proteinlerin genel ozellikleri ve islevleri

Upload: takaclar

Post on 05-Jan-2016

258 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

kimya

TRANSCRIPT

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    1/45

    PROTENLERN GENELZELLKLER VE

    LEVLER

    Do. Dr. Nurzen SEZGN

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    2/45

    PROTENLER

    Organizmada en yksek oranda bulunan

    makromolekller

    % 70 su% 15 protein% 15 dier

    Total hcre arl

    Amino asitlerin lineer polimerleriC, O, H, N, S

    N ierii % 16

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    3/45

    Proteinlerin fonksiyonlar

    Enzimler Transport (Hb, HDL,transferrin, seruloplazmin,

    albumin)

    Sinir impuls iletimi (nrotransmitter, glutamat...) Kaslma (miyozin, aktin, kas prot.)

    Koruyucu (keratin, phtlama prot, fibrinojen, Igler)

    Hormon (insulin, glukagon...)

    Depo protein (ferritin, myoglobin...)

    Yapsal protein (kollajen, elastin...)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    4/45

    Proteinlerin Snflandrlmas

    I. ekilsel Fibrz Proteinler Suda erimez

    ekilsel olarak dayankl

    uzun lifliyapsal destek grevi

    Globuler Proteinler Suda eriyebilenkresel

    nemli dinamik fonksiyonlar

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    5/45

    II. Bileimlerine Gre Basit Proteinler

    Albumin, keratin (yalnzca aa ierirler)

    Bileik (konjuge) ProteinlerProtein olmayan (prostetik) grup ierirler

    Kh ierenler glikoprotein

    Lipid ierenler lipoprotein Metal ierenler metalloprotein

    Fosfoprotein., hemoprotein ....

    Proteinlerin Snflandrlmas

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    6/45

    PEPTDLER

    Amino asitlerin (20 aa) -amino ve -karboksilgruplarnn peptid balar ile birbirlerine

    balanmasyla oluurlar

    Peptid Ba

    O

    - C N -

    H

    Amid Ba(kovalent ba)

    Lineer amino asit polimerleri

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    7/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    8/45

    R1

    R2

    R1

    R2Karboksil

    grup

    Aminogrup

    Peptid

    Ba

    Peptid Ba Oluumu

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    9/45

    H3N+CHCOO-

    H

    GLSN(Gly) ALANN(Ala)H3N

    +CHCOO-CH3

    H3N+CH

    H

    CHCOO-CH3

    O

    C_N

    H

    H2Okondenzasyon

    reaksiyonu

    Peptid Ba

    Peptid Ba Oluumu

    Glisilalanin (Gly-Ala)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    10/45

    DPEPTD: GLSLALANN

    Glisin Alanin

    N-terminal

    C-

    terminal

    Peptidba

    su

    Amid grubu dzlemi

    Glisilalanin

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    11/45

    Peptid ba

    Ksmi ift ba zellii

    Fizyolojik pHda polar fakat yksz

    Ba etrafnda rotastyon kstl Trans konfigurasyonunda

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    12/45

    .H2N ( )nCOOHAmino asitler

    lineer polimerler:

    Dipeptid, tripeptid

    Oligopeptid

    Polipeptid (10-100 aa) protein

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    13/45

    Proteinlerin yaplarndaki balar

    Kovalent balar

    Peptit balar

    Dislfit balar Kovalent olmayan balar

    Hidrojen balar

    yon balarHidrofob balar (apolar balar)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    14/45

    Peptidlerin zellikleriAmino-terminalN-terminal (sol)

    OC NH - CH -COO-

    CH3

    HCOHCH2CH2 OH3N

    +CH C NH CH -

    (CH3)2

    CH

    CH2

    Karboksi-terminal

    C-terminal (sa)

    Tripeptid: Fenilalanil lsil - treonin (Phe-Leu-Thr)Rezid (amino asit art): Peptid/protein yapsnakatlan amino asit

    Adlandrma: N-terminal(1) C-terminal(n)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    15/45

    3 boyutlu yap, lineer polimerlerin ok farkl ekillerdekatlanmas ve kvrlmasyla oluur

    Her proteinin spesifik birfonksiyonu vardr

    Biyolojik fonksiyonlar,3 boyutlu yapya baldr

    H2N ( )nCOOH (lineer polimer)

    (polipeptid zincir)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    16/45

    Protein yap eitleri

    1. Primer yap

    2. Sekonder yap

    3. Tersiyer yap

    4. Kuaterner yap

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    17/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    18/45

    1. Primer Yap

    Aaler peptid balarylakovalent baldr

    Peptid balar

    yksek sda uzun srekuvvetli asit veya bazlarla

    Enzim (tripsin vb)

    Kimyasal (siyonejen bromr)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    19/45

    2. Sekonder Yap

    Polipeptid omurgasndaki genellikle dorusaldizilite birbirine yakn aa.lerin boluktakidzenlenimine sekonder yap denir

