t.5. Ácidos nuclÉicos -...
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1. Ácidos nucleicosBiopolímeros formados por unión de nucleótidos (polinucleótidos)
Composición química: C, H, O, N y P
• NUCLEÓTIDO: Unión de 3 componentes:
- Ácido fosfórico (Grupo fosfato)
- Azúcar (pentosa): β-D-ribosa (ARN) y β-D-desoxirribosa (ADN)
- Base Nitrogenada: Púricas (A,G) Pirimidínicas (C,T,U)
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1.1 Nucleósidos
Unión pentosa (ribosa o desoxirribosa) y una base nitrogenada (púrica o pirimidínica)
Solo intervienen 4 bases
- Ribonucleósido → Ribosa + A,G,C,U
- Desoxirribonucleósido → Desoxirribosa + A,G,C,T
Enlace N-glucosídico con pérdida de 1 molécula de agua:
OH hemiacetálico del C1 pentosa + N1 (pirimidinas)
N9 (púricas)
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1.2 Nucleótidos
• Unión (enlace éster) de un ácido fosfórico al nucleósido (–OH del C5’ de la pentosa)
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Tipos de nucleótidos y funciones:
- Nucleótidos difosfato (ADP) y trifosfato (ATP).
Transporta energía
- AMPc (Puente intramolecular con OH del C3’).
Segundo mensajero
- Nucleótidos NO nucléicos (FAD, NAD, CoA).
Coenzimas
- Cadenas de polinucleótidos (enlaces fosfodiester).
Ácidos nucleicos 6
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2.- ADN: ácido desoxirribonucleico
Cadena de polinucleótidos: pentosa (2´desoxirribosa) y las B N (A, G, C, T).
Carácter ácido (igual que el ARN): se tiñe con colorantes básicos.
Se encuentra en el núcleo de la célula eucariota, asociado a proteínas de carácter básico, histonas, y en mitocondrias, cloroplastos y citosol de células procariotas. Además puede formar parte de virus ADN.
En medio acuoso: Adquiere conformación espacial con estructura 1ª y 2ª
• 2.1.- Estructura Primaria
Cadenas lineales de nucleótidos.
Se forman mediante un enlace éster entre el OH del grupo fosfato situado en 5´ y el OH situado en 3´ de la pentosa, liberando 1 molécula de H2O. Encadenamientos 5’ → 3’ → 5’ …
Cada grupo fosfato forma un puente fosfodiéster entre 2 de desoxirribosa
La estructura es una cadena de pentosas y fosfatos de los que salen B N
Siempre presenta dos extremos 3´ y 5´.
5’ …AATTCGCCACGTAAGT…3’
La secuencia de bases tiene la información para la síntesis proteica
Cada cadena de ADN se caracteriza por la composición (% de cada base) y por la secuencia (orden distribución de las bases)
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2.2.- Estructura secundaria
• Doble hélice unidas por puente de H
Modelo de doble hélice ADN–B (propuesto por Watson y Crick)
• CARACTERÍSTICAS:
- Antiparalelas: 3’→5’ y 5’→3’
Ambas cadenas enfrentadas pos sus bases unidas por ptes de H
- Secuencias complementarias: A = T y C ≡ G (3 ptes de H)
La cadena con más C ≡ G será más estable
- Enrrollamiento dextrógiro y plectonémico (trenzadas)
Pares de bases casi horizontales (el eje atraviesa por su centro)
Formas de ADN
ADN-B → Descrita por Watson y Crick
Dextrógira
ADN que interacciona con las proteínas del núcleo (en disolución)
ADN-A → Deshidratación de la forma B
Dextrógira
Solo observada en laboratorio
