morphological and molecular diagnosis of root knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343...

13
--- جمد افدين، الموم الرجمة عم م77 ، العدد4 / لثامي ار العم عدد خاص بالمؤتملحياةوم ا لث لعم ، ص318 - 350 ، 7038 ---- 318 تون في بغدادت الزيشجار وشت افقةتودا تعقد الجذور المرع نيما نوا ئي والجزيص المورفولوجي التشخي اقء العر وبابل وكرب* مي محمد التميوي زينب عميون وارف محمد حن** سماء منصو ارسول ر عبدالءة/جامعة كرب اعت/كمية الزرلنباية ا قسم وقاموصلمعة اللغابات/جا اعة وات/كمية الزرلنباية ا قسم وقا**E- mail: [email protected] *E- mail:[email protected] (3) م ستم ا( 76 / 6 / 7038 بل ؛ ق3 / 33 / 7038 ) انمهخص اسة ىدفت ىذه الدر إلى اء إجر حقمي مسح ل مرف عمى تع أنواعتودا نيما تعقد الجذور افقةة و المرتطفم المشجار ت وشتت وىي بغداد/ث محافظاتون في ث الزينية وبابل/ ا مزرعة الزعفرء/ وكرب السدةندية ومحطة بستنة اليشي العطي سجمت أعمى مرضي لتعقد الجذوريل نسبة إصابة وأعمى دل في بغداد/ م انية/ زرعة الزعفرحقل بمغت ال100 و% 3 عمى التوالي فيكل منيما لت نفس المنطقة/ حين سجمظمة اقل نسبة العقد الجذور بمغت مرضي لتيل إصابة ودل6.6 و% 0 عمى التواليكل منيما ل. لعجاني وىما طريق النمط اقد الجذور عنتودا تع نيماوعين من تم تشخيص نM.javanica وM.incognita جميع في اسة وتم تأكيد تشخيص النوعطق الدر مناM.incognita ئي بتقنية التشخيص الجزيPCR . ت الدالة :ما الكملعجاني،تودا تعقد الجذور، النمط ا، تشخيص نيما الزيتونئي التشخيص الجزي. ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ــــــــ ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ــــــ ـــMorphological and Molecular Diagnosis of Root Knot Nematode Species Associated with Olive Seedling and Trees in Baghdad, Babil and Karbala/ Iraq Waref M. Hanoon Zeinab A. Altememe Asmaa M. Abdel rasool Department of Plant Protection/ College of Agriculture Department of Plant Protection University of Karbala College of Agriculture and Forestry University of Mosul ABSTRACT The study was aimed to conduct a field survey to identify the Root knot nematodes species associated with olive trees and nurseries in provinces of Baghdad /Al- Zaafaraniya, Babil /Al- Sada, Karbala /Al-Atishi and Al-Hindiah Horticulture Center. Baghdad /Al- Zaafaraniya had the highest percentage of disease incidence (100%) and root-knot index (3) in the field, while nurseries under shade conditions in the same region had the least percentage of disease incidence and root-knot index (6.6% and 0), respectively. Two species of root-knot nematodes M. javanica and M.incognita were identified in all study location, the perineal pattren technique was used for identification . M.incognita identification was molecularly confirmed by the PCR to be used in all study trials. Keywords: Olive, Root knot nematode Diagnosis, Perineal Pattran, PCR. ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ـــــــــ ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ

Upload: others

Post on 29-Sep-2020

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

----7038، 350-318، ص لث لعموم الحياةعدد خاص بالمؤتمر العممي الثا / 4، العدد 77مجمة عموم الرافدين، المجمد ---

318

التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا تعقد الجذور المرافقة ألشجار وشتالت الزيتون في بغداد وبابل وكربالء العراق

ر عبدالرسولاسماء منصو ** وارف محمد حنون زينب عميوي محمد التميمي *

قسم وقاية النبات/كمية الزراعة والغابات/جامعة الموصل قسم وقاية النبات/كمية الزراعة/جامعة كربالء

**E-mail: [email protected]

*E-mail:[email protected](3)

(7038/ 33/ 3؛ ُقبل 7038/ 6/ 76)ُاستمم

انمهخص

وشتالت ألشجارالمتطفمة و المرافقة تعقد الجذور نيماتودا أنواعتعرف عمى ملمسح حقمي إجراء إلى ىدفت ىذه الدراسة سجمت أعمى العطيشي ومحطة بستنة اليندية السدة وكربالء/ مزرعة الزعفرانية وبابل/ الزيتون في ثالث محافظات وىي بغداد/

لكل منيما عمى التوالي في 3 % و100الحقل بمغت زرعة الزعفرانية/م في بغداد/ نسبة إصابة وأعمى دليل مرضي لتعقد الجذور .لكل منيما عمى التوالي 0% و 6.6إصابة ودليل مرضي لتعقد الجذور بمغت الظمة اقل نسبة حين سجمت نفس المنطقة/

في جميع M.incognita و M.javanica تم تشخيص نوعين من نيماتودا تعقد الجذور عن طريق النمط العجاني وىما . PCRبتقنية التشخيص الجزيئي M.incognitaمناطق الدراسة وتم تأكيد تشخيص النوع

.التشخيص الجزيئي الزيتون، تشخيص نيماتودا تعقد الجذور، النمط العجاني،الكممات الدالة : ــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ

Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot Nematode Species

Associated with Olive Seedling and Trees in Baghdad, Babil and Karbala/ Iraq

Waref M. Hanoon Zeinab A. Altememe Asmaa M. Abdel rasool

Department of Plant Protection/ College of Agriculture Department of Plant Protection University of Karbala College of Agriculture and Forestry

University of Mosul

ABSTRACT

The study was aimed to conduct a field survey to identify the Root knot nematodes species

associated with olive trees and nurseries in provinces of Baghdad /Al- Zaafaraniya, Babil /Al- Sada,

Karbala /Al-Atishi and Al-Hindiah‎‎Horticulture Center. Baghdad /Al- Zaafaraniya had the highest

percentage of disease incidence (100%) and root-knot index (3) in the field, while nurseries under

shade conditions in the same region had the least percentage of disease incidence and root-knot index (6.6% and 0), respectively.

