nutrition bactérienne introduction introduction besoins energetiques et elementaires besoins...
TRANSCRIPT
Nutrition BactérienneNutrition Bactérienne
• INTRODUCTIONINTRODUCTION• BESOINS ENERGETIQUES ET BESOINS ENERGETIQUES ET
ELEMENTAIRESELEMENTAIRES• BESOINS SPECIFIQUES: FACTEURS DE BESOINS SPECIFIQUES: FACTEURS DE
CROISSANCECROISSANCE• FACTEURS PHYSIQUESFACTEURS PHYSIQUES• PRINCIPES DE CONTRUCTION D’UN PRINCIPES DE CONTRUCTION D’UN
MILIEU DE CULTUREMILIEU DE CULTURE
1.INTRODUCTION1.INTRODUCTION
Pour étudier les microorganismes, il faut les cultiver en culture pure et pour cela il faut connaître leurs exigences nutritionnelles ainsi que les conditions physiques ( pH, T°, pression osmotique)
2. BESOINS ENERGETIQUES ET 2. BESOINS ENERGETIQUES ET ELEMENTAIRESELEMENTAIRES
• Substrats énergétiques ou une source Substrats énergétiques ou une source d’énergie (lumière)conduisant à la d’énergie (lumière)conduisant à la production d’énergie sous forme d’ATP production d’énergie sous forme d’ATP nécessaire aux biosynthèses cellulaires nécessaire aux biosynthèses cellulaires
• Substances élémentaires (eau , C, N, S, Substances élémentaires (eau , C, N, S, P, éléments minéraux) pour les P, éléments minéraux) pour les biosynthèsesbiosynthèses. .
• Certains micro-organismes ont des besoins spécifiques en facteurs de croissance
2.1 Source d’énergie et types trophiques2.1 Source d’énergie et types trophiques
• Le terme Le terme type trophiquetype trophique (du verbe (du verbe grec trophus, « action de nourrir ») grec trophus, « action de nourrir ») spécifie la manière dont un spécifie la manière dont un organisme vivant constitue sa propre constitue sa propre matière organique..
• Pour synthétiser de la matière Pour synthétiser de la matière organique, un être vivant a besoin :organique, un être vivant a besoin :
• Source d’énergieSource d’énergie
• Source de carbone Source de carbone
• d’accepteur final d’électron dans les d’accepteur final d’électron dans les réactions d’oxydo-réduction réactions d’oxydo-réduction
Sur la base de la nature de ces trois élémentsSur la base de la nature de ces trois éléments
On définit les types trophiques On définit les types trophiques
Types trophiquesTypes trophiques Classe du besoin Nature du
besoin Type trophique
Source d'énergie
Rayonnement lumineux
Phototrophe =Photosynthétique
Oxydation de composés organiques ou inorganiques
Chimiotrophe =Chimiosynthétique
Cellule hôte Paratrophe
Les différents types nutritionnels ou trophiques Classe du besoin Nature du besoin Type trophique
Source d'énergie
Rayonnement lumineux
Phototrophe
Oxydation de composés organiques ou inorganiques
Chimiotrophe
Donneur d'électrons Minéral Lithotrophe
Organique Organotrophe
Source de carbone Composé minéral Autotrophe
Composé organique Hétérotrophe
Facteurs de croissance
Non nécessaires Prototrophe
Nécessaires Auxotrophe
Source d'énergie
Source de pouvoir
réducteur
Source de carbone Type trophique
LumièrePhoto-
Composé organique-organo-
Organique-hétérotrophe
Photoorganohétérotrophe
Minérale (dioxyde de carbone)-autotrophe
Photoorganoautotrophe
Inorganique-litho-
Organique-hétérotrophe
Photolithohétérotrophe
Minérale (dioxyde de carbone)-autotrophe
Photolithoautotrophe
Composé chimique organique ou nonChimio-
Composé organique-organo-
Organique-hétérotrophe
Chimioorganohétérotrophe
Minérale (dioxyde de carbone)-autotrophe
Chimioorganoautotrophe
Inorganique-litho-
Organique-hétérotrophe
Chimiolithohétérotrophe
Minérale (dioxyde de carbone)-autotrophe
Chimiolithoautotrophe
• Exemples de bactéries photolithotropheExemples de bactéries photolithotrophe
Clorobacteriaceae Clorobacteriaceae (bactéries vertes sulfureuses), (bactéries vertes sulfureuses),
ThiorhodaceaeThiorhodaceae((bactéries pourpres sulfureuses)((bactéries pourpres sulfureuses)
• Exemples de bactéries photoorganothropheExemples de bactéries photoorganothrophe
