programa de vigilancia epidemiológica fitosanitaria en...
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Programa de Vigilancia
Epidemiológica Fitosanitaria en la
Roya del Cafeto, México
Tecamac, Edo. de México, 15-19 Agosto, 2016
Gustavo Mora Aguilera, COLPOS-LANREF (Ponente)
Gerardo Acevedo, LANREF
Eduardo Guzmán, LANREF
Juan José Coria Contreras, LANREF
Coral Mendoza Ramos, LANREF
Laura R. Jiménez González, LANREF
Baldemar Santana Peñaloza, LANREF
Rigoberto Gonzalez Gomez, DGSV
Abel Lopez Buenfil, DGSV
Miguel Ángel López Javier, DGSV
Pedro Carraza Velázquez, DGSV
Contacto: [email protected]
Simposio Internacional de Plagas Cuarentenarias
¿Cómo se
concibió el
Modelo?
Concepción del Sistema
1.Orientado a solución del
problema.
2.Sustentable
3.Marco teórico y metodológico
aplicable a otras cadenas.
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
E F M A M J J A S O N D
Inci
den
cia d
e ro
ya d
el c
afé
(%
)
Incidencia 1982-1983 México (aprox. 650 msnm)
CICLO 1982 CICLO 1983 CICLO 1984
A
1982
1983
1984
Detección H. vastatrix
1981 2014
Antecedentes
Baja prevalencia de H. vastatrix
2012 2013
Brote Epidémico Inicio PVEF-Cafeto
Ch
iap
as
Ve
rac
ruz
Ch
iap
as
V
era
cru
z
Pu
eb
la
• Cambio en la intensidad epidémica
• Variabilidad climática
Inicio del PVEF-Cafeto para monitoreo/muestreo regionalde H. vastatrix
Mancha de hiero(Cercospora coffeicola)
Nematodo Lesionador(Pratylenchus coffeae)
Roya del Café(Hemileia vastatrix)
Ojo de gallo(Mycena citricolor)
Ácaro Rojo del Café(Olygonychus coffeae
Brasil, Colombia
Antracnosis (Collecotrichum
kahawae)África, Brasil, Cuba
Cochinilla del café(Planococcus lilacinus)
Guatemala, Centroamérica, África, Asia, Australia
Nematodo agallador(Meloidogyne exigua)
Centroamérica y Caribe
Phoma(Phoma costarricensis)
Minador del café(Leucoptera coffeella)
¿Cual es el
Principio de la
Accionabilidad?
Nivel de sanidadvegetal
Tiempo
Línea de mejora
2010 20……
¿Un nuevo paradigma?SINAVEF
Nivel 1
NIMF 6 y NIMF 8
a) Presencia
b) Ausenciac) transitoriedad
Nivel 2
Caracterización
epidemiológica:
Delimitación y contención
Nivel 3
Monitoreo y accionabilidad:
a) Alerta fitosanitaria
b) Planes de acción
c) DNEd) Campaña Fitosanitaria
Acción en los 3 Principios de Fitoprotección:
1. Exclusión2. Erradicación3. Control
El hongo Hemileia vastatrix es un patógeno del
cafeto (Coffea spp) con un patrón de dispersión
agregada y periodos de patogénesis largos por
lo que exhibe marcados focos regionales los
cuales pueden manejarse con criterios
integrados de accionabilidad epidemiológica de
tres tipos: Pronóstico de intensidad epidémica
de 1ciclo productivo; 2Indicadores epidémicos
quincenales, y 3Alertas tempranas semanales.
Principio de la Accionabilidad
Determinar criterios epidemiológicos
cuantitativos que permitan iniciar en
forma efectiva y oportuna acciones
regionales de control preventivo y
protectivo contra la roya del cafeto,
causado por Hemileia vastatrix, en
regiones cafetaleras México como una
fase inicial de contención del brote
epidémico.