Two species of root-knot nematodes M. javanica and M.incognita were identified in all study

location, the perineal pattren technique was used for identification .M.incognita identification was

molecularly confirmed by the PCR to be used in all study trials.

Keywords: Olive, Root knot nematode Diagnosis, Perineal Pattran, PCR.

ـــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــــ

Page 2: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

319

المقدمةتعجود Olea europaeaالكجريم سجبع مجرات واسجميا العممجي شججرة مباركجة ورد ذكرىجا فجي القجران Olive treesشججرة الزيتجون ، تشجتير زراعتيجا فجي منجاطق (7000وىي مجن األشججار الخشجبية المعمجرة دائمجة الخضجرة )الكاتج ، Oleaceaإلى العائمة الزيتونية

وتزيد أصجناف الزيتجون عمجى حوض البحر األبيض المتوسط و يعتقد العمماء أن الزيتون المزروع حاليا ناتج من تطور الزيتون البري تشججير إصحصججائيات أن عججدد أشجججار الزيتججون (.7000 ،صججنفا )الججدوري والججراوي 40صججنف يوجججد منيججا فججي العججراق أكثججر مججن 3000

طجن ومعجدل إنتجاج الشججرة الواحجدة فجي العجراق ىجو 35331شجرة واإلنتجاج السجنوي مجن الثمجار ىجو 667,657في العراق المزروعة . (7035 ،الزراعي اإلحصاءمديرية % ) 7,5ة أشجار الزيتون ألشجار الفاكية األخرى ىي ونسب ،كغم 77,8

تصا أشجار الزيتون بالعديد من األمراض التي تصي المجموع الجذري ومن ضمنيا األمراض النيماتودية ويعد مرض واحد من أىم األمراض النيماتودية التي Meloidogyne sppالمتسب عن الجنس Disease Root-Knotتعقد الجذور

مسببة خسائر اقتصادية كبيرة يعود ذلك إلى عدة عوامل من أىميا، انتشارىا السريع في جميع النباتاتتصي مدى واسع من بات المرضية مثل الفطريات أنحاء العالم، ومداىا العائمي الواسع، وكذلك تعاونيا مع األحياء األخرى بتييأت منافذ لدخول المسب

والبكتريا متسببة في إحداث الكثير من األمراض النباتية المركبة التي يصع مكافحتيا، باإلضافة إلى قدرتيا عمى كسر مقاومة Berkeleyكانت من قبل إليياأول أشارة و ( 7030 النباتات لبعض األمراض النباتية األخرى و إضعاف النباتات )ابو غربية،

إشارة لوجود نيماتودا تعقد أولبينما كانت ،م عمى جذور نباتات الخيار المزروعة في أحد البيوت الزجاجية في أنجمترا 3855 عام .(3955 ،م )اصعظمي 3955الجذور في العراق عام

نتشرة عالميًا المالنيماتودا المتطفمة عمى النبات من اكثر مجموعات .Meloidogyne spp تعد نيماتودا تعقد الجذور ( ويتركز انتشارىا في المناطق ذات المناخ الدافئ والحار 3976 ،وآخرونواخطرىا في المناطق اصستوائية والمعتدلة )ثابت

) التالية األنواعتعد نوعا مسجاًل 80(. يعرف لحد اآلن أكثر من ,7005Agriosوالشتاء القصير او المعتدل )M. incognita و M. javanica و M. arenaria و M. hapla الرئيسية المنتشرة في معظم المناطق الزراعية األنواع( من

الدراسات التي اجريت ترتيبيا تنازليًا أوضحتعربيًا فقد وأىميتيااما مدى انتشارىا (.Karrsen, 2002في العالم ) .M. hapla (1.75 )%،M%( و 30.75) M.arenaria%( و 30 ) M.incognita ( و%57.25) M.javanicaوىي

artiella (0.5اما انتشارىا محميًا فتعتبر نيماتودا تعقد الجذور 7004 ،%( )ابو غربية والعزة .)النوع وباألخصM.javanica نوع إلى باإلضافةة محميًا الرئيسي األربعة األنواعشخصت والعراق اذ (Cook, 2000) معظم الدولانتشارا في األنواع أكثرمن

(.3980 ،قاسم ؛ 3974 ،الراوي ؛ Katcho, 1972 ؛ 3955 ،)اصعظمي M. thamsiخامس وىو .Meloidogyne sppالمختمفة لنيماتودا تعقد الجذور األنواعتميز المستخدمة في تشخيص و ىناك العديد من الطرق

وسالصت نيماتودا تعقد الجذور ألنواعتعريف دقيق وصورة واضحة إعطاءويعد الجمع بين الطرق التشخيصية ضروريًا من اجل ىذه الطرق تطبيقا ىي الطريقة المورفولوجية التي تعتمد عمى الصفات المورفولوجية أكثر و طريقة مكافحة فعالة ليا. إلىلموصول التعريف الدقيق إعطاءمن القياسية في جدوى وفائدة األكثرالصفات النوعية والقياسية وتعد الصفات النوعية أيالعامة

(1Jepson, 198 2004؛ Karajeh, )ويعد شكل النمط العجاني ،يافعات الطور الثاني وذكور و إناثالحياتية من لألطوار

