panorámica de las metodologías de investigación asignatura: metodologías de investigación...

Panorámica de las Metodologías de InvestigaciónPanorámica de las Metodologías de Investigación

Asignatura: Metodologías de Investigación

Universidad de Salamanca (Curso 2014-2015)

Javier Burguillo

Tema 0

Panorámica de la asignatura


Partes de la asignatura

• Prácticas: a) Discusión de casos prácticos.

b) Hacer un trabajo de investigación personal (del tipo: revisión sistemática con meta-análisis)

c) Presentar trabajo en formato revista y disertación oral (en español o en inglés)

• Módulo 1: Diseño de un proyecto de investigación.

• Módulo 2: Cómo se realiza un trabajo de Investigación y se analizan sus datos

• Módulo 3: Presentación de los resultados como publicación en revista y disertación oral.


Plan de trabajo de la asignatura

• Sesiones teóricas: Exposición de cada tema con diapositivas y demostraciones por ordenador

• Sesiones prácticas: Casos prácticos y realización de un tema de investigación a lo largo del cuatrimestre (en los portátiles de los alumnos)

• Las sesiones teóricas y las prácticas se irán intercalando a lo largo del curso.

• Cada grupo de 3 alumnos elegirá un tema de investigación de entre los sugeridos en una lista de proyectos.


• Presentación de un trabajo de investigación en formato revista y como disertación oral

Evaluación

Documentos y tutorías • Diapositivas de clase en: http://simfit.usal.es/burguillo

• Mensajes en: [email protected]

• Tutorías: Dpto. Química Física, Facultad de Farmacia


Panorámica de los módulos de la asignatura


Módulo 1

Diseño de un proyecto de investigación


Investigación= Método Científico

Pregunta

Hipótesis

Observaciones, Medidas

•Análisis de datos (Estadística)

•Conclusiones

•Validación Hipótesis

Módulo 1


Pregunta a investigar y Antecedentes Bibliográficos

Diseño de experimentos

Obtención datos

Exploración de datos

Análisis de datos : tests estadísticos, ajuste de curvas ... etc

Etapas de una investigación

Discusión y conclusiones

Módulo 1


Pregunta a investigar(Según es la pregunta así es la metodología a emplear)

Módulo 1

• ¿Qué características tienen los pacientes de infarto en Salamanca? (estadística descriptiva)

Estudios observacionales

• ¿Es más efectivo un nuevo fármaco que otro de referencia? (t student, Ji cuadrado, ANOVA, )

• ¿Cuánto vale la Dosis Eficaz 50 de un fármaco? (ajuste de la ecuación logística por regresión no lineal)

Estudios experimentales


Antecedentes sobre el tema (Búsquedas bibliográficas)

• Bases de datos: PubMed, CINAHL, Cochrane Library, etc.

• Técnicas de búsqueda: AND, OR, NOT, etc.

• Tomar nota de las búsquedas, imprimir los artículos de interés.

• Gestor de citas bibliográficas: RefWorks

Módulo 1


Página de inicio de PubMed

Módulo 1

Caja para escribir los términos en “Búsqueda básica”

Ayudas Búsquedas específicas: por autor, por clínica..

Búsquedas por MESH, ensayos clínicos……

Lanza la: “Búsqueda avanzada”


Módulo 1

Búsqueda basica en PubMed

Filte

rs

Demasiados


Módulo 1

Búsqueda avanzada en PubMed


Módulo 1

Búsqueda avanzada en PubMed

Reducido de 8839


Guardar búsquedas en MyNCBI (Darse de alta)

Módulo 1


Guardar búsquedas en MyNCBI

Guardar búsquedas con nombres

• Configurar actualizaciones y alertas

Módulo 1


Gestores de citas bibliográficas(Programa RefWorks)

Módulo 1

1) Darse de alta dentro WIFI USAL (gratis)

2) Crear carpetas

3) Importar citas


Incorporando citas a un documento (MS Word y RefWorks a la vez: Write-N-Cite)

Módulo 1


Haciendo la bibliografía de forma automática con RefWorks

Bibliografía

AbleBits (2008) Add-in tools for excel. WWW document. URL: http://www.ablebits.com/about-us.php. ASTERIAS (2008) Applications for the analysis of genomic data. WWW document. URL: http://asterias.bioinfo.cnio.es/.

