nukleosida: basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa nukleotida:
DESCRIPTION
Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa + fosfat Esterifikasi terjadi antara ggs OH pada C-5 ribosa/deoksiribosa dengan ggs fosfat Nukleosida monofosfat contoh: AMP = Adenosin 5’monofosfat - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/1.jpg)
• Nukleosida: • Basa purin / pirimidin +
ribosa/deoksiribosa
• Nukleotida:• Basa purin / pirimidin +
ribosa/deoksiribosa + fosfat– Esterifikasi terjadi antara ggs OH
pada C-5 ribosa/deoksiribosa dengan ggs fosfat
– Nukleosida monofosfat contoh: AMP = Adenosin 5’monofosfat
– Nukleosida difosfat contoh: ADP– Nukleosida trifosfat contoh: ATP
![Page 2: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/2.jpg)
• Rangkaian nukleotida, contoh:
• Trinukleotida : 5’ - A-C-G- 3’ pApCpG ACG• Urutan basa ditulis dari 5’ -3’
P PP OH
A C G
3’ 3’ 3’
5’ 5’ 5’
![Page 3: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/3.jpg)
• Pembentukan asam nukleat• RNA
ATP, UTP, GTP, CTP RNA polimerase
RNA
• DNA dATP, dTTP, dGTP, dCTP DNA polimerase
DNA
![Page 4: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/4.jpg)
• DNA• T.d. 2 utas rantai
polinukleotida yang membentuk struktur double-helix
antiparalel
• RNA• T.d. 1 utas rantai
polinukleotida
A T G C
T A C G
5’
5’
3’
3’
![Page 5: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/5.jpg)
• DNA• 2 utas double
helix
• A T G C pur pir pur pir
• Rantai lebih panjang• Deoksiribosa• Ikatan Hidrogen A T G C Hukum berpasangan
• RNA• t.d. 1 utas rantai
polinukleotida
• A U G C
• Rantai lebih pendek
• Ribosa.
![Page 6: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/6.jpg)
.
![Page 7: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/7.jpg)
RNA dan DNA• .
![Page 8: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/8.jpg)
RNA• mRNA = messenger RNA berisi kodon-kodon asam amino yang
akan dirangkai• tRNA = transfer RNA Berbentuk seperti daun semanggi Mempunyai bagian yang disebut
antikodon yang berpasangan dengan kodon asam amino yang dibawa
Bertugas membawa a.a yang akan dirangkai
• rRNA = ribosomal RNA Komponen ribosom
![Page 9: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/9.jpg)
EKSPRESI GEN
• .
![Page 10: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/10.jpg)
• EKSPRESI GEN• GEN --- mRNA --- polipeptida/ protein
Upstream Downstream DNA 5’ ------ ACTGCC ------ 3’ utas coding 3’ ------ TGACGG ------ 5’ utas cetakan mRNA 5’ --- ACUGCC --- 3’ tRNA 3’-- UGA -- 5’ (bgn antikodon) Thr (a.a yg dibawa)
TRANSKRIPSI TRANSLASI
![Page 11: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/11.jpg)
• Utas coding = utas sense Urutan nt di sini menentukan urutan a.a pada
rantai polipeptida yang dibentuk. – Kode genetik: 1 a.a dikode oleh urutan 3 nt – Urutan basa N dibaca dari 5’-3’
• Utas template = utas cetakan– Sebagai utas cetakan bagi pembentukan
mRNA
• mRNA– Sesuai hukum berpasangan apabila di utas
cetakan tertulis A maka pada utas mRNA tertulis U, apabila tertulis G maka pada utas mRNA tertulis C
– Urutan basa N dibaca dari 5’-3’– Satu kodon t.d 3 nt 1 asam amino
![Page 12: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/12.jpg)
• Gen: suatu segmen DNA yang berisi informasi/ kode genetik urutan asam amino dari suatu rantai polipeptida / protein
• Gen: terdapat pada rantai DNA• Peta gen: menunjukkan letak gen pd rantai
DNA
• mRNA: – Urutan kodon (kode genetik pada mRNA)
menentukan urutan a.a yg akan dirangkai– Satu kodon terdiri dari 3 nukleotida (triplet)
• Kode genetik bersifat hampir universal– Universal berarti kodon yang sama berlaku
untuk asam amino yang sama pada semua mahluk hidup
![Page 13: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/13.jpg)
• .
