panorama de l'information scientifique et technique pour le doctorant

©Club photo et Maxime Storn

Panorama de l'Information Scientifique et Technique pour le doctorant

L'intégrale

Céline Andrieu, Alain Marois – Bibliothèque Michel SerresPhilippe Eyraud – Bibliothèque du LMFA

(épisode 1 + épisode 2)



Episode 1


Formation Doctorants Episode 1 - Bibliothèque 16/05/11 216/05/2011

La lourde tâche du doctorant...

Rédiger sa thèseRédiger et publier

des articles

Préparer sa vie professionnelle

Valoriser son travail

Se faire connaître, entrer dans un réseau

Assister à des séminaires

Participer à des congrès

http://bibli.ec-lyon.fr/


Mais il n'est pas si seul !

Collège des pairs (évaluation)

Équipe de recherche

Outils à sa disposition

Autres doctorantsAssistance de la bibliothèque,

d'un documentaliste



Vraiment pas seul...

Collège des pairs (évaluation)

Équipe de recherche

Outils à sa disposition

Autres doctorantsAssistance de la bibliothèque,

d'un documentaliste

Vague connaissance croisée sur un autre campus du PRES

Geekette sympa rencontrée à la machine à café

« Le type là-bas qui connaît LaTeX »La secrétaire du Pr. X,

« super calée en Word »



Objectifs de cette formation

Episode 1

● Se situer dans l'environnement de l'IST

● Optimiser l'utilisation des sources d'information

scientifiques et techniques

● Comprendre l'évaluation de l'information scientifique

● Mettre en place une stratégie de veille



Objectifs de cette formation

Episode 2 :

● Organiser son travail bibliographique

● Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans

sa production, en fonction du logiciel choisi

● Publier et archiver sa production



Se situer dans l'environnement de l'IST



Qu'est-ce que l'IST ?

« L'information scientifique et technique (IST) regroupe l'ensemble des informations produites par la recherche et nécessaires à l'activité scientifique comme à l'industrie ». (Ministère de l'Enseignement supérieur)

L'IST couvre tous les secteurs scientifiques et techniques et se présente sous de multiples formes.



IST

articles, revueset ouvrages scientifiques

BDD bibliographiques

spécifications techniques décrivant des processus de fabrication

banques de données brutes

notices de brevet

archives ouvertes et entrepôts de données accessibles sur internet

normes

documentation technique accompagnant les produits

portails

littérature grise : thèses, pre-prints, rapports, actes de congrès...

« Information Scientifique et Technique »



Positionnement du doctorant

Produire l'ISTPublierArchiver

Analyser le sujetRechercher et évaluer l'information

Mettre en place une stratégie de veille

Gérer l'information

=> penser « flux »



Optimiser l'utilisationdes sources d'informationscientifiques et techniques



1. Le kit de survie

Les moteurs de recherche scientifiques sur le web

Les Techniques de l'ingénieur

Les catalogues de bibliothèques



Choisir des sources d'informations http://bibli.ec-lyon.fr/ressourcesElec/ressourcesElec.php

Les sources d'info les plus pertinentes

Accès aux sources d'informations depuis le site de la bibliothèque


http://bibli.ec-lyon.fr/ressourcesElec/ressourcesElec.php


Les Techniques de l’Ingénieur : recherche avancée

Encyclopédie spécialisée en sciences et techniques

Formulaire de recherche avancée

Veille technologique et actualités


http://www.techniques-ingenieur.fr/


Les Techniques de l’Ingénieur : résultats



Les Techniques de l’Ingénieur : article

Article au format PDF

Accédez à des données et services complémentaires en vous identifiant : biblio; signets,...



Les Techniques de l’Ingénieur : traducteur multilingue

Champ de recherche

http://www.techniques-ingenieur.fr/lexique.html


http://www.techniques-ingenieur.fr/lexique.html


Les catalogues

des bibliothèques localisées sur le campus ECL

des bibliothèques de l'enseignement supérieur et de la recherche en France : universités, grandes écoles...

de plus de 70 000 bibliothèques dans le monde

Pour trouver des livres, revues, thèses...



Le catalogue des bibliothèques du campus ECL :Bibliothèque Michel Serres et bibliothèques de laboratoires

http://doc.ec-lyon.fr

Un « catalogue », cela permet de trouver une référence (ex : le titre d'un livre) et d'accéder au document (ex : le livre papier ou électronique)


http://doc.ec-lyon.fr/


Catalogue des bibliothèques du campus ECL : recherche experte

Localisation des exemplaires sur le campus1

2

Pole + Cote => vous trouvez le document



Le SUDOC, Système universitaire de documentation

http://www.sudoc.abes.frLa recherche avancée : évitez le bruit informationnel (les « bons » résultats noyés dans la masse)

