stratÉgie et activitÉs - bium.ch · afin d’amélio e les taux de ep odu tiilité et la...
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STRATEacuteGIE ET ACTIVITEacuteS
laquo OPEN SCIENCE raquo Agrave LA
BIBLIOTHEgraveQUE DU CHUV
2016-2018
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1 httpswwwfosteropenscienceeufoster-taxonomyopen-science-definition2 httpssfdoraorg
Les services offerts par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine (BiUM) geacutereacutee par le Dr Ceacutecile Lebrand ont pour objectif de permettre aux chercheurs FBM drsquoeffectuer une phase de transition rapide vers une science plus ouverte integravegre et reproductible appeleacutee ldquoOpen Sciencerdquo LrsquoOpen Science est deacutefinie comme une pratique scientifique qui vise agrave ce que les donneacutees de recherche les notes de laboratoire et autres processus de recherche soient librement disponibles dans des conditions permettant la reacuteutilisation la redistribution et la reproduction de la recherche[1]
LrsquoOpen Science telle que deacutefinit par le FNS et Swissuniversities est un concept qui englobe toutes les activiteacutes qui œuvrent agrave louverture de la science telles i) lrsquoOpen Access to publications (libre accegraves aux publications scientifiques) ii) lrsquoOpen Data (libre accegraves aux donneacutees de recherche accompagnant un article publieacute) et iii) le passage agrave une promotion de la recherche conforme aux principes de la deacuteclaration Dora3
Ce rapport vise agrave preacutesenter en deacutetail la strateacutegie et les activiteacutes laquo Open Science raquo meneacutees par la bibliothegraveque depuis 2016 afin de faciliter pour les chercheurs de la faculteacute de Biologie et de Meacutedecine (FBM) lrsquoimpleacutementation pratique de ces preacuteceptes
Sa mise en pratique permettra drsquoameacuteliorer la qualiteacute la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche effectueacutee agrave lrsquoUNIL ou au CHUV
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Deacutefinition Open Science 2
Contexte crise reproductibiliteacute amp politiques 3 -6
Vision Open Science BiUM 7Membres de lrsquouniteacute de gestions des publications 8-9 Collaborations avec services GDR 10Strateacutegie amp offre de services Open Science BiUM 11-12Activiteacutes Open Science raquo agrave la BiUM en quelques chiffres 13Visibiliteacute accrue publications et sets de donneacutees FBM 14- 16Boicircte agrave outils Open Science BiUM 17Communication intensive 18-27
Objectifs BiUM Open Science 28
DEacuteFINITION DE l OPEN SCIENCE
CONTEXTE CRISE DEREPRODUCTIBILITEacuteDES EacuteTUDESBIOMEacuteDICALESPUBLIEacuteES
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De nombreuses eacutetudes ont reacuteveacuteleacute quentre 51 et 89 des travaux publieacutes en recherche preacuteclinique ne seraient pas reproductibles Les faibles taux de reproductibiliteacute des recherches effectueacutees en sciences de la vie sont alarmants puisquils occasionnent des retards et des coucircts majeurs dans les deacuteveloppements theacuterapeutiques Au niveau mondial ce manque de reproductibiliteacute occasionnerait une perte drsquoenviron 100 milliards de dollars par an pour les eacutetudes preacutecliniques subventionneacutees dans le domaine public1
De multiples causes contribuent agrave cette absence de reproductibiliteacute des eacutetudes en sciences de la vie1234 Les chercheurs effectuent tregraves souvent leurs expeacuteriences preacutecliniques de maniegravere non aveugle et ont donc tendance agrave deacuteceler les reacutesultats quils anticipaient agrave cause drsquoun parti pris Toute une seacuterie de problegravemes reacutecurrents ont eacutegalement eacuteteacute mis en eacutevidence dont le manque de reacutepeacutetitions du nombre drsquoexpeacuteriences lrsquoabsence de controcircles adeacutequats lrsquoabsence de validation des reacuteactifs et la non-utilisation de tests statistiques approprieacutes En plus de cela les chercheurs tregraves souvent choisissent la meilleure expeacuterience plutocirct que de reacutefeacuterencer lensemble des donneacutees et les reacutesultats neacutegatifs ne sont que tregraves rarement publieacutes En particulier ces eacutetudes ont clairement montreacute que les donneacutees de recherche associeacutees agrave une publication sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes
Ce manque de standards et de bonnes pratiques ont conduit non seulement agrave lrsquoabsence de reproductibiliteacute des expeacuteriences individuelles mais eacutegalement au fait que les conclusions principales des articles ne sont souvent pas eacutetayeacutees correctement
1 httpjournalsplosorgplosbiologyarticleid=101371journalpbio10021652 httpcircresahajournalsorgcontent1161116full
3httpwwwnaturecomnaturejournalv483n7391full483531ahtml4httpwwwsciencedirectcomsciencearticlepiiS0140673609603299
3
Afin drsquoameacuteliorer les taux de reproductibiliteacute et la reacuteutilisation de reacutesultats preacutealablement publieacutes les donneacutees de recherche qui sont associeacutees agrave une publication doivent ecirctre accessibles Pour cette raison les eacutediteurs de revues scientifiques introduisent depuis peu des politiques obligatoires de partage des donneacutees de la recherche accompagnant lrsquoarticle en accegraves libre crsquoest agrave dire lrsquoOpen Data12 Cette exigence est due au fait que les donneacutees de recherche sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes dans les articles de recherche
Les organismes de financement Ameacutericains et Europeacuteens (programme Horizon H2020)1 oblige tregraves fortement les auteurs agrave partager leurs donneacutees de recherche accompagnant les publications (Open Data) srsquoil nrsquoy a pas de raisons drsquoen restreindre laccegraves comme dans les cas de protection des donneacutees personnelles ou drsquoarrangements commerciaux
INITIATIVES OPEN SCIENCE
AU NIVEAU NATIONAL amp INTERNATIONAL
1httpwwwnaturecomnaturejournalv490n7419fullnature11556html2 httpsciencesciencemagorgcontent34862421422fullijkey=ha1o5D9wvW4ZQampkeytype=refampsiteid=sci
3httpeceuropaeuresearchparticipantsdocsh2020-funding-guidecross-cutting-issuesopen-access-data-managementdata-management_enhtm
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Open Access to Publications
Le FNS astreint les chercheuses et les chercheurs agrave publier les reacutesultats des projets quil soutient dans des revues ou des bases de donneacutees en libre accegraves (Open Access OA) Lobjectif est de publier 100 des reacutesultats en OA dici 2020 Les chercheurs reccediloivent des subsides pour cela
POLITIQUE
OPEN SCIENCE DU
FONDS NATIONAL SUISSE
Open Research Data
Depuis octobre 2017 il est obligatoire drsquoinclure un plan de gestion des donneacutees (Data Management Plan ou DMP) lors de la soumission drsquoune requecircte pour la plupart des instruments drsquoencouragement
Le FNS sattend en outre agrave ce que les donneacutees produites au cours des travaux de recherche soient archiveacutees dans des bases de donneacutees numeacuteriques en libre accegraves pour autant quaucune clause juridique eacutethique concernant le droit dauteur ou autre ne sy oppose
httpwwwsnfchfrpointrecherchedossiersopen-sciencePagesdefaultaspx
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Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
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VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
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MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
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8 16
1
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0 19
5 23
1 26
5
25
5
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9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
32
1 httpswwwfosteropenscienceeufoster-taxonomyopen-science-definition2 httpssfdoraorg
Les services offerts par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine (BiUM) geacutereacutee par le Dr Ceacutecile Lebrand ont pour objectif de permettre aux chercheurs FBM drsquoeffectuer une phase de transition rapide vers une science plus ouverte integravegre et reproductible appeleacutee ldquoOpen Sciencerdquo LrsquoOpen Science est deacutefinie comme une pratique scientifique qui vise agrave ce que les donneacutees de recherche les notes de laboratoire et autres processus de recherche soient librement disponibles dans des conditions permettant la reacuteutilisation la redistribution et la reproduction de la recherche[1]
LrsquoOpen Science telle que deacutefinit par le FNS et Swissuniversities est un concept qui englobe toutes les activiteacutes qui œuvrent agrave louverture de la science telles i) lrsquoOpen Access to publications (libre accegraves aux publications scientifiques) ii) lrsquoOpen Data (libre accegraves aux donneacutees de recherche accompagnant un article publieacute) et iii) le passage agrave une promotion de la recherche conforme aux principes de la deacuteclaration Dora3