![Page 14: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/14.jpg)
• Total ada 43 = 64 kodon • 3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi• Kodon inisiasi: AUG (sebagian kecil organisme GUG) • Jumlah asam amino dasar penyusun
protein : 20, jadi banyak asam amino yang punya lebih dari 1 kodon
• Kodon pada mRNA akan dikenali oleh antikodon pd tRNA yang akan membawa asam amino yang sesuai dengan kodon tersebut untuk dirangkai
![Page 15: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/15.jpg)
• .
mRNA urutan kodon
![Page 16: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/16.jpg)
Transfer RNA (tRNA)
• .
![Page 17: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/17.jpg)
Organisme dg materi genetik RNA• Terdiri dari beberapa macam
virus yang :– Tidak pernah mentranskripsikan
materi genetik ke molekul DNA– Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA) •E.reverse transkriptase•Diintegrasikan ke genom inang
acuan ekspresi gen RNA virus yang baru
![Page 18: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/18.jpg)
MUTASI
• .
![Page 19: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/19.jpg)
MUTASI PADA TINGKAT GEN•Substitusi •Insersi (1 atau lebih)•Delesi (1 atau lebih)
![Page 20: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/20.jpg)
MOLEKUL DNA EUKARIOT• Sebagian besar di inti (dalam
kromosom)•DNA terikat protein kromatin
+ DNA+ Histon + Protein non histon
+ RNA (sedikit)
• Di dalam mitokhondria (mengandung sedikit gen)
» Tidak mengandung histon,» Berbentuk sirkuler
![Page 21: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/21.jpg)
rRNA prokariota
• 3 spesies rRNA :
– rRNA 23 Ssub unit ribosom 50 S
– rRNA 5 S
– rRNA 16 S sub unit ribosom 30S
• S (Svedberg) : koefisien sedimentasi
![Page 22: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/22.jpg)
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
• hn RNA (Eukariot)
![Page 23: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/23.jpg)
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
• Capping
![Page 24: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/24.jpg)
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
• .
![Page 25: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/25.jpg)
REKOMBINASI KROMOSOM
PERLU PENJAJARAN KROMOSOM HOMOLOG
![Page 26: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/26.jpg)
Organisme dg materi genetik RNA• Terdiri dari beberapa macam
virus yang :– Tidak pernah mentranskripsikan
materi genetik ke molekul DNA– Dapat mentranskripsikan materi
genetik ke dsDNA (cDNA) •E.reverse transkriptase•Diintegrasikan ke genom inang
acuan ekspresi gen RNA virus yang baru
![Page 27: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/27.jpg)
PEMATANGAN mRNA (Eukariot)
• .
![Page 28: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/28.jpg)
JENIS MOLEKUL RNA•Messenger RNA (mRNA)•Transfer RNA (tRNA)•Ribosomal RNA (rRNA)•Pada eukariota juga ada :
•snRNA (small nuclear RNA) berperan pada proses splicing
![Page 29: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/29.jpg)
Messenger RNA (mRNA)• Acuan (template) untuk sintesis
protein• Berfungsi meneruskan informasi
genetik dari gen (DNA).• Berisi instruksi dlm penyusunan
asam amino• mRNA eukariot :
– Ujung 5’ ada topi 7 mGTP– Ujung 3’ ada ekor poli A (20 – 200 A),
kecuali mRNA histon
![Page 30: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/30.jpg)
Transfer RNA (tRNA)
• Membawa aa aktif ke ribosom untuk dirangkai menjadi rantai polipeptida sesuai urutan pada mRNA
• Minimal ada 20 jenis tRNA• Adaptor, memp. tempat spesifik
untuk :– mengikat aa– Mengenal nukleotida pada mRNA
![Page 31: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/31.jpg)
Transfer RNA (tRNA)• Terdiri dari 70 – 90 nukleotida• Berbentuk daun semanggi• Ujung 3’ : CCA• Gugusan OH atom C-3 adenosil
berikatan ester dg gugusan karboksil asam amino
• Banyak mengandung basa yang tidak umum pada RNA (inosin, ribotimin, pseudourasil, dihidrourasil)
![Page 32: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/32.jpg)
Transfer RNA (tRNA)
• Lengkung dihidrourasil (DHU) :– Pengenalan thd enzim aminoasil-tRNA
transferase• Lengkung antikodon :
– Pengikatan dengan kodon (pada mRNA)• Lengan ekstra• Lengkung ribotimin-pseudourasil-
sitosin (TΨC) :– Pengikatan tRNA dengan ribosom
• Ujung 3’ : CCA
![Page 33: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/33.jpg)
EKSPRESI GEN
• .
