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Rede speciesLink
Sistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas:A integração do Species Analyst e SinBiota
Vanderlei Perez CanhosAlexandre Marino
Centro de Referência em Informação Ambiental, CrIA
Amazon Basin Biodiversity Information Facility
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O principal objetivo
do projeto
speciesLink foi o de
desenvolver um
sistema de buscas
distribuído
integrando diversas
coleções biológicas
e tornando seus
dados primários
disponíveis através
da Internet.
speciesLinkSistema de Informação Distribuído para Coleções Biológicas
http://splink.cria.org.br
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peixes: 3
herbários: 4 microrganismos: 3
ácaros: 2
inventário: SinBiota
Distribuição geográfica das coleções participantes
Coleções do Estado de São Paulo Coleções do Estado de São Paulo – Fase I (2 anos)– Fase I (2 anos)
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Suporte às coleçõesSuporte às coleções
• Provendo equipamentos e infraestrutura de rede
• Auxiliando na escolha do software de gerenciamento
• Auxiliando no treinamento e na importação de dados
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Protocolo e Esquema de DadosProtocolo e Esquema de Dados
• Protocolo DiGIR (Distributed Generic Information Retrieval)
Potencial para ter aceitação global
• Componentes DiGIR (Portal Java & Provedor PHP)
Desenvolvimento colaborativo
• DarwinCore v.2
Cobre o conteúdo comum a todos os grupos taxonômicos contemplando todos os dados básicos (identificação taxonômica, localização e data da coleta)
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Interface de Interface de Busca SimplesBusca Simples
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speciesLink site
Camada de apresentação
speciesLink site
Camada de apresentação
Portal DiGIR(Java)
Portal DiGIR(Java)Perl
Perl
Conectividade baixa ou instável
Conectividade rápida e estável
DadosCliente SOAP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção C
Repositóriode Dados
DadosCliente SOAP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção B
Repositóriode Dados
DadosProvedor
PHP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção A
PostgresProvedor
PHP
SOAP Server
SQL
Servidor Regional
Arquitetura do Arquitetura do SistemaSistema
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Servidor Regional
Servidor Regional
Servidor Regional
Servidor Regional
Representação da redeRepresentação da rede
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speciesLink site
Camada de apresentação
speciesLink site
Camada de apresentação
Portal DiGIR(Java)
Portal DiGIR(Java)Perl
Perl
Conectividade baixa ou instável
Conectividade rápida e estável
DadosCliente SOAP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção C
Repositóriode Dados
DadosCliente SOAP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção B
Repositório deDados
PostgresProvedor
PHP
Servidor SOAP
SQL
Servidor Regional
DadosProvedor
PHP
Sistema deGerenciamento
da Coleção
SQL
Coleção A
Arquitetura do Arquitetura do SistemaSistema
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Software para migrar dadosSoftware para migrar dados
• Independente de plataforma (java)
• Conecta-se a qualquer banco de dados acessível via JDBC(também suporta arquivos texto)
• Oferece controle completo sobre os dados
• Baixo tráfego de rede
• Possibilidade de filtrar dados sensíveis usando expressões regulares
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Resultado de busca simplesResultado de busca simples
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speciesLink speciesLink – Fase II (+2 anos)– Fase II (+2 anos)
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~40 coleções conectadas~40 coleções conectadas
~940.000 registros on-line~940.000 registros on-line
Março/2006Março/2006
JBRJ
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FUTUROFUTURO
JBRJ
Rede Paranaense
Rede Capixaba