Bardsley, W.G. (2009) SIMFIT statistical package. university of manchester (U.K.). WWW document. URL: http://www.simfit.man.ac.uk.

Bax, L., Yu, L.M., Ikeda, N. & Moons, K.G. (2007) A systematic comparison of software dedicated to meta-analysis of causal studies. BMC Medical Research Methodology, 7, 40.

Benjamini, Y. & Hochberg, Y. (1995) Controlling the false discovery rate: A practical and powerful approach to multiple testing. J. R. Statis. Soc. B. 57, 289-300.

Breitling, R. & Herzyk, P. (2005) Rank-based methods as a non-parametric alternative of the T-statistic for the analysis of biological microarray data. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 3, 1171-1189.

Breitling, R., Armengaud, P., Amtmann, A. & Herzyk, P. (2004) Rank products: A simple, yet powerful, new method to detect differentially regulated genes in replicated microarray experiments. FEBS Letters, 573, 83-92.

Módulo 1


Estrategia para manejar bibliografía

PubMed (Medline)

MyNCBI

RefWorks

Word + RefWorks

Imatinib AND microarray*

Búsqueda_Imatinib(21-9-08)

Citas_Imatinib

Imatinib_trabajo.doc

Módulo 1


Recopilar separatas importantes (pdf, fotocopias,.... )

• Descargar texto completo en pdf en PubMed

• Revistas electrónicas en USAL(http://bibliotecas.usal.es)

• Servicio de peticiones USAL (a través de la Facultad o Departamento)

Módulo 1


PoblaciónConjunto todos los individuos

Inferencia estadística

Media ()

Desviación Estándar ()

Media

Desviación Estándar (s)

x

Diseño de la Investigación: especificar Diseño de la Investigación: especificar población y muestrapoblación y muestra

Módulo 1

MuestraSubconjunto individuos


Reconocer el tipo de Reconocer el tipo de variable del proyectovariable del proyecto

Variable cualitativa (categórica) Variable cuantitativa (de escala)

Dolor

( 1= leve 2=moderado 3=severo )

Grupo sanguíneo (0, A, B, AB)

OrdinalNominal

Módulo 1

ContinuaDiscreta

Nº de fracturas

(1 ,2 , 3,...,7,...)

De intervalo

(Temp. ºC)

(-10, 0, 10)

De razón

(Temp. K)

(273, 283..)


Programar objetivo y diseñar el experimento

1) Medir presión sistólica en pacientes tratados con un fármaco frente a pacientes tratados con placebo.

Módulo 1O

bjet

ivo

Dis

eño

1. Diseñar el tamaño de muestra necesario para detectar una diferencia relevante clínicamente.

2. Decidir el tipo de muestreo: Aleatorio simple, aleatorio estratificado, por cuotas


Solicitud de un proyecto1) Título

2) Resumen

3) Introducción(Antecedentes bibliográficos, identificación del nicho a investigar,

justificación, interés y originalidad del tema elegido)

4) Objetivos (general y particulares)

5) Materiales y métodos a utilizar (Reactivos, pacientes (población y muestreo), tamaño de muestra,

diseño de experimentos)

6) Plan de trabajo y cronograma

7) Presupuesto

9) Referencias bibliográficas

Módulo 1


Módulo 2

Realización de la investigación y análisis de datos


En estudios observacionales

• Recopilación de datos

Edad Presión sistólica

Glucosa Colesterol total

Triglicéridos

52 13.2 140 280 120

• Calibrado de las técnicas analíticas

En estudios experimentales

• Medidas concentración-tiempo, dosis-repuesta, etc.

Módulo 2


Estudios observacionales Recopilación de datosRecopilación de datos

Sexo Grup.S. P.Sistol. P. Diast. Nº fracturas Dolor [Colesterol]

H A 13.5 8.8 2 1 140

M B 13.4 7.2 1 3 170

M AB 16.3 7.8 3 2 120

H A 13.8 6.8 4 1 135

M B 14.7 8.3 2 1 270

H B 9.3 7.3 3 2 240

M A 12.8 7.9 1 3 150

M O 10.8 8.2 4 1 210

H A 13.8 7.9 3 2 350

…. …. …. …. …. …. ….