Ce rapport vise agrave preacutesenter en deacutetail la strateacutegie et les activiteacutes laquo Open Science raquo meneacutees par la bibliothegraveque depuis 2016 afin de faciliter pour les chercheurs de la faculteacute de Biologie et de Meacutedecine (FBM) lrsquoimpleacutementation pratique de ces preacuteceptes
Sa mise en pratique permettra drsquoameacuteliorer la qualiteacute la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche effectueacutee agrave lrsquoUNIL ou au CHUV
2
Deacutefinition Open Science 2
Contexte crise reproductibiliteacute amp politiques 3 -6
Vision Open Science BiUM 7Membres de lrsquouniteacute de gestions des publications 8-9 Collaborations avec services GDR 10Strateacutegie amp offre de services Open Science BiUM 11-12Activiteacutes Open Science raquo agrave la BiUM en quelques chiffres 13Visibiliteacute accrue publications et sets de donneacutees FBM 14- 16Boicircte agrave outils Open Science BiUM 17Communication intensive 18-27
Objectifs BiUM Open Science 28
DEacuteFINITION DE l OPEN SCIENCE
CONTEXTE CRISE DEREPRODUCTIBILITEacuteDES EacuteTUDESBIOMEacuteDICALESPUBLIEacuteES
2 |
De nombreuses eacutetudes ont reacuteveacuteleacute quentre 51 et 89 des travaux publieacutes en recherche preacuteclinique ne seraient pas reproductibles Les faibles taux de reproductibiliteacute des recherches effectueacutees en sciences de la vie sont alarmants puisquils occasionnent des retards et des coucircts majeurs dans les deacuteveloppements theacuterapeutiques Au niveau mondial ce manque de reproductibiliteacute occasionnerait une perte drsquoenviron 100 milliards de dollars par an pour les eacutetudes preacutecliniques subventionneacutees dans le domaine public1
De multiples causes contribuent agrave cette absence de reproductibiliteacute des eacutetudes en sciences de la vie1234 Les chercheurs effectuent tregraves souvent leurs expeacuteriences preacutecliniques de maniegravere non aveugle et ont donc tendance agrave deacuteceler les reacutesultats quils anticipaient agrave cause drsquoun parti pris Toute une seacuterie de problegravemes reacutecurrents ont eacutegalement eacuteteacute mis en eacutevidence dont le manque de reacutepeacutetitions du nombre drsquoexpeacuteriences lrsquoabsence de controcircles adeacutequats lrsquoabsence de validation des reacuteactifs et la non-utilisation de tests statistiques approprieacutes En plus de cela les chercheurs tregraves souvent choisissent la meilleure expeacuterience plutocirct que de reacutefeacuterencer lensemble des donneacutees et les reacutesultats neacutegatifs ne sont que tregraves rarement publieacutes En particulier ces eacutetudes ont clairement montreacute que les donneacutees de recherche associeacutees agrave une publication sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes
Ce manque de standards et de bonnes pratiques ont conduit non seulement agrave lrsquoabsence de reproductibiliteacute des expeacuteriences individuelles mais eacutegalement au fait que les conclusions principales des articles ne sont souvent pas eacutetayeacutees correctement
1 httpjournalsplosorgplosbiologyarticleid=101371journalpbio10021652 httpcircresahajournalsorgcontent1161116full
3httpwwwnaturecomnaturejournalv483n7391full483531ahtml4httpwwwsciencedirectcomsciencearticlepiiS0140673609603299
3
Afin drsquoameacuteliorer les taux de reproductibiliteacute et la reacuteutilisation de reacutesultats preacutealablement publieacutes les donneacutees de recherche qui sont associeacutees agrave une publication doivent ecirctre accessibles Pour cette raison les eacutediteurs de revues scientifiques introduisent depuis peu des politiques obligatoires de partage des donneacutees de la recherche accompagnant lrsquoarticle en accegraves libre crsquoest agrave dire lrsquoOpen Data12 Cette exigence est due au fait que les donneacutees de recherche sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes dans les articles de recherche
Les organismes de financement Ameacutericains et Europeacuteens (programme Horizon H2020)1 oblige tregraves fortement les auteurs agrave partager leurs donneacutees de recherche accompagnant les publications (Open Data) srsquoil nrsquoy a pas de raisons drsquoen restreindre laccegraves comme dans les cas de protection des donneacutees personnelles ou drsquoarrangements commerciaux
INITIATIVES OPEN SCIENCE
AU NIVEAU NATIONAL amp INTERNATIONAL
1httpwwwnaturecomnaturejournalv490n7419fullnature11556html2 httpsciencesciencemagorgcontent34862421422fullijkey=ha1o5D9wvW4ZQampkeytype=refampsiteid=sci
3httpeceuropaeuresearchparticipantsdocsh2020-funding-guidecross-cutting-issuesopen-access-data-managementdata-management_enhtm
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Open Access to Publications
Le FNS astreint les chercheuses et les chercheurs agrave publier les reacutesultats des projets quil soutient dans des revues ou des bases de donneacutees en libre accegraves (Open Access OA) Lobjectif est de publier 100 des reacutesultats en OA dici 2020 Les chercheurs reccediloivent des subsides pour cela
POLITIQUE
OPEN SCIENCE DU
FONDS NATIONAL SUISSE
Open Research Data
Depuis octobre 2017 il est obligatoire drsquoinclure un plan de gestion des donneacutees (Data Management Plan ou DMP) lors de la soumission drsquoune requecircte pour la plupart des instruments drsquoencouragement
Le FNS sattend en outre agrave ce que les donneacutees produites au cours des travaux de recherche soient archiveacutees dans des bases de donneacutees numeacuteriques en libre accegraves pour autant quaucune clause juridique eacutethique concernant le droit dauteur ou autre ne sy oppose
httpwwwsnfchfrpointrecherchedossiersopen-sciencePagesdefaultaspx
5
Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
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VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
7
MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
16
REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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CONTEXTE CRISE DEREPRODUCTIBILITEacuteDES EacuteTUDESBIOMEacuteDICALESPUBLIEacuteES
2 |
De nombreuses eacutetudes ont reacuteveacuteleacute quentre 51 et 89 des travaux publieacutes en recherche preacuteclinique ne seraient pas reproductibles Les faibles taux de reproductibiliteacute des recherches effectueacutees en sciences de la vie sont alarmants puisquils occasionnent des retards et des coucircts majeurs dans les deacuteveloppements theacuterapeutiques Au niveau mondial ce manque de reproductibiliteacute occasionnerait une perte drsquoenviron 100 milliards de dollars par an pour les eacutetudes preacutecliniques subventionneacutees dans le domaine public1
De multiples causes contribuent agrave cette absence de reproductibiliteacute des eacutetudes en sciences de la vie1234 Les chercheurs effectuent tregraves souvent leurs expeacuteriences preacutecliniques de maniegravere non aveugle et ont donc tendance agrave deacuteceler les reacutesultats quils anticipaient agrave cause drsquoun parti pris Toute une seacuterie de problegravemes reacutecurrents ont eacutegalement eacuteteacute mis en eacutevidence dont le manque de reacutepeacutetitions du nombre drsquoexpeacuteriences lrsquoabsence de controcircles adeacutequats lrsquoabsence de validation des reacuteactifs et la non-utilisation de tests statistiques approprieacutes En plus de cela les chercheurs tregraves souvent choisissent la meilleure expeacuterience plutocirct que de reacutefeacuterencer lensemble des donneacutees et les reacutesultats neacutegatifs ne sont que tregraves rarement publieacutes En particulier ces eacutetudes ont clairement montreacute que les donneacutees de recherche associeacutees agrave une publication sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes
Ce manque de standards et de bonnes pratiques ont conduit non seulement agrave lrsquoabsence de reproductibiliteacute des expeacuteriences individuelles mais eacutegalement au fait que les conclusions principales des articles ne sont souvent pas eacutetayeacutees correctement
1 httpjournalsplosorgplosbiologyarticleid=101371journalpbio10021652 httpcircresahajournalsorgcontent1161116full
3httpwwwnaturecomnaturejournalv483n7391full483531ahtml4httpwwwsciencedirectcomsciencearticlepiiS0140673609603299
3
Afin drsquoameacuteliorer les taux de reproductibiliteacute et la reacuteutilisation de reacutesultats preacutealablement publieacutes les donneacutees de recherche qui sont associeacutees agrave une publication doivent ecirctre accessibles Pour cette raison les eacutediteurs de revues scientifiques introduisent depuis peu des politiques obligatoires de partage des donneacutees de la recherche accompagnant lrsquoarticle en accegraves libre crsquoest agrave dire lrsquoOpen Data12 Cette exigence est due au fait que les donneacutees de recherche sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes dans les articles de recherche