Perineal pattren الشائعة األربعة األنواعمن بين الصفات الشكمية والنوعية لمتميز بين األىم األنثىفي مؤخرة جسمM.javanica و M.incognita و M.hapla و M.arenaria ،(7030 )ابو غربية. نجاحا وىي تقنية التشخيص الجزيئي باستخدام البصمة أثبتتواحدث طرق التشخيص المستخدمة التي وأسرع أدق أماقميمة من خالل عزل أيامقة خالل النيماتودا وتعطي نتائجًا دقي أنواعوالتي من خالليا يمكن تميز خالئط من DNAالوراثية لج

Page 3: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

340

من خالل تفاعل البممرة DNAثم تضخيم الج ، مفردة او مجتمعة أو اإلناثالطور الثاني افعاتي من بيض او DNAوتنقية الج Zijlstra et) لمتفريق بين أنواع نيماتودا تعقد الجذور Polymerase Chain Reaction (PCR)المتسمسل

al., 1995 قاعدة تكمل التسمسالت الموجودة عمى الج 71-38( باستخدام بادئات طولياDNA، فصل كيربائي لحزم إجراءثم يتمثم مقارنة حجم الحزم الناتجة مع ما يمثميا من كل نوع واستخدمت ،المضخمة ومشاىدتيا تحت اصشعة فوق البنفسجية DNAالج

( في تميز اصنواع المحمية من نيماتودا ,.7005Karajeh et al( واألردن )Haroon et al., 2003ىذه الطريقة في مصر )تعقد الجذور ضمن المنطقة العربية وفي العراق لم نعثر عمى اي دراسة حول استخدام تقنية التشخيص الجزيئي باستخدام البصمة

الوراثية. المواد وطرائق العمل

)اربجع بيجوت بالسجتيكية، ظمجة ، وىي بغداد/الزعفرانية تمثمت بمزرعجة الزعفرانيجةأجري المسح الحقمي في ثالث محافظات العطيشججي شججمل المسججح حقججل تججابع –حقججل لمزيتججون( ومحافظججة بابل/السججدة شججمل المسججح ثالثججة بسججاتين متجججاورة أمججا محافظججة كججربالء

لكمية الزراعة ومحطة بستنة اليندية.أخججذت العينجات مججن اشجتالت وأشجججار الزيتجون فجي منججاطق المسجح المججذكورة سجابق ُجمعجت عينججات مجن جججذورنــات: جمـ العي -1

فجي التربجة القريبجة مجن مسجاقط الكبيجرة تجم الحفجر األشججار إلجىبالنسجبة أمجاالجذور الرفيعة عشجوائيًا بعجد قمجع الشجتالت الصجغيرة بالكامجل كمجا موضجحة Barker 1985))الشججرة الثانيجة وحسج طريقجة ويقابمو من الجية اليسرى من األولىمن الجية اليمنى لمشجرة األوراق

ألخجذ العينجات مجن سم حس عمر الشججرة 10-30سم عن جذع الشجرة وتراوح عمق الحفر بين 50-10( وعمى بعد 3في الشكل ) .الجذور الرفيعة

.Barker 1985)) نموذج مقترح لجم عينات التربة من االشجار والشجيرات عن: 1الشكل

لحجين اججراء عمميجة تشجخيص اصجنجاس ºم5نقمت عينات الجذور والتربة الى المختبر ووضجعت فجي الثالججة عنجد درججة حجرارة

فججي كججل منطقججة مججن منججاطق اإلصججابةدىا فججي كججل منطقججة مججن منججاطق الدراسججة تججم حسججا نسججبة المتطفمججة عمججى جججذور الزيتججون و تواججج الدراسة باصستعانة بالمعادلة التالية 300× عدد النباتات المصابة= النسبة المئوية لإلصابة

العدد الكمي لمنباتات المفحوصة / منطقجة مجن منجاطق الدراسجة باصسجتناد إلجى الجدليل المرضجي الجذي Root-knot indexفضال عن حسجا الجدليل المرضجي

.Sasser, and Hartman(3987)و Sasser, and Taylor(3978) وضعو كل من

Page 4: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

343

الموضوع من قبل .Meloidogyne sppنيماتودا تعقد الجذور ل يوضح معايير قياس الدليل المرضي :1الجدول Taylor and Sasser, (1978) وand Sasser, (1987) Hartman.

عدد العقد أو كتل البيض الدليل المرضي(

جذور خالية من العقد أو كتل البيض صفر

عقدة أو كتمة بيض 7-3جذور فييا 3

عقد أو كتل بيض 30 - 1جذور فييا 7

عقدة أو كتمة بيض 10 – 33جذور فييا 1

عقدة أو كتمة بيض 300 – 13فييا جذور 4

عقدة أو كتمة بيض 300جذور فييا أكثر من 5

ــنمط العجــاني -2 ــت الزيتــون باالعتمــاد عمــت الصــزات المورفولوجيــة لم تشــخيص أنــواع نيمــاتودا تعقــد الجــذور المتطزمــة عمPerineal Pattren :

ظيرت عمييجا أعجراض اصصجابة بنيمجاتودا تعقجد الججذور إلجى المختبجر و جمبت عينات جذور الزيتون من مناطق المسح التيغسمت الجذور المصابة بالنيماتودا بتيار ماء خفيف إلزالة األتربة والمواد العالقة بيا، استخرجت منيا اإلناث بعد إزالة كتل البجيض