Choisir un type de document

Trouvez tout ce que peuvent avoir les différentes bibliothèques participantes


http://carmin.sudoc.abes.fr/aidesudoc/FR/accueil/aidesudoc_index.html

http://www.sudoc.abes.fr/


Le SUDOC : résultats et localisation

Localisaction des exemplaires sur la France

1

2

3

Types de documents

Trouver ce livre en France

Vous pouvez emprunter gratuitement dans les principales BU de Lyon (Insa, Lyon1,2,3, ENS,...); sinon, pensez au Prêt Entre Bibliothèques(PEB)


http://bibli.ec-lyon.fr/index.php?rubrique=services&ssRubrique=pebBiblio


WorldCat http://www.worldcat.org/


http://www.worldcat.org/?lang=fr


Focus : rechercher et consulterdes thèses imprimées ou électroniques



Comment consulter une thèseLes thèses soutenues en France (recensées dans le

SUDOC) peuvent être consultées :

● sous forme imprimée dans la bibliothèque de

l’établissement de soutenance (possibilité de faire un PEB)

● sous forme électronique sur le site des bibliothèques ou

sur TEL-Thèses en ligne



Coming soon...


http://www.abes.fr/abes/page,667,portail-des-theses.html


STARApplication qui permet de traiter et diffuser les thèses soutenues en France



Portail européen des thèses électroniques, dont les thèses françaises déposées dans STAR depuis 2009

http://www.dart-europe.eu


http://www.dart-europe.eu/basic-search.php


Trouver une thèse dans le SUDOC : recherche

Choix du type de document


http://www.sudoc.abes.fr/


Trouver une thèse dans le SUDOC : résultats

Thèse électronique

Thèse imprimée

1

2

3

Lien vers la thèse électronique



Consulter une thèse électroniquesur TEL – Thèses en ligne

● Sous-ensemble de l'archive ouverte française HAL : serveur d'auto-archivage● Dépôt des thèses françaises● Objectif : rendre rapidement et gratuitement disponibles des documents scientifiques

http://tel.archives-ouvertes.fr/

Attention : dépôt volontaire par le doctorant (ou via le circuit de la thèse électronique pour l'ECL par exemple)...

...donc si toutes les thèses de TEL sont signalées dans le Sudoc, tout ce qui est dans le Sudoc n'est pas dans TEL !


http://tel.archives-ouvertes.fr/


Les moteurs de recherche scientifiques

Elsevier ...2001

Google ...2004



Des outils parmi d'autres....


http://www.allconferences.com/

http://www.osti.gov/scienceconferences/

http://oaister.worldcat.org/

http://citeseerx.ist.psu.edu/

http://www.academicindex.net/

http://www.intute.ac.uk/

http://scholar.google.fr/

http://www.scirus.com/srsapp/aboutus/

http://www.sciseek.com/

http://www.scitopia.org/scitopia/


« Scientific information only » ?


http://scirus.com/


Que peut-on y trouver ?

Sites « de qualité » indexés

Silos de données indexés

Précisions sur les sources



Gérer la multiplicité des sources



Trier par type de fichiers

Contrôle des sources

Disciplines (algorithme)




http://www.scirus.com/srsapp/search?q=%22photonic+crystal%22+microlaser&t=all&sort=0&g=s


« Un jeune homme brillant,mais inconstant... »


http://scholar.google.com/


● Simplicité + rapidité

● Facilite l'accès au texte intégral

● Index de citations => ranking, « bibliométrie »

● Large couverture

● Gratuité...

Brillant !



● Nombre de résultats variables

● Opacité (Sources ? Couverture ?? Algorithme ???)

● Affiliations ?

● Métadonnées (auteurs,...) laissant à désirer

● Peu d'options avancées

Inconstant...




http://scholar.google.fr/scholar?hl=fr&q=microlaser+%22photonic+crystal%22&lr=&as_ylo=&as_vis=0


Pensez-y : les opérateurs de GS



Résultats Google Scholar via la « recherche universelle » Google



Focus : Archives ouvertes( HyperArticles en Ligne, arXiv.org)



HAL permet un dépôt et un signalement rapide des articles, colloques,...par les chercheurs eux-mêmes


http://hal.archives-ouvertes.fr/


HAL est une « archive ouverte » incarnant en France le mouvement dit du libre accès à l'information scientifique (Open Access). Généralise le modèle historique qu'est arXiv.org


http://www.earlham.edu/~peters/fos/overview.htm

http://arxiv.org/


2. Approfondir sa recherche avec

Pour trouver des articles, pre-prints, actes de congrès...

des bases de données bibliographiques

des portails d'accès aux revues scientifiques : accès ECL et CNRS



Les bases de données bibliographiques



Scopus

● BDD pluridisciplinaire créée en 2004 par Elsevier

● Donne accès à de nombreuses références scientifiques

issues de :

● revues à comité de lecture

● sites internet de qualité (< Scirus)

● bases de brevets



Outil similaire...

