud zřejmě ve všech známých kulturách zákaz incestu a sňatků uvnitř rodiny

tyto tabu se možná zrodily z empirických pozorování

dnes známo asi 4 000 genetických chorob

Page 69: Úvod do obecné genetiky

Cystická fibrosa

nejčastější dědičná choroba v USA 1: 2500 bílých obyvatel každý 25 člověk je přenašeč (4%) zdravá alela kóduje membránový přenašeč

pro chloridové ionty recesívní homozygoti mají tyto kanály

nefunkční, výsledkem je mimořádně vysoká koncentrace extracelulárního Cl-

výsledkem je hlen přítomen v pankreatu, plicích, trávicí soustavě a dalších orgánech.

Page 70: Úvod do obecné genetiky

Cystická fibrosa

baktérie i buňky imunitního systému jsou v tomto hlenu zachyceny, což dále zhoršuje stav pacienta

neléčena způsobuje smrt před dosažením pátého roku věku

při léčbě a denních dávkách antibiotik přežívá polovina pacientů 20 let.

Page 71: Úvod do obecné genetiky

Tay-Sachsova nemoc

je způsobena nefunkčním enzymem, který není schopen rozložit jisté lipidy v mozku

symptomy obvykle několik měsíců po narození; dítě má bolestivé křeče, slepne, nastává degenerace motorických i mentálních schopností

smrt nastává do několika let po narození u aškenázů – židů – (cca Německo) je poměr

1:3600, což je 100x víc než u sefardských židů (cca Španělsko)

Page 72: Úvod do obecné genetiky

Srpkovitá anémie

1:400 u Afroameričanů každý desátý Afroameričan je přenašeč u nemocných jsou třeba pravidelné

transfúze, léčba zatím neexistuje heterozygoti jsou zdrávi, ale pokud se

vyskytují delší dobu v místech s menším parciálním tlakem kyslíku, mohou mít problémy

balancovaný polymorfismus: dominantní homozygot zemře na malárii recesívní homozygot zemře na anémii heterozygot přežije

Page 73: Úvod do obecné genetiky

Fenylketonurie (PKU)

1:10 000 až 1:15 000 neschopnost odbourat fenylalanin neléčena způsobuje u dětí mentální

retardace (někdy je IQ kolem 50, jindy téměř 100)

léčba neexistuje, jen dieta bez fenylalaninu

Page 74: Úvod do obecné genetiky

Dominantně děděné choroby

mnohem vzácnější – neexistují přenašeči, kdo škodlivou alelu má, je nemocný

achondroplasie, familiální hypercholesterolemie, Huntingtonova nemoc

Page 75: Úvod do obecné genetiky

Achondroplasie

= trpasličí vzrůst výskyt

1:10000… … z čehož

vyplývá že 99,9% populace jsou recesívní homozygoti

Page 76: Úvod do obecné genetiky

Achondroplasie

Page 77: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s disease

auosomálně dominantní dědičnost

Page 78: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova choroba

= degenerativní neuropsychiatrická nemoc, zasahující basální ganglia, ovšem postihující rovněž široké oblasti celého nervového systému

dědičnost je autosomálně dominantní: P: Aa x aa F1: Aa Aa aa aa

1 : 1 = každé dítě, které má jednoho postiženého

rodiče má 50% risk, že je nositelem HD alely

Page 79: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova choroba

Symptomy se objevují obvykle mezi 35 a 50 rokem života...

...ačkoli nemoc může propuknout kdykoli mezi dětstvím a pokročilým věkem

smrt nastává v průměru 15 let po objevení se prvních příznaků

jedná se o tzv. late-onset disease, symptomy se objevují obvykle ve věku, kdy již postižená osoba má vlastní děti

Page 80: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova choroba

1983 - byl objeven gen způsobující Huntingtonovu chorobu. Nachází se na p raménku chromozómu 4.

1993 - gen byl isolován gen je defektní kvůli abnormálně velkému

počtu repeticí CAG jakou funkci v organismu má zdravý gen,

není známo

Page 81: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Disease

Objev HD genu v roce 1993 vyústil v dostupnost přímého genetického testování pro osoby v riziku choroby nebo pro osoby již nemocné pro potvrzení diagnózy. Z krevního vzorku se analyzuje DNA a zjistí se počet repetic CAG v HD lokusu

terapie v současnosti neexistuje žádost o provedení testu je většinou založena

na úmyslu založit rodinu a plánování rodičovství či na plánu pro další vlastní život.