، شخصججت أنججواع نيمججاتودا تعقججد (Stereomicroscope)مججن نياياتيججا الخمفيججة بواسججطة إبججرة التشججريح واصسججتعانة بمجيججر التشججريح Taylor and لإلنججاث البالغجججة حسجج Perineal pattrenالجججذور باصسججتناد عمجججى الصججفات المورفولوجيجججة لمججنمط العججججاني

Netscher, (1974) ( 3987) و, Sasser Hartman and ، ،استخرجت خمسة اناث بالغة من كل عينة لغرض التشخيصدقائق عمى شريحة زجاجية نظيفجة وقطعجت النيايجة الخمفيجة ليجا بواسجطة مشجرط 5-1نثى في قطرة من الكميسرين لمدة إذ وضعت األ

( ثجم نقمجت إلجى شجريحة زجاجيجة أخجرى تحجوي 7) شجكلالحاد صمم ليذا الغرض وجرى تنظيفيا من األحشاء الداخمية العالقة بجالمؤخرة ة ثجم خجتم محجيط غطجاء الشجريحة مجع الشجريحة بمجادة صجبو األظجافر وتركجت لتججف، قطرة من الالكتوفينول وبعد وضع غطاء الشجريح

.( Binocular Microscopeوفحصت المقاطع بواسطة المجير الضوئي المرك )

Perineal Pattren : طريقة تحضير النمط العجاني2الشكل

Polymerase Chain Reactionتشـخيص نـوع نيمـاتودا تعقـد الجـذور باالعتمـاد عمـت تزاعـل البممـرة المتسمسـل -3

PCR) )

Page 5: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

347

اجججري ىجججذا التشجججخيص فجججي مختبجججر فايروسججات النبجججات التجججابع لقسجججم وقايجججة النبججات/ كميجججة الزراعجججة/ جامعجججة كجججربالء وبمسجججاعدة وحسج من اناث نيماتودا تعقد الجذور المعزولة من أشجار وشجتالت الزيتجون DNAتم عزل الحامض النووي ، د.عدنان عبدالجميل

ظير بنسبة كبيرة في محافظة كربالء بعد اكثاره عمى مزرعة نقية ض تأكيد تشخيص النوع الذي لغر Robin et al., 2005طريقةPure culture.

الناث نيماتودا تعقد الجذور: DNAعزل الحامض النووي -1حسجججج طريقججججة العمججججل الموصججججوفة مججججع العججججدة المصججججابة المزرعججججة النقيججججةالكمججججي مججججن DNAأجريججججت عمميججججة اسججججتخالص لمججججج

DNeasy Plant Mini kit من شركة Qiagenوكما يمي: اصلمانية (Eppendrofe tube)ووضجعت فجي انبوبجة صجغيرة ،مميغرام( من اصناث الناضججة 300-50اخذت عينة مكونة من ) -3

ل العالقجة باسجتخدام وسجحقت العينجة جيجدا إلزالجة الكتج RNase ميكرولتجر مجن اصنجزيم 4و AP1‎ ميكرولتجرمن البفجر 400إضيف ليا .Vortex( ورجت العينة رجًا خفيفًا باستخدام جيازالج Micro pestleالمدقة الصغيرة )

مججرة خججالل فتجرة التسججخين ويججتم فجي ىججذه الخطججوة تحطججيم 1-7دقججائق مجع الججرج 30ْم لمججدة 65سجخن الخمججيط بدرجججة حجرارة -7 خاليا العينة.

دقججائق فجججي ىجججذه الخطججوة يجججتم تحطجججيم 5المججزيج مجججع الججرج ثجججم حفجججظ بججالثمج لمجججدة الجججى P3ميكجججرو لتججرمن بفجججر 310أضججيف -1 البروتينات.

دقجائق ونقجل الرائجق الجى انبوبجة 5دورة فجي الدقيقجة( لمجدة 34000اجراء انتباذ مركزي لمعينة في جياز الطجرد المركجزي ) -4 نظيفة. ليتم في ىذه الخطوة التخمص من الرواس .

مجججل مججججن نججججوع 7عمميجججة التحطججججيم والتحمججججل بواسجججطة الماصججججة الصججججغيرة ونقمجججت الججججى انبوبججججة جمجججع جديججججدة حجججججم اخجججذ نججججاتج -5((QIAshredder Mini spin column lilac ( لمدة 34000ثم نقمت الى جياز الطرد المركزي )دقيقة. 7دورة في الدقيقة

الى أنبوبة جديدة. ميكرولتر من السائل المتدفق النازل من الخطوة السابقة 450نقل -6

ميكرولتجر 675المضجاف لجو ايثجانول لمنجاتج مجن الخطجوة السجابقة اي تقريبجا AW1‎اضيف حجم ونصف الحججم مجن بفجر -7 وخمط المحتويات جيدا باستخدام الماصة الصغيرة.، ويقل الحجم حس حجم المحمول من الخطوة السابقة

7ابقة مع الراسج باسجتخدام ماصجة ووضجعت فجي انبجو جمجع جديجد حججم من خميط الخطوة الس ميكرولتر 650 سح -8التجي تحتجوي عمجى فمتجر خجاص ثجم نقمجت جميجع اصنابيج الجى جيجاز الطجرد المركجزي DNeasy Mini spin column مجل مجن نجوع

دورة في الدقيقة( لمدة دقيقة واحدة بعدىا يتم التخمص من السائل النافذ. 8000)

.AW1‎واضافة بفرالعينة المتبقية باستخدام انبو جمع وة السابقة معكررت الخط -9

مججن ميكرولتججر 500مججل واضججيف لججو 7فججي انبججو جمججع جديججد Mini spin columnDNeasyوضججعت فالتججر -30 .دورة في الدقيقة( لمدة دقيقة واحدة 8000جياز الطرد المركزي ) إلىوالمضاف لو ايثانول ثم AW2بفر

