modul mikrobiologi 1314-1

8/18/2019 MODUL Mikrobiologi 1314-1

1/15

0

MODUL

MIKROBIOLOGI AIR (BDI 206)

MIKROBIOLOGI AKUATIK (BDI612205)

Oleh:

ESTI HARPENI, S.T., MAppSc.

PROGRAM STUDI BUDIDAYA PERAIRAN

FAKULTAS PERTANIAN

UNIVERSITAS LAMPUNG

20!

MIKROORGANISME PERAIRANModul Mikrobiologi Air_EH 2013


2/15

1

A. KOMPETENSI DASARMahasiswa memiliki pemahaman an! "aik #en#an! mik$%%$!anisme

pe$ai$an&

B. INDIKATOR1& Mahasiswa 'apa# menelaskan 'en!an "aik 'enisi mik$%%$!anisme

pe$ai$an&2& Mahasiswa 'apa# mene"*#kan "e$"a!ai kel%mp%k mik$%%$!anisme

pe$ai$an&+& Mahasiswa 'apa# menelaskan ka$ak#e$is#ik *m*m masin!,masin!

kel%mp%k mik$%%$!anisme pe$ai$an&-& Mahasiswa 'apa# mem"e$ikan .%n#%h spesies 'a$i "e$"a!ai kel%mp%k

mik$%%$!anisme pe$ai$an 'ise$#ai ka$ak#e$is#ik se$#a pe$an spesies

#e$se"*#&

". LEMBAR KEGIATANLK .. P#$%'$('% )&*&+l&h pe#(&-&&pe#(&-&& +e#'%/( '' e1& +e 1& Apa an! 'imaks*' 'en!an mik$%%$!anisme pe$ai$an /2& e"*#kan kel%mp%k,kel%mp%k mik$%%$!anisme pe$ai$an +& elaskan s#$*k#*$ 'an si%l%!i 'a$i p$%ka$i%#ik (kesamaan #*$ pa'a

'%main Bacteria 'an Archaea)

LK .2. B&c(e#'& & A#ch&e& )&*&+l&h pe#(&-&&pe#(&-&& +e#'%/( '' e1& +e 1& B*a#lah esai men!enai minimal 1 kel%mp%k an! #e$!%l%n! 'alam D%main

Ba.#e$ia 2& B*a#lah esai men!enai minimal 1 kel%mp%k an! #e$!%l%n! 'alam D%main

A$.haea LK .!. P#$('3(& & F/1'1& elaskan men!enai is#ilah,is#ilah "e$ik*# ini

• Noctiluca

• Pfesteria piscicida

• Ca!obacteria

• Ma$ine li.hens2& elaskan - pe$an 3*n!i 'i pe$ai$an LK .4. V'#/3B*a#lah esai men!enai pen!a$*h 4i$*s 'i pe$ai$an

Modul Mikrobiologi Air_EH 2013


3/15

2

D. BAHAN BA"AAN

MIKROORGANISME PERAIRAN

Mik$%%$!anisme pe$ai$an a'alah %$!anisme "e$*k*$an mik$%sk%pis an!

hi'*p 'i lin!k*n!an pe$ai$an& en!el%mp%kkan mik$%%$!anisme pe$ai$an

men!ik*#i #i!a '%main p%h%n kehi'*pan7& 8il%!ene#ik p%h%n kehi'*pan ini

men*n*kkan "ahwa #i!a '%main #e$se"*# "e$"e'a 'a$i origi!al u!i"ersal

a!cestor ,na (Gam"a$ 1)& 9p%#he#i.al an.es#%$ ini men*n*kkan "ahwa

kehi'*pan "e$kem"an! ke '*a a$ah *#ama& a#* a$ah "e$e4%l*si mena'i

Ba.#e$ia: se'an!kan a$ah an! lain #e$"a!i la!i mena'i s*"'i4isi A$.haea 'an

;*ka$a& A$.haea: an! sem*la 'ian!!ap se"a!ai kel%mp%k kh*s*s 'a$i "ak#e$i:

se"ena$na *s#$* se.a$a l%!ene#ik le"ih 'eka# kepa'a ;*ka$a 'a$ipa'a

Ba.#e$ia& Ba.#e$ia 'an A$.haea a'alah kel%mp%k an! san!a# "e$"e'a ka$ena

masin!,masin! memiliki sea$ah e4%l*sina sen'i$i& Me$eka sama,sama memiliki

%$!anisasi sel an! se'e$hana: nam*n memiliki "anak pe$"e'aan an!

