mic, microbiologically influenced corrosion sd.pdfmic (microbiologically influenced corrosion) +31...

+31 50 520 54 70 | [email protected] | www.microbialanalysis.com

MIC, microbiologically influenced

corrosion

Lasgroep Noord

Sabine Doddema

(MIC specialist)


Aaltje Joldersma

(Moleculair biologisch specialist)


Bioclear – Microbial Analysis


Interpretatie &

Advisering Veldondersteuning

Identificatie & detectie van

Micro-organismen


Wat zijn “Micro-organismen”?


Waar denk je aan?


Waar denk ik aan?

Bron: Micropia, The Netherlands


Korte introductie.

Definitie:

“De verzamelnaam voor alle niet met het blote

oog waarneembare organismen, meestal

bestaande uit één cel”

Bacteriën, archaea, schimmels en virussen”

http://www.google.nl/url?sa=i&rct=j&q=&esrc=s&source=images&cd=&cad=rja&uact=8&docid=61u62iTCmq3u7M&tbnid=1YcQTdJ-Z6ZxEM:&ved=0CAUQjRw&url=http://www.hoogenhaak.nl/nieuws/nieuwe-definitie-reclame-per-1-januari-2011/800&ei=8OKhU5r-I6u6ygP-0oHoDw&bvm=bv.69137298,d.d2k&psig=AFQjCNGJHeumu3wMNVPzgKsOK-azXhy2Qg&ust=1403204684179117


Feit: Micro-organismen zijn overal!

Soil

108/gram Water

106/ml

Bacterial Life

Air

103/m3

Sou

rce

of

pic

ture

: 4ev

er.e

u


Water, bron van leven


Proost!


Groot, kleiner, kleinst

decameter meter dm cm mm 100 µm 10 µm µm 100 nm 10 nm nm

Blauwe Vinvis 3 30 300 3000 30000 300000 3000000 30000000 300000000 30000000000 300000000000

Mens 0.2 2 20 200 2000 20000 200000 2000000 20000000 2000000000 20000000000

Muis 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 100000 1000000 100000000 1000000000

Vlieg 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 100000 10000000 100000000

Vlo 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 10000 1000000 10000000

Huisstofmijt 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000 100000 1000000

Menselijke cel 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 10000 100000

Bacterie 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100 1000

Virus 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10 100

Viroïde 0.000000001 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1 10

Molecuul 0,0000000001 0.000000001 0.00000001 0.0000001 0.000001 0.00001 0.0001 0.001 0.01 0.1 1


Korte introductie.

Micro-organismen

zijn overal!

150 verschillende soorten bacteriën

1.500 per cm2

Gemiddeld bureau: 400x zoveel bacteriën dan

een toilet


Micro-organismen die metalen beïnvloeden

Meerdere benamingen:

Microbiële corrosie

Biologische corrosie

Bacteriële corrosie

Biocorrosie

Microbiologisch beïnvloede corrosie

MIC (Microbiologically Influenced Corrosion)


Korte introductie.

Definitie MIC:

“Corrosie geïnitieerd en/of versneld door de

activiteit van micro-organismen”

http://www.google.nl/url?sa=i&rct=j&q=&esrc=s&source=images&cd=&cad=rja&uact=8&docid=61u62iTCmq3u7M&tbnid=1YcQTdJ-Z6ZxEM:&ved=0CAUQjRw&url=http://www.hoogenhaak.nl/nieuws/nieuwe-definitie-reclame-per-1-januari-2011/800&ei=8OKhU5r-I6u6ygP-0oHoDw&bvm=bv.69137298,d.d2k&psig=AFQjCNGJHeumu3wMNVPzgKsOK-azXhy2Qg&ust=1403204684179117


Effect MIC


De activiteit van micro-organismen leidt tot 100 keer snellere corrosiesnelheden

Bij ~ 40% van de corrosie gevallen is MIC betrokken

Bij ~15% van de corrosie gevallen is MIC de directe oorzaak van schade


Hoe herken je MIC?


Eigenschappen van MIC


Checklist voor het vaststellen van MIC

Morfologie:

Putcorrosie? Biofilm? Kleur? Geur?