ثججم نقمججت الججى جيججاز الطججرد Mini spin columnDNeasyإلججىAW2 ميكرولتججر بعججدىا مججن بفججر 500فة إضججا -33 ‎/‎دورة ‎14000‎ دقيقة لمتخمص من الراشح واججري عمميجة انتبجاذ مركجزي اخجرى بسجرعة 7دورة في الدقيقة ( لمدة 34000المركزي )

كحججول اصثيمججي. والججتخمص مججن بقايججا ‎ض النججووي الموجججود فججي اصعمججدةالفمتججر الحججاوي عمججى الحمجج ألجججل تجفيججف دقيقججة 7لمججدة ،دقيقججة . AW2وىذه الخطوة تمنع من انتقال الكحول مع الخميط وجمعت في انبو جديد. بعد الغسل مع بفر

-35دقجائق فجي درججة حجرارة الغرفجة ) 5التحضجين لمجدة الى الفالتر الناتجة من الخطوة السابقة بعدىا AEاضيف بفر -37 دورة في الدقيقة( لمدة دقيقة واحدة. 8000ثم نقمت اصنابي الحاوية عمى الفالتر الى جياز الطرد المركزي )درجة مئوية(، 75

Page 6: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

341

ميكروليتجر مجن 50 ىجذه الخطجوة باضجافة إعجادةومجن الممكجن جديجد كجررت الخطجوة السجابقة مجرة اخجرى باسجتخدام انبجو -31 لة يكون تركيز الحمض النووي اقل.الى الفالتر، وفي ىذه الحا AE بفر

PCRتزاعل البممرة المتسمسل -2

-Readyباسجتخدام Polymerase chain reaction (PCR)كقالج فجي التفاعجل البممجرة المتسمسجل DNAاسجتخدم الجج

To-Go PCR Beads kit من شركةGE Healthcare وكاصتي: / المممكة المتحدة Taqو انجزيم MgCl2 ،dNTPsمجايكروليتر ويتكجون مجن محمجول التفاعجل، 75متفاعجل ىجو كجان الحججم النيجائي ل -3

polymerase مججججججايكروليتر مججججججن المججججججاء المقطججججججر باإلضججججججافة 17التججججججي تكججججججون عمججججججى شججججججكل مججججججادة جافججججججة والتججججججي اذيبججججججت فججججججي .DNAيتر من الج مايكرول 7( و 1جدول المايكروليتر من كل من البادئات الموضحة أدناه ) 3 الى

المستخدم لتشخيص نيماتودا تعقد الجذور : صزات البادئ2الجدول نوع

نيماتودا تعقد الجذور

حجم الحزمة اسم البادئ ( 3- 5تسمسل البادئ من ) (bp)

المصدر

Meloido

gyne incognita

CGCGAATRGCTCATTACAACAGC Forward primer

Nem-18S-F

898 Robin

et al.,

2005 GGGCGGTATCTGATCGCC Reverse primer

Nem-18S-R

دورة 15ْم ثجم 94دقجائق بدرججة حجرارة 5لمجدة Intial Denaturation ظروف التفاعل تبدا بخطجوة مرحمجة المسجال اصولجي 54ثانيجو بدرججة حجرارة 10لمجدة Annealingْم ثم اصلتصجاق 94ثانية بدرجة حرارة 10تتكون من ثالث مراحل تبدأ بالتفكك مدة

Finalتبدأ الخطوة األخيرة لمتفاعل المتمثمة بالتمدد النيائي . بعدىا ̊م 77ثانية بدرجة حرارة 60لمدة Extensionالتمدد بعدىا̊ م

extension ̊م 77دقائق بدرجة حرارة 30لمدة .

rDNA18s: برنامج تضاعف الجين 3الجدول

Cدرجة الحرارة عدد الدوراتº عدد الدورات الوقت

- دقائق Intial Denaturation 94 5مرحمة المسال اصولي

ثانية Denaturation 94 10 المسال

ثانية Annealing 54 10 اصلتحام)التصاق( دورة 35

ثانية Extension 77 60 اصستطالة

- دقائق Final extension 77 10 مرحمة اصستطالة النيائية

- - Storing 4 نيائية لمخزنالمرحمة ال

-10 % لمجدة3.5تركيجز Agroseباسجتخدام الترحيجل الكيربجائي عمجى وسجط ىجالم PCRمرحمة الترحيل رحجل نجاتج الجج

( لتحديد حجم حزمجة تفاعجل 100pb) Ladderمايكروليتر من صبغة بروميد اصثيديوم بوجود دليل حجمي 5دقيقة بعد إضافة 60لتبدأ حركة الحامض النووي من القطج السجال الجى القطج الموجج 65فولت وتيار 70ىالم اصكروز بفولتية مقدارىا البممرة عمى

Page 7: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

344

عمى طول موجي UV transiluminator وبعد اكتمال عممية الترحيل تم مالحظة الحزم باستخدم جياز اصشعة الفوق البنفسجية نانوميتر لغرض فحص نتائج التفاعل. 365

فجي سجيئول Macrogen ة ْم لغجرض ارسجالو الجى شجرك 70 –فجظ نجاتج التفاعجل الفجائض فجي الثالججة تحجت درججة حجرارة ح وتم تحميل النتائج باستخدام طجرق مختمفجة مجن المعموماتيجة DNA /كوريا الجنوبية المختصة بتحديد التسمسل النوكميوتيدي لعينات الج

امريكججا وحسجج الموقججع المركججز الججوطني لممعمومججات الحيويججة/ إلججىلغججرض التوثيججق رسججالياوا الجميججل الحيويججة مججن قبججل د.عججدنان عبججد المتخصصين. أسئمةعمى واإلجابةوبعد ملء البيانات /https://www.ncbi.nlm.nih.gov اصلكتروني