men'asa$ (Ta"el 1)&

G&5+ . implikasi #i!a '%main p%h%n kehi'*pan& Aka$ 'a$i p%h%nkehi'*pan ini 'ihip%#esiskan se"a!ai se"a!ai u!i"ersal a!cestor an! "e$e4%l*si'a$i kehi'*pan p$esel*le$ ( proge!otes) (M*nn: 200-)&

T&+el . e$"e'aan 8i#*$ el*le$ Men'asa$ Ti!a D%main %h%n Kehi'*pan (M*nn:

200-)

P#$pe#(' B&c(e#'& A#ch&e& E/%-&#$*k#*$ sel $%ka$i%#ik $%ka$i%#ik ;*ka$i%#ikCo"ale!tl closed circular#NA


4/15

+

sel#$*k#*$ $i"%s%m >0 >0 ?0

(>0 'i %$!anel)#R=A inisia#%$ pa'asin#esis p$%#ein

=,3%$mlme#hi%nine

Me#hi%nine Me#hi%nine (=,3%$ml

me#hi%nine 'i%$!anela)ensi#i4i#as elo!gatio!$actor #e$ha'ap #%ksin'i3#e$i

Ti'ak 50

m (%ari!e prokarotes)&

G&5+ 2. kema s#$*k#*$ sel p$%ka$i%#ik& 9ana se'iki# $i"%s%m: i!clusio!bod 'an p$%#ein pe$m*kaan an! a'a& Te$'apa# 4a$iasi s#$*k#*$ ampl%p 'anpe$m*kaan 'i alam (M*nn: 200-)&



5/15

-

T&+el 2. Ka#e!%$i n*#$isi mik$%%$!anisme

. BA"TERIA

e.a$a se'e$hana: '%main Ba.#e$ia 'apa# 'ia"a$kan 'alam s*a#* p%h%n

l%!ene#ik an! men*n*kkan keke$a"a#an melal*i seC*en.in! 16 $R=A&

e"a!ian "esa$ 'i4isi men'iami ha"i#a# la*# (Gam"a$ +)& Be"e$apa

kel%mp%k '%main Ba.#e$ia: 'ielaskan 'alam m%'*l ini& Ba.#e$ia memiliki

ka$ak#e$is#ik an#a$a lain mem"$an lipi' an! #e$s*s*n 'a$i 'ia.l !l.e$%l

'ies#e$: $R=A "a.#e$ia 'an R=A p%lme$ase an! se'e$hana&

G&5+ !& %h%n l%!ene#ik '%main Ba.#e$ia& e#ak #e"al men*n*kkanha"i#a# la*# (M*nn: 200-)&

&. B&%(e#' F$($(#$6% A$%3'1e'%

&7Purple sulfur & nonsulfur bacteria

Bak#e$i ini #e$!%l%n! $%#e%"a.#e$ia 3%#%#$%k an! #i'ak

men!hasilkan %ksi!en selama 3%#%sin#esis& Purple phototroph

men!an'*n! bacteriochlorophll se"a!ai pi!men 3%#%sin#esis an!

"e$sama pi!men carote!oid mem"e$ikan wa$na "e$"e'a pa'a

"ak#e$i& Purple sul$ur bacteria men!!*nakan 92 a#a* k%mp%nen



6/15

5

$e'*ksi s*l3*$ se"a!ai s*m"e$ $e'*k#an& e"a!ian "esa$ (an!