Objetivo
Las Bases
Metodológicas
Características de PVEF1. El PVEF es nivel III:
Detecta + Cuantifica + Acciona
2. La Base Racional es el Sistema Epidemiológico:
Planta, Patógeno, Clima y Manejo
3. Es un Sistema WEB con secciones pública y privada.
4. Opera en la totalidad de los estados cafetaleros (11) a nivel
nacional.
5. Vincula 3 áreas:
Planeación + Operación + Investigación
Recurso humano:
Oficial y planeación (DGSV): 7
Técnicos operativos (CESV): 66
Investigación (COLPOS-INIFAP): 10
Alerta Regional
Alerta Quincenales
Matriz de datos Regional Muestreo Monitoreo WWW.lanref.royacafe.org.mx
Reg-N [6 estados productores]P.e. Chiapas: 80%Has56Mpios
80% Has Café/México
Selección Municipios/Estado
Alerta TempranaCriterios
Accionabilidad
Alerta semanal
Metodología I: Selección de Parcelas de Evaluación
Estado Parcelas Muestreo/semana Parc. Monitoreo/semana
Chiapas 160 80
Veracruz 120 60
Puebla 100 50
Oaxaca - 50
Guerrero 80 40
San Luis Potosí 40 20
Variables de Fenología
(Quincenal)
Ciclo-i
Productivo
(Estatal)
n-ARCOs
(Focos Regionales en Has)
Variables de Daño
(semanal)
Criterios
de
Accionabilidad
Metodología II. Análisis Epidemiológico
Alertas de Precisión (campo)
Alertas de Pronóstico (estimación)
Proyecciones geoestadísticas: Kriging, IDW, IDW2, etc.
Curvas fenológicas y epidémicas: Y0, Yf, Ymax, Xi, …n-Variables.
Vig
ilan
cia
de F
oco
s
Metodología III. Variables y Algoritmos DesarrolladosÍndice/
Indicador
Epidémico Se
v.
Hoja
Incid
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Hoja
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Se
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Ecuación
Pató
gen
o/D
añ
o
Daño
IntegralX X X X X
Severidad Integrada X X
Severidad Planta X
Severidad Hoja X
Defoliación X
Inóculo Potencial X
Índice Epidémico X X X X X X X
Inductividad por
Unidad EspacialX X X X X X X X
Pla
nta
/Fe
no
log
ía
Vigor X X X X
Potencial
ProductivoX X X X X X
Brotación X
Senescencia X X
Juvenilidad X X
Tejido Susceptible X X
Clim
a
#Horas Favorables
de Ínductividad Epid.X X
Horas Favorables de
ÍnductividadX X X
Sist
em
a Ep
idem
io-
lógi
co
La Aplicación
del Modelo
𝐈𝐄 =𝐒𝐇𝐦𝐞𝐝 + 𝐒𝐏𝐦𝐞𝐝 + #𝐇𝐑
𝐒𝐇𝐦𝐚𝐱 + 𝐒𝐏𝐦𝐚𝐱 + #𝐇𝐑𝐦𝐚𝐱
𝐃𝐦𝐞𝐝𝐌𝐚𝐱𝐃𝐦𝐞𝐝
∗ 𝐈𝐏 +𝐒𝐇𝐦𝐞𝐝 + 𝐒𝐏𝐦𝐞𝐝 𝐒𝐇𝐦𝐚𝐱 + 𝐒𝐏𝐦𝐚𝐱
+#𝐇𝐑
#𝐇𝐑𝐦𝐚𝐱+𝐇𝐉
𝐇𝐉−𝐦𝐚𝐱+𝐇𝐉
𝐇𝐉 + 𝐇𝐕Variedades
Clima
ni
Manejo
Agronó-
micoFenología
Roya del
Cafeto
Café
𝒇(𝒚)=𝑺𝑯𝒎𝒆𝒅𝒗𝒊,𝑺𝑷𝒎𝒆𝒅𝒗𝒊,𝑯𝒓𝒇𝒂𝒗𝒗𝒊,𝒇𝒊∗𝑷𝒄𝒊
y0
yf
1. Se han generado y validado un total de 16 algoritmos Epidémicos.
Los cuales se integraron para generar 3 criterios de accionabilidad
>10%<10%
2. Se generó un diagrama de flujo para aplicación de 3 criterios de Accionabilidad
¿Región-j es Inductiva en el Ciclo-i?