Les organismes de financement Ameacutericains et Europeacuteens (programme Horizon H2020)1 oblige tregraves fortement les auteurs agrave partager leurs donneacutees de recherche accompagnant les publications (Open Data) srsquoil nrsquoy a pas de raisons drsquoen restreindre laccegraves comme dans les cas de protection des donneacutees personnelles ou drsquoarrangements commerciaux
INITIATIVES OPEN SCIENCE
AU NIVEAU NATIONAL amp INTERNATIONAL
1httpwwwnaturecomnaturejournalv490n7419fullnature11556html2 httpsciencesciencemagorgcontent34862421422fullijkey=ha1o5D9wvW4ZQampkeytype=refampsiteid=sci
3httpeceuropaeuresearchparticipantsdocsh2020-funding-guidecross-cutting-issuesopen-access-data-managementdata-management_enhtm
4
Open Access to Publications
Le FNS astreint les chercheuses et les chercheurs agrave publier les reacutesultats des projets quil soutient dans des revues ou des bases de donneacutees en libre accegraves (Open Access OA) Lobjectif est de publier 100 des reacutesultats en OA dici 2020 Les chercheurs reccediloivent des subsides pour cela
POLITIQUE
OPEN SCIENCE DU
FONDS NATIONAL SUISSE
Open Research Data
Depuis octobre 2017 il est obligatoire drsquoinclure un plan de gestion des donneacutees (Data Management Plan ou DMP) lors de la soumission drsquoune requecircte pour la plupart des instruments drsquoencouragement
Le FNS sattend en outre agrave ce que les donneacutees produites au cours des travaux de recherche soient archiveacutees dans des bases de donneacutees numeacuteriques en libre accegraves pour autant quaucune clause juridique eacutethique concernant le droit dauteur ou autre ne sy oppose
httpwwwsnfchfrpointrecherchedossiersopen-sciencePagesdefaultaspx
5
Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
6
VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
7
MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
8
Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
9
Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
11
OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Afin drsquoameacuteliorer les taux de reproductibiliteacute et la reacuteutilisation de reacutesultats preacutealablement publieacutes les donneacutees de recherche qui sont associeacutees agrave une publication doivent ecirctre accessibles Pour cette raison les eacutediteurs de revues scientifiques introduisent depuis peu des politiques obligatoires de partage des donneacutees de la recherche accompagnant lrsquoarticle en accegraves libre crsquoest agrave dire lrsquoOpen Data12 Cette exigence est due au fait que les donneacutees de recherche sont fondamentales pour valider les analyses et les reacutesultats publieacutes dans les articles de recherche
Les organismes de financement Ameacutericains et Europeacuteens (programme Horizon H2020)1 oblige tregraves fortement les auteurs agrave partager leurs donneacutees de recherche accompagnant les publications (Open Data) srsquoil nrsquoy a pas de raisons drsquoen restreindre laccegraves comme dans les cas de protection des donneacutees personnelles ou drsquoarrangements commerciaux
INITIATIVES OPEN SCIENCE
AU NIVEAU NATIONAL amp INTERNATIONAL
1httpwwwnaturecomnaturejournalv490n7419fullnature11556html2 httpsciencesciencemagorgcontent34862421422fullijkey=ha1o5D9wvW4ZQampkeytype=refampsiteid=sci
3httpeceuropaeuresearchparticipantsdocsh2020-funding-guidecross-cutting-issuesopen-access-data-managementdata-management_enhtm
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Open Access to Publications
Le FNS astreint les chercheuses et les chercheurs agrave publier les reacutesultats des projets quil soutient dans des revues ou des bases de donneacutees en libre accegraves (Open Access OA) Lobjectif est de publier 100 des reacutesultats en OA dici 2020 Les chercheurs reccediloivent des subsides pour cela
POLITIQUE
OPEN SCIENCE DU
FONDS NATIONAL SUISSE
Open Research Data
Depuis octobre 2017 il est obligatoire drsquoinclure un plan de gestion des donneacutees (Data Management Plan ou DMP) lors de la soumission drsquoune requecircte pour la plupart des instruments drsquoencouragement
Le FNS sattend en outre agrave ce que les donneacutees produites au cours des travaux de recherche soient archiveacutees dans des bases de donneacutees numeacuteriques en libre accegraves pour autant quaucune clause juridique eacutethique concernant le droit dauteur ou autre ne sy oppose
httpwwwsnfchfrpointrecherchedossiersopen-sciencePagesdefaultaspx
5
Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
6
VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
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MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
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M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Open Access to Publications
Le FNS astreint les chercheuses et les chercheurs agrave publier les reacutesultats des projets quil soutient dans des revues ou des bases de donneacutees en libre accegraves (Open Access OA) Lobjectif est de publier 100 des reacutesultats en OA dici 2020 Les chercheurs reccediloivent des subsides pour cela
POLITIQUE
OPEN SCIENCE DU
FONDS NATIONAL SUISSE
Open Research Data
Depuis octobre 2017 il est obligatoire drsquoinclure un plan de gestion des donneacutees (Data Management Plan ou DMP) lors de la soumission drsquoune requecircte pour la plupart des instruments drsquoencouragement
Le FNS sattend en outre agrave ce que les donneacutees produites au cours des travaux de recherche soient archiveacutees dans des bases de donneacutees numeacuteriques en libre accegraves pour autant quaucune clause juridique eacutethique concernant le droit dauteur ou autre ne sy oppose
httpwwwsnfchfrpointrecherchedossiersopen-sciencePagesdefaultaspx
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Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
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VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
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MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
12
ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Au niveau national (eg EPFL1 Bern2hellip) ainsi que international (eg MIT Cambridge Universityhellip) les bibliothegraveques universitaires ont deacuteveloppeacute des offres de services qui visent agrave aider les chercheurs de leur institution agrave geacuterer leurs donneacutees de recherche en fournissant des outils et des conseils tout au long du cycle de vie des donneacutees
Ces services ont pour but drsquo aider les chercheurs agrave mieux comprendre la gestion des donneacutees de recherche agrave trouver les outils et ressources approprieacutes et agrave conseiller sur de nombreux aspects tels que bull Plan de gestion des donneacutees (DMP) bull Formats de donneacutees meacutetadonneacutees et normes nom de fichierbull Anonymisation des donneacuteesbull Exigences des bailleurs de fonds et des eacutediteursbull Licences droits dauteur et questions juridiquesbull Deacutepocircts de donneacutees et conservation agrave long termebull Publication de donneacuteesbull Principes FAIR
SERVICES OPEN SCIENCE
DEacuteVELOPPEacuteS PAR LES
BIBLIOTHEgraveQUES UNIVERSITAIRES
1 httpsresearchdataepflch2httpwwwunibechuniversityservicesuniversity_libraryservicesopen_scienceindex_enghtml
6
VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
7
MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
8
Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
9
Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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VISION OPEN SCIENCE
Agrave LA BIBLIOTHEgraveQUE
UNIVERSITAIRE DE
MEacuteDECINE DU CHUV
Le Reacutesultat proposeacute ndash
consiste en une offre de services Open Science agrave la bibliothegraveque de Meacutedecine pour les chercheurs de la FBM UNILCHUV Notre uniteacute de gestion des publications et donneacutees de recherche a pour mission drsquoaider les chercheurs agrave effectuer de la recherche de maniegravere conforme aux normes internationales Open Science en respectant de hauts standards de transparence et de reproductibiliteacute scientifique
La Bibliothegraveque propose son expertise et son soutien durant tout le processus de publication de leacutecriture agrave la diffusion des reacutesultats de recherche
Notre uniteacute est une plateforme multidisciplinaire drsquoinformation de consulting et de formation concernant quatre aspects majeurs de lrsquoOpen Science bull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherche amp ORCIDbull Impact de la recherche
Les objectifs speacutecifiques ndash
permettent aux chercheurs de trouver un appui efficace afin de publier des travaux de qualiteacute et conformes aux directives qui sont instaureacutees par les maisons drsquoeacutedition de revues scientifiques et les agences de financement Nos services facilitent le partage des deacutecouvertes publieacutees de maniegravere libre en Open Access et ainsi ameacutelioreront la transparence et la diffusion des reacutesultats
Lrsquoobjectif global ndash