#e$!%l%n! γ ,$%#e%"a.#e$ia menempa#i se'imen anae$%" 'i 'ana*

'an!kal 'an ma#a ai$ "e$s*l3*$: ke.*ali "e"$apa #ipe sepe$#i

'hiocapsa 'an Ectothiorhodospira *!a 'apa# 'i#em*kan 'i se'imen

la*# 'an!kal an! anae$%" 'an ke'alaman an! #in!!i ka'a$ 9 2

na 'an sina$ ma#aha$i masih 'apa# mas*k& e'an!kan purple

!o!sul$ur bacteria (α, a#a* β,$%#e%"a.#e$ia) 'apa# #*m"*h se.a$a

ae$%"ik 'alam ke!elapan men!!*nakan k%mp%nen %$!anik a#a* 92

se"a!ai '%n%$ elek#$%n& Banak p*la an! mamp* #*m"*h se.a$a

3%#%a*#%#$%3 men!!*nakan O2 'an 92 a#a* 3%#%he#e$%#$%3

men!!*nakan k%mp%nen %$!anik sepe$#i ka$"%n&

b)Green sulfur bacteriaKel%mp%k ini memiliki kemi$ipan me#a"%lisme 'en!an purple sul$ur

bacteria wala*p*n #e$pisah se.a$a l%!ene#ik 'a$i $%#e%"a.#e$ia&

=am*n s*l3*$ 'ihasilkan 'i l*a$ sel "*kan 'i 'alam sel !$an*la&

Kel%mp%k ini memiliki bacteriochlorophll c( d a#a* e) i!men

#e$se"*# #e$'apa# 'alam .hl%$%s%me (s#$*k#*$ ika#an mem"$an)&

+. B&%(e#' F$($(#$6% O%3'1e'% 8 "-&$+&c(e#'&

an%"a.#e$ia memiliki kemamp*an melak*kan 3%#%sin#esis ae$%"ik

('an anae$%"ik) 'en!an "an#*an chlorophll a "e$sama 'en!an

phcobili!: e"el*mna se$in! 'i!%l%n!kan se"a!ai Blue *ree! Algae&

an%"a.#e$ia menempa#i ha"i#a# l*as 'a$i 'a$a#an sampai la*#an

#e$mas*k wilaah "e$s*h* eks#$im 'an k%n'isi hpe$saline& Gene$a

*#amana a'alah +!echococcus 'an Prochlorococcus an!

"e$%n#$i"*si "esa$ 'alam sikl*s ka$"%n&

c. B&%(e#' N'(#'6%&3'

Bak#e$i ini #*m"*h men!!*nakan k%mp%nen ni#$%!en an%$!anik an!

#e$e'*ksi se"a!ai '%n%$ elek#$%n& Bak#e$i ini "e$a'a 'i pa$#ikel,pe$#ikel

#e$s*spensi 'an 'i lapisan a#as se'imen #e$mas*k Nitroso%o!as 'an

Nitrosococcus&

. Ke5$l'(#$($9 Pe1$%3'&3' S/l9/# & Be3'

'hiobacillus( Beggiatoa( 'hiothri, 'an 'hio"ulu% *m*mna ae$%":

'i#em*kan 'i se'imen la*# "a!ian a#as an! kaa s*l3*$ a#a*

hdrother%al "e!ts 'an cold seeps "aik hi'*p "e"as a#a* "e$sim"i%sis&

'hioploca 'an 'hio%argarita a'alah !ene$a kem%li#$%#%3 pen!%ksi'asi

s*l3*$ "e$"en#*k lamen an! pen#in! 'alam %ksi'asi s*l# 'i se'imen



7/15

6

ana$%"& Bak#e$i ini 'apa# hi'*p se.a$a a*#%#$%ph ma*p*n miks%#$%k

men!!*nakan m%lek*l %$!anik se"a!ai s*m"e$ ka$"%n&

e. B&%(e#' Pe1$%3'&3' H'#$1e

Kel%mp%k sepe$#i A-ui$e, mamp* men!%ksi'asi 92 se.a$a

kem%a*#%#$%3& Me$eka "iasa "e$as%siasi 'en!an se'imen 'an pa$#ikel,

pa$#ikel #e$s*spensi 'imana k%nsen#$asi %ksi!en 'i "awah 10E a'alah

k%n'isi %p#imal pe$#*m"*hanna&

9. R'c%e((3'&

G$am ne!a#i3 ke.il an! %"li!a# pa$asi# pa'a sel hewan 'an "e$eplikasi

'i si#%plasma se"el*m mene"a"kan lisis sel inan!na&

1. Sp'#'ll&

B'ell%4i"$i% a'alah salah sa#* .%n#%hna: an! meman!sa "ak#e$i

G$am ne!a#i3 lainna& B'ell%4i"$i% menempel pa'a man!sana:

men!*"*$ 'i$i 'alam 'in'in! sel 'an "e$eplikasi 'i periplas%ic space

mene"a"kan lsis sel inan! 'an melepaskan sampai +0 anakanna&

h. P#$(e$+&c(e#'& Pe#e/%3' S/l9/# & S/l9&(

Te$!%l%n! δ,$%#e%"a.#e$ia: men!!*nakan k%mp%nen %$!anik a#a*

h'$%!en se"a!ai '%n%$ elek#$%n 'an O-2, a#a* s*l3*$ se"a!ai

aksep#%$ elek#$%n ('issimila#%$i s*l3a#)&

'. B&%(e#' G#&5 p$3'('9

D*a .a"an! "ak#e$i G$am p%si#i3 ai#* F'#5'c/(e3 an! *nisel 'an

$en'ah $asi% GFna se'an!kan Ac('$+&c(e#'& memiliki m.elia 'an

#in!!i $asi% GFna& %n#%h 8i$mi.*#es a'alah Bacillus 'an

Clostridiu%& %n#%h A.#in%"a.#e$ia a'alah Mcobacteriu% %ari!u%&

. "-($ph&1&Fl&;$+&c(e#'/5B&c(e#$'e3


8/15

>

2. AR"HAEA

Ka$ak#e$is#ik '%main A$.haea an#a$a lain a'alah mem"$an lipi' an!

#e$s*s*n 'a$i is%p$en%i' !l.e$%l 'ie#he$ a#a* 'i!l.e$%l #e#$ae#he$: $R=A

a$.haea: 'an R=A p%lme$ase an! k%mpleks& %h%n l%!ene#ik A$.haea

mem"a!i + l*m *#ama ai#* ;*$a$.hae%#a: $ena$.hae%#a 'an

K%$a$.hae%#a (Gam"a$ -)&

G&5+ 4. %h%n l%!ene#ik '%main A$.haea& e#ak #e"al men*n*kkan ha"i#a#

la*# (M*nn: 200-)

&. E/#-ch&e$(&

&7Me(h&$1e

Me#han%!en "e$si3a# mes%phili. a#a* #he$m%phili.: 'apa# 'iis%lasi

'a$i "e$"a!ai ha"i#a# #e$mas*k sal*$an pen.e$naan hewan: se'imenan%ksik 'an ma#e$ial #e$'ek%mp%sisi& Me#han%!en melak*kan

"i%'e!$a'asi anae$%"i. ma#e$ial %$!anik an! men!hasilkan

me#hane se"a!ai p$%'*k akhi$&

+7H-pe#(he#5$ph'l'c "he5$$#1&$(h#$ph 8 Thermococcus &

Pyrococcus

Gene$a ini "anak 'i#em*kan 'i h'$%#he$mal 4en#s 'en!an s*h*

pe$#*m"*han %p#im*m ?00 &

c7H-pe#(he#5$ph'l'c 3/l9&(e#e/ce#3 & '#$$=''>e#3 8

Archaeoglobus & FerroglobusModul Mikrobiologi Air_EH 2013


9/15

?

Gene$a ini #e$!%l%n! %$!anisme anae$%"ik an! men!k%m"inasikan

$e'*ksi s*l3a# mena'i %ksi'asi 92 'an k%mp%nen %$!anik: an!

men!hasilkan 92&

7E=(#e5e h&l$ph'le3

T*m"*h pa'a k%nsen#$asi =aL le"ih 'a$i E "ahkan men.apai

+5E& Um*mna 'i#em*kan 'i 'ana* !a$am sepe$#i G$ea# al# Lake:

U#ah 'an La*# Ma#i&

+. "#ech&e$(&

&7H-pe#(he#5$ph'le3 8 De3/l9/#$c$cc&le3

O"li!a# anae$%" 'en!an sel "e$"en#*k .%..*s 'an "anak

'i#em*kan 'i h'$%#he$mal 4en#s& &

+7Uc/l(e#e p3-ch#$ph'l'c 5'e "#ech&e$(&

elama ini: an!!%#a $ena$.hae%#a 'ikenal se"a!ai e@#$eme

#he$m%philes: nam*n kem*'ian 'i#em*kan an!!%#a lain 'i pe$ai$an

%li!%#$%k #e$mas*k An#a$#ika 'an la*# 'alam 'en!an s*h* ,20 &



10/15

II. EUKARYOTIK

T&+el !. e$"e'aan sel p$%ka$%#ik 'an e*ka$%#ik

$%#is#a 'an 3*n!i sama,sama memiliki n*kle*s an! 'iika# %leh '*a mem"$an

n*kle*s 'an 'ilan*#kan 'en!an sis#em kanal mem"$an ai#* $e#ik*l*m

en'%plasma: se$#a memiliki %$!anel an! lain ai#* $i"%s%m 'an G%l!i appa$a#*s&



11/15

10

G&5+ ?. Taks%n%mi e*ka$%#i. m%'e$n (M*nn: 200-)

. PROTISTA

$%#is#a melip*#i sel*$*h %$!anisme e*ka$%#ik an! #i'ak #e$!%l%n!

kin!'%m plan#ae: animalia ma*p*n 3*n!i&

&. Fl&1el&(& &$pl&%($'%

;*!leni' J Ha!ela#a he#e$%#$%k 'an mi@%#$%k "e$*k*$an 2,20 m

(nan%plank#%n)& Kel%mp%k ini me$*pakan !$ae$ "a.#e$ia an! san!a#

esien ka$ena kemamp*anna "e$enan!& eman!sana a'alah $%#is#a

an! le"ih "esa$ (.ilia#a 'an 'in%Ha!ela#a)& Be"e$apa mamp* 'iis%lasi

'i la"%$a#%$i*m& %n#%h kel%mp%k ini J Paraphso%o!as 'an

.chro%o!as

Kine#%plas#i' J Bodo an! selna %4al panan!na -,10 m

h%an%Ha!ela#a 'en!an Ha!ell*m #*n!!al an! mem"awa ali$an ai$

melal*i lamen .in.in mi$ip #en#akel 'i sekelilin! sel "a!ian a#as

memiliki $eedi!g cells an! *!a 'i#em*kan pa'a sp%n!e&

+. D'$@&1el&(&



12/15

11

e"a!ian "esa$ an!!%#ana hi'*p 'i la*#& Ka$ak#e$is#ik *#amana

a'alah '*a Ha!ela: #$ans4e$sal 'an l%n!i#*'inal: an!

mem*n!kinkanna "e$!e$ak "e$p*#a$ saa# "e$enan!& elain i#* al4e%li

a'alah ka$ak#e$is#ik *nik 'in%Ha!ela#a lainna& Gene$a #i!ophsis(

Protopteridiu%( *%!odi!iu% 'an l*m Prrophta a'alah "e"e$apa

.%n#%h 'in%Ha!ela#a&

c. "'l'&(&

Klasikasina #e$*#ama "e$'asa$kan s*s*nan .ilia an! 'i#em*kan

minimal pa'a sa#* 3ase sikl*s hi'*pna& %n#%hna #in#inni' an!