Ymed > 15%SH
¿El municipio-k en la región-j esta en zona foco?
SH≈2 y SP ≈ 10% con σ2 ≈ 10%
¿Fenología del predio-z en el municipio-k es propicia
para control?
Fenología ≠ Fruto Maduro
¿Manejo del predio-z es el mínimo requerido para
control?
Manejo = Podas, control sombra, chapeo, etc
¿Cuál es el estatus epidémico de Ymed?
Producto
Protectivo /
Sistémico
Producto
Preventivo/
Contacto
No
Si
No
No
No
Si
Si
Si
Alerta de Ciclo
Alerta Semanal
Alerta Quincenal
𝑆𝑃𝑗 =
𝑖=1𝑛 𝑆𝑃𝑖𝑑𝑖𝑗2
𝑖=1𝑛 1
𝑑𝑖𝑗2
𝑆𝐻𝑗 =
𝑖=1𝑛 𝑆𝐻𝑖𝑑𝑖𝑗2
𝑖=1𝑛 1
𝑑𝑖𝑗2
𝐼𝑛𝐻𝑟𝑓𝑎𝑣𝑝𝑟𝑒𝑑𝑖𝑜−𝑘 = 𝑡…𝑛𝑡1 [(20 > °𝐶 > 22 𝑦%𝐻𝑅 > 90 | 00:00 > 𝐻𝑟𝑠 > 08: 30]
𝑡…𝑛𝑡1 𝐻𝑟𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑒𝑠
-
5.00
10.00
15.00
20.00
25.00
30.00
35.00
40.00
45.00
50.00
55.00
60.00
65.00
70.00
1 2 3 4 5 6 7 8 9 101112131415161718192021222324252627282930313233343536373839404142434445464748495051525354555657585960616263646566676869707172737475
% p
rom
ed
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ev
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da
d f
olia
r / p
lan
ta
Semana
Promedio de %SEV. MED HOJA Promedio de %SEV. MED PLANTA Estimación Sev.Hoja
Estim
ació
n+4
sem
anas
...?
Ciclo Epidémico 2013 Ciclo Epidémico 2014
Y0
Ymax
Yf
Ymax
Yf / Y0
Sev. Planta Sev. Hoja Ind. Hrs. Fav.
𝒇(𝑰𝒖𝒆𝒗𝒊) = 𝑺𝑯𝒎𝒆𝒅𝒗𝒊 , 𝑺𝑷𝒎𝒆𝒅𝒗𝒊 , 𝑯𝒓𝒇𝒂𝒗𝒗𝒊 , 𝒇𝒊 ∗ 𝑷𝒄𝒊
𝑰𝒖𝒆𝒋 =
𝟑∗
𝒊=𝟏𝒏 𝑺𝑷𝒊
𝒅𝒊𝒋𝟐
𝒊=𝟏𝒏 𝟏
𝒅𝒊𝒋𝟐
+ 𝟐∗
𝒊=𝟏𝒏 𝑺𝑯𝒊
𝒅𝒊𝒋𝟐
𝒊=𝟏𝒏 𝟏
𝒅𝒊𝒋𝟐
+ 𝟏∗ 𝒕…𝒏
𝒕𝟏 𝟐𝟎>°𝑪>𝟐𝟐 𝒚%𝑯𝑹>𝟗𝟎 𝟎𝟎:𝟎𝟎>𝑯𝒓𝒔>𝟎𝟖:𝟑𝟎
𝒕…𝒏
𝒕𝟏 𝑯𝒓𝒕𝒐𝒕𝒂𝒍𝒆𝒔
𝟑,𝟐,𝟏
Curvas
Epidémicas1
Parametrización2
Algoritmos
Epidemiológicos3
Análisis Espacial
y Temporal4
Epidemiología
Multivariada y Reg.5
Mapa Multivariado de Alerta Regional
Alertas Quincenales
Critério Accionabilidad 2: Alertas quincenales basadas en hospedero, patógeno y enfermedad
Riesgo Alto: Control
Riesgo Moderado: Inspección
Riesgo Bajo: No action
Indice Epidemico
y = -0.0157x2 + 1.0513x - 2.1075R² = 0.6384
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 10 20 30 40 50 60 70
Sev_Planta vs Var_SevPla (Semana 1-65)
y = -0.0176x2 + 1.1291x - 1.8402R² = 0.6447
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 10 20 30 40 50 60
Sev_Planta vs Var_SevPla (Semana 39-51)
y = -0.02x2 + 1.3646x - 6.8539R² = 0.3863
0
5
10
15
20
25
30
35
40
0 10 20 30 40 50 60 70
Sev_Planta vs Var_SevPla (Semana 52-65)
Veracruz, Sep, 2013 – Ene, 2015 Veracruz, Ago, 2014 – Oct, 2014