النتائج والمناقشة ودليل فهرست العقد الجذرية: اإلصابةنسبة

( ان أعمى نسبة اصابة سجمت في بغداد/ مزرعة الزعفرانية/ الحقل تمتيا نفس المنطقة البيت 4الجدول )يتضح من نتائج % لكل منيما عمى التوالي في حين وصل دليل فيرست العقد 93.3% و100اذ وصمت نسبة اصصابة الى 1البالستيكي وفي كربالء محطة ،لكل منيما عمى التوالي، لوحظت أقل نسبة اصابة في بغداد/ مزرعة الزعفرانية/ الظمة 3و 1الجذرية الى

0دليل فيرست العقد الجذرية الى لكل منيما عمى التوالي ووصل30% % و6.6بستنة اليندية الظمة اذ وصمت نسبة اصصابة الى اختالف طرق الري من منطقة صخرى في مواقع الدراسة الى اإلصابةلكل منيما عمى التوالي، وربما يرجع التباين في نس 1و

(. وربما يرجع سب ان الشتالت في الظمة كانت مزروعة في اكياس من البولي اثمين اصسود والمعروف عن المون 2014 ،)عياشصسود انو يمتص الحرارة وبالتالي تقمل من كمية الرطوبة التي تحتاجيا النيماتودا وتجف التربة بسرعة مقارنة مع تمك المزروعة في ا

اصرض حيث تحتفظ اصرض بالرطوبة لفترة أطول نتيجة لزيادة المساحة السطحية ليا مقارنة مع اصكياس. وىذا يعرض األكياسالشمس لفترات طويمة قبل تعبئة ألشعةربة معرضة وقد يكون السب ىو ترك اصحا المشاتل الت

النيماتودا صشعة الشمس المباشرة وبالتالي الجفاف وقمة أعدادىا وربما يعود السب الى حساسية اصصناف المزروعة في كل موقع العقد أعداداتودا في المواقع التي قمت بيا نتيجة وجود بعض المفترسات والمتطفالت التي تتطفل عمى النيم من مواقع الدراسة او

لمدفاع عن نفسو او العمميات إضافيةالتي تزود النبات بوسائل األسمدةواصناث وكتل البيض وربما بسب استخدام المبيدات او و المصري 1992 ،او أكثر تؤثر عمى أطوار النيماتودا وبالتالي تنعكس عمى اصصابة )الحازمي األسبا الزراعية واحد من ىذه

وربما عدم مالئمة الصنف المزروع لمنيماتودا أو ان المواد الغذائية لمجذر كانت غير ( Ali et al., 2016؛ 2011،واخرون . تطورىا عمى المجموع الجذري إكمالمستساغة ولم تكمل دورة حياتيا وربما كانت اصصابة حديثة ولم تتمكن النيماتودا بعد من

نيماتودا تعقد الجذور عمت الزيتون في مواق المسحوالدليل المرضي ل سبة االصابة: ن4الجدول

الدليل المرضي نسبة االصابة مواق الدراسة

بغداد / مزرعة الزعفرانجججججججججججججية

1 91.1 3بيت بالستيكي

1 80 7بيت بالستيكي

1 51.1 1بيت بالستيكي

1 80 4بيت بالستيكي

0 6.6 مةظ

1 300 حقل

Page 8: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

345

بابل / السجججججدة

7 85.7 3بستان

1 85.7 7بستان

7 85.7 1بستان

7 81.1 حقل كربالء/العطيشي

3 10 ظمة كربالء/ محطة بستنة اليندية

: Perineal Pattrenتشخيص نوع نيماتودا تعقد الجذور باالعتماد عمت الصزات المورفولوجية لمنمط العجاني يرت نتائج التشخيص بطريقة النمط العجاني الى وجود نوعين من نيماتودا تعقد الجذور في المناطق الممسوحة وىي اظ

M.javanica و M.incognita( الذي يمثل مقطع لمنمط العجاني لمنوع 1اذ نالحظ من الشكل )M.javanica والذي تميز Dorsal Archقسم النمط العجاني الى منطقتين وىي المنطقة الظيرية بشكل واضح ي Lateral fieldبوجود الحقمين الجانبين

وتعد اىم صفة يمتمكيا ىذا النوع، تمتاز المنطقة الظيرية بخطوط كيوتكل خشنة مستقيمة الى Ventral Archوالمنطقة البطنية مميزة نياية الذيل واضحة برميمية تكون Anusوفتحة المخرج Vulva متموجة الشكل ذات قوس دائري منخفض، الفتحة التناسمية

Aydinli and ؛ Tuminem et al., 2015؛ (Eisenbach et al.,1981 وتطابقت ىذه الصفات مع دراسات سابقة ،الشكل

Mennan, 2016. )

M.javanica : النمط العجاني لنيماتودا تعقد الجذور3الشكل

اتصف الشكل المورفولوجي لمنمط العجاني M.incognita وىو اما النوع الثاني من نيماتودا تعقد الجذور أو الحقول الجانبية بصورة واضحة في النموذج فضال عن وجود فواصل او تجاعيد بدص عنيا ( بعدم وجود الخطوط4)شكل ال

خشنةنياية الذيل برميمية او وتميزت المنطقة الظيرية بارتفاعيا وبدت مربعة الشكل تقريبا، خطوط الكيوتكل ناعمة الى متعرجةمخرج واضحة عمى النمط العجاني كما ىو الحال مع النوع الفتحة التناسمية وفتحة ال M.javanica المظير كما في النوع

M.javanica وىو مطابق لما ذكرهEisenbach et al., 1981 ؛Tuminem et al., 2015 ؛ Aydinli and Mennan, 2016 .