![Page 34: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/34.jpg)
Aktivasi dan pengikatan asam amino pada tRNA
• Terjadi di sitosol• E.aminoasil-tRNA sintetase• 2 tahap :
– Pengaktifan asam amino•Perlu ATP
– Pengikatan aminoasil AMP ke tRNA•Terbentuk aminoasil tRNA (charge
tRNA)
![Page 35: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/35.jpg)
TRANSLASI
• Perubahan bahasa dari urutan nukleotida dari mRNA menjadi urutan asam amino polipeptida
• Lokasi : ribosom• Cetakan / template : mRNA• Pembawa asam amino ke
ribosom : tRNA
![Page 36: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/36.jpg)
TRANSLASI
Terdiri dari 3 tahap :•Tahap inisiasi•Tahap elongasi•Tahap terminasi
![Page 37: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/37.jpg)
TRANSLASI
![Page 38: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/38.jpg)
Tahap inisiasi translasi
•Pengikatan faktor inisiasi (IF1,IF2,IF3) ke ribosom sub unit kecil
•Pengikatan mol.charge tRNA dan mRNA ke ribosom sub unit kecil
•Pembentukan kompleks inisiasi 70S
![Page 39: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/39.jpg)
Tahap elongasi translasi
•Pengikatan aminoasil tRNA
•Pembentukan ikatan peptida
•Translokasi
![Page 40: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/40.jpg)
PEMBENTUKAN IKATAN PEPTIDA
• .
![Page 41: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/41.jpg)
TAHAP ELONGASI TRANSLASI• .
![Page 42: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/42.jpg)
KODE GENETIK• Terdapat di mRNA• Mengkode spesifisitas asam amino
penyusun protein• Terdiri dari 3 nukleotida (triplet)
kodon• Total ada 64 kodon• 3 kodon (UAA, UAG, UGA) : kodon
terminasi• Hampir universal• Akan dikenal oleh antikodon pd tRNA
![Page 43: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/43.jpg)
TAHAP TERMINASI TRANSLASI• Situs A ditempati stop kodon• Tak ada tRNA yang mengenali
stop kodon• Situs A ditempati release factor• Memicu pelepasan polipeptida
dari peptidil tRNA, pemecahan secara hidrolitik
• Kompleks ribosom pecah menjadi komponen semula
![Page 44: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/44.jpg)
TAHAP TERMINASI TRANSLASI• .
![Page 45: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/45.jpg)
POLISOM
• .
![Page 46: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/46.jpg)
PEMATANGAN PROTEINDapat terjadi :• Pelepasan ggs N-formil pada
ujung amino• Pelepasan metionin• Pemutusan rantai polipeptida• Reaksi oksidasi• Reaksi hidroksilasi• Pembentukan ikatan disulfida• Dan lain-lain
![Page 47: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/47.jpg)
INHIBITOR SINTESIS PROTEINPADA PROKARIOT
ANTIBIOTIKA
CARA KERJA
Streptomisin Berikatan dg subunit ribosom 30S shg menghambat inisiasi dan menyebabkan salah baca mRNA
Tetrasiklin Berikatan dg subunit ribosom 30S dan menghambat pengikatan aminoasil tRNA
Kloramfenikol Berikatan dg subunit ribosom 50S dan menghambat aktivitas peptidiltransferase
Eritromisin Berikatan dg subunit ribosom 50S dan menghambat translokasi
![Page 48: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/48.jpg)
INHIBITOR SINTESIS PROTEINPADA PROKARIOT DAN
EUKARIOTINHIBITO
RCARA KERJA
Puromisin Analog aminoasil-tRNA, shg terjadi terminasi dini
Actinomisin D Mengikat DNA dan menghambat gerakan RNA polimerase, shg mencegah transkripsi
Mitomisin Terjadi iktan kovalen antara 2 rantai DNA, sehingga replikasi menurun
![Page 49: Nukleosida: Basa purin / pirimidin + ribosa/deoksiribosa Nukleotida:](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062502/56814b68550346895db854c0/html5/thumbnails/49.jpg)
INHIBITOR SINTESIS PROTEIN
PADA EUKARIOT
Sikloheksimid
menghambat aktivitas peptidil transferase
ribosom sub unit 60 S