contribue agrave consolider lrsquoinfluence la visibiliteacute et lrsquoexcellence de notre faculteacute sur les scegravenes nationale et internationale Notre uniteacute est une des plateformes du Deacutepartement de la Formation et la Recherche qui aide agrave garantir que agrave la FBM reste un lieu de preacutedilection et de reacutefeacuterence pour le deacuteveloppement de projets innovateurs et audacieux
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MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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MEMBRES DE LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET
DES DONNEacuteES DE RECHERCHE
Gestionnaire Serval amp Open Access
A lrsquoissu de son PhD en Neuroscience au DNF le Dr Alexandre Pinault se consacre agrave la meacutediation scientifique au travers de lrsquoenseignement la creacuteation et lrsquoanimation drsquoateliers
Aujourdrsquohui il associe son expertise des techniques de communication audiovisuelles avec sa passion pour la communication scientifique en tant que reacutealisateur indeacutependant dans sa compagnie httpswwwbigbangbraincom
Son profil hybride permet drsquoapporter une expertise essentielle dans le cadre de son activiteacute agrave la Bibliothegraveque pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Access agrave la FBM Il est en charge des deacutepocircts de Manuscrits et de la gestion des validations Serval pour les chercheurs ainsi que de la creacuteation de leur bibliomeacutetrie
httpsorcidorg0000-0002-8099-6025
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Cheffe de projets scientifiques amp Open Science advocate
Extrecircmement impliqueacutee dans les activiteacutes drsquoinformation sur les enjeux de lrsquoOpen Science et de lrsquoeacutedition scientifique Le Dr Ceacutecile Lebrand appreacutecie particuliegraverement les missions scientifiques et de gestion de projets qui lui sont confieacutees dans son activiteacute
Son expeacuterience en tant que chercheuse en neurobiologie dans plusieurs institutions internationales de renom (MIT - USA Universiteacute de Cambridge ndash UK) directrice de laboratoire agrave lrsquoUNIL et manager directeur du NCCR Robotics (EPFL) lui permettent drsquoappreacutecier pleinement les enjeux scientifiques et financiers lieacutes agrave la mise en place de politiques de gestion et de partage de donneacutees de recherche Par ailleurs sa longue expeacuterience de publication avec 26 articles dans les meilleurs revues scientifiques internationales (Neuron Nature Neurosciences Nature Com PLoS Biology PLoS Geneticshellip) lrsquoautorise agrave bien comprendre les rouages et la complexiteacute du domaine de lrsquoeacutedition scientifique
Depuis avril 2015 elle supervise lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches de la FBM agrave la BiUM Dans le cadre de cette fonction elle deacuteveloppe des services afin drsquoameacuteliorer la visibiliteacute des publications FBM en favorisant les modegraveles en Open Access Son offre de services visent eacutegalement agrave aider les chercheurs FBM agrave une meilleure gestion de leurs donneacutees de recherche agrave des fins de publication
httpsorcidorg0000-0002-2750-3164
MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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MEMBRES DES BIBLIOTHEgraveQUES FBM ASSOCIEacuteS AUX ACTIVITEacuteS OPEN SCIENCE
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Alexandre Racine est titulaire drsquoun Masteren Sciences de linformation de la Hauteeacutecole de gestion de Genegraveve (HEG)
Alexandre a reacutealiseacute son travail de Master encollaboration avec le deacutepartement IT duCERN et a occupeacute un poste drsquoassistantdrsquoenseignement au sein de la HEG duranttrois ans
Fort de son expeacuterience sur les technologiesde linformation il travaille aujourdrsquohuicomme bibliotheacutecaire scientifique affilieacute aupocircle informatique de la BiUM
Jeacuterocircme Zbinden est expert informatique au sein de la FBM et partage ses activiteacutes entre la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine et la Direction formation et recherche
Ingeacutenieur en informatique diplocircmeacute de lEPFL Jeacuterocircme a travailleacute plusieurs anneacutees au CERN en tant que chef de projet et gestionnaire de services en lien avec la publication scientifique et la gestion eacutelectronique de documents
Il supervise aujourdrsquohui le pocircle informatique de la Bibliothegraveque et propose des solutions permettant un suivi et un appui aux activiteacutes acadeacutemiques de la FBM
POcircLE INFORMATIQUE BIUM
Josiane Bonetti Section des sciences fondamentales
Magdalena Czartoryjska Meier Bibliothegraveque Institut Universitaire
Histoire Meacutedecine et Santeacute Publique
Laurent Gouban Bibliothegraveque de lrsquoHocircpital ophtalmique Jules Gonin
Marylegravene Grzesiak Bibliothegraveque Psychiatrique Universitaire de
Lausanne
Veacuteronique Joris Bibliothegraveque de lrsquoInstitut de Pathologie
Chantal Petoud dei Rossi Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire de
Meacutedecine Sociale et Preacuteventive
Aline Sager Bibliothegraveque de lrsquoInstitut Universitaire Romand de Santeacute
au Travail
RESPONSABLES VALIDATION
DES PUBLICATIONS FBM
Chaque anneacutee les responsables de validation agrave la BiUM et dans les diffeacuterentes bibliothegraveques de la FBM valident plus de 3rsquo000 reacutefeacuterences Ils sont eacutegalement tregraves impliqueacutes dans la mise en Open Access des manuscrits des auteurs de leur deacutepartement respectif sur Serval et participent agrave ameacuteliorer la visibiliteacute de la production scientifique FBM
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
COLLABORATIONS AVEC LES
SERVICES INTERNES amp EXTERNES
DE GESTION DE DONNEacuteES DE
RECHERCHE (GDR)
La gestion organiseacutee et centraliseacutee des donneacutees primaires de la recherche au niveau des universiteacutes demande lrsquointervention de plusieurs services extrecircmement speacutecialiseacutes ainsi que leur collaboration eacutetroite agrave diffeacuterents niveaux du cycle de la gestion des donneacutees de recherche
La BiUM a concentreacute son expertise et activiteacute pour la FBM sur un service drsquoaide aux chercheurs concernant la creacuteation de Data Management Plan et la publication des sets de donneacutees qui accompagnent les articles publieacutes en Open Access Cette deacutemarche est tout agrave fait leacutegitime puisqursquoelle gegravere deacutejagrave lrsquoauto-archivage des publications de la FBM et est speacutecialiste des questions concernant le partage de donneacutees en Open Access
Lrsquointervention de notre service sur ces aspects est solliciteacutee par le service des ressources informationnelles et archive (UNIRIS) qui a reccedilu le mandat du rectorat UNIL de coordonner la gestion des donneacutees agrave lrsquoUNIL Notre service participe activement aux journeacutees drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo (cf annexes) ainsi qursquoau groupe de travail laquo Seacuteance consultantmiddotemiddots Open Science raquo placeacute sous lrsquoeacutegide drsquoUNIRIS
En interne notre service
Collabore de maniegravere eacutetroite avec les services du DFR de lrsquoUNIL et du CHUV impliqueacutes dans les eacutetapes en aval cest-agrave-dire la gestion centraliseacutee des donneacutees primaires et actives (en cours drsquoacquisition et drsquoanalyse) issues de la recherche
A ce titre la BiUM a deacutejagrave rencontreacute et meneacute divers travaux avec plusieurs acteurs actifs dans ce domaine notamment
bull PACTT avec qui nous interagissons reacuteguliegraverement pour des questions de droits drsquoauteur et probleacutematiqued de proprieacuteteacute intellectuelle (voir article)
bull DSI avec qui nous avons reacuteorganiseacute les documents DMP et stockage de donneacutees neacutecessaires aux chercheurs CHUV
bull Service informatique FBM et Ci UNIL
bull Plates-formes DFR qui assistent les chercheurs dans lrsquoacquisition de donneacutees de recherche CIF GTF MEF CIBM hellip
bull Centre de recherche clinique CRC
En externe notre service
bull Collabore avec Vital-ITSIB dans les deacuteveloppements de lrsquooutil DMP Canvasgenerator et lrsquoorganisation conjointe du workshop Data Management Plan pour le programme doctoral StarOmics (cf annexes)
bull Repreacutesente lrsquoAcadeacutemie suisse des sciences meacutedicales (ASSM) dans le groupe de travail chargeacute de reacutediger la Factsheet Open Science in Switzerland
bull Interagit reacuteguliegraverement avec le FNS pour la creacuteation de DMP lors de demandes de fonds
bull Interagit avec la Commission cantonale (VD) deacutethique de la recherche sur lecirctre humain
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PARTAGE DE NOTRE EXPERTISE
STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
11
OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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STRATEacuteGIE ET MISE EN
ŒUVRE DE NOTRE
OFFRE DE SERVICE
OPEN SCIENCE
Reacutesistances au changement
les nouvelles directives pour une Open Science vont entraicircner un surplus de travail consideacuterable agrave toutes les eacutetapes du cycle de recherche et eacutegalement une surcharge administrative pour les laboratoires de recherche