Doble hélice más ancha y corta
ADN-Z → En zonas de alterancia de numerosas GC
Levógira
Doble hélice más larga y estrecha en forma de zig-zag
Interviene en procesos de expresión del material genético
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2.3 Desnaturalización del ADN• Separación de las dos cadenas de ADN (rotura puentes de H entre
bases) sin afectar a los puentes fosfodiester
• Factores:
- Tª (fusión = Desnaturalización del ADN por ↑ Tª )
(Punto de fusión → Tª a la cual está desnaturalizado la mitad de las moléculas de ADN)
- Variaciones Ph
- Condiciones iónicas del medio
• Proceso reversible: Gran afinidad entre las bases complementarias. Recupera su forma inicial de doble hélice (renaturalización)
- Aplicaciones:
Hibridación: (ADN-ADN; ADN-ARN) → utilizada en tecnología de ADN recombinante Relación genética o parentesco entre dos ADN
Obtención de numerosas copias de ADN (Reacción en Cadena de la Polimerasa; PCR)
Elaboración de sondas (fragmentos ADN monocatenarios conocidos para detectar ADN complementario)
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Descubrimiento de la doble hélice del ADN
• 1869. J. Friedrich Miescher. Descubrió la nucleína al núcleo
• 1950 Alexander R. Todd. Establece composición del ADN
• 1951 Erwin Chargaff. Reglas de Chargaff (Relación cuantitativa de los nucleótidos)
A=T; G=C => A/T =1 y G/C =1 A+G=C+T A+T ≠ G+C
A+T / G+C => Distingue ADN de diferentes especies (Valores más parecidos → especies emparentadas)
• 1952 Rosaling Flanklin y Maurice Wilkins. Fotografía difracción de rayos X de la forma ADN-B
• 1953 James Watson y Francis Crick. Estructura secundaria del ADN (modelo de la doble hélice)
• 1962 Premio Nobel de Medicina para Wilkins, Watson y Crick
Fotografía 5113
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3. OTROS NIVELES DE COMPLEJIDAD DEL ADNAlmacenamiento del ADN en un volumen reducido, facilitando el acceso a la información que contiene.
• Empaquetamiento:
Varía según se trate de organismos procariotas o eucariotas:
• 3.1.- Empaquetamiento del ADN en procariotas:
En procariotas, mitocondrias y cloroplastos doble hélice circular.
Se pliega como una superhélice en forma de ochos (circular) y
asociada a una pequeña cantidad de proteínas.
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3.2.- Empaquetamiento del ADN en eucariotas: Cromatina y cromosomas
ADN unido a histonas (H1,H2A,H2B,H3,H4) (en espermatozoide, protaminas)
Niveles de organización estructural:
- Nucleosoma. (octámero de histonas + 2 vueltas de ADN)
- “Collar de perlas” (11 nm)
- Fibra cromatínica o de 30 nm (empaquetamiento de solenoide) núcleo en interfase → Célula activa
- Bucles o lazos radiales Rosetones (300 nm)
- Espiral de rosetones (empaquetamiento de cada cromátida; 700nm)
- Cromosoma (1400 nm)
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4.- Ácido ribonucleico (ARN)
Ribonucleótidos unidos mediante enlaces fosfodiéster en sentido 5´-3´
Están formados por una sola cadena (excepto el ARN bicatenario de reovirus)
Niveles estructurales:
• Estructura primaria: Secuencia de las bases nitrogenadas que constituyen sus nucleótidos.