Veracruz, Nov, 2014 – Ene, 2015
Criterio 3. Umbrales de Delimitación de Focos Regionales V
aria
nza
Sev
. de
Pla
nta
Severidad de Planta (%) Severidad de Planta (%)
Var
ian
za S
ev. d
e P
lan
ta
Ymax (Sev. Max.)Ymax (Sev. Max.)
Yf (Sev. Final)
Yf (Sev. Final)
0
5
10
15
20
25
0 10 20 30 40 50 60Severidad de Planta (%)
Va
ria
nza
Máxima Varianza
Foco Roya
Umbral de Accionabilidad
Ma
ne
jo
de
Fo
co
Pre
ve
nc
ión
de
Fo
co
y = 0.0018x2 + 0.3874x - 0.624R² = 0.70
0.00
10.00
20.00
30.00
40.00
50.00
60.00
70.00
0.00 10.00 20.00 30.00 40.00 50.00 60.00
% S
eve
rid
ad
en
Ho
ja
% Severidad en Planta
Sev. Planta vs Sev_Hoja
2 3 4Clases
(0%) Puntos cloróticos (2%) (7%) (45%) (≥70%)(20%)
5 6Sev:
Criterio 3: Alerta semanal. Umbrales de severidad para
definir la accionabilidad de control de roya
Fase
Epidémica
Prevención Foco 2016
Control de
Focos
2016
Fase de Focos
Manejo de Focos Regionales: ARCO’s dinámicos en tiempo y espacio
Región Frailesca
Criterio 1. Alerta Regional
Criterio 3: Alerta Semanal
Criterio 2. Alerta Quincenal
WWW.lanref.royacafe.org.mx
Comunicación de Riesgo
Dinámica
Equipos de
Cómputo
Dispositivos
Móviles
Tipos de Análisis
Nacional (+1edo)
-Estatal (+1reg)
-Regional (+1mun)
-Municipal (+1parc.)
-Parcelario
WWW.lanref.royacafe.org.mx
¿Qué hemos
Aprendido?
¿Qué hemos aprendido a 3 años del PVEF-Cafeto?
1. Es posible hacer una vigilancia integral al
cultivo:
Sanidad: 6 Plagas cuarentenarias
5 Plagas de importancia económica
2. El Modelo es rentable:
11% de la inversión en control (2016)
0.09% del valor de la producción (2015)
3. El Modelo es aplicable a otras cadenas
productivas
Plagas bajo vigilancia en el PVEF-Cafeto México
Mancha de hiero(Cercospora coffeicola)
Nematodo Lesionador(Pratylenchus coffeae)
Ojo de gallo(Mycena citricolor)
Ácaro Rojo del Café(Olygonychus coffeae
Brasil, Colombia
Antracnosis (Collecotrichum
kahawae)África, Brasil, Cuba
Cochinilla del café(Planococcus lilacinus)
Guatemala, Centroamérica, África, Asia, Australia
Nematodo agallador(Meloidogyne exigua)
Centroamérica y Caribe
Phoma(Phoma costarricensis)
Minador del café(Leucoptera coffeella)
Roya del Café(Hemileia vastatrix)
Xyllela fastidosa sp paucaCentro América,
Brasil
Mal de Hilachas(Pelilcularia koleroga)
Detección H. vastatrix
1981 2014 2015 20??