Page 82: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Disease

Zdraví jedinci mají obvykle 28 nebo méně repeticí CAG

jedinci postižení Huntingtovou chorobou mají obvykle 40 nebo víc repeticí CAG

malé procento osob má však počet repeticí mezi 30 až 40, tedy v zóně, kdy nelze přesně určit, zda nemoc propukne či ne.

Nestabilní trinukleotidová repetice se může prodloužit při přenosu z rodiče na dítě

Page 83: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova choroba

Note: Dr. Michael McCormack cituje případ, kdy měla pacientka o jednu repetici více než její matka. Pacientka byla symptomatická již ve 40 letech, zatímco její matka byla v 70 roce věku ještě bez symptomů. Po nástupu nemoci se u někoho stav rapidně zhoršuje, zatímco jindy nemoc progreduje pomaleji.

Page 84: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova chorobaklinické rysy Emoční, kognitivní a motorické poruchy nejčastější emoční poruchy: deprese,

iritabilita, apatie, výbuchy agrese, impulzivnost, sociální odtažitost

kognitivní poruchy: ztráta rychlosti a pružnosti uvažování. Na pracovišti pacient není schopen udržet tempo práce.

Page 85: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Diseaseclinical features Motorické poruchy: vědomé a nevědomé,

involuntární pohyby, zejména chorea. Pacienti mají zprvu zhoršenou manuální zručnost, špatně artikulovanou řeč, potíže s polykáním, později se stávají rigidní a neschopní vykonat jakýkoli voluntární pohyb. Pacienti, kteří se dožijí tohoto stadia jsou upoutáni na lůžko a nejsou schopni se podílet na péči o sebe

Page 86: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Disease

Genetický test odhalí přítomnost HD alely, ale nikoli nástup nemoci

USA: v současnosti asi 30 000 nemocných; dalších

150 000 jsou v riziku onemocnění 1:10 000 je nemocných

Page 87: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Disease

Varlam Shalamov(1907 - 1982)

Page 88: Úvod do obecné genetiky

Huntingtonova chorobaetické problémy

Nancy Wexler

Page 89: Úvod do obecné genetiky

Huntington´s Diseaseethical issues

Informational self – determination•právo vědět•právo nevědět

• v případě HD jen asi 10% osob chce vědět...

Page 90: Úvod do obecné genetiky

Testování heterozygotů

dnes možno u stále většího počtu chorob cystický fibrosa srpkovitá anémie Tay – Sachsova nemoc

etické a sociální dopady: pojišťovny a zaměstnavatelé (přenašeči jsou naprosto zdrávi)

Page 91: Úvod do obecné genetiky

Fetální testování

amniocentéza 14 – 16 týden těhotenství pro karyotyp ale buňky musíme nechat několik týdnů růst cca 1% riziko krvácení či potratu

chorionické klky 8 – 10 týden těhotenství buňky rostou rychle cca 1% riziko krvácení či potratu

dnes buňky plodu z krve matky - neinvazívní ultrazvuk – neinvazívní fetoskopie - neinvazívní

Page 92: Úvod do obecné genetiky

Amniocentéza a testování chorionických klků

Page 93: Úvod do obecné genetiky

Testování novorozenců

běžně na fenylketonurii (PKU)

Page 94: Úvod do obecné genetiky

Spojení mendelismu a chování chromosomů se zlepšováním parametrů mikroskopů byla

objevena mitóza 1875 meióza 1890

v roce 1900 v souvislosti se znovuobjevením Mendelových zákonů se začaly tyto zákony dávat do souvislosti s mitózou a meiózou

kolem roku 1902 vzniká chromosomální teorie dědičnosti (Walter Sutton a Theodor Boveri)

Page 95: Úvod do obecné genetiky

Chromozomáln

í teorie dědičnosti

= snaha spojit cytologii s Mendelovou dědičností

Page 96: Úvod do obecné genetiky

Thomas Hunt Morgan

užívá Drosophila melanogaster mnoho potomků (cca stovky) laciný chov krátká generační doba (14 dní) relativně snadné pozorování (lupa) jen 4 páry chromozómů (2n = 8)

Morgan po roce experimentování získal drosophilu s bílýma očima

Page 97: Úvod do obecné genetiky

Drosophila melanogaster

Sameček Samička

Page 98: Úvod do obecné genetiky

Drosophila melanogaster

Page 99: Úvod do obecné genetiky

Drosophila melanogaster

3 páry autozomů a jeden pár gonozomů chromosomové určení pohlaví stejné jako

člověk: sameček XY samička XX

Page 100: Úvod do obecné genetiky

Thomas Hunt Morgan(1866 – 1945)

„To breed or not to breed. That´s the question.“

Page 101: Úvod do obecné genetiky

Dědičnost vázaná na pohlavíklasický Morganův pokusDrosophila má totéž chromosomální určení pohlaví jako člověk:XY … samečekXX … samička

Na první pohled probíhá pokus přesně podle Mendela – v F2 máme poměr 3:1Překvapivé ovšem je, že bílé oči mají vždy pouze samečci!