Diferencias ARN – ADN:
- Pentosa: Ribosa → OH en C 2’ libres → tensiones (menos estable que ADN)
ARN → 1ª molécula con capacidad de replicación necesaria para el origen de la vida
- B.N.: A,C,G y U. En ARNt otras bases (pseudouracilo, dimetilguanina, …)
• Estructura secundaria: Regiones con secuencias
complementarias capaces de aparearse
• Estructura terciaria: Plegamiento de la secundaria
4.1 Clases de ARN
• ARN vírico Forman parte del genoma de virus (Ej.- Retrovirus)
• ARN precursores ARN primarios o pre-ARN → se transforman (maduración) en otros ARN
ARN heterogéneo nuclear (ARNhn) → Se transforma en ARN mensajero
ARN nucleolar (ARNn) → Se sintetiza en nucleolo y se transforma en ARN ribosómico
• ARN reguladores Regulan expresión génica
ARN interferente (ARNi)→ Inhiben traducción ARNm → Controla desarrollo y diferenciación celular
• ARN con actividad catalítica Se comportan como enzimas (Ribozimas)
ARNr 28S Cataliza enlace peptídico en ribosomas
ARN pequeños nucleares (ARNpn) Maduración de cadenas de ARNm
• ARN implicados en síntesis de proteínas
ARN mensajero (ARNm): Copia la información del ADN
ARN ribosómico (ARNr): Forma estructuras de los ribosomas
ARN transferente (ARNt): Transporta aminoácidos hasta ribosomas
CLASIFICACIÓN
Se basa en coeficiente de sedimentación (Velocidad de sedimentación)
Se expresa en unidades Svedberg (S)
Mide masa molecular y dimensiones de la molécula
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4.2.- ARN mensajero (ARNm)
- Cadenas de largo tamaño con estructura primaria (lineal)
- Mensajero → transporta la información necesaria para la síntesis proteica.
- Se origina a partir de una de las cadenas del ADN.
- Su vida media es corta.
• Función: transmitir el mensaje codificado en el ADN.
• Características de los ARNm:
a) En procariotas el extremo 5´posee un grupo trifosfato
b) En eucariotas
En el extremo 5´ posee un grupo metil-guanosina unido al trifosfato (Cap; protege de degradación)
En el extremo 3´posee una cola de poli-A (transporte fuera del núcleo).
Además:
- Exones, secuencias de bases que codifican proteínas
- Intrones, secuencias sin información.
• En eucariotas sufre el proceso de maduración (eliminación de intrones) antes de hacerse funcional.
Antes de madurar, el ARNm recibe el nombre de ARN heterogeneonuclear (ARNhn ) o Transcrito primario (o pre-ARNm)
• Se encuentra en menor cantidad en la célula (5%).
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4.3.- ARN ribosómico (ARNr)
- Cada ARNr presenta cadena de diferente tamaño, con estructura secundaria y terciaria.
- Forma parte de las subunidades ribosómicas cuando se une con muchas proteínas.
- Están vinculados con la síntesis de proteínas.
Tipos:
- Procariotas: 23S (ribozima), 16S y 5S
- Eucariotas: 28S (ribozima), 18S, 5,8S y 5S
Estructura de un ribosoma bacteriano. El ARNr se aprecia en anaranjado,las proteínas de la subunidad menor en azul, y las de la subunidad mayor en verde.La pequeña estructura en rojo corresponde a una molécula de antibiótico unido a lasubunidad menor.
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4.4.- ARN transferente (ARNt)
• Moléculas de pequeño tamaño (80 – 100 nucleótidos)
• Presenta bases modificadas (p.e.- pseudouracilo)
• Función: unir aminoácidos y transportarlos hasta el ARNm para sintetizar proteínas.
• Estructura:
- Poseen estructura secundaria donde no hay bases complementarias → aspecto de bucles (hoja de trébol).
- Los plegamientos se llegan a hacer tan complejos que adquieren una estructura terciaria
• Características:
- Brazo aceptor: OH extremo 3’ → Unión con aminoácido
- Brazo TψC: Lugar de reconocimento del ribosoma
- Brazo D: Reconocimiento de aminoacil-ARNt sintetasa
- Anticodón: Lugar exacto para colocarse en el ARNm
(las complementarias en el ARNm se llaman codón).
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5. FUNCIONES ÁCIDOS NUCLEICOS
• Replicación o duplicación del ADN: Transmite la información de una generación celular a la siguiente.
- Expresión del mensaje genético: Almacena la información y controla la actividad de la célula.
• Transcripción del ADN para formar ARNm y otros ARN
• Traducción, en los ribosomas, del mensaje contenido en el ARNm a proteinas.