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MARCADORES GENÉTICOS
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MARCADORES GENÉTICOS
La diferencia entre individuos se denotaba señalando diferencias en su aspecto externo (fenotipo)
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Carácter Informativo Variación
POLIMORFISMO
Marcadores Morfológicos
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Marcadores Morfológicos
Genes asociados a caracteres fenotípicos, fáciles de identificar
visualmente.
Número limitado
Poco informativos
Herencia compleja (herencia dominante/recesiva,
multigénicos,etc.)
Ambiguos y subjetivos
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Grupos sanguíneos
Inmunoglobulinas
Isoenzimas (enzimas con la misma función pero con distinto tamaño, carga o
conformación)
Marcadores Bioquímicos
Los marcadores bioquímicos se basan en la observación del polimorfismo en la
secuencia de aminoácidos de una proteína.
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EL NIVEL DE OBSERVACIÓN ES EL FENOTÍPICO (TIPIFICAN
PROTEÍNAS).
ANALIZAN SÓLO LAS SECUENCIAS CODIFICANTES DE LOCI
ESTRUCTURALES, QUE CORRESPONDEN APROXIMADAMENTE AL
5% DEL GENOMA.
LA FUNCIONALIDAD DE LAS PROTEÍNAS LIMITA EL GRADO DE
POLIMORFISMO.
LAS MUESTRAS TIENEN QUE SER FRESCAS YA QUE LAS
PROTEÍNAS SE DETERIORAN CON FACILIDAD.
Marcadores Bioquímicos
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DESVENTAJAS:
NO SE EXPRESAN EN TODOS LOS TEJIDOS.
NO SE EXPRESAN EN TODAS LA EDADES.
INFLUENCIADOS POR EL AMBIENTE.
POCO POLIMÓRFICOS.
BAJA REPRESENTACIÓN EN EL GENOMA
Marcadores Bioquímicos
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Métodos de detección de polimorfismos directamente a nivel de ADN
Marcadores Genéticos
MARCADOR MOLECULAR ES UN SEGMENTO DE ADN
CON UNA UBICACIÓN FÍSICA IDENTIFICABLE Y CUYA HERENCIA
GENÉTICA SE PUEDE RASTREAR
Un marcador puede ser un gen o puede ser alguna sección del ADN sin
función conocida.
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Características de los Marcadores Genéticos
Estar presentes en el individuo en el momento del nacimiento
Poseer herencia mendeliana sencilla. Codominante
Estar distribuidos por todo en genoma
Ser informativos o sea POLIMORFICOS
La metodología empleada debe ser repetible, automatizable y estandarizable
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Marcadores Genéticos
MARCADORES BIOQUÍMICOS MARCADORES GENÉTICOS
Solo muestras frescas Muestras frescas, congeladas o conservadas en alcohol, parafina, etc.
Solo muestras de sangre Cualquier clase de tejidos: pelo, músculo, hueso, semen dientes, etc.
Número limitado de marcadores Número Ilimitado de marcadores
Moderado grado de información Alto grado de información
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Según la región de ADN de la que formen parte pueden tener distintos modos de
Herencia
Marcadores Genéticos
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Tipos de Marcadores Genéticos
SNP (o Single nucleotide polymorphism)
RFLP (o Polimorfismo en la longitud de fragmentos de restricción)
Microsatélites o STR
RAPD (o Random amplification of polymorphic DNA)
VNTR (o Número variable de repeticiones en tándem)
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Muestra biológica Extracción de ADN
Amplificación por
PCR Diferentes métodos de análisis
A
216.1
B
218.0
C
220.2
D
222.2
224
224.1
F
226.1
G
228.2
H
230.1
232
232.1
234
233.9
K
236.0
L
238.0
M
240.1
N
242.1
244
243.9
P
246.3
Q
248.3
H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002
0
1000
2000
3000
4000
DIK5108
Métodos de estudio de Marcadores Genéticos
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¿Cómo determino el Genotipo de una muestra?
PCR-RFLP
PCR-Alelo especifica
PCR-Secuenciación
PCR-Microsatélites o Minisatelites
PCR-RAPD s
Amplificación por PCR
Análisis por distintos métodos
Determinación del genotipo
Variantes de PCR
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Polimorfismos de Nucleótido Simple
SNPs
Es una variación en la
secuencia de ADN que afecta
a una sola base (adenina (A),
timina (T), citosina (C) o
guanina (G)) de una secuencia
del genoma.
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GTCCGATCC GTCCAATCC
Estas variaciones deben darse al menos en un 1% de la población para ser
consideradas como un SNP.
Polimorfismos de Nucleótido Simple
SNPs
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Homocigota GG Homocigota AA Heterocigota GA
Genotipificación de SNPs
Grupo en estudio
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PCR-RFLP
(Polimorfismos de longitud de los fragmentos de restricción)
Digestión con enzima de restricción BSTN I 5’…CCWGG…3’
3’…GGWCC…5’
Primer reverse
Primer forward
5’
3’
3’
5’
PCR
Homocigota AA
Heterocigota AG Homocigota GG
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Microsatélite o STR (short tándem repeat)
A
216.1
B
218.0
C
220.2
D
222.2
224
224.1
F
226.1
G
228.2
H
230.1
232
232.1
234
233.9
K
236.0
L
238.0
M
240.1
N
242.1
244
243.9
P
246.3
Q
248.3
H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002
0
1000
2000
3000
4000
DIK5108
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Fragmentos obtenidos por amplificación (PCR) al azar del ADN
genómico
No se conoce la ubicación genómica de las bandas
Utilidad en organismos de genoma desconocido: sondeo de variabilidad
RAPDs (Random Amplified Polymorphic DNA)
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Utilidades de los Marcadores genéticos
Identificación individual
Identificación de patógenos
Caracterización de
especies
Análisis de filogenias
Genética forense
(paternidad, identidad)
Conservación de biodiversidad
genética
detección de
enfermedades genéticas
Sexado
embrionario
Adulteración de alimentos
Marcadores
Genéticos
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A
216.1
B
218.0
C
220.2
D
222.2
224
224.1
F
226.1
G
228.2
H
230.1
232
232.1
234
233.9
K
236.0
L
238.0
M
240.1
N
242.1
244
243.9
P
246.3
Q
248.3
H01 081118_M176_STRB_STRO_BTA5Run01 HeM 92002
0
1000
2000
3000
4000
DIK5108A
216.1
B
218.0
C
220.2
D
222.2
224
224.1
F
226.1
G
228.2
H
230.1
232
232.1
234
233.9
K
236.0
L
238.0
M
240.1
N
242.1
244
243.9
P
246.3
Q
248.3
D01 081127_M179_STRO_BTA5Run01 HeM X71
0
1000
2000
3000
DIK5108