Módulo 2


Tabulación de Tabulación de frecuenciasfrecuenciasExploración de datosExploración de datos

Grupo Sanguineo

Frecuencia absoluta

Frecuencia relativa

(%)

0 25 50

A 17 34

B 5 10

AB 3 6

Diagrama de sectoresDiagrama de sectores

Diagrama de barrasDiagrama de barras Con variables cualitativasCon variables cualitativas

o variables cuantitativas discretaso variables cuantitativas discretas

Módulo 2


Tabulación de frecuenciasTabulación de frecuencias

P. Sist.

13.5

13.4

16.3

13.8

14.7

9.3

12.8

10.8

13.8

….etc

Intervalo de clase

Centro intervalo

Frecuencia absoluta

9.30-10.13 9.72 1

10.13-10.96 10.55 1

10.96-11.79 11.38 3

11.79-12.62 12.21 8

12.62-13.45 13.04 11

13.45-14.28 13.87 9

14.28-15.11 14.7 6

15.11-15.94 15.53 7

15.94-16.77 16.36 2

16.77-17.60 17.19 2

P. Sist.

9.3

10.8

11.0

11.1

11.1

11.8

11.8

12.1

12.3

….etc

Con variable cuantitativa continuaCon variable cuantitativa continua

Se ordenanValores

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Histogramas de frecuenciasHistogramas de frecuencias

Con variable cuantitativa continuaCon variable cuantitativa continua

Módulo 2


De dispersión:

n

xi

22 )(

:Varianza

100 .V. : variacióneCoeficient

C

2:estándar Desviación

De tendencia central:

n

xi:Media

frecuenciamayorconvalor:Moda

6.17,...3.14......5.13,......0.11,8.10,3.9

: ordenadaserieladecentralvalorMediana

MedianaMitad inferior Mitad superior

Con variable cuantitativa continua medida en la población

Indices que caracterizan una distribución Indices que caracterizan una distribución de frecuenciasde frecuencias

Exploración datosExploración datos

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Indices de distribución frecuenciasIndices de distribución frecuencias

De posición :

9.3,10.8,11.0,....12.6….13.0,13.3,13.3…..13.5,….14.0,14.1,14.3,…14.7….16.3,17.5,17.6

Cuartiles: valores que dividen a los datos en 4 partes iguales

Se ordenan los valores de presión sistólica de menor a mayor

Q1=12.60 Q2=13.50 Q3=14.78

Percentiles: son los valores que dividen a los datos en 100 partes iguales

( P20 significa que el 20 % de los valores están por debajo de ese valor)

Hincapié : Q2 = Mediana = P50

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Diagramas de caja Diagramas de caja

mediana

Q1

Q3

Extremo superior

Extremo inferior

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos La distribución normalLa distribución normal

Normal Normal estandarizada:

)( i

i

xz

:adosestandariz valores

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Estimación de una media con límites Estimación de una media con límites de confianzade confianza

:. ndoGeneralizan

μ en veces % 95 un caemuestra cualquier demedia La

2

n

szx

Estima de de la población desde una muestra grande:

Donde:

zdesvío para riesgo

96.1z

Donde:

),( t “t” Student con grados de libertad y riesgo

n

n

stx ),(

Estima de de la población desde una muestra pequeña:

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Tipos de barras de errorTipos de barras de error

n

stx

n

stx

n

stxsx

3 datos LC 95%

3 datos barras 1s

sx sx

7 datos LC 95%

7 datos barras 1s

30 datos LC 95%

30 datos barras 1s

Módulo 2


Exploración de datosExploración de datos Correlación entre 2 variablesCorrelación entre 2 variables

Recta de regresión de y sobre x:

)(, xxbyy xy

nxxnyxxyb xy 22

,

Recta de regresión de x sobre y:

)(, yybxx yx nyynyxxyb yx

22,

Coeficiente de correlación:

yxxy bb ,, r Test de independencia:

2r-12-n

rt orrelaciónC),(t t si c

ciaIndependen),(t t si c

)2n(

Módulo 2


Eligiendo el Test estadísticoEligiendo el Test estadístico

•Test de Kolmogorov-Smirnov para probar si datos siguen una distribución (NP)

•Test de SW para probar si datos siguen una distribución normal (NP)•Test “t” de comparación de la media de los datos con una media teórica (P)

•Test “t” de comparación de 2 medias con datos independientes (P)

•Test “t” de comparación de 2 medias con datos apareados (P)•Test “U” de Mann-Whitney comparación 2 grupos datos independientes (NP)•Test de rangos con signos de Wilconxon 2 grupos apareados (NP)