● au Web of Science, mais couverture + large (+ de 18000

revues)

● à Google Scholar, mais + performant (bonne gestion des

auteurs, citation tracking…)

● Outre la recherche par sujet, elle fournit des indicateurs

pour évaluer la production scientifique d'un auteur ou

d'une institution, une revue (citations depuis 1996)



Scopus : recherche de document

Choix du champ d’interrogation

Combiner ses mots-clés

Appliquer des limites


http://www.scopus.com/home.url


Scopus : résultats

Accès direct à l'article*

Affiner ses résultats

Résultats sur le web, dans les brevets...

Résultats dans Scopus

* le lien pointe vers l'article sur le site web de la revue; l'accès n'est effectif que si l'ECL est abonnée à la revue via la bibliothèque



Scopus : notice détaillée

Les auteurs et leurs affiliations

Références de l'article

Télécharger le PDF



Scopus : recherche par auteur

Outil conseillé pour retrouver toutes les publies d'un auteur ou éviter les homonymes




Accès à la fiche de l'auteur

Accès à ses publications




Accès à ses publications



Accès au Web of Science

Web of Science : accès CNRS

Le CNRS propose des « portails » thématiques; au sein de ces portails vous pouvez accéder à de nombreuses bases


http://bibliost2i.inist.fr/


Web of Science : recherche de document

Choix du champ d’interrogation

Combiner ses mots-clés

Appliquer des limites



Web of Science : résultats

Références de l'articleLes auteurs

Télécharger le PDF



Les portails d'accèsaux revues scientifiques



Depuis le site de la bibliothèque

Editeurs de revues commerciales

Accès via la rubrique « Documentation électronique »

Revues en libre accès (Open access journals)

Accès payé par l'ECL


http://bibli.ec-lyon.fr/index.php?rubrique=ressourcesElec&ssRubrique=NewrevElec


Les portails d'information du CNRS

Accès par mot de passe, propre à chaque laboratoire CNRS demandant l’accès à ce service. Accès nomade


http://www.inist.fr/IMG/pdf/guide_portails_2010.pdf


Exemple : le portail BiblioST2I

Editeurs de revues commerciales


http://bibliost2i.inist.fr/


Comparaison accès ECL / BiblioST2I

ECL BiblioST2IWeb of Science 1991-2011

(abonnement interrompu en 2009)+ Medline

1899-2011+ Current Contents+ Medline+ Journal Citation Report+ Essential Science Indicator

Science Direct (Elsevier) 1995-2011 Origines-2011 pour de nombreux titres

Springerlink 1997-2011 Origines-2011 pour denombreux titres

Springer e-books Lecture Notes in Computer Science (LNCS)

Collection chimie/sciences de l’ingénieur + LNCS


http://elsevier.inist.fr/article.php3?id_article=34

http://springer.inist.fr/article.php3?id_article=91


Comprendre l'évaluation de l'information scientifique :

de l'évaluation qualitative à l'évaluation quantitative de la recherche



Critères d'analyse d’un article scientifique

● Auteurs

● Institution (affiliation)

● Notoriété de la revue (Facteur d'impact)

● Date de publication

● Structuration du contenu (démarche scientifique)

● Bibliographie…→ Grille d'analyse d'un article scientifique


http://bibli.ec-lyon.fr/documents/formation_pe/session_2/3.3_Grille_analyse_article_scientifique.pdf


L'évaluation quantitative de la production scientifique : indicateurs

● Pour un auteur : nombre et types de documents

produits, nombre de citations de sa production, h index...

● Pour un article : nombre de fois où il est cité par d'autres

articles, la revue dans laquelle il est publié (facteur

d'impact)



Outils pour évaluer la production scientifique

● Google Scholar : nombre de citations d'un article

● Scopus : Author Evaluator (nombre de documents

produits, de citations et h index) et View citation overview,

Analytics (comparaison entre revues)...

● Web of Science : Citation Map (pour un document),

Citation Report (pour un auteur), h index

● Journal Citation Reports



Google Scholar : citations

Nombre de citations par document



Scopus : fiche d'un auteur

Accès aux types de documents produits, aux citations et au h index

Accès aux documents citant la production de cet auteur



Attention : qu'évalue-t-on exactement ?

En réalité seulement 39 articles sur 101 documents produits



Les biais des indicateurs...

On peut enlever les auto-citations

Et cela impacte le h index



Mise en garde par Scopus...



Scopus : recherche par affiliation1

2

Accès au nombre de documents et auteurs appartenant à cette affiliation



Scopus : recherche par affiliation



Scopus : Analytics

Permet de comparer les citations de plusieurs revues entre elles



Web of Science : Citation Map

Lancer Citation Map à partir d'une publication

1

2



Web of Science : Citation Map1

2

Choisir le type de graphique qu'on souhaite afficher



Web of Science : recherche par auteur1

Nombre de publications de l'auteur...indexées (présentes) dans la base du WoS2



Web of Science : Citation Report

Accéder au Citation Report



Web of Science : Citation Report

Nombre de citations, d'articles cités, h index...

h index

Possibilité d'enlever les auto-citations



Les limites du h index

● Le h index n’a de sens que si l’on compare des auteurs

dans une même discipline et d'une même tranche d'âge

● Cf Hirsch, J. E. (2005). An index to quantify an

individual's scientific research output. Proceedings of the

National Academy of Sciences of the United States of

America, 102(46), 16569-16572.



