12-10-29

1

Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund

Proteiner

Vardagsfrågor

•  Vad händer när man permanentar håret? •  Varför stelnar ägg när de kokas? •  Varför klumpar sig mjölk när den surnar? •  Varför luktar det olika när ull och bomull

brinner?

Exempel på proteiner •  Strukturproteiner

hår, naglar, ben •  Lagringsproteiner

äggvita, i fröer, rotfrukter •  Muskelproteiner

aktin, myosin •  Försvarsproteiner

antikroppar, sekropiner •  Peptidhormoner

insulin, glukagon, leptin

•  Enzymer amylas, pepsin, laktas

Myoglobin

I muskler binder syre

12-10-29

2

Aminosyror

Aminogrupp -NH3+

Karboxylsyragrupp -COO- Väte Variabel sidogrupp 20 olika

Enklaste

Opolära sidogrupper Aromatiska

Polära oladdade sidogrupper

Hydroxid -OH Amid -CONH2

12-10-29

3

Cystein

svavel reagerar lätt med tungmetaller stabilisering av proteinstruktur katalys

Laddad sidogrupp

+ Positiv laddning från amin

-  Negativ laddning från karboxylsyragrupp -COO-

Ull och Bomull

Ull - Polymer av aminosyror Innehåller H, C, N, S

Bomull - cellulosa - Polymer av glukos Innehåller H, C, O

Peptidbindning Dipeptid

Kovalent bindning Specialfall av Amidbindning

Proteinstruktur Primärstruktur

Tripeptid

N - C - C

Riktning Amminoterminal / N-terminal Karboxyterminal / C-terminal

Stommen

Di-, tri-, tetra-, etc. peptider Oligopeptider Polypeptider Proteiner

12-10-29

4

Sekundärstrukturer Vätebindningar α-helix

Olika sätt att illustrera α-helix

Proteinstrukturer β-veckstruktur

Utsträckt struktur

antiparalell

Vätebindnigar mellan kedjor antiparalella eller paralella R-grupper upp och ner

Sätt att illustrera β-veckstruktur

12-10-29

5

Proteinstruktur Tertiärstruktur

Ferritin

FA binding protein Lysozym

Den hydrofoba effekten

Vattenstruktur

Störande molekyler opolära

Cysteinbryggor = SS Bryggor = Disulfidbryggor Stabiliserar tertiärstrukturen

Hår? Myoglobin

Prostetisk grupp

12-10-29

6

Proteinstruktur Kvartärstruktur

Cro protein λ-Fag två subenheter

Hemoglobin från människa fyra subenheter

Denaturering

Värme Extrema pH

Organiska lösningsmedel Detergenter

Urea, Guanidiniumklorid Merkaptoetanol

Luft

Vardagsfrågor

•  Vad händer när man permanentar håret? •  Varför stelnar ägg när de kokas? •  Varför klumpar sig mjölk när den surnar? •  Varför luktar det olika när ull och bomull

brinner?