Afin drsquoanticiper le mieux possible toute reacutesistance au changement et preacuteparer au mieux le terrain pour le deacuteveloppement de lrsquoOpen Science le management du changement a eacuteteacute eacutetudieacute par le prisme des recommandations faites par John Paul Kotter1 agrave ce sujet et compleacuteteacutees par celles des organismes de reacutefeacuterence en politique Open Access tels que SPARC Europe2 et le Joint Information Systems Committee (Jisc) au Royaume-Uni3
1 httpwwwkotterinternationalcomthe-8-step-process-for-leading-change2 httpsparceuropeorgwp-contentuploads201508SETools_Flyerpdf3 httprepositoryjiscacuk61431oa-top-tipspdf
Creacuteer un sentiment drsquourgence et une vision partageacutee par tous les chercheurs de la graviteacute des conseacutequences financiegraveres dues agrave lrsquoabsence drsquoune Open Science
Creacuteer une puissante coalition pour guider en incluant degraves le deacutepart tous les pouvoirs et personnes drsquoinfluence de lrsquoinstitution (service drsquoeacutevaluation et deacutecanat de la FBM) les services speacutecialiseacutes UNILCHUV dans ces questions (UNIRIS VDE CRC DSI Ci VitalITSIB plateformes DFR drsquoacquision de donneacutees) ainsi que les leader drsquoopinion dans ce domaine
Consolider et ancrer une culture Open Science afin drsquoeacuteviter tout retour en arriegravere
Deacutevelopper une vision et une strateacutegie qui soit ldquoattirante pour le cœur seacuteduisante pour lrsquoespritrdquo en preacutesentant les nombreux avantages de lrsquoOpen Access et en ancrant un sentiment de fierteacute agrave pratiquer une Open Science plus rigoureuse transparente reproductible et propice agrave lrsquoinnovation
Donner un pouvoir drsquoaction aux employeacutes en impliquant au maximum les chercheurs agrave tous les niveaux afin qursquoils deviennent les acteurs actifs de la reacutevolution de lrsquoOpen Science
Geacuteneacuterer des reacuteussites agrave court terme en mesurant quantitativement lrsquoavancement de lrsquoOpen Science (pex calcul de lrsquoaugmentation du nombre drsquoarticles en Open Access) en remettant des prix laquo Open Science raquo et en diffusant des laquo success stories raquo
Communiquer sur la vision
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
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ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
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2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
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0 19
5 23
1 26
5
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5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
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M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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OFFRE DE SERVICES ET CONSEILS OPEN SCIENCE OFFERTS PAR LrsquoUNITEacute DE
GESTIONS DES PUBLICATIONS ET DES DONNEacuteES DE RECHERCHES Agrave LA BIUM
Publication amp Open Access
bull Exigences Open Access des bailleurs de fonds et des eacutediteurs sur les publications
bull Disseacutemination (Green Open Access sur Serval Fonds Gold Open Access)
bull Lecture de contrat drsquoeacutediteurbull Droit drsquoauteur et licences pour articlebull Plagiatbull Choix de journaux (Open Access Traditionnel Publications
preacutedatrices)
bull Mise en place drsquoun Data Mangement Planbull Exigences des bailleurs de fonds et eacutediteurs sur les donneacuteesbull Formats et description des donneacutees (metadata)bull Disseacutemination - publication de sets de donneacutees bull Droits drsquoauteurs et Licences pour datasetsbull Notion drsquoeacutethique
Gestion des donneacutees amp Open Data
Visibiliteacute de la recherche
bull Orcidbull bioRxivbull Profil Google Scholar bull Profil Impactstory
Impact de la recherche
bull Deacutefinition des index de citationbull Bibliomeacutetrie responsable bull Altmeacutetrie
12
ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
15
Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
16
REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
17
REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
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J U I N 2016
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The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
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The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
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M A I 2017
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The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
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La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
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WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
ACTIVITEacuteS laquo OPEN SCIENCE raquo AgraveLA BIUM EN QUELQUES CHIFFRES
2016-2018
2rsquo642 pages vues
Open Science sur site web de la BiUM
16 sets de donneacutees de
recherche publieacutees par la FBM sur Zenodo
153 seacuteminaires cours et
workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science
1rsquo669 participants
doctorants postdocs et chefs de groupe formeacutes agrave lrsquoOpen Access amp Open Data DMP et ORCID
11 outils Open Science
pour accompagner les chercheurs
8 subsides Open Access
FBM de 3rsquo000 francs
650 Author Manuscripts
FBM mis en Open Access via SERVAL et lieacutes agrave PubMed
4rsquo700 PDFs en OA
rapatrieacutes sur Serval agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
100rsquo000 documents
UNILCHUV teacuteleacutechargeacutes sur Serval chaque mois
13
2rsquo059 ORCID iDs
UNILCHUV
REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
14
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
48
7
62
0 65
3
77
5 81
6
82
9 90
0
58
9
18
1
31
9
34
2 41
7 45
1 52
3 56
2
52
4
82 84
77 1
04
12
2
76 86
18
12
8 16
1
14
0 19
5 23
1 26
5
25
5
26
9
0
100
200
300
400
500
600
700
800
900
1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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REacuteALISATIONSSUBSIDES laquo OPEN ACCESS raquo amp LIEN SERVAL-PUBMED
En deacutebut de lrsquoanneacutee 2018 la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a mis au concours avec le soutien de la Faculteacute huit subsides Open Access de 3rsquo000 francs chacun pour des frais de publication dans des journaux Gold Open Access
Cette action avait pour but drsquo encourager nos chercheurs FBM agrave une deacutemarche Open Access mais eacutegalement avait comme ambition de permettre notre eacuteligibiliteacute au projet LinkOut Le projet LinkOut geacutereacute par Pubmed permet de faire le lien entre PubMed et les articles disponibles en Green Open Access sur les serveurs institutionnels comme Serval
Gracircce agrave la mobilisation de nos chercheurs et le deacutepocirct de plusieurs centaines de manuscrits Serval compte aujourdrsquohui parmi les 31 deacutepocircts institutionnels au niveau mondial qui ont reacuteussi agrave inteacutegrer le projet LinkOut
Nous sommes donc maintenant agrave mecircme drsquooffrir une tregraves grande visibiliteacute aux publications FBM mise en Open Access sur Serval qui se retrouvent en lien direct avec PubMed et de valoriser ainsi la recherche de nos chercheurs au niveau international
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Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
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7
62
0 65
3
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400
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1000
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017
Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
15
Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
16
REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
17
REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
Notre uniteacute de gestion des publications a deacuteveloppeacute des services et outils adapteacutes pour permettre aux chercheurs FBM de publier en Open Access en suivant la voie Green ou Gold conformeacutement aux directives FNS SwissUniversities et UNIL Nous avons eacutegalement reacuteussi agrave mettre en place un monitoring preacutecis et semi-automatiseacute de nos publications FBM mises en Open Access selon une de ces voies
bull Tutorial Servalbull Nouvelles fonctionnaliteacutes Serval pour deacutepocircts Manuscrits Auteursbull Monitoring Open Access FBMbull Informations actualiseacutees sur directives OA et financements
FNSH2020bull Droits drsquoauteurs conseils et recommandationsbull Strateacutegie de publication Open Access
Nos efforts combineacutes agrave celui de nos chercheurs ont permis la publication en open Access de plus de 650 Author Manuscripts FBM via SERVAL depuis 2016 Nous avons eacutegalement rapatrieacutes sur Serval de maniegravere semi-automatiseacutee 4rsquo700 PDF eacutediteurs (pur Gold hybrid platinium green) et 537 Manuscrits en OA agrave partir de PMC ou de sites eacutediteurs
