tanja populaciona novo

52
POPULACIONA GENETIKA dr Tanja Adnađević IBISS

Upload: metodicar4

Post on 16-Jan-2017

4.109 views

Category:

Science


5 download

TRANSCRIPT

Page 1: Tanja populaciona novo

POPULACIONA GENETIKA

dr Tanja Adnađević

IBISS

Page 2: Tanja populaciona novo

Populaciona genetika

• genetička struktura populacije

Page 3: Tanja populaciona novo

Populaciona genetika

• genetička struktura populacije

grupa jedinki iste vrste koje su reproduktivno povezane

Page 4: Tanja populaciona novo

Populaciona genetika

• genetička struktura populacije

grupa jedinki iste vrste koje su reproduktivno povezane

• aleli• genotipovi

Determiniše potencijal za evolutivne promene i adaptacije

Page 5: Tanja populaciona novo

Opisivanje genetičke strukture• frekvenca genotipova

• frekvenca alela rr = beli

Rr = pink

RR = crveni

Page 6: Tanja populaciona novo

200 beli

500 pink

300 crveni

• frekvenca genotipova• frekvenca alela

200/1000 = 0.2 rr500/1000 = 0.5 Rr300/1000 = 0.3 RR

ukupno = 1000 cvetova

frekvenca genotipova:

Opisivanje genetičke strukture

Page 7: Tanja populaciona novo

200 rr

500 Rr

300 RR

• frekvenca genotipova• frekvenca alela

900/2000 = 0.45 r1100/2000 = 0.55 R

ukupno = 2000 alela

frekvencaalela:

= 400 r

= 500 r= 500 R

= 600 R

Opisivanje genetičke strukture

Page 8: Tanja populaciona novo
Page 9: Tanja populaciona novo

Populaciona genetikaŠta je populaciona genetika?

Opisivanje

Zašto je bitna genetička varijabilnost?

- frekvenca genotipova- frekvenca alela

Kako se menja genetička struktura?

Page 10: Tanja populaciona novo

Promene u frekvenci alela F na Lap lokusu kroz 20 generacija

Genetička varijabilnost u prostoru i vremenu

Page 11: Tanja populaciona novo

Zašto je bitna genetička varijabilnost?Potencijal promena genetičke strukture

• adaptacije na promene spoljašnje sredine - konzervacija•divergencija populacija - biodiverzitet

Genetička varijabilnost u prostoru i vremenu

Page 12: Tanja populaciona novo

Zašto je bitna genetička varijabilnost?

varijabilnost

nema varijabilnosti

IZUMIRANJE!!

Promena životne sredine

opstanak

Page 13: Tanja populaciona novo

Zašto je bitna genetička varijabilnost?

varijabilnost

nema varijabilnosti

sever

jug

sever

jug

Page 14: Tanja populaciona novo

Zašto je bitna genetička varijabilnost?

varijabilnost

nema varijabilnosti

divergencija

NEMA DIVERGENCIJE!!!

sever

jug

sever

jug

Page 15: Tanja populaciona novo
Page 16: Tanja populaciona novo

promene u alelskim frekvencama i/ili frekvencama genotipova kroz vreme

Kako se genetička struktura menja?

Page 17: Tanja populaciona novo

promene u alelskim frekvencama i/ili frekvencama genotipova kroz vreme

Kako se genetička struktura menja?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

Page 18: Tanja populaciona novo

Idealna populacija?!?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

Hardi-Vajnbergov zakon

Page 19: Tanja populaciona novo

Hardi-Vajnbergov princip i ravnotežaako je poznata učestalost alela moguće je odrediti učestalost genotipova

Page 20: Tanja populaciona novo
Page 21: Tanja populaciona novo

Single crossPopulation level

Page 22: Tanja populaciona novo

Hardi-Vajnbergova princip i ravnoteža

učestalosti alela i genotipova se održavaju kroz generacije

AA Aa aap2 2pq q2

Page 23: Tanja populaciona novo
Page 24: Tanja populaciona novo

HW neravnoteža

Page 25: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

spontane promene na DNK•stvaranje novih alela

•izvor genetičke varijabilnosti

Page 26: Tanja populaciona novo
Page 27: Tanja populaciona novo
Page 28: Tanja populaciona novo
Page 29: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

kretanje jedinki izmedju populacija

•izvor novih alela •protok gena

Page 30: Tanja populaciona novo
Page 31: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

neki genotipovi ostavljaju više potomaka• razlike u

preživljavanju i reprodukcijirazlike u

fitnesu

• dolazi do adaptacija

Page 32: Tanja populaciona novo
Page 33: Tanja populaciona novo
Page 34: Tanja populaciona novo
Page 35: Tanja populaciona novo

Natural selection

Resistance to antibacterial soapGeneration 1: 1.00 not resistant

0.00 resistant

Page 36: Tanja populaciona novo

Natural selection

Generation 1: 1.00 not resistant 0.00 resistant

Resistance to antibacterial soap

Page 37: Tanja populaciona novo

Natural selection

Resistance to antibacterial soap

mutation!

Generation 1: 1.00 not resistant 0.00 resistant

Generation 2: 0.96 not resistant 0.04 resistant

Page 38: Tanja populaciona novo

Natural selection

Resistance to antibacterial soapGeneration 1: 1.00 not resistant

0.00 resistant

Generation 2: 0.96 not resistant 0.04 resistant

Generation 3: 0.76 not resistant 0.24 resistant

Page 39: Tanja populaciona novo

Natural selection

Resistance to antibacterial soapGeneration 1: 1.00 not resistant

0.00 resistant

Generation 2: 0.96 not resistant 0.04 resistant

Generation 3: 0.76 not resistant 0.24 resistant

Generation 4: 0.12 not resistant 0.88 resistant

Page 40: Tanja populaciona novo

Selekcija alela za srpastu anemiju

aa – abnormalni ß hemoglobin srpaste anemije

nizakfitnes

intermed.fitnes

visokfitnes

Selekcija favorizuje heterozigote (Aa).Oba alela se održavaju u populaciji (a na niskom nivou).

Aa – oba ß hemoglobina rezistencija na malariju

AA – normalni ß hemoglobin podložan malariji

Page 41: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

slučajne genetičke promene

•greška uzorkovanja•nereprezentativan

uzorak•mala populacija

Page 42: Tanja populaciona novo

Genetički drift – efekat osnivača

Ostrvo

Page 43: Tanja populaciona novo

Genetički drift – efekat uskog grla

Page 44: Tanja populaciona novo

Genetički drift

8 RR8 rr

Pre:

Posle :2 RR6 rr

0.50 R0.50 r

0.25 R0.75 r

Page 45: Tanja populaciona novo

unutar populacija između populacija

porast genetičke varijabilnosti

mutacijemigracije

neki tipovi prirodne selekcije

mutacijegenetčki drift

neki tipovi prirodne selekcije

smanjenje genetičke

varijabilnosti

genetički driftneki tipovi prirodne

selekcije

migracijeneki tipovi prirodne

selekcije

Page 46: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

uzrokuju promene u alelskim frekvencama

Page 47: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?

• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

uzrokuje promene u frekvencama genotipova

Page 48: Tanja populaciona novo

Kako se genetička struktura menja?• mutacije• migracije• prirodna selekcija• genetički drift• neslučajno ukrštanje

ukrštanjem se kombinuju aleli u genotipove

neslučajno ukrštanje

neslučajne kombinacije

alela

Page 49: Tanja populaciona novo
Page 50: Tanja populaciona novo
Page 51: Tanja populaciona novo
Page 52: Tanja populaciona novo

Odstupanje od 2nd HW