Journal Citation Reports :Facteur d'impact d'une revue

L’édition Science couvre plus de 7200 revues dans 171 disciplines



Journal Citation Reports

Choisir une catégorie de sujet

1

2

Puis classer par facteur d'impact




Comment se situe la revue par rapport aux autres revues, selon son facteur d'impact




Possibilité d'enlever les auto-citations

1

2 Impact des auto-citations




Accéder au JCR à partir du Web of Science

Facteur d'impact sur 5 ans

1

2



Les limites du facteur d'impact

● Il reflète la situation des revues des 2 années

précédentes (et non la situation actuelle)

● Peu d’articles d’une revue donnée sont fortement cités,

publier dans une revue à fort facteur d’impact n’assure

donc pas forcément que l’article sera lu

● Comparer des facteurs d’impact dans une même

discipline



Mettre en place une stratégie de veille



La veille : définition

« Activité continue et en grande partie itérative visant à une surveillance active de l'environnement technologique, commercial, etc., pour en anticiper les évolutions ». (Norme AFNOR XP X50-053, avril 1998)

Elle nécessite la mise en place d’une stratégie



La veille : objectifs

● Faciliter l'identification des ressources pertinentes

● Maintenir un flux régulier d’informations dans son

domaine / actualiser ses informations

● Déceler les évolutions du domaine étudié

● Continuer à être informé de nouvelles parutions

pertinentes après une recherche documentaire



La veille : objectifs

● Faciliter l'identification des ressources pertinentes

● Maintenir un flux régulier d’informations dans son

domaine / actualiser ses informations

● Déceler les évolutions du domaine étudié

● Continuer à être informé de nouvelles parutions

pertinentes après une recherche documentaire

Gagnerdu

temps !



La veille : les étapes...

ciblagerécolte

analysediffusion

VEILLE

ciblagerécolte

analysediffusion

VEILLE



...pour une approche stratégique● Le ciblage : définir les thèmes étudiés et les sources à utiliser

● La récolte des informations : utiliser les bons outils

● L’analyse des données : collecter uniquement ce qui est utile

en excluant les données non fiables et non pertinentes

● La diffusion des résultats de la veille pour valoriser (on la

gestion / conservation / partage)



La veille : accès à l’informationDeux méthodes :

● PULL : l’usager va chercher l’information (recherche

précise mais qui demande du temps)→ historiques de recherche, signets web, consultation de sommaires de revues, personnes ressources...

● PUSH : l’information vient à l’usager (gain de temps

mais risque de surabondance de l'information)→ profils et alertes par e-mail, fils rss...



La méthode PUSHElle apporte de manière directe et automatique des informations en

fonction de critères préétablis. Différents outils peuvent être utilisés :

● Bulletins d’informations, newsletters électroniques

● Listes de discussion

● Fils d’informations grâce aux flux RSS rassemblés dans des agrégateurs

(Netvibes, Google Reader…)

● Services d’alertes par envoi de courriels (Google Alerts)

● Outils de monitoring qui aspirent, à intervalles définis, les sites web

sélectionnés et signalent les changements intervenus (Wysigot Light,

WebSite-Watcher, Update Scanner....)



Veille et flux RSS : exemple sur le web

Fils RSS : flux structurés de contenus en provenance de sites Internet, incluant les titres des articles et des liens vers ces articles à consulter en ligne.

Certains sites proposent plusieurs flux


http://www2.cnrs.fr/presse/8.htm


Veille et flux RSS : exemple sur le web

Pour plus d'informations sur l'utilisation des flux RSS => « Optimiser sa veille avec les flux RSS »http://bibli.ec-lyon.fr/documents/RSS_2010-2.pdf

Pour lire un flux RSS facilement, utiliser un...logiciel de lecture de flux RSS

Les navigateurs modernes sont compatibles avec les flux RSS. Ce peut être un premier choix


http://bibli.ec-lyon.fr/documents/RSS_2010-2.pdf

http://bibli.ec-lyon.fr/documents/RSS_2010-2.pdf


Veille avec une BDD biblio : Scopus

● Recevoir les derniers articles correspondant à votre recherche : sauvegarder une requête et créer une alerte par e-mail ou par flux RSS

● Etre prévenu d'une nouvelle citation d'un article : créer une alerte sur un document cité

● Connaître les nouvelles publications d’un auteur ou des publications citant cet auteur : créer une alerte sur un auteur