Ces efforts nous ont permis drsquoameacuteliorer consideacuterablement la visibiliteacute de la production intellectuelle de la FBM notamment en eacutetant reacutefeacuterenceacute sur Google Scholar et en devenant eacuteligible pour le projet Linkout (lien avec PubMed) (environ 100rsquo000 down-loads chaque mois sur Serval pour les publications UNIL amp CHUV)
Enfin les bibliothegraveques FBM offrent un soutien reacutegulier en saisissant et validant plus de 3rsquo000 publications sur Serval chaque anneacutee
REacuteALISATIONS VISIBILITEacute ACCRUE
DES PUBLICATIONS FBM EN OPEN
ACCESS SUR SERVAL
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Publi OA sur PMC PDF Pure Gold OA
Author Manuscripts PMC Author Manuscripts Serval
Monitoring Publications FBM en Open Access 2010-2017
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Consultations et teacuteleacutechargements de publications UNILCHUV sur Serval en 2018
Nb de notices Serval vues mois Nb de PDFs teacuteleacutechargeacutes sur Serval mois
Nb de documents additionnels teacuteleacutechargeacutes
REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
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REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
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Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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REacuteALISATIONSVISIBILITEacute ACCRUE
DES SETS DE DONNEacuteES
FBM SUR ZENODO
Nous avons creacutee un espace privileacutegieacute sur le deacutepocirct Zenodo pour faciliter la publication en Open Access des donneacutees de recherche FBM UNILCHUV de maniegravere conforme aux exigences des journaux de lrsquoUNIL et du FNS
Cet espace a dors et deacutejagrave permis la publication et valorisation de 16 sets de donneacutees de recherche publieacutes par la FBM
16
REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
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M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
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S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
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La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
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WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
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M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
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Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
REacuteALISATIONSCREacuteATION ET MISE Agrave DISPOSITION
DrsquoUNE BOIcircTE Agrave OUTILS
OPEN SCIENCE
Gestion des donneacutees amp Open Data
bull Templates DMP FNS speacutecifiques pour FBM UNIL amp CHUV bull DMP canvas Generatorbull Formats de fichiers conseils et recommandationsbull Droits drsquoauteur amp Proprieacuteteacute intellectuelle licences CC BYbull Standards pour meacutetadonneacutees conseils et recommandationsbull Deacutepocircts de sets de donneacutees tutoriaux Zenodo et Dryad
Notre collaboration avec VitalITSIB pour lrsquoapplicabiliteacute de lrsquooutil laquoDMP Canvas Generatorraquo aux besoins speacutecifiques de nos chercheurs FBM srsquoest aveacutereacutee particuliegraverement fructueuse En effet cet outil guide nos utilisateurs pour reacutepondre aux exigences relatives agrave la gestion des donneacutees et produit un document conforme aux instructions SNSF pour la creacuteation drsquoun DMPhttpswwwvital-itchresearchsoftwareDMPCanvasGenerator
17
REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
18
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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REacuteALISATIONS COMMUNICATION
INTENSIVE
Seacuteminaires Open Science donneacutes dansdeacutepartementsservices FBM UNILCHUV
2016 2017 2018Commission recherche amp deacuteveloppement de la direction des soins
Institut universitaire de pathologie Service de meacutedecine nucleacuteaire
Centre inteacutegratif de geacutenomique Service de neacuteonatologie Deacutepartement de physiologie
Institut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive
Service de pharmacie Service de meacutedecine interne
Centre de recherche en neurosciences Deacutepartement doncologie fondamentale
Centre universitaire romand de meacutedecine leacutegale
Deacutepartement de gyneacutecologie- obsteacutetrique et geacuteneacutetique meacutedicale
Service de meacutedecine preacuteventive hospitaliegravere
Service de pharmacie
Preacutesentation Deacutecanat (Prof I Decosterd) Service de soins palliatifs et de
support
Service de neacuteonatologie
Deacutepartement de pharmacologie et toxicologie
Dido doyens de lrsquoUNIL Institut des Sciences du Sport UNIL
Deacutepartement de biochimie (Prof N Fasel)
Policlinique meacutedicale universitaire Service dendocrinologie diabeacutetologie et meacutetabolisme
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Service de gastro-enteacuterologie et dheacutepatologie
Services des uniteacutes deacutepartementales du Deacutepartement de psychiatrie
Radiophysique appliqueacutee Service des Maladies infectieuses Deacutepartement deacutecologie et eacutevolution
Service dalcoologie Uniteacute de valorisation des donneacutees et des eacutechantillons
DG CHUV Service de chirurgie visceacuterale
Hocircpital ophtalmique Jules Gonin Equipe jeunes PIs du CHUV
Institut universitaire de formation et de recherche en soins
Deacutepartement de microbiologie fondamentale
Institut universitaire romand de santeacute au travail
Service de pneumologie
Deacutepartement neurosciences fondamentales
Histoire de la meacutedecine et santeacute publique
Deacutepartement de psychiatrie
Institut universitaire de microbiologie (IMU)
Deacutecanat FBM
Collegravege Acadeacutemique des Professeurs FBM
Rectorat UNIL (Prof F Bussy)
Notre service drsquoaide agrave la gestion des publications a mis en place ces trois derniegraveres anneacutees une large campagne de communication combinant divers meacutedias afin de sensibiliser les chercheurs et les dirigeants de la FBMaux probleacutematiques Open Access et questions concernant la gestion des donneacutees de recherche
Nous avons combineacute divers types drsquointerventions sur les theacutematiques Open Science telles que des preacutesentations in situ dans les deacutepartements de nos chercheurs des interventions lors de meetings speacutecialiseacutes lrsquo organisation drsquoeacutevegravenements cours et workshops pratiques
Preacutesentations Open ScienceFBM UNIL CHUV
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SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
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M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
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La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
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D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
SEacuteMINAIRES ET WORKSHOPS
OPEN SCIENCE DE LA BIUM
Ces deux derniegraveres anneacutees notre service a notamment organiseacute ou a participeacute avec succegraves agrave plus de 150 seacuteminaires ou workshops pratiques en lien avec lrsquoOpen Science pour reacutepondre aux besoins grandissant des chercheurs
Nous avons enregistreacute une audience de plus de 1500 participants avec comme public cible privileacutegieacute les chercheurs cadres de la FBM En effet ces derniers une fois convaincus pourront asseoir et relayer les principes Open Science dans leur laboratoire et notre faculteacute
Notre service a continuellement eacutetoffeacute son offre de formations continues et seacuteances drsquoinformation pour la FBM bull 23 workshops Serval amp Open Accessbull 22 workshops ORCIDbull 51 preacutesentations Open Sciencebull 38 workshops sur la mise en place drsquoun Data
Management Plan en Life sciencesbull 13 workshops Open Data
Pour deacutecouvrir en deacutetail le contenu de ces formations vous pouvez consulter notre page drsquoinformation sur nos workshopset le site de formation continue du CHUV
Atelier Bibliomeacutetrie Responsable reacuteserveacute FBM 3
Atelier DMP 1
Atelier DMP reacuteserveacute FBM 37
Atelier Open Data reacuteserveacute
FBM 13
Atelier Orcid reacuteserveacute FBM 22
Preacutesentation Open Science reacuteserveacutee
FBM 44
Preacutesentation Serval amp Open
Access 24
NOMBRE DrsquoEacuteVEacuteNEMENTS 2016-2018
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere
263
Chercheurs agrave tous niveaux de carriegravere et speacutecialistes information 500
Doctorants 48
Personnel Administratif Principal
Investigator 75
Principal Investigator 575
Principal Investigator Senior Scientist 161
Principal Investigator Post-doc 47
PUBLIC CIBLE amp NIVEAU DE CARRIEgraveRE
19
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
4 |
M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
20
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