فتحة المخرج

انذنب

الحقالن الجانبيان

البطنية المنطقة

انمنطقة انظهرية

سهية انفتحة انتنا

انتناسهية

Page 9: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

346

M. incognita : النمط العجاني لنيماتودا تعقد الجذور 4الشكل Polymerase Chain Reactionتشخيص نوع نيماتودا تعقد الجذور باالعتماد عمت تزاعل البممرة المتسمسل

PCR) ) المزرعة النقيةاتجة من الترحيل الكيربائي لعزلة نيماتودا تعقد الجذور المعزولة من ( ان حجم الحزمة الن5يبين لنا الشكل )

.898bpوالتي بمغت

خطىط انكيىتكم متعرجة

انحقىل انجانبية غير

واضحة ووجىد تجاعيذ او

فىاصم بذال عنها

موجودة المخرج فتحة

برميلية الذيل نهاية

مرتفعة الظهرية المنطقة

مربع شكلها تقريبا

متعرجة الكيوتكل خطوط

وخشنة

واضحة التناسلية الفتحة

Page 10: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

347

. 898bp: حجم الحزمة الناتجة من الترحيل الكهربائي5الشكل لنيماتودا تعقد الجذور ومقارنتيا مع 898 ذات الحجم 18S rRNAتم تسجيل تتابع القواعد النيتروجينية لجين

Center Biotechnologyامريكا عموماتية اصحيائية /( بعد مراسالت مع المركز الوطني لمم6) شكلالمايماثميا من النوع

Information (NCBI) المختصين تم تأكيد تشخيص النوع أسئمة عمى واإلجابة Meloidogyne incognita وىو تشخيص وتم تسجيميا كما موضح في Perineal Pattren التشخيص بطريقة النمط العجاني أثناءتأكيدي لمنتائج التي حصمنا عمييا

( عمما ان الجية المانحة: المركز الوطني لممعمومات اصحيائية /أمريكا 7( والشكل )6الجدول )

الزيتون في محافظة كربالء. اشجار : الرقم العالمي لمعزلة العراقية واسم الجين لنيماتودا تعقد الجذور المعزولة من6الجدول

الموق االلكتروني العزلةعدد القواعد

يةالنيتروجين اسم الجين المسجل الرقم العالمي

Meloidogyne

incognita 18S subunit

Ribosomal RNA

gene partial sequence

https://www.

ncbi.nlm.nih.gov

898

bp

MF511

154.1

ITS/ rDNA

region

Page 11: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

348

لمنيماتودا.18S rRNA : مقارنة بين تسمسل تتاب قواعد النيوكميوتيدات لجين 6الشكل

: المعمومات المسجمة في الموق العالمي لبنك الجينات يوضح جمي المعمومات المتعمقة بالجين المسجل والمعزول 7 الشكل

بنيماتودا تعقد الجذور الزيتون المصابة من اشجار

ار الى انتشار نيماتودا تعقد الجذور عمى أغم الذي اشet al., 1988 Stephan ويؤيد النتائج التي حصمنا عميياعمى الزيتون وعمى بقية المحاصيل المزروعة في M.incognita و M.javanicaالنباتات المزروعة في العراق وشخص النوعين

العراق.

Page 12: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

وآخرون وارف محمد حنون

349

العربية المصادر. نيماتودا النبات في البمدان (2010)يع دوابة عبد السم،احمد؛ عزيز اسطيفان،زىير ؛سعد الحازمي ،احمد ؛ابو غربية، وليد ابراىيم

العربية الجزء اصول والثاني، دار وائل لمطباعة والنشر. .77 -22،3 .(. النيماتودا المصاحبة لمنباتات في البمدان العربية. مجمة وقاية النبات العربية7004العزة ) ،طم ؛وليد ،أبوغربية .15نواع نيماتودا تعقد الجذور في العراق. وزارة الزراعة. مطبعة الزىور. بغداد (. تشخيص ا3955عبد الرزاق ) ،اصعظمي

جامعة ، . عمم أمراض النبات( (1976محمد فييم ،مصطفى؛ الشييد أحمد ،عبد اهلل؛ محمود ماىر ،رج ؛ ثابت، كمال عمي .كمية الزراعة مطبعة السعادة، القاىرة

ص.173 ،نيماتولوجيا النبات، الطبعة األولى كمية الزراعة مطابع جامعة الممك سعود(. مقدمة في 3997الحازمي، احمد بن سعد )(. إنتاج الفاكية. مطبعة دار الكت لمطباعة والنشر. جامعة 7000خضر سعيد الراوي ) ،عادل؛عمي حسين عبد اهلل ،الدوري

ص. 574العراق. ،موصل ،الموصلة وتشخيص ديدان العقد الجذرية عمى النباتات القثائية في محافظة بغداد . رسالة (. ديناميكي3974فرقد عبد الرحيم ) ،الراوي

جامعة بغداد. –كمية الزراعة –ماجستير المصاحبة Meloidogyne spp.‎ وسالصت نيماتودا تعقد الجذور ألنواعمسح (. ‎2014‎ فالح السبع ) ،رياض؛ لؤي مطر ،عياش

. ‎289‎ - ‎301‎ ،خاص ببحوث المؤتمر الرابع( )عدد ‎12‎ لمعموم الزراعية نوى. مجمة اصنبار لنباتات الباذنجان في محافظة ني(. تشخيص الديدان الثعبانية المسببة لمرض تعقد الجذور التي تصي الخضروات وغربمة بعض اصناف 3980اكرم حمدي ) ،قاسم

