penyebab penyakit layu stewart pada tanaman … · belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart...
TRANSCRIPT
![Page 1: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/1.jpg)
BAKTERI Pantoea stewartii subsp stewartiiPENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA
TANAMAN JAGUNG DI BALI
I Gede Rai Maya Temaja (NIDN: 0009106204)G.N. Alit Susanta Wirya (NIDN: 0015016802)
Ni Made Puspawati (NIDN: 0016095302)
![Page 2: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/2.jpg)
Penyakit layu stewart (Pantoea stewartii subsp.
Stewartii) : penyakit baru di Indonesia.
Sampai tahun 2006 masih merupakan OPTK A1 (OPT
yang belum ada di Indonesia)
2008 dilaporkan di Sumatera Barat, 2009 : di Lampung,
Jabar, Jateng, Jatim, Gorontalo (KP 9-40%)
Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali
patogen tular benih: menyebar secara luas bersamaan
dengan penyebaran bahan tanaman
![Page 3: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/3.jpg)
• Dapatkah terdeteksi secara molekuler P. stewartii
subsp. stewartii .
• Bagaimana hubungan kekerabatan patogen isolat
Bali dengan isolat sejenis dari wilayah geografi
lain, berdasarkan gen cps
• Bagaimana sebaran geografis penyakit layu
stewart di Bali
PERUMUSAN MASALAH
![Page 4: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/4.jpg)
• Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang
berasosiasi dengan penyakit layu stewart pada
tanaman jagung di Bali.
• Menganalisis hubungan kekerabatan bakteri
penyebab penyakit layu stewart jagung isolat Bali
dengan isolat sejenis dari wilayah geografi lain,
berdasarkan gen cps.
• Menentukan sebaran geografis penyakit layu
stewart di daerah sentra produksi jagung di Bali
TUJUAN PENELITIAN
![Page 5: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/6.jpg)
• Patogen penyebab penyakit layu stewart
• Hubungan kekerabatan patogen isolat Bali
• Peta sebaran geografis penyakit
• Publikasi pada jurnal terakreditasi (JFI)
![Page 7: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/7.jpg)
Pengambilan Sampel dan PenentuanSebaran Geografi Penyakit di Bali
• Survei di semua kabupaten di Bali
• Pengamatan:
• Gejala
• Insiden penyakit
• Intensitas penyakit
• Deteksi patogen dengan ELISA
![Page 8: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/8.jpg)
Identifikasi
• Isolasi Total DNA
• Amplifikasi DNA gen cps
• Sekuensing nukleotida
• analisis filogenetika
Hubungan kekerabatan patogenberdasarkan sekuen gen CPS
![Page 9: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/9.jpg)
Sekuensing
• Analisis sekuen dilakukan PT. Genetika Science Indonesia yang hasilnya diteruskan untukanalisis filogenetik. Penentuan urutan(sekuensing) DNA merupakan prosespenentuan urutan basa suatu segmen DNA.
![Page 10: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/10.jpg)
• Analisis filogenetika menggunakan software Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA 6) dan BLAST dari NCBI.
• Isolat dari Bali dianalisis filogenetiknya bersama dengan isolat dari beberapa negara lain, sehingga dapat diketahuikekerabatannya.
Analisis Filogenetik
![Page 11: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/11.jpg)
Sampel Insiden
Penyakit (%)
Intensitas
Penyakit (%)
Gejala Penyakit
Denpasar 23 10 Terdapat garis kuning membujur sejajar tulang daun
yang lama kelamaan menjadi layu
Tabanan 16 5 Garis kuning membujur sejajar daun.
Gianyar 21 10 Garis kuning tidak beraturan sejajar dengan tulang
daun
Karangasem 11 3 Bercak kuning pada daun dan layu
Persentase Insiden Penyakit Layu Stewart di Provinsi Bali
![Page 12: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/12.jpg)
Morfologi Koloni Bakteri
• Sampel yang berasal dari desa Padang Galak, Denpasar mempunyai bentuk koloni bulat, berwarnakuning dengan eksoselulerpolisakarida yang cukupbanyak.
• Hal ini sesuai dengan apa yang diungkapkan olehSchaad (2001) mengenai morfologi koloni bakteriPantoea stewartii subsp stewartii yaitu koloni padaNutrient agar, bulat, pertumbuhan yang lambat danberwarna kuning, tidak berlendir.
![Page 13: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/13.jpg)
Deteksi Menggunakan PCR
1 2 M 3 4 5 6 7 8
1100bp
Keterangan:[1], [2] Padang Galak Denpasar; [3],[4] Kediri, Tabanan; [5],[6] Blahbatu Gianyar; [7], [8] Manggis Karangasem
![Page 14: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/14.jpg)
Matrik similaritas Pantoea stewarti subsp stewartii isolat Bali dan isolathomologinya yang terdaftar di GeneBank berdasarkan sekuen gen CPS (%)
DOAB 021 (EU215383.1) Kanada : 98,97%DC283 (AF077292.2) USA : 98,97%cpsD (AB894429.1) Jepang: 99,08%DOAB 022 (EU215384.1) Kanada: 99,08%
![Page 15: PENYEBAB PENYAKIT LAYU STEWART PADA TANAMAN … · Belum ada laporan kejadian penyakit layu stewart di Bali ... • Mendeteksi dan mengidentifikasi bakteri yang ... Morfologi Koloni](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022052204/5c8a590809d3f2ac578c9221/html5/thumbnails/15.jpg)
Filogeni kekerabatan P. stewartii subsp stewartii isolatBali terhadap isolat-isolat homologinya