máme na to? aneb nebojme se evropy! - doc. bílková - spinup 2013
TRANSCRIPT
![Page 1: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/1.jpg)
Máme na to?
Aneb nebojme se Evropy!
Zuzana Bílková Katedra biologických a biochemických věd
Fakulta chemicko-‐technologická
Universita Pardubice
![Page 2: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/2.jpg)
Úvod • Jak to vše začalo….. • Studijní pobyt • Mikrofluidika • Evropské projekty • Bioanalýza • Katedra a studijní obory
Závěr
![Page 3: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/3.jpg)
Kdy a kde to vše začalo….. • PřF UK, Praha -‐ Molekulární biologie a geneNka -‐ 1989
• VÚOS – Toxila -‐ 1990
• Univerzita Pardubice, FCHT, Katedra analyNcké chemie -‐ 1993 (bioafinitní chromatografie, magne2cké čás2ce, imunochemie)
![Page 4: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/4.jpg)
SuperparamagneEcké mikro/nanočásEce
PřednosE velký specifický povrch vyšší účinnost separace kineNka enzymové reakce apod. Integrace a pohyb čásEc 1) Pohyb mobilní fáze 2) Elektrické pole 3) Centrifugace 4) MagneEcké pole
![Page 5: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/5.jpg)
![Page 6: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/6.jpg)
h_p://www.youtube.com/watch?v=67A3bKgLU6w
Michal Babič – kolega z ÚMCh AV ČR
skupina polymerních čásEc -‐ Dr. Daniela Horák
![Page 7: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/7.jpg)
(Bio)Afinitní Chromatografie (Imuno)Afinitní Chromatografie)
Průkaz, izolace, purifikace a strukturní charakterizace klinicky významných biomarkerů z biologických materiálů
Nádorová imunologie Infekční imunologie
NeurodegeneraNvní choroby Enzymová katalýza
Biosenzory
![Page 8: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/8.jpg)
1. Sensitivita x Specificita
2. Miniaturizace
3. Automatizace
4. Integrace
5. Multiplexita
Moderní trendy v diagnosEce
![Page 9: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/9.jpg)
h_p://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed
1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010
(as of April 19, 2010)
“MICROFLUIDIC” v medicínských databázích
![Page 10: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/10.jpg)
Miniaturizace v praxi
µTAS
Lab-‐on-‐chip
Chip array
Micro array
Bed site test
Rapid test
Strip test
![Page 11: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/11.jpg)
Lab on chip – instrumentace a bioanalýza
Lab on chip -‐ instumentaNon h_p://www.youtube.com/watch?v=0VcXZ2TG5YI
Lab-‐on chip -‐ blood analysis
h_p://www.youtube.com/watch?v=D72_ZBqa6tY
![Page 12: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/12.jpg)
Kdy a kde to vše začalo….. • PřF UK, Praha -‐ Molekulární biologie a geneNka -‐ 1989
• VÚOS – Toxila -‐ 1990
• Univerzita Pardubice, FCHT, Katedra analyNcké chemie -‐ 1993 (bioafinitní chromatografie, magne2cké čás2ce, imunochemie) • InsNtute Curie, Paříž, Francie -‐ 2000
• Katedra biologických a biochemických věd
![Page 13: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/13.jpg)
Dr. Jean-‐Louis Viovy
![Page 14: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/14.jpg)
Mohamadi M.R., Svobodova Z., et al., 2010
Integrace separačních procesů
![Page 15: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/15.jpg)
BSE – prionový protein
![Page 16: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/16.jpg)
Bioafinitní izolace (anN-‐PrP Ab) + enzymová fragmentace (proteináza K)
![Page 17: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/17.jpg)
Fakulta chemicko-‐technologická, Katedra biologických a biochemických věd, Studentská
573, 532 10, Pardubice
Skupina imunochemie a analýzy proteinů Marcela Slováková, Lucie Korecká, Lenka Brůčková Karel Královec Barbora Jankovičová Zuzana Svobodová Jana Kučerová Rudolf Kupčík Lucie Holubová Veronika Dvořáková Lenka Hromádková Jana Kňavová Ivana Fousová
Katedra biologických a biochemických věd
![Page 18: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/18.jpg)
Projekty 6. a 7. RP EU – spoluřešitel
NeuroTAS: Development of “lab-on-chip” systems for the early diagnosis of neurodegenerative diseases; Dr. Jörg Kutter, Copenhagen, Dánsko,
CAMINEMS: Integrated Micro-Nano-Opto Fluidic systems for high-
content diagnosis and studies of rare cancer cells; Dr. Jean-Louis Viovy, Francie
NADINE: NAnosystems for the early DIagnosis of NEurodegenerative
Diseases (Large-scale Integrating Collaborative Project), Dr. Jörg Kutter, Copenhagen, Dánsko
LOVE FOOD: Love wave fully integrated Lab-on-Chip platform for food-
pathogen detection, Dr. Electra Gizeli, Řecko
![Page 19: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/19.jpg)
Projektová terminologie
Milestones Deliverables NegoNaNon
Working package
Risk indenNficaNon
? DisseminaNon
Proposal Tasks x.x.
