stopnje katabolizma - studentski.net · oksidativna fosforilacija sklop dveh procesov: elektronska...

25
Stopnje katabolizma V citratnem ciklu nastaneta NADH in FADH 2 , ki preneseta e - v elektronsko prenašalno verigo. V citratnem ciklu in pri pretvorbi piruvata v acetil-CoA se sprošča CO 2 . citosol mitohondrij

Upload: others

Post on 07-Sep-2019

7 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Stopnje katabolizma

V citratnem ciklu nastaneta NADH inFADH2, ki preneseta e- v elektronskoprenašalno verigo.

V citratnem ciklu in pri pretvorbipiruvata v acetil-CoA se sprošča CO2.

citosol

mitohondrij

Page 2: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Acetil-CoA

Page 3: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Acetil-CoA

Oblike poti!

Page 4: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Nastanek acetil-CoA iz piruvata

Nastanek acetil-CoA iz piruvata (oksidativno dekarboksilacijo piruvata) katalizira multiencimski kompleks piruvat dehidrogenaza, ki združuje encime za:

- dekarboksilacijo piruvata (E1)- oksidacijo ketonske skupine na C2 (E2)- tvorbo tioestrske vezi s CoA (E3)

Page 5: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Nastanek acetil-CoA iz piruvata

Mehanizem delovanja kompleksa piruvat dehidrogenaze.

Page 6: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Kompleks piruvat dehidrogenaze

Prerez strukture kompleksa piruvat dehidrogenaze(pod elektronskim mikroskopom)

Pri sesalcih je premer kompleksa okoli50 nm (5-krat večji od ribosoma)

Sestavljen iz:

- 60 kopij E2 (20 trimerov tvorijedro kompleksa)

- do 30 kopij E1- do 12 kopij E3

Nahaja se v matriksu mitohondrija.

Page 7: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Citratni ciklus

Citratni ciklus poteka v matriksu mitohondrija, oksidativna fosforilacija pa preko notranjemembrane.

do 5000 Da

Page 8: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Citratni ciklus

Neto reakcija citratnega ciklusa:

𝑎𝑐𝑒𝑡𝑖𝑙𝐶𝑜𝐴 + 3 𝑁𝐴𝐷+ + 𝐹𝐴𝐷 + 𝐴𝐷𝑃 𝐺𝐷𝑃 + 𝑃𝑖 + 2 𝐻2𝑂 → 2 𝐶𝑂2 + 3 𝑁𝐴𝐷𝐻 + 3 𝐻+ + 𝐹𝐴𝐷𝐻2 + 𝐴𝑇𝑃 𝐺𝑇𝑃 + 𝐶𝑜𝐴

Page 9: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Citratni ciklus

Page 10: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Regulacija citratnega ciklusa

Regulacija na stopnjah enosmernih reakcij.

Page 11: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Citratni ciklus

Citratni ciklus je amfiboličen (deluje prikatabolizmu in anabolizmu). Intermediaticitratnega ciklusa služijo tudi kot prekurzorjiza sintezo bioloških molekul.

Reakcije piruvat karboksilaze, PEP karboksikinazein NAD-malatnega encima so anaplerotične –nadomestijo intermediate, ki se porabijo zabiosintezo.

glukoneogeneza

Page 12: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Oksidativna fosforilacija

Page 13: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Oksidativna fosforilacija

Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki žene sintezo ATP.Sklopitev sistemov imenujemo kemiosmotska sklopitev.

Page 14: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

Elektroni se po transportni verigi prenašajo preko štirih proteinskih kompleksov in mobilnihprenašalcev (CoQ in cit C). Končni prejemnik je kisik.

Kompleks I Kompleks III

Kompleks II

Kompleks IV

I

II

III IV

4 4

Page 15: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

Elektroni se po transportni verigi prenašajo preko štirih proteinskih kompleksov in mobilnihprenašalcev (CoQ in cit C). Končni prejemnik je kisik.

Kompleks I Kompleks III

Kompleks II

Kompleks IV

Page 16: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

Elektroni se po transportni verigi prenašajo preko štirih proteinskih kompleksov in mobilnihprenašalcev (CoQ in cit C). Končni prejemnik je kisik.

Fe-S gruče

Page 17: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

Elektroni se po transportni verigi prenašajo preko štirih proteinskih kompleksov in mobilnihprenašalcev (CoQ in cit C). Končni prejemnik je kisik.

hem C iz citokrom C oksidaze

Page 18: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

Elektroni se po transportni verigi prenašajo preko štirih proteinskih kompleksov in mobilnihprenašalcev (CoQ in cit C). Končni prejemnik je kisik.

Kompleks I Kompleks III

Kompleks II

Kompleks IV

Page 19: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

V elektronsko transportno verigo lahko vstopa tudi NADH iz citosola. V skeletni mišici inmožganih vstopa preko glicerol-3-fosfata.

Page 20: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Elektronska transportna veriga

V elektronsko transportno verigo lahko vstopa tudi NADH iz citosola. V srčni mišici in jetrihvstopa preko malat-aspartatnega transportnega sistema.

Page 21: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Sinteza ATP

ATP sintetizira encimski kompleks F0-F1 ATP sintaza. Energijo za delovanje dobi iz tokaprotonov preko kompleksa.

Page 22: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Transport ATP

Sintetiziran ATP se iz matriksa prenese v medmembranski prostor preko translokazeadeninskih nukleotidov.

Page 23: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Oksidativna fosforilacija

Celokupen izplen oksidativne fosforilacije na molekulo glukoze:

Page 24: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Proizvodnja prostih radikalov

Med oksidativno fosforilacijo v mitohondriju nastajajo kisikovi prosti radikali zaradi razlik vhitrosti prenosa elektronov in njihovega vstopanja v transportno verigo. Mitohondriji so razvilisistem za njihovo odstranjevanje.

Page 25: Stopnje katabolizma - studentski.net · Oksidativna fosforilacija Sklop dveh procesov: elektronska veriga ustvarja protonski gradient, ki ženesintezo ATP. Sklopitev sistemov imenujemo

Razklop mitohondrijev

V rjavem maščevju lahko pride do razklopa elektronske transportne verige in ATP sintaze naračun prozivodnje toplote namesto ATP. Na ta način se grejejo dojenčki in hibernirajoče živali.