AthiorhodaceaeAthiorhodaceae
• Exemples de bactéries Exemples de bactéries chimiolithotropheschimiolithotrophes
Bactéries oxydant l’hydrogène: Bactéries oxydant l’hydrogène: HydrogenomonasHydrogenomonas
Bactéries oxydant l’ammoniaque:Bactéries oxydant l’ammoniaque:
NitrosomonasNitrosomonas
Bactéries oxydant les composés réduits du soufre:Bactéries oxydant les composés réduits du soufre:
ThiobacillusThiobacillus
• Exemples de bactéries Exemples de bactéries chimioorganothropheschimioorganothrophes
Champignons levures moisissuresChampignons levures moisissures
2.2 Source de carbone 2.2 Source de carbone
Les groupes nutritionnelles (selon la source Les groupes nutritionnelles (selon la source d’énergie)d’énergie)
-- Source Source d’énergied’énergieSource Source d’énergied’énergie
ChimiotrophesChimiotrophes
PhototrophesPhototrophes ParatrophesParatrophes
Chimio-Chimio-organotrophorganotropheses
Chimio-Chimio-lithotrophelithotrophess
Photo-Photo-organotrophorganotropheses
Photo-Photo-lithotropheslithotrophes
- Donneur d’Donneur d’ee--
InorganiqueInorganique(H2S, NH(H2S, NH44
++, , H2O)H2O)
- Bactéries sulfureuses Vertes et pourpres-Chlorobacteriaceae-Theorodaceae-2H2O 4H+ + 4e- + O2
- Donneur d’- Donneur d’ee--
organiqueorganique
- Oxydation de Oxydation de substance exogène substance exogène minérales (H2, minérales (H2, ammoniaque, ammoniaque, nitrite, composées nitrite, composées réduite du soufre)réduite du soufre)
HydrogenomonasNitrosomonasNitrobacterTheobacillus
- Oxydation Oxydation des substances des substances exogène s exogène s organiquesorganiques
Champignons- Levures- Moisissures
- L’énergie est L’énergie est fournie fournie exclusivement exclusivement par l’hôtepar l’hôte
VirusBactéries endocellulaires
Eg. ChlamydiaTrachome
• --Types nutritionnels (selon la source de carbone)
Source de Source de carbonecarbone
Autotrophes Hétérotrophes
Strictes facultatifsAuxotrophesPrototrophes
- CO2
Bactéries nutrifiantesBactéries sulfooxydantes« présence obligatoire de CO2
Bactéries photosynthétiques
- CO2 ou un autre composé organique
Bactéries pourpres non sulfureuses
- Composés organiques simples (sucres, acide organiques
-Bacillus subtilus-Escherichia coli-Pseudomonas
- Exiges quelques substances essentiels qu’elles sont incapable de les synthétiser
-La plupart des pathogènes: lien obligatoire hôte-microorganisme
Types nutritionnelsTypes nutritionnels
Inorganique : litho(H2S, H2O, etc….
• --
Organique : Organique : OrganoOrgano
Inorganique : Inorganique : litholitho
Inorganique : Inorganique : litholitho
Organique : Organique : OrganoOrgano
CO2CO2 Source Source organique organique ( CO2( CO2peut utilisé)peut utilisé)
COCO2, 2, HH22S, HS, H2, 2,
SOSO44, e, eSource Source organique organique Le COLe CO22
peut utilisépeut utilisé
PhotolithoautotroPhotolithoautotrophesphesPhotolithoautotroPhotolithoautotrophesphes
PhotorganohétérotropPhotorganohétérotropheshesPhotorganohétérotropPhotorganohétérotropheshes ChimiolithoautotrChimiolithoautotr
ophesophesChimiolithoautotrChimiolithoautotrophesophes
ChimioorganohétérotropChimioorganohétérotropheshesChimioorganohétérotropChimioorganohétérotropheshes
AlguesAlguesBs sulfureuses Bs sulfureuses pourpres et pourpres et vertesvertescyanobactériescyanobactéries
Bs non Bs non sulfureuses sulfureuses pourpres et pourpres et vertesvertes
Bs oxydants le S, Bs oxydants le S, H, Fe Bs H, Fe Bs nutrifiantesnutrifiantes(Cycles (Cycles biogéochimiquesbiogéochimiques))
ProtozoairesProtozoairesMycètesMycètesLa plupart des La plupart des bactéries bactéries pathogènespathogènes
Energie Energie lumineuse: lumineuse: PhotoPhoto
Energie Energie ChimiqueChimique : :ChimioChimioDonneur d’eDonneur d’e--Donneur d’eDonneur d’e--
2.3 Source d’azote2.3 Source d’azote
Classification et propriété des facteurs de croissanceClassification et propriété des facteurs de croissance
3 catégories de facteurs