memp$%'*ksi l%$i.a (.an!kan! p$%#ein: p%lisaka$i'a 'an pa$#ikel,

pa$#ikel 'i ai$)& 8*n!sina pen#in! 'alam mi.$%"ial l%%p ka$ena

kemamp*anna men.e$na "a.#e$ia 'an $%#is#a ke.il lainna *!a

se"a!ai makanan "a!i %%plank#%n 'an $%#is#a an! le"ih "esa$&

. D'&($5

An!!%#ana palin! "anak #e$se"a$ 'i pe$ai$an #awa$ ma*p*n la*#&

Ka$ak#e$is#ik *#amana a'alah selna 'i#*#*pi %leh '*a lempen! sili.a

mem"en#*k se$*pa s#$*k#*$ !elaska.a& Dia#%m se$in! men!alami

"l%%min! m*siman& Be"e$apa 'ian#a$ana "e$a.*n "ahkan

mene"a"kan kema#ian pa'a mamalia 'an "*$*n!,"*$*n! la*#&

e. "$cc$l'(h$ph$#'3%..%li#h%ph%$i's a'alah an!!%#a kel%mp%k al!a Haptophta

(k%mp%nen *#ama #%plank#%n)& %..%li#h%ph%$i's me$*pakan

Ha!ela#a *nisel an! "iasana men!an'*n! hap#%nema (Ha!ella #ipis)&

Ak*m*lasi pla# .%..%li#h%ph%$i's 'i la*#an akan mem"en#*k se'imen

'an "a#*an 'i la*#an: .%n#%hna E%ilia!a hu,lei&

9. R&'$l'& & 9$#&5''9e#&

Um*mna "e$a'a 'i la*#an 'en!an ka$ak#e$is#ik "en#*k #*"*h

am%e"%i' men!!*nakan pse*'%p%'ia *n#*k pe$!e$akan 'an makan

*k*$anna $ela#i4e "esa$ "ahkan sampai "e"e$apa sen#ime#e$&

Ra'i%la$ia men'ep%si#kan sili.a se'an!kan 3%$amini3e$a

men'ep%si#kan kalsi*m ka$"%na# 'i 'asa$ pe$ai$an&

2. FUNGI

8*n!i se"a!ian "esa$ men'iami 'a$a#an 'an pe$ai$an #awa$& =am*n 'emikian

me$eka 'apa# #*m"*h 'i la*#an& 8*n!i "e$si3a# he#e$%#$%k 'an *m*mna

sap$%#ik an! "e$pe$an 'alam 'ek%mp%sisi ma#e$ial %$!ani. k%mpleks 'i

lin!k*n!an& 8*n!i an! hi'*p 'i la*# *m*mna "e$as%siasi 'en!an



13/15

12

'ek%mp%sisi ma#e$ial #*m"*han (ka* an! mem"*s*k: 'a*n 'an $*mp*#

in#e$#i'al)& 8*n!i *!a "anak 'i#em*kan "e$as%siasi 'en!an man!$%4e 'an

#*m"*han in#e$#i'al: 'an p%#ensial se"a!ai s*m"e$ enim 'an 3a$masi&


14/15

1+

G&5+ . In3eksi "a.#e$i%pha!e (M*nn: 200-)

en!ama#an 4i$*s 'i pe$ai$an: an! #i'ak mem"*#*hkan in3eksi pa'a inan! an!

'apa# 'ik*l#*$: *m*mna 'ilak*kan 'en!an "an#*an NepiH*%$es.en.e li!h#

mi.$%s.%p ;LM 'an N#$ansmissi%n ele.#$%n mi.$%s.%p T;M ) =am*n: s#$*k#*$

an! 'iama#i akan 'ise"*# N4i$*s,like pa$#i.les L (Gam"a$ >) sampai #e$"*k#i

mamp* men!in3eksi 'an mene"a"kan kema#ian pa'a inan! an! #epa#&

G&5+ . i$*s,like pa$#i.les an! men!in3eksi "ak#e$i 'i la*#& (a) Nma#*$epha!e 'i 'alam sel inan! se"el*m lsis (") L "e"as (M*nn: 200-)&

i$*s #e$na#a "e$pen!a$*h pa'a p%p*lasi "ak#e$i 'i pe$ai$an 'an se'imen&

K%n#$%l p%p*lasi mik$%al!a pene"a" Nha$m3*l al!al "l%%ms 9AB melal*i in3eksi

4i$*s *!a mena'i p%k%k kaian pen!en'alian N$e' #i'es a#a* N"$%wn #i'es&

elain i#*: se.a$a men!e*#kan 4i$*s *!a mamp* mempen!a$*hi p$%ses,p$%ses

.*a.a se.a$a !l%"al&



15/15

1-

REFERENSI

9%!!: & 2005& ;ssen#ial Mi.$%"i%l%!& %hn Pile Q %ns L#'&

M*nn: &B& 200-& Ma$ine Mi.$%"i%l%!J ;.%l%! an' Appli.a#i%ns& BIO .ien#i.

*"lishe$s&

"ATATAN

&&&


modul mikrobiologi 1314-1

Documents