proteinové inženýrství (josef "faskal" novák)
DESCRIPTION
Genetická modifikace je zajímavá, ale to pravé umění je modifikovat proteiny. Jak vytvořit vlákno silnější než ocel, vymýšlet nové léky? Které metody se používají k určení 3D struktury proteinů, a jak se tyto znalosti používají k navrhování proteinů s novými vlastnostmi?TRANSCRIPT
![Page 1: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/1.jpg)
Proteinové inženýrství Josef „Faskal“ Novák
![Page 2: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/2.jpg)
Dogma molekulární biologie
• Tok informací v buňce
– Kde se může stát chyba? Všude
– Kde ji opravit? Na DNA!
![Page 3: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/3.jpg)
![Page 4: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/4.jpg)
Určování struktury proteinů Krystalografie
• Proč krystaly? Obsahují opakující se jednotky
• Konstruktivní interference (Braggův zákon)
![Page 5: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/6.jpg)
Odbočka - DNA
Nezapomenout:
Šroubek a laserové ukazovátko
![Page 7: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/7.jpg)
Proteiny
![Page 8: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/9.jpg)
• Výpočetně velmi náročné
• Kvalita závisí na kvalitě krystalu a měření
• Může obsahovat chyby
![Page 10: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/10.jpg)
Fold It!
![Page 11: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/11.jpg)
Další metody určování struktury
• Jaderná magnetická resonance
– Hlavně na malé molekuly
• Mrazová elektronová mikroskopie
– Hlavně velké struktury
![Page 12: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/12.jpg)
![Page 13: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/14.jpg)
Celkem
Jenom NMR
Jenom CryoEM
Myoglobin, původní model z plastelíny
![Page 15: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/15.jpg)
GFP
• Aequorea victoria
• První mutace objeveny náhodou, další uměle připravené
• Martin Chalfie, Osamu Shimomura and Roger Y. Tsien 2008 – Nobelova cena
![Page 16: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/16.jpg)
![Page 17: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/17.jpg)
![Page 18: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/18.jpg)
![Page 19: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/19.jpg)
Hledání léků
• Hledání malé molekuly, která by přesně seděla do klíčového místa proteinu
![Page 20: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/21.jpg)
![Page 22: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: Proteinové inženýrství (Josef "Faskal" Novák)](https://reader031.vdocuments.mx/reader031/viewer/2022013102/55958f861a28ab95318b45fb/html5/thumbnails/24.jpg)
Čas na diskuzi