Page 102: Úvod do obecné genetiky

Morganovy závěry

gen způsobující bílou barvu očí musí mít lokus na X chromosomu

protože alela pro bílou barvu očí je recesívní, budou mít samičky bílé oči pouze v recesívně homozygotní konstelaci

sameček má pouze jeden chromosom X, tedy stačí, aby právě tato jedna (a jediná) alela kódovala bílou barvu

Page 103: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

genů je v organismu mnohem víc než chromosomů – na jednom chromosomu je tedy velké množství genů

jsou-li lokusy dvou genů těsně vedle sebe na jednom chromosomu, je malá pravděpodobnost, že se crossing-over „trefí“ právě mezi ně

výsledkem je fakt, že se tyto geny dostanou do gamety zpravidla spolu

Page 104: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

v jedné variantě pokusu křížil Morgan mezi sebou drosophily s černým/normálním tělem a se zakrnělými/normálními křídly b+ šedé, normální tělo b černé tělo (b = black) vg+ normální křídla vg zakrnělá křídla (vg = vestigial)

Page 105: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

Morgan křížil divoké, normální drosophily b+

b+ vg+ vg+ s černými drosophilami se zakrnělýmí křídly bbvgvg b+ b+ vg+ vg+ x bbvgvg F1: b+ b vg+ vg - vzhledově normální, divoká

drosophila (šedé tělo, normální křídla)

nyní provedl Morgan klasické zpětné křížení: samičky z F1 zkřížil se samečky z P generace bbvgvg

Page 106: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

z tohoto křížení (b+ b vg+ vg x bbvgvg) by mělo podle Mendelových zákonů vzniknout potomstvo v poměru 1:1:1:1 tedy: ¼ šedých s normálními křídly ¼ černých se zakrnělými křídly ¼ šedých se zakrnělými křídly ¼ černých s normálními křídly

avšak…

Page 107: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

Page 108: Úvod do obecné genetiky

Vazba genůkřížení b+ b vg+ vg x bbvgvg

skutečné výsledky byly zřetelně odlišné: bylo velké množství divokých typů

(šedé/normální křídla) a dvojitých mutantů (černí/zakrnělá křídla)

Page 109: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

Morgan uzavřel, že gen pro barvu těla a gen pro zakrnělost křídel musí ležet na stejném chromosomu a při crossing-overu jdou většinou společně…

…ovšem jen většinou - rekombinantní fenotypy přece jenom vznikly

Page 110: Úvod do obecné genetiky

Nezávislá segregace chromosomů a crossing-over produkují genetické rekombinanty kdybychom křížili v podobném pokusu, jaký

učinil Morgan žlutý a kulatý hrášek s genotypem YyRr se zeleným a svraštělým yyrr YyRr x yyrr

vyšel by nám skutečný poměr ve shodě s předpovězeným 1:1:1:1

hrášky žluté a kulaté spolu se zelenými svraštělými bychom označili jako parentální typ

a hrášky žluté a svraštělé spolu se zelenými kulatými bychom označili jako rekombinanty

Page 111: Úvod do obecné genetiky

Nezávislá segregace chromosomů a crossing-over produkují genetické rekombinanty protože by v našem pokusu byla polovina (50%)

parentálních typů a polovina (50%) rekombinantů, hovořili bychom o 50% frekvenci rekombinace

celá situace je způsobena tím, že gen pro žlutá/zelená semena a gen pro kulatá/svraštělá semena leží na odlišných chromosomech

což má za následek fakt, že při metafázi meiosy I se chromosomy s těmito geny dostávají zcela náhodně do dceřinných buněk

Page 112: Úvod do obecné genetiky
Page 113: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

geny na jednom chromosomu ovšem nesegregují zcela náhodně – čím jsou blíže u sebe, tím je menší pravděpodobnost, že se mezi ně „trefí“ crossing-over