● Suivre l’actualité d’une institution : créer une alerte sur une institution

104



Votre veille sous Scopus : 4 méthodes

105

Scopus

requête document

auteur institution



Scopus : créer son compte

106

Pour créer son compte1

2


http://www.scopus.com/home.url


Scopus : créer une alerte sur une requête

107

Sauvegarder une requête dans « My settings »

Créer une alerte par e-mail sur la requête

Créer une alerte grâce au fil RSS



Scopus : créer une alerte sur une citation

108

Créer une alerte par e-mail sur un document cité




Scopus : créer une alerte sur un auteur

109

Créer une alerte par e-mail sur une nouvelle publication de cet auteur


Créer une alerte par e-mail sur une nouvelle citation d'une publication de cet auteur



Scopus : créer une alerte sur une institution

110

Créer une alerte par e-mail sur une nouvelle publication rattachée à cette institution Créer une alerte

grâce au fil RSS



Scopus : gérer ses alertesdans « My alerts »

111



Scopus : « My settings »

112

Requêtes sauvegardéesAlertes

sauvegardées

Listes bibliographiques sauvegardées



En attendant l'épisode 2...Retrouvez nos supports de formation thématiques :

http://bibli.ec-lyon.fr/Formation/consulter_supports.php?rb=supports



Questions ?

Céline Andrieu 04.72.18.67.44 [email protected] Marois 04.72.18.64.50 [email protected]

Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 [email protected]


mailto:[email protected]





Episode 2


Formation Doctorants Episode 2 - Bibliothèque 26/05/2011 2

Rappels...

Episode 1

● Se situer dans l'environnement de l'IST

● Optimiser l'utilisation des sources d'information

scientifiques et techniques

● Comprendre l'évaluation de l'information scientifique

● Mettre en place une stratégie de veille



Ce qu'on vous propose aujourd'hui

Episode 2 :

● Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans

sa production, en fonction du logiciel choisi :

● Zotero

● Mendeley

● Publier et archiver sa production



Gérer ses références bibliographiques et les utiliser dans sa production



Trop de références bibliographiques

sur une idée originale de Valentin Vivier


http://blog.novoseek.com/index.php/resources/a-review-of-the-main-reference-management-softwares.html/


Gérer sa bibliographie

● S'organiser● Capitaliser● Privilégier le fond sur la forme● Partager des références, collaborer● Découvrir de nouveaux travaux ?



Des outils dédiés



Besoins* classiques...et émergents

sur une idée originale de Martin Fenner

*données 06/2010


http://blogs.nature.com/mfenner/2009/03/15/reference-manager-overview


Zotero



Zotero● Extension du navigateur Firefox + services en ligne (http://www.zotero.org)● = > Windows + Mac + Linux● Gratuit...● ...comptes « premium » si besoin● Opensource● Institutions + vaste communauté● Nombreux styles bibliographiques● Évolution rapide


http://www.zotero.org/


Zotero : l'appui institutionnel

+



Un couteau suisse



Installation de Zotero




http://www.zotero.org/


Installation : autoriser et redémarrer Firefox1

2

Comme toute extension Firefox, vous devez redémarrer votre navigateur pour finaliser l'installation

Cliquer sur Installer...

3

Une fois Firefox redémarré, Zotero apparaît dans la liste des modules complémentaires



Il vous est proposé de vous créer un compte sur le site zotero.org. Ce n'est pas obligatoire...

...mais cela vous permettra d'utiliser les fonctionnalités de synchronisation et de collaboration de l'outil



Utilisation de Zotero



Votre bibliothèque et vos marqueurs

La barre d'outils La recherche

Détail d'une référence



Zotero :: Collecter des références



Zotero :: Organiser sa bibliothèque



Zotero :: Citer des références



Zotero :: Exporter pour BibTeX



« Avant toute chose : avoir du style »

Répertoire public des styles zotero. Respecte le standards CSL1.0.

Les fichiers de styles sont chargés automatiquement (« Install »)


http://zotero.org/styles


Zotero :: Synchroniser et collaborer



La confidentialité en question

« Tout ou rien » : vous ne pourrez pas (pour l'instant) restreindre la visibilité de certaines collections; idem pour les notes



Les groupes Zotero

Les groupes permettent de partager des notices, notes et fichiers entre membre en maitrisant finement la confidentialité

Private Groups : pas de profil public; page du groupe visible pour membres invités; invisible dans les recherchePublic, Closed Membership : pqge publique possible; sur invitation ou validation d'une demandre; collections visible ou pas au sein de la bibliothèquePublic, Open Membership : adhésion libre; visibilité; pas de stockage de fichiers

