ReMIX, Présentation générale

But

1. Large stockage + accès rapide aux données

2. Traitement rapide des données

Moyens

1. 512 GB de mémoire �ash• Accès disque dur : 10 milli-secondes• Accès �ash : 20 micro secondes

2. FPGA : Field-programmable gate array(Circuit logique programmable)

• Ensemble de cellules logiques assemblables à loisir• Parallélisme à grain �n : 160 opérateurs

ReMIX, Présentation générale

But

1. Large stockage + accès rapide aux données

2. Traitement rapide des données

Moyens

1. 512 GB de mémoire �ash• Accès disque dur : 10 milli-secondes• Accès �ash : 20 micro secondes

2. FPGA : Field-programmable gate array(Circuit logique programmable)

• Ensemble de cellules logiques assemblables à loisir• Parallélisme à grain �n : 160 opérateurs

Une carte remix

• 64 GB FLASH • un FPGA

Remix, vision globale

Remix, quelques résultats

700 000 protéines contre le génome humain (blast)

Sans remix

• Environ 400 jours

Avec remix

• Environ 16 jours et demi sur une carte

• Sur huit cartes (parallélisme à gros grain) :

environ 2 jours