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OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
FEacute V R I E R 2016
Workshop laquo Gestion des donneacutees de la recherche raquo
Luniteacute de Documentation et Donneacutees en Santeacute Publique de lInstitut universitaire de meacutedecine sociale et preacuteventive (IUMSP) du CHUV a organiseacute une demi-journeacutee consacreacutee agrave la gestion des donneacutees de la recherche
La gestion des donneacutees de la recherche est un enjeu crucial pour lrsquointeacutegriteacute et la reproducibiliteacute de la science De nombreux intervenants de lUNIL de lUNIGE et de lEPFL ont apporteacute agrave cette occasion un eacuteclairage nouveau autour de cette theacutematique
Dr Ceacutecile Lebrand responsable de lrsquouniteacute de gestions des publications agrave la Bibliothegraveque universitaire de meacutedecine a preacutesenteacute les services proposeacutes aux chercheurs de la FBM pour les aider agrave publier en Open Access les sets de donneacutees ayant directement contribueacute agrave la publication Elle a pu expliquer eacutegalement comment ce service reacutepond aux nouvelles directives internationales ldquoOpen Datardquo des agences de financement et des maisons deacutedition qui visent agrave ameacuteliorer la transparence et la reproductibiliteacute de la recherche biomeacutedicale
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M A R S 2016
Journeacutee drsquoeacutetude laquo Parole aux chercheurmiddotemiddots et expertmiddotemiddots de lrsquoUNIL raquo
Cette demi-journeacutee co-organiseacutee par le Service des ressources informationnelles et archives UNIRIS et le Dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL eacutetait entiegraverement deacutedieacutee agrave la theacutematique de la gestion des donneacutees de recherche
Lrsquoobjectif principal eacutetait de sensibiliser la communauteacute UNIL agrave cette theacutematique et agrave ses nombreux enjeux transdisciplinaires notamment par le dialogue entre expertmiddotemiddots internes et chercheurmiddotemiddots de lrsquoUNIL et par le partage drsquoexpeacuteriences
Dr Ceacutecile Lebrand responsable agrave la BiUM du soutien aux chercheurs de la Faculteacute de Biologie et de Meacutedecine de la gestion des donneacutees de recherche publieacutees et de lrsquoOpen Access participa en tant qursquoexperte pour preacutesenter laquo Les enjeux de lrsquoOpen Access de lrsquoOpen Data et de la publication raquo
httpsunirisunilchresearchdataevenementjournee-etude-20160322
J A N V I E R 2016
Workshop laquoMeet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit of the University Medical Library has organized a workshop laquo Meet Editors to discuss and learn about novel ways for publishing and promoting your researchraquo
This was a unique opportunity for FBM UNILCHUV researchers to discuss their work with two senior journal Editors (BMJ and PLoSMedicine) and to discover new developments related to scholarly publications Researchers were also invited to exchange their views on sharing standards for open practices in biomedical research such as the need of publishing underlying research data of open reviews and of reporting standards
Dr Clare Garvey Senior Research Editor Dr Trish Groves Head of Research BMJ amp Editor-in-chief
For more information
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J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
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WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
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Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
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24
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
J U I N 2016
Get to know your neighbours at the IMUL DMF and EPFL UnconventionalMeeting
The IDEUM unconventional meeting included presentations by several group leaders chalk talks how abouts on the publishing process a ldquoMy project in 180 secondsrdquo contest a brainstorming session and speed geeking
In order to inform and help researchers better use new ways of publishing and sharing scientific results the FBM Publication Management Unit participated to the meeting
Dr Ceacutecile Lebrand gave a talk entitled New tips for managing your publications and research visibility get visible or vanishraquo
In the first part of her talk she presented how making published works and their accompanying datasets freely accessible and reusable through Open Access can benefit researchers and the scientific community eg by improving transparency and increasing results reproducibility In this context she also explained how the BIUM Research amp Publication unit actually helps researchers address the Open Access requirements from major funding agencies (SNSF Horizon2020)
In the second part of her talk considering the gradual paradigm shift from ldquopublish or perishrdquo to ldquoget visible or vanishrdquo in todayrsquos digital and open access environments she presented innovative ways of increasing the visibility of your work and of yourself (ORCID id) Finally she discussed the use of responsible and fair metrics that respect the principles of robustness humility transparency diversity and reflexivity which should be important during the evaluation process of research quality
More information about the program and the different activities
S E P T E M B R E 2 0 1 6
The 13th edition of the Lemanic Neuroscience Annual Meeting (LNAM16) took place on Friday and
Saturday 2-3 September at the Maison des Congregraves in Les Diablerets
On Saturday an Open Science Workshop took place including a talk by Prof Malcolm Mcleod (University of Edinburgh) and an introduction to a series of Open Science workshops for Lemanicresearchers by Dr Ceacutecile Lebrand (FBM Publication Management Unit CHUVUNIL)
Programme
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2016
21
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
More information about the program and the different activities
La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
impact avec une audience de plus de 150 chercheurs de lrsquoarc Leacutemanique et speacutecialistes de lrsquoinformation scientifique
The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
Have a look at our final programme
22
D E C E M B R E 2 0 1 7
WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
Programme et informations sur le site web de la manifestation
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2017
23
Temps Forts Activiteacutes Open Science BiUM2018
N O V E M B R E 2018
Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
Have a look at our final programme
M A R S 2 0 1 8
Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
More information about the program and the different activities
Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
24
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DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
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Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
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Bibliomeacutetrie responsable
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DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
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Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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M A I 2017
Workshop II on laquo Data management amp Open Data raquo
The workshop was fully booked with more than 150 participants (researchers in the biomedical field from UNIL CHUV EPFL UNIGE and HUG at all career stages as well as scientific informationdata manager specialists)
During the first part of this workshop researchers have learned what are the upcoming policies concerning data management and data sharing of the SNFS funding agency They have also discovered the visions of Prof F Bussy (Vice Rector for Research and International Relations UNIL) and Prof P Vandergheynst (Vice President for education EPFL) on Open Science To help researchers professionals involved in Big Data management at VitalITSIBas well as in Data Management Plan preparation at EPFLDLCM have shown to researchers best practices in data management
The second part of the workshop was dedicated to Open Data Researchers have been introduced to journal (PLoS Nature Publishing Group) guidelines concerning data sharing They also learned about data paper (Scientific Data a Nature Research Journal) as well as Zenodo and figshare two adapted data repositories for publishing biomedical research data underlying their publication
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La seacuterie de workshops en anglais ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo soutenue par lrsquouniteacute de gestions des publications et des donneacutees de recherches agrave la Bibliothegraveque de Meacutedecine leacutecole doctorale leacutemanique en neurosciences et RESAL a eacuteteacute une occasion unique pour les chercheurs FBM UNILCHUV de discuter et de deacutecouvrir les bonnes pratiques et standards de lrsquoOpen Science agrave toutes les eacutetapes du cycle de la recherche
