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Medline via l’interface Pubmed

Georges Beuzet, Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO

BU Santé

mai 2012mai 2012

Internes de médecine – 21 mai 2012

Objectifs de la séance Connaître les principes de constitution de la

base Medline

Se repérer dans Pubmed

Savoir effectuer une requête pertinente dans la base

Savoir mettre en place des alertes sur un thème

Pour suivre les exercices

Support de cours et informations complémentaires sur

http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine

Ne pas confondre

Medline ≠ Pubmed

Le contenu(la base de données)

L'interface d'interrogation

Bases de données Un éditeur privé ou un

organisme institutionnel

Un référencement humain

Un thésaurus organisé

Une interface d'interrogation

Medline

Qui?

Quoi?

Thésaurus MESH

Interface PUBMED (il en existe d'autres)

National Library of Medicine Etats-Unis)

20 M de références d'articles biomédicaux,

issues de 5200 périodiques depuis 1948

S'il te plaît, dessine-moi...

...un thésaurus

Vocabulaire normalisé

Descripteurs

Hiérarchie

Le thésaurus de Medline : le MeSH

Medical Subject Headings

Mots-clefs uniquement en anglais

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

Le MESH : MEdical Subject Headings

liste de termes normalisés dans le domaine biomédical

outil à utiliser en priorité pour une recherche pertinente

Le MESH

Descripteurs (>25 000)

Qualificatifs (83)

« L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »*

*(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)

Recherche sans les mots-clefs MESH

Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques

multiple sclerosis environmental factors

Recherche avec les mots-clefs MESH

Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques

Environnement ET sclérose en plaques /étiologie

Correspondances Mesh français – Mesh anglais

=> « Mesh bilingue  de l’INSERM » :http://mesh.inserm.fr/mesh/

ou

=> « Portail terminologique de santé » (CISMEF)

http://pts.chu-rouen.fr/

Exercices

1- Rechercher les affiliations descripteurs/qualificatifs correspondant :

à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche

à l’épidémiologie de la maladie de Crohn

Limiter la recherche aux 2 dernières années

Réponses1- Rechercher les affiliations

descripteurs/qualificatifs correspondant :

à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche "Legg-Perthes Disease/surgery"[Mesh]

à l’épidémiologie de la maladie de Crohn "Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]

Adresse de la base Medline (via l’interface Pubmed)

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Ne pas confondre

Exercice

Trouver des articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés dans les 10

dernières années

Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années

"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh]

+ Filters activated : English, French,

published in the last 10 years

Les opérateurs booléens

.

Affichage des résultats

Notice d'article affichée en mode « summary »

Notice affichée en mode « abstract »

3 façons de trouver les bons mots-clefs MESH En naviguant dans l'arborescence

cf. sur le Mesh bilingue de l'INSERM À partir d'un moteur de recherche

Mesh anglais de l'interface Pubmed PTS du Cismef

À partir des mots-clefs déjà attribués à un article qui nous intéresse

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

1) Directement dans la barre de recherche simple

2)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond)

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

3) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

My NCBI : votre Pubmed personnalisé

Ouvrir un compte sur My NCBI « Sign in » « Register for an account »

Paramétrer dans votre compte les filtres suivants Anglais Français Texte intégral gratuit Universite de Bretagne Occidentale Service

commun de documentation

Exercices

2 - Saignement de nez et hypertension

Recherche de références à partir des mots MESH et sauvegarder des références dans MY NCBI

Réponses

2 - Saignement de nez et hypertension

"Epistaxis"[Mesh] AND "Hypertension"[Mesh]

Exercices

3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu. Exclure les traitements médicamenteux et la chirurgie. Limiter aux publications des deux

dernières années

Créer une alerte dans My NCBI

Réponse

3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu. Exclure les traitements médicamenteux et la chirurgie. Limiter aux

publications des deux dernières années

("Acute Coronary Syndrome/therapy"[Mesh]) NOT ( "Acute Coronary Syndrome/drug therapy"[Mesh] OR "Acute

Coronary Syndrome/surgery"[Mesh] )

Alerte My NCBI : cliquer sur « Save Search »

Des mots MESH ?

.

Ne contient pas de mots MESH

Contient des mots MESH

Pubmed advanced search

Interrogation sur un champ en particulier

Historique de la recherche Relancer et combiner les

recherches

Pubmed avanced search Les facteurs environnementaux de la sclérose en

plaques

Recherche dans les champs titres et résumés et exclusion des notices comportant des mots clés

Multiple sclerosis [tiab] AND environment* [tiab] NOT medline [sb]

Exercices

2 - Saignement de nez et hypertension

Recherche de références à partir des mots du titre et du résumé dans le module « Advanced

search » en excluant les références indexées et sauvegarde de la stratégie complète avec veille

mensuelle dans MY NCBI

Réponse

(epistaxis [tiab] OR nasal bleeding [tiab] OR nosebleed [tiab] OR nose bleed [tiab]) AND (hypertension [tiab] OR high blood pressure [tiab]) NOT medline [sb]

Recherche d’informations sur les essais cliniques et la médecine fondée sur les preuves

L’outil « Clinical queries » permet de retrouver :

Questions cliniques Revues systématiques Etudes en génétique médicale

Recherche d’informations sur les essais cliniques et la médecine fondée sur les preuves

Memo Pubmed

1) trouver les bons mots-clefs MESH et la bonne équation de recherche2) limiter et filtrer les résultats en fonction de ses besoins3) accéder au texte intégral via le filtre BU Santé4) paramétrer des alertes automatiques par courriel

Merci de votre attention

Retrouver le diaporama de la formation et les informations sur les autres séances

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02 98 01 64 77

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Les autres formations proposées par la BU Santé- autres ressources en Santé (parce qu'il n'y a pas que Pubmed dans la vie...) :

Cochrane Library Pascal BDSP Cismef EM-Premium etc...

- outils bibliographiques : norme Vancouver et logiciels Zotero/EndNote

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