3 types de groupes


http://methodoc.univ-rennes2.fr/content.php?pid=164734&sid=1390070


L'avenir de Zotero



Zotero : aide, information

Forums actifs sur Zotero.org

Zotero francophone, communauté fr autour de Zotero

Blog de Zotero

Tutoriels vidéo en ligne


http://zotero.hypotheses.org/

http://forums.zotero.org/categories/

http://www.zotero.org/blog/

http://methodoc.univ-rennes2.fr/content.php?pid=164734


Mendeley



Mendeley

● Logiciel à installer + service en ligne (http://www.mendeley.com)● Windows + Mac + Linux● Modèle de Last.fm (partage de musique)● Version beta, gratuit, mais... ●...business model en évolution, mais...●... « what is free now will remain free »● Société basée à Londres


http://www.mendeley.com/


Mendeley


http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation


Installation de Mendeley



Téléchargement : option 1

Par défaut, téléchargement suite à l'initialisation d'un compte


http://www.mendeley.com/


Téléchargement : option 2

Il est aussi possible d'installer l'outil sans créer de compte à priori

Mendeley est disponible sur de nombreuses plateformes



Installation : les plugins Word et OpenOffice1 2

34

Compatibilité Word 2003 - 2007

Compatibilité OpenOffice



Vue d'ensemble de l'interface « Desktop »

Collections, collections partagées, corbeille

Filtres (auteurs, journaux, tag, mots clés auteur)

Liste des références

Détails, tag et annotations, références citées

Moteur de rechercheBarre d'outils



Créer sa bibliothèque de références



Ajouter des références : via Mendeley Desktop

Différentes stratégies :● Ajout d'un document ou d'un répertoire de documents● « Watch a folder », pour l'import automatique de PDF● Ajout de références au format EndNote, BibTeX, RIS, etc.

Ajout par « glisser-déposer » de fichiers PDF...

...et Mendeley extraira les descriptions du document PDF automatiquement



Ajouter des références : utiliser l'import web

Un simple lien placé dans la barre d'adresse permet d'importer directement des résultats de recherche à partir des sites compatibles

Choisir les références dans la fenêtre dédiée, annoter, ajouter des tag

1

2



Compatible avec Firefox, Chrome, Safari, Internet Explorer...

Import web : installation et compatibilité

Les principales sources d'information scientifique

http://www.mendeley.com/import


http://www.mendeley.com/import


Synchronisation de sa bibliothèque de références

Synchronisez votre bibliothèque Mendeley Dekstop avec votre compte en ligne

Gestion et édition en ligne de vos références



Si vous disposez d'un lot de fichiers PDFIndiquez le dossier à importer contenant les PDF

L'importation se déroule automatiquement et les références correspondant aux documents PDF apparaissent

Mendeley va chercher les informations décrivant les documents dans les bases de données d'information scientifique

1

3

2



Si vous venez de EndNote

1

Exporter en Xml, ou .txt avec le style RefMan(RIS)

Sélectionner les références à exporter

2

Dans Mendeley, choisir le format d'import RIS ou EndNote Xml suivant le format d'export EndNote

De la même manière, Mendeley peut importer des listes de références aux formats BibTeX, Zotero.sqlite, OVID,...



Gérer sa bibliothèque de références



Des fonctions de gestion simples et utiles

Affichez le PDF attaché à la référence pour lecture

Les références peuvent être marquées comme « à lire », « lues », « favorites »

Créez vos propres collections

Filtrez vos listes de références de façon aisée

Triez rapidement vos listes en cliquant sur les entêtes de colonne

Collections créées par défaut : ●Toutes les références●Ajouts récents●Mes favoris●Références à vérifier●Mes publications●Publications non classées



Recherche incrémentielle et suggestion de recherche

Mise à jour de la liste de résultats au cour de la frappe

Recherche dans les références et les PDF de toutes les collections

Mise en contexte et surlignage des termes recherchés

Suggestion de termes au court de la frappe



Utilisation avancée du moteur de recherche

champs:terme à rechercher

Exemples : ● author:harnad● keyword:Bacteria● publication:nature● tag:tools● title:« open access »



PDF : lecteur intégré et recherche de mots-clés

Surlignage du terme recherché dans le PDF

Outils d'exploitation avancée : notes, surlignage manuel, lecture plein écran, etc.

Ouverture des PDF dans des onglet dédiés



PDF : surlignez et annotez vos documents

Annotation (avec auteur et date) Notes générales

Passage surligné manuellement

Listes des annotations avec leurs liens pour une navigation aisée



Classez et renommez automatiquement vos fichiers

L'outil de gestion des fichiers et ses options

Classement et nommage paramétrables

Tools > Option > File Organizer



Classez et renommez automatiquement vos fichiers

Fichiers organisés automatiquement en arborescence

PDF (et autres fichiers) joints renommés



Prenez soin de vos métadonnées : homogénéisation des noms de journaux, auteurs, tag, etc.