رسالة Fusarium solaniلوحدىا وبمصاحبتيا الفطر بالنيماتودا لإلصابةمدى مقاومتيا إليجادالخضروات الميمة جامعة الموصل . –كمية الزراعة والغابات -ماجستير

،(. تصنيف النباتات البذرية. الطبعة الثانية. مطبعة دار الكتا لمطباعة والنشر. جامعة الموصل7000يوسف منصور )، الكات ص . 584العراق. ،موصل

العراق (. الجياز المركزي لإلحصاء، وزارة التخطيط.7035مديرية اإلحصاء الزراعي )النيماتودية المتطفمة المرافقة لتربة القطن (. ديناميكية المجتمعات ‎2011‎ ابو الفضل ) ،تيسير؛ العسعس ،خالد؛ المصري، ميمونة

. ‎27‎ ( ‎1‎ )، ‎351‎ - ‎364 ‎ .مجمة جامعة دمشق لمعموم الزراعية وجذوره في المنطقة الوسطى من سورية.

األجنبيةالمصادر Agrios, G.N. (2005). ''Plant Pathology''. 5

th ed. Elsevier Academic Press. 948 p.

Ali, N.; Johannes, T.; Elodie, C.; Thierry, M. (2016). Trend to Explain the Distribution of Root

Knot Nematodes Meloidogyne spp. Associated with Olive Trees in Morocco. J. Agriculture,

Ecosystem and Environment. 225,22-32

Aydinli, G.; Mennan, S. (2016). Identification of Root Knot Nematode (Meloidogyne spp.) From

Greenhouse in The Middle Black Sea Region of Turkey. Turkish J. Zoology. 40,675-685. Barker, K.R. (1985). Nematode extraction and bioassays. An advanced treatiseon Meloidogyne. In:

Baker KR, Carter CC, Sasser JN., editors Methodology. vol II. Raleigh, NC: North Carolina

State University Graphics; pp. 19–35.

Cook, R.J. (2000). Advances in Plant health management in the twentieth century. Annu. Rev.

Phytopathol. 38, 95–116. Eisenback, J.D.; Hirschmann H.; Sasser J.N.; Trianttaphyllou A.C. (1981). A guide to the four most

common species of Root Knot Nematode (Meloidogyne spp.) with A Pictorial Key.

Washington DC (US): North Carolina State University.

Page 13: Morphological and Molecular Diagnosis of Root Knot ......ÁÃرخآÃ ÁÃوح دمحم ¼راÃ 343 لبق نم عوضوما Meloidogyne spp. روذجا دقعت ادوتامين

............التشخيص المورفولوجي والجزيئي ألنواع نيماتودا

350

Haroon, S.; Al-Ghor, A.A.; El-Rheem, M.A.; Abdella, E. (2003). Identification of differential root-

knot nematodes and detection of intra- species and intra- population genetic variabilities

between different nematode samples using RAPD technique. Arab J. Biotechnol., 6(2), 247-

266.

Hartman, K.M.; Sasser, J.N. (1987). Identifcation of Meloidogyne species on the basis of

differential host and perineal-pathern morphology. In :An Advanced (Barkey; C.C. Carter and

J.N. Sasser, eds PP.69-7. North Carolina state Univ. graphics.

Jepson, S. (1983). Identification of Meloidogyne : a general assessment and a comparison of male

morphology using light microscope, with akey to 24 species . Rev . Nematol., 6, 291-309.

Karajeh, M.R. (2004). Identification, Distribution, and Genetic Variability of the Root-knot

nematode (Meloidogyne spp.) on Jordan . ph. D. Thesis, University of Jordan. 152 p.

Karajeh, M.R.; Abu-Gharbiea, W.I.; Masoud S.A. (2005). First report of the Root-Knot Nematode

Meloidogyne arenaria Race 2 from Several Vegetable Crops in Jordan . Pl. Dis., 89(2), 206.

Karrsen, G. (2002). The plant – parasitic nematode genus Meloidogyne Goldi 1892 (Tylenchida) in

Europe. Koninklijke Brill NV, Leiden, The Netherlands. 157 p.

Katcho, Z.A. (1972). First occurance of certion root – knot nematodes spp. In Iraq . Plant Dis.

Reptr. 56, 824. Robin, M.F.; Alex, D.R.P.; Johan, D.L.; Craig R.S. (2005). Nematode-specific PCR primers for the

18S small subunit ‎rRNA gene. Natural Environment Research Council, British Antarctic

Survey, High Cross, Madingley Road, Cambridge, CB3 0ET, UK

Stephan, Z.A. (1988). Newly reported hosts of root-knot nematode in Iraq. Int. Nematol. Net Work.

Newsl. 5(3),36-43

Taylor, A.L.; Sasser, J.N. (1978). Biology. Identification and control of root – knot nematodes

(Meloidogyne spp.) Coop. Pub. Dep. Plant pathol. North Carolina state Univ., and U.S.

Agency. In. T. Dev. Raleigh, N. C.111 p.

Taylor, D.P.; Netscher, C. (1974). An inproved techniaue for preparing perinealpatterns of

Meloidogyne spp. Nematologica. 20, 268-269.

Tuminem, S.; Meity, S.S.; Giyanto (2015). First Report on The Root Knot Nematodes Meloidogyne

spp. of Sweetpotatoes in Sorong Regency, West Papua Indonesia. International J. Sci. Basic

and Applied Research (IJSBAR). 21(2),325-334 Zijlstra, C.; Lever, A.E.M.; Uenk, B.J.; Van Silfhout, C.H. (1995). Differences between ITS regions

of isolates of root-knot nematodes Meloidogyne hapla and M. chitwoodi. Phytopathology.

85,1231-1237.