Notre big event ldquoData Management amp Open Data in Life Science raquo en mai 2017 a eu un fort
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The ldquoOpen Science amp reproducibilityrdquo workshop series initiative
J U I N 2017
Workshop III on ldquoImproving experimental design in basic and clinical research for increased science reproducibilityrdquo
This workshop given by Dr Romain-Daniel Gosselin was fully booked with 21 participants
The first course gave basic concepts of biostatistics and experimental design
The second half was dedicated to practical activities where attendees can apply their newfound skills in critically assessing the quality of designs presenting their design in grant application and publications as well as using software and online tools
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WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
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The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
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Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
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Workshops sur la gestion des donneacutees de rechercheet le Data Management Plan pour doctorants et postdocs FBM
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Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
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du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
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Bibliomeacutetrie responsable
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DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
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En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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WBI-UNIL Confeacuterence Open Access 2017Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche
Agrave lrsquoheure des laquo nouvelles alternatives raquo ou fake news qui nous parviennent quotidiennement notamment via les reacuteseaux sociaux les publications deacutemontreacutees scientifiquement restent quant agrave elles payantes alors mecircme qursquoelles sont financeacutees par le contribuable (via les contributions aux Universiteacutes et au FNS)
Ce paradoxe implique une reacuteflexion sur lrsquoorganisation de lrsquoaccegraves aux publications de recherche Dans cette perspective la confeacuterence laquo Pratiques croiseacutees de la valorisation de la recherche raquo vise agrave mettre en lumiegravere lrsquoeacutetat de lrsquoart dans le domaine de lrsquoOpen Access en srsquoappuyant sur des expeacuteriences meneacutees en Suisse et en Belgique pour tenter de changer de paradigme au sein des universiteacutes
cette confeacuterence publique a eacuteteacute co-organiseacutee par le dicastegravere Recherche de lrsquoUNIL et par le service UNIRIS en partenariat avec Wallonie-Bruxelles International (WBI)
Au cours de cette confeacuterence Dr Ceacutecile Lebrand responsable Open Science agrave la FBM a donneacute une preacutesentation intituleacutee laquoUniversiteacute de Lausanne ndash Serval point sur les deacuteveloppements pour la diffusion en Open Access et la valorisation des publications de LrsquoUNIL et du CHUVraquo
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Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
This workshop animated and organized by Dr Lebrand Ceacutecile Jeacuterocircme Zbinden and Alexandre Racine from the CHUV Library is integrated into the PhD programmes of the FBM doctoral school and Lemanic Neuroscience Doctoral School
During the first part of this workshop doctoral students were taught best practices in data management and how to collect describe store secure and archive research data
The second half of the workshop was dedicated to practical exercises on data management where doctoral students learned how to prepare a DMP corresponding to their PhD thesis project and how to share their published data on adapted repository
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Workshop on laquo Data Management Planrdquo
The workshop was fully booked with 31 researchers at all career stages
This workshop animated and co-organized by Dr C Lebrand from the CHUV Library and Dr Anastasia Chasapi from the SIBVitalIT was part of the Doctoral Program StarOmics of the Universities of Bern Fribourg Geneva Lausanne and Neuchacirctel
During the first part of this workshop researchers were introduced to the need for a Data Management Plan (DMP) preparation an evolving document reporting how the research data will be managed during and after a research project
The second half of the workshop was dedicated to a practical session on Data management where they have learned how to fill a DMP corresponding their own research project
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Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
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- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
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Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Workshop on laquo Data management amp Open Data raquo in life science
The workshop was fully booked with 20 PhD from the FBM UNILCHUV
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2020-2024
En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
28
SITE WEB OPEN SCIENCE
DE LA BIBLIOTHEgraveQUE
Sur le site web de la bibliothegraveque un pan entier est deacutedieacute speacutecifiquement aux 4 grands axes Open Science sur lesquels nous basons nos actionsbull Publication amp Open Accessbull Gestion des donneacutees amp Open Databull Visibiliteacute de la recherchebull Impact de la recherche
Adresse Web httpswwwbiumchenpublication-open-access
Ces chapitres en anglais preacutesentent en deacutetail- les preacuteceptes Open Science- Nos services et formations pour aider les chercheurs agrave plusieurs eacutetapes
du flux de travail de recherche reacutedaction publication et mise en Open Access diffusion et eacutevaluation
- Tous les outils neacutecessaires agrave nos chercheurs pour une mise en pratique simplifieacutee de lrsquoOpen Science
Sur notre page actualiteacute nous avons pu relayer aupregraves de la FBM et de lrsquoUNIL tous les derniers deacuteveloppements Open Sciences importants au niveau mondial national et local httpswwwbiumchnews
En 2 ans plus de 2500 visites de nos pages Open Science et plus de 1000 visites pour les annonces de nos workshops DMPOpen Data
Bibliomeacutetrie responsable
363
Gestion des donneacutees amp Open Data
733
Publication amp Open Access
1230
Visibiliteacute de la recherche
316
Nombre de pages ldquo4 axes Open Sciencerdquo consulteacutees sur notre site depuis Sept 2016
25
ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
26
PREacuteSENTATION DE NOS ACTIONS SUR LES
REacuteSEAUX SOCIAUX (LINKEDIN TWEETER YOUTUBE FACEBOOK)
27
OBJECTIFS BIUM OPEN SCIENCE
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En 2016
bull Pas de politique institutionnelle Open Access amp Open Data bull Problegraveme de gestion et visibiliteacute des publications FBMbull Peu drsquooutils performants pour reacutepondre au haut standard Open Science en terme de gestion des donneacutees amp FAIR data
Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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ARTICLES DE VULGARISATION SUR LES ENJEUX
DE LrsquoEacuteDITION ET LrsquoOPEN ACCESS
httpwwwinvivomagazinecomfrmens_sanarecherchearticle387le-savoir-libere
Notre uniteacute de gestion des publications a participeacute agrave plusieurs reprises agrave la reacutedaction drsquoarticles de vulgarisation scientifique dans le journal In Vivo du CHUV sur les theacutematiques concernant les auteurs drsquoune publication lrsquoimpact facteur des journaux lrsquoOpen Access et Open Data afin de sensibiliser les chercheurs aux probleacutematiques Open Science
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Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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Objectifs 2020 - 2024
bull Politique Open Access effective (70 en 2020 -100 en 2024)bull Participation directe au deacuteploiement de laquoServal 3raquo avec performances et fonctionnaliteacutes augmenteacuteesbull Excellente gestion amp visibiliteacute des publications FBM (tous les cadres acadeacutemiques avec un ORCID iD)bull Deacutevelopper une culture Open Science en accord avec les politiques UNIL Swissuniversities et FNSbull Aide au service drsquoeacutevaluation FBM pour la transition vers une promotion de la recherche conforme aux principes DORAbull Collaboration avec les services speacutecialiseacutes IT et Big Data pour le deacuteveloppement drsquooutils innovants (canvas DMP speacutecifique aux disciplines et deacutepocirct FAIR pour donneacutees cliniques non anonymisables)
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