Projektin tulokset Oulussa

Digitointiseminaari17.11.2011

Piia Partanen ja Erno Kuusela

• Oulun yliopiston kasvi- ja eläinmuseoissa kokoelmien digitointi aloitettiin joulukuussa 2010– Digitointiohjeisiin perehtyminen, tunnisteiden

luominen, digitoinnin työprosessien ja tarvittavien kokoelmanhallintaohjelmien kehittäminen

– Aiemmin taulukko-ohjelmiin tallennettujen kokoelmatietojen muokkaaminen

– Digitoinnin yhteydessä tehty jonkin verran näytteiden määritysten tarkistamista

Kasvimuseon sammalkokoelma

• Kasvimuseolla digitointi aloitettiin sammalnäytteistä– Itiökasvien digitointiaste oli alhaisin (3%)– Luotettavasti määritettyjä ja hyvin

paikannettavissa olevia• Aluksi rajaus elinympäristön mukaan• Kotimaiset sekä itärajan takaisten alueiden

näytteet

Tulokset kasvimuseolla

• Projektin aikana näytteitä tallennettiin n. 11 500 kappaletta (15%)

• Digitointia on jatkettu Oulun yliopiston omalla rahoituksella

• Tällä hetkellä sammalnäytteitä tallennettu n. 24 000 kappaletta (32%)

• Nyt sammalkokoelmaa käydään läpi aakkosjärjestyksessä– Ulkomaiset näytteet?

• Kasvimuseolla sammalnäytteitä n. 74 000, joten koko sammalkokoelman digitointi olisi mahdollista n. 3 vuodessa

• Seuraavaksi digitointia myös sienille DNA-barcoding –projektin yhteydessä

Tulokset eläinmuseolla

• Selkärangattomien kokoelman digitointi– Yleinen kokoelma– Tyyppinäytteet– Uunio Saalaan kokoelma

• N.6000 näytettä digitoitu projektin aikana.• Tällä hetkellä kokonaismäärä n. 19 000– Digitointia jatkettu yliopiston omalla rahoituksella

Yleinen kokoelma

• Hyönteiset + muut niveljalkaiset• Muut selkärangattomat (esim. nilviäiset)• 1-2 miljoonaa näytettä• N. 4000 näytettä digitoitu– Pistiäisiä, kaksisiipisiä ja perhosia

• MuseoData –tietokanta (n. 100 000 näytettä)– Pääasiassa perhosia– Yksilöiden löytäminen kokoelmasta hyvin työlästä

Tyyppinäytteet

• 92 näytettä• Kaikki digitoitu ja valokuvattu• Kuvat saatavilla myöhemmin Joensuun

MorphBankin kauttaLahko Näytteitä

Coleoptera 11

Hymenoptera 10

Hemiptera 8

Araneae 2

Lepidoptera 61

Uunio Saalaan kokoelma

• Historiallinen kovakuoriaiskokoelma– 1800-luvun lopulta 1950-luvulle

• Kaikki 16 276 näytettä digitoitu• Kladikirjojen digitointi– Skannaukset saatavilla

http://gbif.oulu.fi/saalas

Tekninen toteutus Oulussa

• Kokoelmanhallintajärjestelmä Specify– Eläinmuseon kokoelmat:• Selkärangattomat ja selkärankaiset

– Kasvimuseo:• Sammalet, sienet (tulossa)

• TapirLink tiedon jakamiseen (GBIF)• HTTP URI –etikettien tulostus ja kirjanpito• HTTP URI –palvelu

Tekninen toteutus Oulussa

Specify

• Hidas massadigitoinnissa näytteet kirjataan Exceliin ja viedään Specifyhin– Oma makropohjainen Excel-taulukko• Kuntatarkistukset, koordinaattimuunnokset ym.

TapirLink ja GBIF• Tiedot suoraan Specifyn tietokannasta ”välivarastoon”

automaattisesti kerran vuorokaudessa • TapirLink käyttää GBIF-jakelussa tätä välivarastoa• Siirron yhteydessä datan karkeistukset ym.– Muunto Darwin Core –muotoon

HTTP URI -tunnisteet

• Kaikki näytteet yksilöity HTTP URI –tunnuksilla– Kasvimuseo: http://id.herb.oulu.fi/0001234– Eläinmuseo: http://id.zmuo.oulu.fi/OE.1234

• Tunnus toimii myös suoraan linkkinä – Uudelleenohjaus gbif.oulu.fi –palvelimelle– Näytteen tiedot HTML-sivuna– Samat tiedot kuin GBIF:n kautta