Page 114: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

kdyby ležely geny v Morganově pokusu opravdu těsně vedle sebe, vznikla by kombinace 1:1:0:0

v Morganově pokusu bylo přibližně 17% rekombinantů – ačkoli zde vazba je, není zcela kompletní

frekvence rekombinace = Rekombinanti/všichni x 100

Page 115: Úvod do obecné genetiky
Page 116: Úvod do obecné genetiky

Vazba genů

Page 117: Úvod do obecné genetiky

Z rekombinačních frekvencí lze zhotovit genetickou mapu genetická mapa = lineární sekvence genů na

chromosomu (Alfred Sturtevant) Sturtevant si uvědomil, že frekvence

rekombinace – v našem případě 17% - vypovídá cosi o vzdálenosti mezi dvěma geny na chromosomu

předpokládal, že crossing-overy se trefují se stejnou pravděpodobností do všech míst chromosomu…

… čím jsou gny na chromosomu od sebe dál, tím je crossing-over mezi nimi pravděpodobnější

Page 118: Úvod do obecné genetiky

Z rekombinačních frekvencí lze zhotovit genetickou mapu A.Sturtevant zkoumal tři geny: nám známý b,

rovněž známý vg a gen cn (cinnabar = rumělka) drosophila s genem cn má světlejší oči než divoký

typ

Výsledky: cn a b = 9% cn a vg = 9,5% b a vg = 17%

Page 119: Úvod do obecné genetiky

Z rekombinačních frekvencí lze zhotovit genetickou mapu

jediná možnost je umístit gen cn mezi geny b a vg 1% = 1 centimorgan

Page 120: Úvod do obecné genetiky

Genetická mapa

některé geny jsou na jednom chromosomu od sebe natolik vzdáleny, že efekt vazby mezi nimi není pozorovatelný

takové geny mají maximální hodnotu – 50% - frekvence rekombinace (=volná vazba)

např. v Mendlových pokusech je barva semene a barva květu na stejném chromosomu 1, ale tak daleko od sebe, že se jedná o volnou vazbu

pouze pro jednu dvojici ze sedmi Mendelových znaků objevili genetici vazbu: výška rostliny a tvar lusku: pro tuto dvojici Mendel dihybridní F2 nedělal (F1 ano)

Page 121: Úvod do obecné genetiky

Genetická mapa

u Drosophily byly zjištěny celkem 4 skupiny genů tvořících vazbu, což odpovídá čtyřem chromosomům drosophily

crossing overy se ale „netrefují“ do všech míst na chromosomu se stejnou frekvencí…

…genetická mapa tak sice ukazuje seřazení chromosomů, ale není schopna stanovit abslotní vzdálenost mezi chromosomy

Page 122: Úvod do obecné genetiky

Genetická mapa

i když vzdálenost mezi dvěma geny není natolik velká, aby je „rozpojila“ a vznikla volná vazba, přece může být natolik značná, že vznikne pravděpodobnost nikoli jen jednoho, ale dvou crossing-overů mezi oběma lokusy

druhý crossing-over (d.c.o.) tak zruší účinek prvního

mnohonásobný crossing-over odpovídá za matematické nepřesnosti na obrázku:

Page 123: Úvod do obecné genetiky

Genetická mapa

A. Sturtevant objevil celkem čtyři vazbové skupiny genů u drosophily, což odpovídá počtu 4 chromosomů (2n=8)

každý chromosom má lineární sekvenci lokusů pro konkrétní geny

genetická mapa ovšem nedává absolutní velikost chromosomu: crossing-overy se netrefují ze stejnou pravděpodobností do všech míst chromosomu

Page 124: Úvod do obecné genetiky

Genetická mapa

Zjednodušená genetuická mapa chromosomu II.Barvu očí ovlivňuje mnoho genů

Page 125: Úvod do obecné genetiky

Cytogenetická mapa

cytogenetická mapa se snaží najít geny v souvislosti s různě obarvenými místy na chromosomech

cílem je určit přesnou sekvenci všech nukleotidů na chromosomu, délku genů jakož i vzdálenost mezi jednotlivými geny v párech bazí

Page 126: Úvod do obecné genetiky

Pohlavní chromosomy

člověk: polovina spermií je 22X a polovina spermií 22Y; všechny oocyty jsou 22X

anatomicky je pohlaví embrya odlišitelné ve stáří cca dvou měsíců – před tím jsou pohlavní orgány rudimentární – záleží na hormonech, zda vznikne chlapec nebo dívka

lidské embryo se vyvíjí původně ženským směrem (VIZ syndrom testikulární feminizace – bude probráíno později)

