rna virusvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · kompleks, struktur sgt kompleks dan...
TRANSCRIPT
![Page 1: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/1.jpg)
RNA VIRUSdrh. Sruti Listra Adrenalin, M.Sc.
3 Maret 2020
![Page 2: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/2.jpg)
VIRUS
Virion : kesatuan partikel virus
F/ : mengirim genom RNA/DNA ke sel host u/ di ekspresikan (translasi, transkripsi) o/sel host
Kapsid : protein pelindung as. Nukleat, disandi genom
Nukleokapsid : gab kapsid + as.Nukleat
Kapsomer : Kapsid terbentuk dari banyak subunit protein
![Page 3: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/3.jpg)
KLASIFIKASI VIRUS
1. Bentuk:
Ikosahedral, bentuk 20 segitiga sama sisi, dengan sumbu rotasi ganda. C/ virus polio, adenovirus, picornaviridae, Calicivirade, Togaviridae, Flaviviridae, Reoviridae, Retroviridae.
Heliks, menyerupai batang panjang, nukleokapsid tidak kaku dalam selaputpembungkus lipoprotein dan berbentuk heliks, memiliki satu sumbu rotasi. Contoh :Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Filoviridae, Rhabdoviridae.
Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibandingdengan virus lainnya.
![Page 4: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/4.jpg)
… KLASIFIKASI VIRUS
2. Selubung
Virus berselubung, mempunyai selubung yang tersusun atas lipoprotein atauglikoprotein. Contoh : Poxvirus, Herpesvirus, Orthomyxovirus, Paramyxovirus, Rhabdovirus, Togavirus, Retrovirus.
Virus tdk berselubung, Nukleokapsid tidak diselubungi oleh lapisan yang lain hanyamemiliki kapsid (protein) dan asam nukleat. Contoh : Adenovirus, Papovavirus, Parvovirus, Picornavirus, Reovirus.
3. Asam Nukleat
Virus DNA Contoh : Poxvirus, Hepesvirus, Adenovirus, Papovavirus, Parvovirus.
Virus RNA Contoh : Orthomyxoviruses, Paramyxoviruses, Rhabdoviruses, Picornaviruses, Togaviruses, Reoviruses, Retroviruses.
![Page 5: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/5.jpg)
RNA vs DNA VIRUS
DNA RNA
Umumnya double stranded Single stranded
Kemampuan mutase lebih rendah Kemampuan mutase tinggi
Replikasi terjadi di nucleus Replikasi di sitoplasma
Sugar deoxyribose Sugar ribose
Stabil pd kondisi alkalin Tidak stabil
Basa: adenine-thymin (AT), cytocine-guanine (CG) Adenin-uracil (AU), cytocine-guanine (CG)
Self replicating RNA disintesis dari DNA berdasarkan kebutuhan
Bertanggung jawab terhadap penyimpanan dan transfer informasi genetic
Secara langsung mengkode asam amino dan sebagaimessenger antara DNA dan ribosom untuk membuatprotein
![Page 6: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/6.jpg)
BALTIMORE CLASSIFICATION
![Page 7: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/7.jpg)
![Page 8: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/8.jpg)
RNA VIRUS
![Page 9: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/9.jpg)
KLASIFIKASI BALTIMORE
RNA VIRUS 1
dsRNA (Class III):
1. Reoviridae
2. Birnaviridae
ssRNA (+) (class IV):
1. Coronaviridae
2. Flaviviridae
3. Caliciviridae
4. Picornaviridae
5. Togaviridae
RNA VIRUS 2
ssRNA (-) (Class V):
1. Bunyaviridae
2. Orthomyxoviridae
3. Filoviridae
4. Bornaviridae
5. Paramyxoviridae
6. Rhabdoviridae
ssRNA (RT) (Class VI):
1. Retroviridae
![Page 10: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/10.jpg)
REOVIRIDAE
Virions are nonenveloped, spherical in outline, 5580 nm in diameter.
Virions are composed of three concentric capsid layers, all with icosahedral symmetry; the outer capsid differs in appearance in the various genera.
Genome is composed of double-stranded RNA
Cytoplasmic replication.
Genetic reassortment occurs between viruses within each genus or serogroup (genetic shift), along with mutation of individual genes (genetic drift).
![Page 11: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/11.jpg)
… R
EOV
IRID
AE
![Page 12: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/12.jpg)
BIRNAVIRIDAE
Virions are nonenveloped, hexagonal in outline, approximately 65 nm in diameter, single shell having icosahedral symmetry.
Genome consists of two molecules of linear double-stranded RNA.
A single major capsid protein, and one or more nonstructural proteins (RNA polymerase (transcriptase)).
Cytoplasmic replication.
Survives at 60°C for 60 min; stable at pH 3-9.