•Test F o test de Levene de comparación de 2 varianzas (P)

¿Qué tests se pueden hacer con 1 muestra?: 15.2, 16.3, 17.2, 16.1,...........15.7

15.2, 16.3, 17.2, 16.1,...........15.7

14.1, 13.3, 14.2, 13.1,...........12.7¿Qué tests se pueden hacer con 2 muestras?:

Variables de tipo cuantitativo

Módulo 2


Estudios observacionales: Tests estadísticos. Por ejemplo: comparación Por ejemplo: comparación de 2 medias en muestras pequeñas por el test “t de student”de 2 medias en muestras pequeñas por el test “t de student”

21 21

222

211

nnnn1)s-(n1)s-(n

XXT

112

21

tT 2colas-)- 0.05,(c

(p<0.05)

Test “t” de datos independientes de tipo bilateral

Distribuciones normales Misma varianza

15.2, 16.3, 17.2, 16.1,...........15.7

14.1, 13.3, 14.2, 13.1,...........12.7

Si...

(Las medias en las poblaciones de hombres y mujeres son iguales)

Si...

•Se quiere determinar si la presión sistólica en hombres y mujeres de Salamanca es la misma•Se toman 2 muestras al azar de hombres y mujeres de Salamanca:

Hombres Mujeres

tT colas-) 2-0.05,(c

(Las medias en las poblaciones de hombres y mujeres no son iguales)

Módulo 2

Prerrequisitos:

Estadístico “T”

H0 = No hay diferencia H1 = Si hay diferencia


•ANOVA para comparación de n medias •Test de Kruskal-Wallis para comparación de n medias

•Test Ji-cuadrado y Fisher exacto para tablas de contingencia. •Análisis de proporciones: riesgos, odds, odds ratios, metaanálisis.

¿Qué tests se pueden hacer con tablas de contingencia y proporciones?:

¿Qué tests se pueden hacer con n grupos?:15.2, 16.3, 17.2, 16.1,...........15.7

14.1, 13.3, 14.2, 13.1,...........12.7

11.1, 12.3, 17.2, 16.1,...........19.7

Hipertensión Normal

Fuman 83 21

No fuman 37 69

Módulo 2


Tipos de estudios clínicos

1. Comunicación de un caso.

2. Series de casos.

3. Estudios transversales

4. Estudios de Cohortes.

5. Estudios de “Casos y Controles”.

6. Ensayos Clínicos.

Módulo 2


Análisis de resultados en Estudios de Cohorte (tabla de contingencia 2 x 2)

Factor de riesgo

Efecto

Infarto si Infarto no

Fuman si a b

Fuman no c d

baa

P

1

dcc

P

2

Riesgo Infarto (en fuman):

Diferencia de riesgos (o riesgo atribuible al factor de riesgo): 21 PPD

Riesgo relativo:

2

1

PP

R

Numero Necesario a Tratar: 21

1PP

NNT

Riesgo Infarto (en no fuman):

Se analiza prospectivamente un grupo de personas con un factor de riesgo (cohorte expuesta) y otro grupo sin el factor de riesgo (cohorte no expuesta), y se va observando en cada una de ellas la aparición del efecto o enfermedad.

Módulo 2


Ejemplo: Curvas Dosis-RespuestaEjemplo: Curvas Dosis-RespuestaAjuste de curvas experimentales

Parámetro Valor Error est. ..95% conf. lim. .. A 9.989E-01 7.86E-03 9.83E-01 1.01E+00 B 9.890E+00 3.33E-01 9.21E+00 1.06E+01 k 9.881E-01 2.68E-02 9.33E-01 1.04E+00

Parámetro Valor Error est. ..95% conf. lim. ..C(50%) 2.319E+00 4.51E-02 2.23E+00 2.41E+00

ktBeA

C 1

Módulo 2


Módulo 3

Presentación de los resultados


Publicación de resultados en formato revista (Word-RefWorks)

• Título• Autores• Resumen• Introducción• Materiales y Métodos• Resultados y Discusión• Conclusiones


Publicación en formato revista

Módulo 3


Disertación oral con Power Point

• Preparación de una plantilla para todas las diapositivas.

• Formatos de diseño.

• Animaciones de las diapositivas

• Estrategias para presentaciones orales.

Módulo 3


Módulo 3

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