Page 127: Úvod do obecné genetiky

Pohlavní chromosomy člověka

Page 128: Úvod do obecné genetiky

Pohlavní chromosomy

zda se embryo bude vyvíjet mužským nebo ženským směrem záleží na přítomnosti či nepřítomnosti chromosomu Y

v roce 1990 byl identifikován gen určující vývoj varlat – byl pojmenován SRY

SRY = Sex determining Region of Y pokud gen SRY chybí, gonády se vyvíjejí

ženským směrem gen SRY působí pouze jako spouštěč mnoha

dalších procesů – SRY kóduje protein, který kóduje mnoho dalších genů

Page 129: Úvod do obecné genetiky

Pohlavní chromosomy

v současnosti byly identifikovány další geny na chromosomu Y, nutné pro normální vývoj muže

pokud jsou tyto geny poškozeny, narodí se chlapec XY, ale nebude schopen tvořit životaschopné spermie

Page 130: Úvod do obecné genetiky

Chromozomální určení pohlaví

alozom = nepárový pohlavní chromosomheterogametické pohlaví = to, které má alozom (např. muž)homogametické pohlaví = to, které má pár totožných pohlavních chromosomů

Page 131: Úvod do obecné genetiky

Geny vázané na pohlaví

geny na pohlavních chromosomech budou vykazovat tentýž vzorec dědičnosti jako běloocí samečkové Morganových drosophil

muži budou předávat tyto geny (=na chromosomu X) na všechny své dcery avšak na žádného syna

matky budou tyto geny předávat svým synům i dcerám

Page 132: Úvod do obecné genetiky

Geny vázané na pohlaví

Page 133: Úvod do obecné genetiky

Geny vázané na pohlaví

na chromosomu Y je obecně málo genů – a to jen ty, které určují pohlaví – většina genů vázaných na pohlaví bude na chromosomu X

u žen budou recesívně děděné choroby velmi vzácné, protože by musely být recesívně homozygotní

muži XY mají naopak jen jeden lokus na chromosomu X – termíny homozygotní či heterozygotní pro ně postrádají smyslu: někdy se říká že jsou hemizygotní

Page 134: Úvod do obecné genetiky

Genetické nemoci vázané na pohlaví Duchenne muscular dystrofy: každý 3 500

muž v USA; málokdy přežívají 20 rok věku; progresívní oslabení svalů a ztráta koordinace; nemoc je způsobena špatným proteinem zvaným dystrofin, který je klíčový pro správnou práci svalů; gen pro dystrofin leží na chromosomu X

hemofilie – absence jednoho nebo více proteinů nutných pro srážlivost krve

Page 135: Úvod do obecné genetiky

Královna Viktorie(1819-1901)

spontánní mutace buď u otce či u matky královny Viktorie způsobila, že královna se stala přenašečkou

prvním hemofilikem byl Leopold, syn královny Viktorie

Leopold přežil a stal se otcem dcery-přenašečky, která alelu předala jednomu ze svých synů.

Viktorie měla ovšem rovněž i dcery-přenašečky a skrze ně se alela dostala na královské dvory v Prusku, Rusku a Španělsku

Page 136: Úvod do obecné genetiky

Královna Viktorie

Page 137: Úvod do obecné genetiky

X inaktivace u savčích samiček

ačkoli mají všechny samičky savců dva X chromosomy, jeden z nich bývá inaktivován během embryonálního vývoje

výsledkem je, že dospělé buňky muže i ženy mají pouze jeden aktivní X chromosom

inaktivní X chromosom u žen kondensuje v kompaktní objekt v jádře, zvaný Barrovo tělísko (Barr body)

většina genů na Barrově tělísku nejsou exprimovány (=nepřepisují se do mRNA a netvoří se z nich bílkoviny), ačkoli nějaké zůstávají aktivní (a jsou aktivní v buňkách, ze kterých vzniknou gamety)

Page 138: Úvod do obecné genetiky

Barrovo tělísko

který z obou X chromosomů se v raném embryu stane Barrovým tělískem, je věcí náhody

výsledkem je, že ženy se stávají mozaikou dvou typů somatických buněk: těch s aktivním X chromosomem od matky a s aktivním X chromosomem od otce

ve chvíli, kdy je jeden z X chromosomů inaktivován, všechny buňky, které z této buňky vzniknou mitózou, budou mít inaktivován stejný X chromosom

Page 139: Úvod do obecné genetiky

Barrovo tělísko

je-li tedy žena heterozygot pro gen ležící na X chromosomu, zhruba polovina jejích buněk bude exprimovat jednu alelu, zatímco druhá polovina jejích buněk bude exprimovat druhou alelu

jev je krásně pozorovatelný na tříbarevných kočkách

u žen je známa mutace, díky které nevznikají potní žlázy – žena pak má potní žlázy mozaikovitě jen na přibližně polovině těla

Page 140: Úvod do obecné genetiky

Barrovo tělísko

Page 141: Úvod do obecné genetiky

Barrovo tělísko

Tři generace žen vykazující nemoc zvanou anhidrotická ektodermální dysplasie (absence potních žláz); všechny ženy jsou pro daný gen umístěný na X chromosomu heterozygotní. Oblasti bez potních žláz jsou vyznačeny zeleně. Rozsah a umístění oblastí bez potních žláz u jednotlivých žen je věcí náhody.

Page 142: Úvod do obecné genetiky

Barrovo tělísko

inaktivace chromosomu X spočívá v metylaci (=přidání –CH3 skupiny) cytosinů na jeho DNA

ale co rozhoduje o tom, který z z obou X chromosomů se stane Barrovým tělískem?

byl objeven gen, aktivní pouze na Barrově tělísku, který se nazývá XIST (X-inactive specific transcript). Jeho produktem je RNA, jejíž mnohé kopie pokrývají celý chromosom

jaký je ale vztah mezi metylací a XIST genem? - a co rozhoduje o tom, který z obou X chromosomů bude mít aktivní XIST a stane se tak Barrovým tělískem?

odpověď není známa

Page 143: Úvod do obecné genetiky

Změny v počtu chromosomů ústí v genetické choroby nondisjunkce = jev, kdy se při meiose I.

homologické chromosomy nerozdělí správně; nebo se nerozdělí správně sesterské chromatidy při meiose II.

v těchto případech získá jedna gameta jednu kopii chromosomu navíc, zatímco druhá nemá žádnou kopii daného chromosomu

Page 144: Úvod do obecné genetiky

Změny v počtu chromosomů ústí v genetické choroby

Page 145: Úvod do obecné genetiky

Změny v počtu chromosomů ústí v genetické choroby

aneuploidie = stav, kdy se gameta s abnormálním počtem chromosomů spojí s normální gametou. Výsledkem je abnosrmální počet chromosomů v organismu

trisomický organismus = buňky mají jeden chromosom navíc (2n+1)

monosomický organismus = buňkám jeden chromosom chybí (2n-1)

pokud organismus vývoj přežije, ve všech svých buňkách bude mít abnormální počet chromosomů

Page 146: Úvod do obecné genetiky

Aneuploidie a polyploidie

někdy může nastat podobná chyba i při mitóze. Pokud k nondisjunkci došlo v rané embryonální fázi, řada buněk organismu bude zasažena, což může vést k závažným poruchám

některé organismy mají více než dvě sady chromosomů. tento stav je zván polyploidie

triploidní (3n) zygota může vzniknout např. tak, že v oocytu je abnormální diploidní stav chromosomů

tetraploidie (4n) může vzniknout např. tak, že po první mitóze zygoty nenásleduje cytokineze.

Page 147: Úvod do obecné genetiky

Polyploidie

polyploidie je relativně častá u rostlin; spontánní polyploidie je u rostlin zřejmě důležitou chvílí pro náhlý vznik nového druhu

řada hospodářských druhů rostlin (pšenice, kukuřice) jsou polyploidní rostliny

u živočichů je polyploidie velmi vzácná, i když je známa u některých ryb a obojživelníků

Page 148: Úvod do obecné genetiky

Polyploidie u savců

v Chile byl identifikován zatím první savčí kandidát na polyploidii, hlodavec viskača Tympanoctomys barrerae, který je zřejmě tetraploidní

Page 149: Úvod do obecné genetiky

Změny ve struktuře chromosomůdelece, duplikace, inverze, translokace

delece – z chromosomu je ztracena část neobsahující centromeru. Takovýto chromosom postrádá pochopitelně mnohé geny. Tento fragment ale nemusí být zcela ztracen, pokud se mu zdaří se připojit k sesterské chromatidě při meiose, vzniká

duplikace inverze – stav, kdy se fragment sice připojí k

sesterské chromatidě, ale v opačné orientaci

Page 150: Úvod do obecné genetiky

Změny ve struktuře chromosomůdelece, duplikace, inverze, translokace

translokace – fragment je připojen k nehomologickému chromosomu

delece a duplikace se objevují zejména během meiosy při crossing-overu, kdy se části nesesterských chromatid nesprávě připojují

pokud má diploidní embryo značné delece či duplikace, zpravidla nepřežije. Rovněž při reciproční translokaci, kdy jsou segmenty nehomologických chromosomů vyměněné navzájem, je sice zachován stav 2n, ale rovněž zpravidla nepřežije. K tomu, aby geny se mohly řádně přepisovat, je totiž nutné, aby byly geny zařazeny ve správné konstelaci u správných promotorů

Page 151: Úvod do obecné genetiky

Změny ve struktuře chromosomůdelece, duplikace, inverze, translokace

Page 152: Úvod do obecné genetiky

Chroroby u lidí způsobené chromosomálními alteracemi většina aneuploidií je neslučitelná se

životem, že buď se embryo ani neimplantuje do endometria dělohy, nebo je spontánně potraceno později

některé aneuploidie ale jsou slučitelné se životem. Takoví jedinci mají sadu symptomů (sada symptomů = syndrom), který charakterizuje daný typ aneuploidie

Page 153: Úvod do obecné genetiky

Downův syndromtrisomie 21. chromosomu

v USA 1:700 narozených dětí typické rysy tváře („mongolismus“) malá postava srdeční defekty poruchy sluchu náchylnost k respiračním

onemocněním mentální retardace náchylní k leukémii a

Alzheimerově nemoci smrt ve středním věku, i dříve většina sexuálně podvyvinutá či

sterilní

Page 154: Úvod do obecné genetiky

Downův syndromtrisomie 21. chromosomu

V některých případech mají lidé s Downovým syndromem obvyklých 46 chromosomů. Výzkum karyotypu však prozradí, že část nebo i celý třetí 21 chromosom je navíc translokován na jiném chromosomu

Page 155: Úvod do obecné genetiky

Downův syndromtrisomie 21. chromosomu Downův syndrom je závislý na věku matky

Page 156: Úvod do obecné genetiky

Downův syndromtrisomie 21. chromosomu

těhotenství žen nad 35 let je považováno vůči Downovu syndromu za rizikové

závislost věku matky na Downovu syndromu dítěte doposud nebyla vysvětlena

většina případů je způsobená nondisjunkcí při meiose I. – monosomie je zřejmě letální.

současné výzkumy předpokládají abnormality závislé na věku při napojování mikrotubulů na kinetochory při meiose I.

trisomie ostatních chromosomů rovněž závisí na věku matky, i když plody s jinými trisomiemi nepřežívají dlouho

Page 157: Úvod do obecné genetiky

Nondisjunkce chromosomu X

nondisjunkce pohlavních chromosomů bývá slučitelná se životem, protože Y chromosom nese jen málo genů a protože všechny nadbytečné kopie X chromosomů jsou uloženy jako Barrova tělíska

Page 158: Úvod do obecné genetiky

Klinefelterův syndrom XXYmuži

1:2 000 testes jsou malé a

muž je sterilní často zvětšená prsa a

další ženské znaky inteligence je o něco

nižší než průměrná

Page 159: Úvod do obecné genetiky

Nondisjunkce pohlavních chromosomů

muži XYY mají tendenci mít vyšší postavu – náchylnost ke zločinům nebyla potvrzena

ženy XXX se vyskytují v poměru 1:1000, jsou zdravé a nelze je rozlišit od normálních s výjimkou karyotypu, jejich IQ je však v průměru nižší než u XX žen a je kolem 85.

Dva bratři. Vpravo XYY

Page 160: Úvod do obecné genetiky

Turnerův syndrom X0ženy 1:5 000 – jediná známá monosomie u člověka

slučitelná se životem sterilní, pohlavní orgány nevyvinuté; pokud je jim

podáván estrogen, vyvinou normální sekundární pohlavní znaky

většina má normální inteligenci

Page 161: Úvod do obecné genetiky

„Cri du chat“ syndrom

delece v chromosomu 5 mentální retardace malá hlava s neobvyklými rysy zvláštní typ pláče (cri du chat) zpravidla umírají v dětském věku

Page 162: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

doposud jsme předpokládali, že každá alela bude mít na organismus stejný efekt, ať již původně pochází z otce nebo z matky…

…což většinou můžeme předpokládat bezpečně

když jsme například křížili hrášek s fialovými květy s hráškem s bílými květy, bylo jedno, zda fialová alela je ve vajíčku nebo v pylové buňce

v současnosti však genetici objevili několik znaků u člověka, včetně některých chorob, u kterých překvapivě záleží na tom, zda je alela zděděna od otce či od matky

Page 163: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

Page 164: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

Prader-Wiliho syndrom – mentální retardace, obezita, krátká postava, neobvykle malé ruce a nohy

Angelmanův syndrom – spontánní, nekontrolovatelný smích, prudké pohyby, a další motorické a mentální symptomy

obě choroby mají zřejmě tutéž příčinu: deleci části chromosomu 15

Page 165: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

pokud zdědí dítě abnormální chromosom 15 od tatínka, výsledkem bude Prader-Wiliho syndrom

pokud dítě zdědí abnormální chromosom 15 od maminky, výsledkem bude Angelmanův syndrom

zdá se, že geny oblasti s delecí by se v normální situaci chovaly jinak pokud by byly zděděné od matky a jinak od otce

Page 166: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

Page 167: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

Prader-Wiliho/Angelmanova hádanka může být vysvětlena jevem popsaným jako genomický imprinting

zdá se, že alela na jednom chromosomu je nějak umlčena, zatímco druhá na homologickém chromosomu se může přepisovat

alely stejného genu mají tedy na potomka různý vliv, podle toho, zda se do zygoty dostaly z vajíčka nebo ze spermie

Page 168: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

v potomkovi se v buňkách, které tvoří gamety genomický imprint „vymaže“

a utvoří se znovu podle toho, zda se jedná o muže nebo o ženu

imprinting zřejmě spočívá v metylaci (přidání skupiny –CH3) cytosinů na imprintované alele, která se nepřepisuje a je inaktivní

někdy ale metylace naopak aktivuje gen! dnes známo asi 20 imprintovaných genů,

odhaduje se, že jich budou stovky

Page 169: Úvod do obecné genetiky

Genomický imprinting

většina imprintovaných genů jsou mimořádně důležité při embryonálním vývoji

experimentálně vytvořené myši, které měly dva homologické chromosomy od otce či dva homologické chromosomy od matky vždy umíraly před narozením

androgenot = embryo s 2n, obě sady jsou od otce gynogenot = embryo s 2n, obě sady jsou od matky normální vývoj tedy zřejmě předpokládá, aby

byla v buňce přítomna přesně jedna kopie aktivního genu: ne dvě a ne žádná

Page 170: Úvod do obecné genetiky

Syndrom fragilního X chromosomu konec X chromosomu visí na tenkém vláknu

DNA chlapci 1:500 dívky 1:2 500 mentální retardace

velký počet repetic CGG (normální 6 – 54, nemocní nad 200) syndrom je častější, pokud je abnormální

chromosom zděděný od matky… …to by odpovídalo pozorování, že syndrom je

častější u chlapců: pokud muž zdědí X chromosom, musí to být od matky

Page 171: Úvod do obecné genetiky

Geny mimo jádro

malé kruhové DNA se nacházejí v mitochondriích a plastidech

tyto cytoplasmatické geny nevykazují mendelovskou dědičnost

u rostlin přijímá zygota téměř vždy všechny plastidy z vajíčka a žádný z pylové buňky

savci dědí mitochondrie po mateřské linii – ze spermie se zpravidla nedostane žádná mitochondrie do jádra

Page 172: Úvod do obecné genetiky

Panašování u rostlin

Euonymus fortunei. Dvoubarevná mosaika na listech je způsobena přítomností dvou typů chloroplastové DNA, jedné normální a jedné způsobující bílé zbarvení. Výsledkem jsou různě zbarvené listy, nebo méně často, celé rostliny

Page 173: Úvod do obecné genetiky

Geny mimo jádro

mitochondriální DNA může způsobit řadu nemocí u lidí – kóduje např. části enzymu ATP-syntázy

chyby v mitDNA tedy vyústí v menší množství vyrobeného ATP

choroby se tedy projeví nejčastěji v orgánech, které jsou závislé na přísunu energie: svaly a nervová soustava

mitochondriální myopathie se např. projevuje slabostí, neschopností snášet fyzickou zátěž a oslabováním svalů

Page 174: Úvod do obecné genetiky

Geny mimo jádro

chyby v mitDNA přispívají alespoň částečně k některým případům cukrovky, srdečního infarktu a Alzheimerově nemoci

Page 175: Úvod do obecné genetiky