Passage surligné manuellement

Les entrées d'index peuvent être glissée-déposée les unes sur les autres pour homogénéiser leurs valeurs

Mendeley modifie automatiquement les références en conséquence

1

2



Citer en utilisant ses références



Citer dans Word et OpenOffice 1/2

Placer son curseur à l'emplacement de l'appel de citation dans votre texte

Cliquer sur « Insert Citation » dans la barre d'outil Mendeley de Word

Dans Mendeley, choisir la référence à citer

1

2

3



Citer dans Word et OpenOffice 2/2

L'appel de citation est intégré au format choisi à l'emplacement du curseur

Cliquer sur « Send Citation to Word »

4

5



Éditer une bibliographie dans Word ou OpenOffice

Finaliser son texte avec tous les appels de citation

Positionner son curseur à l'endroit où doit figurer la bibliographie

Cliquer sur « insert Bibliography »

Choisir un style bibliographique

La bibliographie est générée automatiquement

Vous pouvez changer le style : le document se met à jour

1

2

3



Produire une simple liste de références formatées

Sélectionnez des références

Déplacez les dans votre document (« drag & drop »)

La liste est au format sélectionné

Cela fonctionne aussi par copier-coller



Un vaste choix de styles bibliographiques

Ooo : « Choose Citation Style » Word : « Other citations from Mendeley »

Recherchez et sélectionnez un style



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We define social network sites as web-based services that allow individuals to (1) construct a public or semi-public profile within a bounded system, (2) articulate a list of other users with whom they share a connection, and (3) view and traverse their list of connections and those made by others within the system.

Boyd, D.M., et N.B. Ellison. Social network sites: Definition, history, and scholarship. Journal of Computer-Mediated Communication 13, 2007, 210-230. Available from world wide web: <http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html>.

“

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http://jcmc.indiana.edu/vol13/issue1/boyd.ellison.html%3E


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Finalement, quel outil choisir ?

Voir Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010. Principaux logiciels de gestion bibliographiques utilisés au Cemagref : récapitulatif des avantages et inconvénients. Available at: http://tinyurl.com/RefMagSoftCompareCadiou2010 [Consulté mai15, 2011].


http://tinyurl.com/RefMagSoftCompareCadiou2010


Les «+»● compatible avec Windows, Linux et Mac● gestion des fichiers joints● création de groupes de références● accès aux bases par onglets Les « - » ● encore quelques soucis avec Open Office● pas de partage de données● l’interface reste moins intuitive que celle des autres logiciels● pas de gestion des doublons● importation irrégulière à cause de la répartition des champs en onglets (le contenu d’un champ vide peut se retrouver dans BibTeX)

JabRef

Cadiou, C. & Sarah-Blin, S., 2010


https://ist.cemagref.fr/outils-guides-et-formations/endnote-et-autres-logiciels/LogicielsGestionBiblio-recapitulatifjuin2010.pdf


Les «+»● La capture de pages web très facile, le téléchargement de PDF et la compatibilité avec de nombreux catalogues et bases de données ● Outil gratuit et open source● Requêtes dynamiques● Chronologie, rapport, liste biblio : faciles à éditer● Accès distant : synchronisation possible d’une base sur un serveur de Zotero ou sur un serveur interne WebDav Les « - » ● L’interface pourrait être améliorée● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte gratuit sur serveur● On ne peut gérer qu’une bibliothèque et on ne peut pas synchroniser ou partager une sous-collection● Liens avec traitement de texte pas toujours très fiables

Zotero





Les «+»● Interface claire et intuitive● Le collaboratif avec «Shared Collection»: partage d’une sélection de références et de leurs documents attachés● Tags personnalisés● Gestion des PDF performante (moteur de recherche, annotations...) ● Consultation, édition, et alimentation en ligne de la base● Réseau social, partage avec la communauté de chercheurs Les « - » ● Espace de stockage limité à 500 Mo par compte● Pas plus de 10 participants par "SharedCollection"● Pas de détection des doublons● Pas de gestion et création de styles élaborée● Les nouvelles fonctionnalités ou capacités de stockage sont payantes

Mendeley





Publier et archiver sa production



Droit d'auteur ?

● Vos droits par rapport à votre éditeur et vos lecteurs

● Vos devoirs envers les auteurs que vous citez

● Protection des œuvres littéraires et artistiques, sur tout

support (œuvre originale et mise en forme pour être

communiquée)

● Droits moraux / Droits patrimoniaux



Droits moraux

● Perpétuels, transmissibles aux héritiers

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Droits patrimoniaux

● L'auteur peut par contrat céder ses droits patrimoniaux

ou consentir une licence à un tiers (éditeur) :

rémunération de 5 à 15 %

● Pas de rémunération pour la rédaction d'un article ou

d'un ouvrage collectif (cession gratuite souvent tacite)



Alternative : licences Creative Commons

● Logique inverse : quelques droits réservés (choix de

l'auteur)

● En accord parfait avec le principe du libre accès

● Licences perpétuelles (70 ans après la mort de l'auteur)

et irrévocables (on ne peut revenir sur la licence

accordée)



Creative Commons 101 ● 4 attributs combinables, 6 contrats différents :