Chemie:

Omgevingscondities (nutriënten,

biocide, flow, chloriden)

Mineralogie:

Samenstelling corrosieproduct

Microbiologie:

Aanwezigheid van micro-organismen

RVS

Koolstofstaal

Beton

Corrosieproduct

Bacteriën

Schimmels

Archaea

Water

Temperatuur

pH

C-bron

N-bron Zuurstof


Micro-organismen betrokken bij MIC

Sulfaatreducerende bacteriën

Zwaveloxiderende bacteriën

IJzerreducerende bacteriën

IJzeroxiderende bacteriën

Slijmvormende bacteriën

Zuurproducerende micro-organismen

Methanogenen


Principe MIC

Veel bacteriën en archaea zijn

betrokken bij MIC

SRB worden vaak als indicator

organisme gebruikt

Meten op de groep bacteriën

is niet bruikbaar om MIC te

meten Petroleum Microbiology Research Group, Department of Biological Sciences, University of Calgary, Canada


Hoe meet je micro-organismen eigenlijk?


Bijvoorbeeld via kweek (culturing)

Voorbeelden kweek:

BART ™

MICkit III, MICkit IV

Sani-check

Voordelen van deze techniek:

Gemakkelijk uitvoerbaar

Goedkoop


Nadeel kweek versus voordeel moleculaire methoden


Detectie of Identificatie?


Kijken naar genetisch materiaal (DNA of RNA)

Kwantificatie en gedetailleerde identificatie

Ook van een complexe biologische samenstelling

Hoe veel? Wie?


Detectie Identificatie

Welke aanpak past bij de vraagstelling?

Illustratie aan de hand van een hypothetische dierentuin

http://www.google.nl/url?sa=i&rct=j&q=&esrc=s&source=images&cd=&cad=rja&uact=8&ved=0CAcQjRxqFQoTCLnL0e23rcgCFYG6FAod50AEQw&url=http://visualsunlimited.photoshelter.com/gallery/Microbiology/G00008zHBAH.ekQs/C0000FybHaKQgIWQ&bvm=bv.104317490,d.bGQ&psig=AFQjCNG9sWiqUFrJ4R-FI_zLHptrH7H54w&ust=1444206812468655


Voorbeeld: Meten binnen een dierentuin populatie

http://www.google.nl/url?sa=i&rct=j&q=&esrc=s&source=images&cd=&cad=rja&uact=8&ved=0CAcQjRxqFQoTCJLhrMbHrcgCFUNWFAod0UMEQA&url=http://www.kamapublishing.co.uk/the-beauty-contest-at-the-zoo-book.html&bvm=bv.104317490,d.bGQ&psig=AFQjCNFDqGnjJScmHUYXwDgFry4VJ4Y9eA&ust=1444211021808599


Detectie middels QPCR


Meten van soorten: Target op Apen (vergelijkbaar met meten op Gallionella spp. (ijzeroxidatie))


QPCR meting op soorten

Monstercode Eenheid 001

(N/swab)

Detection limit 1x100

Target op apen Cellen 7x100



Detectie middels QPCR


Meten op functionele genen: Target op gen

verantwoordelijk voor vleesetend (vergelijkbaar met Sulfite Reductase voor SRB activiteit )


QPCR meting op functionele genen


(N/swab)

Detection limit 1x100

Functioneel gen op ‘Vleesetend’ Cellen 1.0x101



Identificatie (Bioprophyler®)


Meting op aanwezige soorten:

Target op bacteriën, archaea op schimmels


Bioprophyler ® (soorten) Monstercode Eenheid 001

(N/swab)

Aap Celllen 7x100

Zebra Celllen 2x100

Olifant Celllen 2x100

Panter Celllen 2x100

Leeuw Celllen 1x100

Slang Celllen 1x100

……………………..



Identificatie (MetaPathViewer)


Meting van aanwezige soorten and functionele genen:

Target op alle organismen and hun functies


MetaPathViewer (soorten en functies) Monstercode Eenheid 001

(N/swab)

Functioneel gen op ‘Vleesetend’ Cellen 10x100

Functioneel gen op ‘Grasetend’ Cellen 3x100

Functioneel gen op ‘Bladetend’ Cellen 3x100

Functioneel gen op ‘Insectenetend Cellen 2x100


(N/swab)

Aap Celllen 7x100

Zebra Celllen 2x100

Olifant Celllen 2x100

Panter Celllen 2x100

Leeuw Celllen 1x100

Slang Celllen 1x100

……………………..



Zelf aan de slag!


Je eigen DNA!


keep MIC in mind

mic, microbiologically influenced corrosion sd.pdfmic (microbiologically influenced corrosion) +31...

Documents