Conclusiones
Baja prevalencia de H. vastatrix
2012 2013 2016
Brote Epidémico Inicio PVEF-Cafeto
• Alertas tempranas regionales
Accionabilidad y control
2017
Ch
iap
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Ve
racru
z
Ch
iap
as, V
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cru
z y
Pu
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la
Ch
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Análisis
Rentabilidad
Productiva
Política
cafetalera
Normatividad
oficial
Estudio de
variabilidad
genética
Materiales
genéticos
resistentes
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
E F M A M J J A S O N D
Inci
den
cia d
e ro
ya d
el c
afé
(%
)
Incidencia 1982-1983 México (aprox. 650 msnm)
CICLO 1982 CICLO 1983 CICLO 1984
A
1982
1983
1984
Mancha de hiero(Cercospora coffeicola)
Nematodo Lesionador(Pratylenchus coffeae)
Roya del Café(Hemileia vastatrix)
Ojo de gallo(Mycena citricolor)
Ácaro Rojo del Café(Olygonychus coffeae
Brasil, Colombia
Antracnosis (Collecotrichum
kahawae)África, Brasil, Cuba
Cochinilla del café(Planococcus lilacinus)
Guatemala, Centroamérica, África, Asia, Australia
Nematodo agallador(Meloidogyne exigua)
Centroamérica y Caribe
Phoma(Phoma costarricensis)
Minador del café(Leucoptera coffeella)
• Cambio en la intensidad epidémica
• Variabilidad climática
• Inicio del PVEF-Cafeto para monitoreo/muestreo regional de H. vastatrix
• Atención de focos
• Accionabilidad para control preventivo/protectivo
Conclusiones
En 2015 y 2016 el sector oficial de la SAGARPA, como ente
coordinador y los Comités Estatales de Sanidad Vegetal
aplican los criterios de accionabilidad para el manejo
regional de la roya del cafeto con una inversión aproximada
de 300 millones MN anual.
Este modelo es el primer caso a nivel internacional de control
regional de roya con una base racional epidemiológica
aplicado en un PVEF.
1.
3.
El PVEF es un modelo que integra:
Innovación Talento Vinculación
2.
LANREF-COLPOS
Dr. Gustavo Mora Aguilera, Epidemiología, Coordinador
Ing. Gerardo Acevedo, Análisis Epidemiológico
MC. Eduardo Guzmán, Desarrollador de Sistemas
Ing. Mayra Hernández, Desarrollador de Sistemas
Ing. Coral Mendoza Ramos, Epidemiología
Ing. Laura R. Jiménez González, Epidemiología
Ing. Juan José Coria Contreras, Epidemiología
Ing. Baldemar Santana Peñaloza, Epidemiología
Ing. Verónica Martínez Bustamante, Epidemiología Molecular
Ing. Viridiana López Bautista, Epidemiología Molecular
Dr. Misael Martínez Bolaños, INIFAP
Oficiales DGSV y apoyo Operativo
Dr. Javier Trujillo Arriaga, Director DGSV
MC. Abel López, Director CNRF-DGSV
Ing. Rigoberto González, Coordinador VEF
MC. Miguel Ángel López Javier, VEF
MC. Héctor Valencia, VEF
MC. Ernesto López Pérez, Coordinador Chiapas
Ing. Julio César Matuz Conde, Coordinador Puebla
Ing. Gerardo Utrera, Coordinador Veracruz
Ing. Fernando García Roque, Coordinador San Luis Potosí
Ing. César Prudencio Jiménez, Coordinador Oaxaca
Ing. Antonio Hernández Tinoco, Coordinador Guerrero
Ing. César Octavio Lechuga Acosta, Coordinador Edo. Méx
Ing. Pablo Zúñiga Castillo, Coordinador Hidalgo
Ing. José Carmen Ugalde, Coordinador Jalisco
Ing. Iber Ulises Figueroa Guzmán, Coordinador Nayarit