1

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 1. Mikroskopiranje Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Zadatak 1. U vidno polje mikroskopa nacrtajte dio preparata (npr. lista vodene kuge) koji vidite kad mikroskopirate a) slabim (8 x) i b) jaim objektivom (40 x)

objektiv 8 x, okular 10 x objektiv 40 x, okular 10 x

Odgovori na pitanja iz zadatka 1:

Zadatak 2. Razlike u mikroskopskoj slici krobnih zrnaca u ovisnosti o promjeru otvora iris-zastora Neobojena zrnca Iris-zastor a) potpuno otvoren b) optimalno otvoren c) potpuno zatvoren Obojena zrnca Iris-zastor a) potpuno otvoren b) optimalno otvoren c) zatvoren

2

Odgovori na pitanja iz zadatka 2:

Zadatak 3. Nacrtajte stanicu ili dio stanice pokoice luka s jezgrom i drugim uklopinama koje ste uoili. Odgovori na pitanja iz zadatka 4:

3

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 2. Plan stanine grae i osnovni organizacijski tipovi stanica Ime i prezime _______________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Zadatak 1. Crte bakterijskih stanica. Zadatak 2. a) Crte stanica kvasca. b) Crte zelene alge Chlorella sp.

4

c) Stanice lista vrste Zebrina pendula ili Rhoeo discolor. d) Crte epitelne stanice iz usne upljine ovjeka. Odgovori na pitanja :

5

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 3. Biomembrane indirektna opaanja Ime i prezime _______________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Tablica 3.1. Prije nego to ponete prireivati otopine ispunite tablicu : Koncentracija otopine saharoze (M) 0,0 0,2 0,4 0,6 0,8 1,0

Volumen matine otopine (ml) 0

Volumen vode (ml) 5

Ukupni volumen (ml) 5 5 5 5 5 5

Objekt istraivanja: Zadatak 1. stanica u destiliranoj vodi stanica u ___ M otopini stanica u ____ M otopini

6

Zadatak 2.

Otopina br. Priblina koncentracija

saharoze Obrazloenje procjene koncentracije: Odgovori na pitanja:

7

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 4. Plastidi Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Zadatak 1. Nacrtajte sliku vegetacijskog vrka koju ste vidjeli kod slabog poveanja, nacrtajte detaljno (imerzijski objektiv) meristemsku stanicu i strukture koje opaate u njoj. Usporedite svjetlosno-mikroskopsku (SM) sliku proplastida s elektronsko-mikroskopskom (EM) slikom. Zadatak 2. Nacrtajte stanicu ili detalj stanice epiderme i mezofila lista (palisadni i spuvasti parenhim). Usporedite SM-sliku plastida s EM-slikom.

8

Zadatak 3. Utvrdite odakle potjee boja nekih latica cvjetova. Nacrtajte detalje stanica s karakteristinim tipom plastida. Usporedite SM-sliku s EM-slikom.

Zadatak 4. Utvrdite odakle potjee boja nekih plodova. Nacrtajte detalje stanica s karakteristinim tipom plastida. Usporedite SM-sliku s EM-slikom.

Odgovori na pitanja:

9

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 5. Stanina jezgra Mitoza Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Mitoza u stanicama vrka korijena vrste __________________________________________. 2n = ____

Zadatak 1. Shematski crte pojedinih koraka u pripremi preparata.

Zadatak 2. Ispunite tablicu. Faze I P PM M A T ukupno stanica br. stanica (1. preparat) br. stanica (2. preparat)

Zadatak 3. Izraunajte mitotski indeks za oba preparata. Mitotski indeks1 =

Mitotski indeks2 =

10

Zadatak 4. Nacrtajte stanice u sljedeim fazama mitoze: a) metafaza, b) anafaza.

Metafaza

Anafaza

Odgovori na pitanja:

11

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 6. Endomitoza Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Zadatak 1. Shematski prikaz postupka izrade preparata divovskih kromosoma. Zadatak 2. Divovski kromosomi iz lijezda slinovnica vrste _____________________________. slabo poveanje jako poveanje (imerzija)

12

Zadatak 3. Preglednim shematskim crteom prikaite postupak pripreme preparata C-mitoze.