ExploitaNon GA, CA, D, M12,…
![Page 20: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/20.jpg)
h_p://www.youtube.com/watch?v=8Xm0zLDyoVQ
Nebát se!
![Page 21: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/21.jpg)
Chování magneEckých čásEc v magneEckém poli
Jednoduchý magnet
![Page 22: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/22.jpg)
Cirkulující nádorové buňky – metastaEcký potenciál
![Page 23: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/23.jpg)
Ferrofluid paoerning
Microcontact printing technique
Ferrofluid Pattern
80 µm
Xia and Whitesides, Annu. Rev. Mater. Sci., 1998 Saliba A.E., et al., PNAS, 2010
pre-designed magnetic array at the bottom
![Page 24: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/24.jpg)
Mikrofludiní systémy
![Page 25: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/25.jpg)
Mechanické operace + „Droplet technology“ h_p://www.youtube.com/watch?v=AENnU0vdjPo h_p://www.youtube.com/watch?v=oU9S2zSsb28
µTAS (µ Total AnalyEcal System)
AnalyEcké plaqormy
Mikrofluidní zařízení
![Page 26: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/26.jpg)
MagneNcká separace h_p://www.youtube.com/watch?v=X9RzI4PZhn4
![Page 27: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/27.jpg)
Fluorescenční kvantové tečky -‐ Qdots Semikonduktorové anorganické krystaly (1-‐10 nm) Prvkové složení ZnS; ZnSe; PbS; CdSe; CdTe -COOH, -NH2
![Page 28: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/28.jpg)
CdTe nanokrystaly
36 crystal elements, 650 atoms, 78 000 Da
3.5 nm 0.8 nm MPA
fluorescence emision 600 nm
![Page 29: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/29.jpg)
7 nm
3.5 nm
6 nm
3.5 nm QD
15 nm
Ab Ag
Anti-OVA protilátky, ovalbumin a CdTe QD
![Page 30: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/30.jpg)
1992 zahájena výuka bakalářského studijního oboru Klinická biologie a chemie
Historie katedry
1994 akreditace navazujícího magisterského studijního oboru Analýza biologických materiálů
1996 Katedra biologických a biochemických věd 2009 zahájena výuka nového oboru akreditovaného i na MZ
Zdravotní laborant – Klinická laboratorní diagnostika
2013 zahájena výuka nového oboru akreditovaného i na MZ Bioanalytik
![Page 31: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/31.jpg)
Analýza biologických materiálů
chemické
předměty
29%
biomedicínské
předměty
57%
ostatní
předměty
14%
ostatní
předměty
14%chemické
předměty
29%
biomedicínské
předměty
57%
Zdravotní laborant
![Page 32: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/32.jpg)
Profil katedry V rámci Katedry biologických a biochemických věd je vyčleněno 6 vědecko výzkumných skupin, jejichž členové se vedle výuky biologicky zaměřených předmětů podílí i na řešení řady výzkumných projektů.
Buněčná biologie
RNDr. K. Královec Ing. D. Nováková MUDr. T. Soukup
Doc.Ing.A.Čegan,CSc. Mgr.R.Kanďár,Ph.D. Mgr.P.Žáková Mgr.Š.Štěpánková,Ph.D. Doc. MVDr. J. Mazurová, CSc.
Doc. Ing. J. Vytřasová, CSc. Ing. M. Pejchalová,Ph.D. Mgr. M. Vydržalová, PhD. Ing. I. Brožková, PhD. