TECHNOLOGIE INFORMATYCZNE

Tydzień 8Przetwarzanie tekstów – część III

Edycja wzorów chemicznych

Przygotował: dr inż. Piotr Rutkowski

Zawartość lekcji

• Isis Draw – edycja wzorów chemicznych

• Ćwiczenia

Programy do edycji wzorów chemicznych

•http://www.mdli.com•MDL Information Systems Inc.•Isis Draw 2.5 (lub wcześniejsze wersje)

•http://www.acdlabs.com•Advanced Chemistry Development•ChemSketch 10 (lub wcześniejsze wersje)

Programy do edycji wzorów chemicznych

Zalety:• darmowy dostęp w

pakiecie edukacyjnym;• intuicyjny interfejs;• kompatybilność z

płatnymi dodatkami, np. bazami danych o związkach chemicznych

Wady:• ograniczona baza

gotowych wzorów;• ograniczone

możliwości nazewnictwa;

• ograniczone możliwości wizualizacji.

Isis/Draw 2.5

Wstawianie wzorów chemicznych do Worda

1. Z poziomu programu Word:• Zaznaczyć miejsce osadzenia obiektu,• Wstaw→Obiekt... (utwórz nowy → typ obiektu → Isis/Draw Sketch

→ OK) – uruchamia się program Isis Draw,• Narysować wzór chemiczny,• Korzystając z opcji „Update Microsoft Office Word” lub „Exit &

Return to Microsoft Office Word” wkleić obiekt do Worda.

2. Z poziomu programu Isis Draw:• Uruchomić program Isis Draw (ikona )• Narysować wzór chemiczny,• Zaznaczyć obiekt i go skopiować • Przejść do pliku tekstowego w programie Microsoft Word,• Wkleić obiekt w odpowiednie miejsce

Wstawianie wzorów chemicznych do Worda

Okno programu

Menu tekstowePasek narzędziSzablony wzorów (Templates)Chem InspectorMenu tytułowe

Isis/Draw – podstawy rysowania wzorówEtapy rysowania:

1. Narysować podstawową strukturę korzystając z „Templates”;

2. Dorysować grupy funkcyjne i pozamieniać węgle na odpowiednie pierwiastki (standardowo wszystkie rysowane wiązania są pomiędzy atomami węgla);

3. Jeśli konieczne dokonać edycji atomów, wiązań lub całej struktury;

4. (opcja) Skorzystać z „Chem Inspector” do sprawdzenia poprawności struktury lub reakcji;

5. (opcja) Zaznaczyć cząsteczkę i korzystając z polecenia: „Object>Clean Molecule…” ujednolicić długości wiązań i kąty między nimi.

Isis/Draw – rysowanie struktur

pasek narzędzi: „Templates”

1. kliknąć na wybrany wzór (zamiast pojawia się znak ) ;2. obiekt wstawić do dokumentu w wybranym miejscu;3. kliknąć na pionowym pasku narzędzi ikonę „lasso select” ;

Isis/Draw – rysowanie struktur

strony „Templates”

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów

myszą rozwinąć menu wiązania

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów: łączenie wiązania z pierścieniem lub łańcuchem

Isis/Draw

rysowanie wiązań i łańcuchów: łączenie wiązania z pierścieniem lub łańcuchem

Isis/Draw

rysowanie atomów

Isis/Draw

Edycja atomów, wiązań i struktur: klikając prawym przyciskiem myszy atom, wiązanie i całą strukturę uaktywnić menu kontekstowe i wybrać opcję „Edit”. Zmodyfikować poszczególne elementy cząsteczki.

Isis/Draw

wyświetlanie atomów węgla i wodoru

Isis/Draw

Wyrównywanie zniekształconej struktury

Isis/Draw – zadanie 1

Narysować poniższe reakcje w programie Isis/Draw, wkleić do MS Word i zapisać

CH3

C C

CH3

CH3

CH3

CH2

C CH

CH3

CH3

CH3

CH3

C CH

CH3

OH

CH3CH3+

85% H3PO4

80 °C

C O

R

CR' ONu

R

CR' ONu

HR

R'

Nu:-

H-Nu:Nu-+

Isis/Draw – zadanie 2

Narysować poniższe wzory w programie Isis/Draw, wkleić do MS Word i zapisać

N

H

NH

HH

HO