● BY : attribution, paternité (droit moral)

● NC (Non Commercial) : pas d'utilisation commerciale de

l’œuvre dérivée

● ND (No Derivate works) : reproduction sans

modification

● SA (Share Alike) : partage aux conditions identiques



Licences Creative Commons



Licences Creative Commons


http://creativecommons.org/


La production scientifique de l'ECL

Toutes les informations sur le dépôt et la rédaction de la thèse


http://bibli.ec-lyon.fr/index.php?rubrique=prodSci


Circuit de la thèse

Vade-mecum : circuit de la thèse


http://bibli.ec-lyon.fr/documents/vademecum-1.pdf


Valoriser sa production dans une archive ouverte



HAL (Hyper Articles en Ligne)

Se créer des alertes

Les derniers dépôts par discipline


http://hal.archives-ouvertes.fr/


● « Archive ouverte » pluridisciplinaire destinée au dépôt et à la diffusion de documents● => communication scientifique directe● Donne libre accès à l’information scientifique et technique

Types de documents présents dans HAL : ● Publications dans des revues à comité de lecture● Conférences invitées dans des congrès● Proceedings à comité de lecture● Publications dans des revues sans comité● Communications à des congrès, symposiums● Séminaires, workshops● Chapitres dans les ouvrages● Livres et ouvrages● Thèses...

HAL (Hyper Articles en Ligne)



Accessibilité + visibilitéConsultation et dépôt ouverts à tousVisibilité scientifique internationale :

● du chercheur● du laboratoire● de l’établissement ou de l’institution● des équipes de recherches par rapport aux financeurs (ANR…)

Dépôt fortement préconisé par l’ECL et le CNRS

Simplicité + pérennitéDépôt simple et rapide : un auteur archive pour les co-auteursPossibilité d’ajout de nouvelles versions du documentPérennité et stabilité des URL (Archivage des données au CINES)

Pourquoi déposer dans HAL ?



Intérêt pour la publicationTaux de citation plus élevé pour un article déposé dans une archive ouverteAccroissement du facteur d’impact de la revueAugmentation du cycle de vie de l’articleExtraction et export de bibliographie (rapport d’activité…)Dépôt simultané dans arXiv

Plagiat / Responsabilité scientifiqueLe dépôt permet :● de garantir la paternité de l’œuvre ● de prendre dateResponsabilisation du déposant (aucun dépôt ne peut être retiré)Validation de la teneur scientifique et technique du document

Pourquoi déposer dans HAL ?



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● Post-print : version auteur finale d’un article après évaluation par les pairs (généralement acceptée pour publication)

● Pdf éditeur : version publiée par l'éditeur sur son site, avec mention du titre du journal

Les différentes versions d'un document scientifique



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http://www.sherpa.ac.uk/romeo/


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Editeur Vert

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Déposer dans HAL : vérification, authentification, inscription

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Déposer dans HAL : dépôt des fichiers



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Philippe Eyraud 04.72.18.65.00 [email protected]






Ressources

● Hull, Duncan, Defrosting the Digital Library: A survey of bibliographic tools for the next generation web. [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur

le world wide web :

<http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web>.

●Hull, Duncan, Steve R Pettifer, et Douglas B Kell. Defrosting the Digital Library: Bibliographic Tools for the Next Generation Web. PLoS

Comput Biol 4, Octobre 2008, e1000204+. Disponible sur le world wide web : <http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204>

● Mendeley Teaching Presentation [cité 20 Avril 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation>

● Reiswig, Jennifer. Mendeley. 98, Avril 2010, 193-194. PubMed Central Link. [cité 31 Mai 2010]. Disponible sur le world wide web :

<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/>

● Readwriteweb, Curt Hopkins Of. Mendeley Throws Open the Doors to Academic Data. The New York Times Avril 2010. [cité 31 Mai 2010].

Disponible sur le world wide web :

<http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html>

● Henning, Victor, et Jan Reichelt. Mendeley - A Last.fm For Research? Dans eScience, IEEE International Conference on, Vol. 0 of, 327-

328, [Los Alamitos, CA, USA]: IEEE Computer Society, 2008

●Pochet, Bernard. La rédaction d’un article scientifique. Petit guide pratique adapté aux sciences appliquées et sciences de la vie à l’heure

du libre accès. [Gembloux (Belgique)]: Les Presses agronomiques de Gembloux, 2009 [cité 24 mai 2011]. Disponible sur le world wide web:

<http://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/24998>.


http://www.slideshare.net/dullhunk/defrosting-the-digital-library-a-survey-of-bibliographic-tools-for-the-next-generation-web

http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1000204

http://www.slideshare.net/luiszz11/mendeley-teaching-presentation

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2859264/

http://www.nytimes.com/external/readwriteweb/2010/04/29/29readwriteweb-mendeley-throws-open-the-doors-to-academic-43750.html

http://orbi.ulg.ac.be/handle/2268/24998

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