pengantar bioinformatika

8/10/2019 PENGANTAR BIOINFORMATIKA

1/22


2/22

WHAT IS BIOINFORMATICS?

TI: The use of computer technology to collect, analyze, and interpretbiological information at the molecular level/ Molecular Biology /

Biotechnology BIOLOGI: The mathematical, statistical and computing methods that aim to

solve biological problems using DNA and amino acid sequences andrelated information."

A set of software tools for molecular sequence analysis

Ilmu yang mengaplikasikan teknologi informatika yaitu teknologi komputasidan komunikasi terutama internet pada ilmu biologi


3/22


4/22

BIOINFORMATIKA vs BIOLOGI

KOMPUTASI


5/22

HISTORY


6/22

DAYHOFF

Dr. Margaret Oakley Dayhoff (1925-1983)pionir

dalam penggunaan komputasi di bidang kimia dan

biologi

Dianggap sebagai salah satu penemu

Bioinformatics 1961Membuat alat untuk membantu

menentukan sekuen asam amino dengan

overlapping sekuen asam amino (Point Accepted

Mutation).

Inisiator "Atlas of Protein Sequence and Structure"


7/22

NEEDLEMAN WUNSCH

NeedlemanWunsch melakukan Global

Alignment terhadap 2 sekuen

Algoritma ini diusulkan oleh Saul Needleman

and Christian Wunsch yang dipublikasikan pada

artikelA general method applicable to the

search for similarities in the amino acid

sequence of two proteins, J Mol Biol. 48(3):443-53.

Untuk sekuen protein dan nukleotida

Dynamic programming, aplikasi pertama

perbandingan (comparing) sekuen biologi


8/22

STADEN

Dikembangkan oleh Rodger Staden di Cambridge, Inggris

Sequence Data Handling by Computer

Metode komputerisasi untuk penyimpanan (storage), editing dan analisis sekuenDNA dan asam amino


9/22

GENBANK OLEH NIH


10/22

NCBINATIONAL CENTER BIOTECHNOLOGY INFORMATION

Computerized information processing methods for the conduct of biomedicalresearch

www.ncbi.nlm.nih.gov

Division of the National Library of Medicine (NLM) at the National Institutes of Health(NIH).


11/22

EMBNET NETWORK

Since its creation in 1988, EMBnet has evolved from an informalnetwork of individuals in charge of maintaining biological

databases into the only organization world-wide bringing

bioinformatics professionals to work together to serve the

expanding fields of genetics and molecular biology.


12/22


13/22

EMBL-EBI

European Molecular Biology Laboratory EBI (European Bioinformatic Institute)


14/22

FIRST BACTERIAL GENOME

Haemophilus influenzae: 1380 kb


15/22

HUMAN GENOME PROJECT (HGP)

3 milyar pasang basa =

2.0 1013meters


16/22

LI

STOFURL

S

FORS

EQ

UENCE

DATABASE


17/22

Pemanfaatan Bioinformatika

mengungkap bagaimana kode genetikditerjemahkan untuk membentuk komponenmakhluk hidup (manusia, hewan, tumbuhan,mikrobia, virus) ?

memprediksi fungsi gen

melacak letak kerusakan gen yangmengakibatkan penyakit genetik

menelusuri evolusi biologi dari organisme mencari kesamaan genetik di antara

berbagai macam organisme


18/22

Pemanfaatan Bioinformatika

membantu identifikasi DNA dalam forensik menyempurnakan diagnosa penyakit dan

terapi gen

membantu perancangan obat baru

memperlancar proyek pemetaan fungsionalgenome manusia (Human Genome Project)sehingga selesai 2 tahun lebih awal

memudahkan kegiatan rekayasa genetika


19/22


20/22

MOLECULAR AND MEDICAL RESEARCH

LIPI

BIOTEKNOLOGI

http://www.lipi.go.id

BIOFARMAhttp://www.biofarma.co.id

EIJKMAN

http://www.eijkman.go.id

BIOTROPhttp://www.biotrop.org

RSHS - Patologi

http://www.rshs.or.id

BPPThttp://www.bppt.go.id

BB BIOGEN

biogen.litbang.deptan.go.id

UNIVERSITASSANBEFARMA

SCI (Stem Cell & Cancer

Institute)

KALBEFARMA

MOCHTAR RIYADI RESEARCH

CENTER - SINGAPORE


21/22

INDUSTRI

(Charon Pokhpan- CPB) Udang

(Astra Agro Lestari) Kelapa sawit

(Bisi International) Jagung

(EWINDO) Bibit Sayur Mayur

(LONSUM) Kelapa Sawit

POLICE DEPARTEMENT

Fingerprintmolecular identification


22/22

pengantar bioinformatika

Documents