strukturen af transkriptionsaktivatorer dna bindende domæne transkriptionsaktiverende domæne
DESCRIPTION
Strukturen af transkriptionsaktivatorer DNA bindende domæne Transkriptionsaktiverende domæne Eventuelt et dimeriseringsdomæne. DNA bindende domæner Zink indeholdende faktorer Homeodomæner basiske leucin zippers basiske helix-loop-helix. Transkriptionsaktiverende domæne Sure aminosyrer - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
Strukturen af transkriptionsaktivatorer1) DNA bindende domæne
2) Transkriptionsaktiverende domæne
3) Eventuelt et dimeriseringsdomæne
DNA bindende domæner1) Zink indeholdende faktorer
2) Homeodomæner
3) basiske leucin zippers
4) basiske helix-loop-helix
Transkriptionsaktiverende domæne1) Sure aminosyrer
2) Glutamin rigt domæne
3) Prolin rigt domæne
Zink finger struktur
-helix-loop--strand
to histidiner i -helix
to cysteiner i -sheet
aminosyrer i -helix kontakter DNA i major groove
Gal4p eksempel på en zink holdig transkriptionsfaktor uden fingerstruktur
zink koordineres af 6 cysteiner
kort helix genkender DNA target
binder i major groove
Kernereceptorer har zinkioner, der er koordineret af fire cysteiner
Homeodomæner indeholder helix-turn-helix strukturer
Homeobox domæner
helix turn helix
Den ene helix genkender major groove i DNAet
bZIP, basisk leucin zipper
dimeriserer via leucin resterne og binde DNA i major groove via basiske aminosyrer
Basisk helix-loop-helix protein
Rekrutering af RNA polymerase holoenzymet til promotoren
Eukaryote transkriptionsfaktorer stimulerer binding af generelle transkriptionsfaktorer og RNA polymerasen til promotorer. Hvordan ?
Hvilke dele af det generelle transkriptionsapparat der interagerer med en transkriptionsaktivator kan bestemmes ved et pull-down eksperiment
eller 2-hybrid analyse
Assay til bestemmelse af generelle transkriptionsfaktorer, der interagerer med det sure transkriptionsaktiverende domæne af GAL4