Birnaviruses occur in chickens (infectious bursal disease virus), salmonid fish (infectious pancreatic necrosis virus), and many species of marine fish and shellfish (aquatic birnaviruses) as well as reptiles, crustaceans, and insects.
![Page 13: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/13.jpg)
CORONAVIRIDAE
Virions are pleomorphic or spherical (Subfamily Coronavirinae) or disc-, kidney-, or rod-shaped (Subfamily Torovirinae); 80220 nm-120140 nm in diameter. Virions are enveloped, with large club-shaped spikes (peplomers).
Virions have an icosahedral core structure within which is a helical nucleocapsid(coronaviruses) or a tightly coiled tubular nucleocapsid in a doughnut (toroviruses) or bacilliform (bafiniviruses) shape.
The genome consists of a single molecule of linear positivesense, single-stranded RNA, 2531 kb in size, and infectious.
Coronavirus virions contain structural proteins: a major spike glycoprotein (S), transmembrane glycoproteins (M and E), a nucleoprotein (N), and, in some viruses, a hemagglutinin esterase (HE).
Viruses replicate in the cytoplasm.
Virions are formed by budding into the endoplasmic reticulum and are released by exocytosis. Cell fusion may occur.
![Page 14: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/14.jpg)
… C
OR
ON
AV
IRID
AE
![Page 15: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/15.jpg)
… C
OR
ON
AV
IRID
AE
![Page 16: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/16.jpg)
… C
OR
ON
AV
IRID
AE
![Page 17: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/17.jpg)
FLAVIVIRIDAE
Flavivirus, mostly arthropod-borne viruses; Pestivirus, nonarthropod-borne, includes several veterinary pathogens; Hepacivirus, human hepatitis C virus and several related and newly identified viruses of animals of uncertain pathogenic significance; Pegivirus, including a group of newly identified human and veterinary viruses of uncertain pathogenic significance.
Virions are spherical, 4060 nm in diameter, and consist of a tightly adherent lipid envelope covered with indistinct spikes (peplomers) surrounding a spherical nucleocapsid.
Genome is a single molecule of linear, positive-sense, single-stranded RNA, infectious.
Cytoplasmic replication; have eight or nine nonstructural proteins and three or four structural proteins.
Maturation occurs on intracytoplasmic membranes without budding.
![Page 18: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/18.jpg)
… FLA
VIV
IRID
AE
![Page 19: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/19.jpg)
… FLA
VIV
IRID
AE
![Page 20: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/20.jpg)
PICORNAVIRIDAE
Virions appear smooth and round in outline, are nonenveloped, ,30 nm in diameter, and have icosahedral symmetry.
The genome consists of a single molecule of linear, positivesense, single-stranded RNA, 78.8 kb in size, infectious.
Virion RNA acts as mRNA and is translated into a polyprotein (s) cleaved to yield some 11 or 12 individual proteins.
Cytoplasmic replication.
![Page 21: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/21.jpg)
… PICORNAVIRIDAE
![Page 22: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/22.jpg)
CALICIVIRUS
Virions are nonenveloped, 2740 nm in diameter, with icosahedral symmetry.
Some virions have a characteristic appearance
Virions are assembled from one capsid protein.
Genome is composed of a single molecule of linear positive-sense, single-stranded RNA, 7.48.3 kb in size, infectious.
Cytoplasmic replication.
Currently five genera.
![Page 23: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/23.jpg)
TOGAVIRIDAE
• Alphavirus, arthropod-borne viruses, and Rubivirus, rubella virus (an exclusively human pathogen).
• Virions are spherical, enveloped, 70 nm in diameter, and consist of an envelope with fine glycoprotein spikes surrounding an icosahedral nucleocapsid.
• The genome is a single molecule of linear, positive-sense, single-stranded RNA, 9.711.8 kb in size, infectious.
• The 50 two-thirds of the genome encodes nonstructural proteins; the 30 one-third encodes the structural proteins,
• Virions contain two (or three) envelope glycoproteins E1, E2, and E3, which form the spikes, and a nucleocapsidprotein, C.
• Replication occurs in the cytoplasm, and maturation occurs via budding from the plasma membrane.
![Page 24: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/24.jpg)
REFERENCES
Amri, I,A., Qosimah, D., Nugroho, W. 2019. Pengantar Virologi Veteriner. UB Press.
MacLachlan, N.J., Dubovi, E.J. 2016. Fenner’s Veterinary Virology 5th Edition. Academic Press.
![Page 25: RNA VIRUSvlm.ub.ac.id/pluginfile.php/42236/mod_resource... · Kompleks, struktur sgt kompleks dan pada umumnya lebih lengkap dibanding dengan virus lainnya. … KLASIFIKASI VIRUS](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022081400/608f924db08bba72485f7de2/html5/thumbnails/25.jpg)