Zadatak 4. Nacrtajte metafaznu plou (maksimalno kondenzirani kromosomi raspreni po stanici) koja moe posluiti za izradu kariograma.

13

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 7. Mejoza Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________

Zadatak 1. Nacrtajte navedene faze mejoze, prema mikroskopskoj slici, koju daje imerzijski objektiv. Obiljeite nacrtane strukture!

14

Zadatak 2. Shematski prikaz postupka izrade preparata mejoze.

Zadatak 3. Rjeenja zadataka.

15

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 8. Izolacija jezgara i izduene niti DNA Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________ Zadatak 1. Shematski prikaz postupka izolacije jezgara. Zadatak 2. Nacrtajte izolirane jezgre obojene orceinom ili acetokarminom (slika koju daje objektiv poveanja 40x).

16

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 9. Izolacija genomske DNA iz biljnog materijala metodom "uradi sam" Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________

Zadatak 1. Navedite sve korake u izolaciji DNA i skicirajte konani rezultat (oznaite koje faze vidite u staklenoj epruveti nakon dodavanja alkohola te u kojoj fazi dolazi do precipitacije DNA).

Zadatak 2. Pokuajte objasniti koja je uloga sredstva za pranje sua u postupku izolacije, a koja kuhinjske soli (smjernica za drugo podpitanje: kako disocira kuhinjska sol u vodi, naboj molekule DNA, utjecaj na precipitaciju).

17

Zadatak 3. Prikaite kako ste pripremili "ekstrakcijsku otopinu". Mislite li da bi eksperiment uspio da ste upotrijebili neto vie ili manje sredstva za pranje sua i/ili soli?

18

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 9. Izolacija genomske DNA iz transgene biljke Arabidopsis thaliana i plazmidne

DNA iz laboratorijskog soja bakterije Escherichia coli Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________

Zadatak 1. Nacrtajte bakteriju E.coli s jednim vektorom. Nacrtajte biljnu stanicu s jednim transgenom u genomu (2n=4).

Zadatak 2. to otvara biljne stanice, a to bakterijske stanice u protokolima za izolaciju?

19

Zadatak 3. Nabrojite korake u izolaciji plazmidne DNA iz bakterija. U kojem koraku dolazi do precipitacije plazmidne DNA? to se dogaa s bakterijskom genomskom DNA?

20

Praktikum iz Stanine i molekularne biologije Vjeba 9. PCR, elektroforeza i restrikcijska analiza DNA Ime i prezime ___________________________________ smjer __________ turnus ______ , datum __________

Zadatak 1. Pretpostavimo da imate dva uzorka DNA. Jedan sadri linearne molekule DNA, a drugi cirkularnu/krunu DNA (plazmid). Obje molekule imaju 17 restrikcijskih mjesta koje prepoznaje (i ree) EcoRI. Koliko fragmenata DNA ete dobiti na gelu nakon inkubacije s EcoRI i elektroforeze u sluaju linearne, a koliko u sluaju krune molekule DNA?

Zadatak 2. Pretpostavimo da nakon 6 ciklusa PCR-a imate u reakciji ukupno 256 molekula DNA i da je uinkovitost amplifikacije/umnaanja u svakom ciklusu 100%. Koliko ste molekula DNA imali nakon 3 ciklusa, a koliko ete ih imati nakon 9 ciklusa?

21

Zadatak 3. O emu ovisi brzina putovanja molekula DNA u gelu tijekom elektroforeze? Nacrtajte gel na kojem putuju tri fragmeta DNA, veliine 150, 250 i 1000 pb (pb = parova baza). Na gelu u prvoj (lijevoj) stazi (eng. lane) nacrtajte marker DNA koji ima 10 fragmenata (od 100pb do 1000pb, razlika u veliini fragmenata markera neka bude 100pb).