    Polipeptid zinciri tekrarlayan hidrojen

    balaryla korunan dzenli bir yapda bklr

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    20/45

    2. Sekonder Yap

    a) helix

    b) krmal tabaka

    c) dnd) Geliigzel kvrmlar

    Spersekonder yaplar

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    21/45

    a) - helix

    Prolin yapy bozar

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    22/45

    b- Beta krmal tabaka

    Polipeptid zinciri zig zag yaparak uzun ekseni boyunca gerilir

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    23/45

    c -Beta dn

    Polipeptid zincirlerinin skk molekller haline gelmesine yardmcolur. H balar ve iyonik balarla stabilize olur, sklkla proteinyzeyine yakn bulunur

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    24/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    25/45

    3. Tersiyer Yap

    Peptid zincirinin uzayda kendi zerine daha ileri

    derecede katlanp bklerek skk bir biim almasn

    ve bylelikle younlamasn salar

    Globler proteinlerde grlr

    Primer yapda birbirinden uzak yaplar bir araya gelir

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    26/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    27/45

    4. Kuaterner (Drdncl) Yap

    Monomerik protein

    Multimerik protein

    ki veya daha fazlapolipeptid alt birimleri

    Alt birimler

    Benzer/farkl Baml/bamsz

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    28/45

    Protein Molekl AAA

    saysZincir

    says

    nslin 5700 51 2Miyoglobin 16 890 153 1

    Albmin 66 000 550 1

    glutamatdehidrojenaz(GDH) 1 000 000 8300 40

    Baz Protein Yaplar

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    29/45

    Protein Denatrasyonu

    Peptid balar hidroliz olmadan protein yapsnn zlp disorganizeolmas

    Is

    Organik zcler

    Mekanik kartrma Kuvvetli asit/bazlar

    Deterjanlar

    Kurun ve civa gibi ar metaller

    Denatre protein kelir

    Renatrasyon

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    30/45

    Spiral veya heliks eklinde kvrlm,(kovalent ve Hbalaryla apraz balanm) zincirlerden oluurlar Suda erimez

    Kendine zg fakat basit yaplar sayesinde mekanikzellik gsterir

    Kollajen, Elastin, Keratin

    Fibrz Proteinler

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    31/45

    Proteolitikenzimlere

    kar direnlidir

    Kollajen: Birbirine sarlm 3 polipeptidzinciri (l heliks)nden oluur

    Memelilerde total proteinin%30unu tekil eder

    Gly,Ala,Pro,Lysdenzengindir, OHPro,OHLys A

    B

    C

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    32/45

    Kollajen

    Tropokollajen, z helezon Birok farkl genetik tip Karbonhidrat ierir Gly-X-Y

    Yksek ekme gc

    Lifler arasna yerlemi hidroksiapatit kristalleri sertlii verir Kollejenaz

    Scorbt Ehler Danlos

    Osteogenez Imperfekta

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    33/45

    Elastin

    Lastik benzeri zellik Kan damarlar duvarlar, akcier

    Glisin ve alaninden zengin

    Lizin , prolin, Hyp ok , OHLys yok

    Karbonhidrat iermez

    Farkl genetik tipleri yok

    1 antitripsin ntrofil elastaz inh

    eksiklii - amfizem

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    34/45

    Keratin

    Dayankllk ve esneklik kazandrr

    Hidrofobik kalntlar ve dislfid apraz

    balarndan zengindir Sa, trnak

    helix

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    35/45

    Skca katlanm helezon eklinde polipeptidzincirlerden oluurElips, kre

    rnek: Albumin, Miyoglobin, Hemoglobin

    Globler proteinler

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    36/45

    Globler proteinler

    Sentez, transport, metabolizma, savunma gibi

    kimyasal fonksiyonlarn ou enzimler, transport

    proteinleri, baz peptid hormonlar ve Igler gibi

    globuler proteinler ile olur

    Katlanm polipeptidler

    Helix, Beta tabaka, geliigzel kvrm

    oul domenler

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    37/45

    OKSJEN BALAYAN PROTENLER(HEMOGLOBN ve MYOGLOBN)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    38/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    39/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    40/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    41/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    42/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    43/45

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    44/45

    Normal insan hemoglobinleri

    Hb tipi Tetramerik yap Adult (Yetikin) Yenidoan

    Adult

    Hb A

    Hb A2

    2 2 (2 alfa, 2 beta)

    22 (2 alfa, 2 delta)

    % 95-98

    % 2-3

    % 20-30

    % 0.2

    Fetal

    Hb F 22 (2 alfa, 2 gama)

  • 7/17/2019 Proteinlerin Genel Ozellikleri Ve Islevleri

    45/45

    Hemoglobinopati

    Hemoglobinopati, hemoglobin moleklndekiglobin zincirlerinden birinin yapsndabozuklua yol aan bir genetik bozukluktur

    Hemoglobinin biyolojik fonksiyonu deimitir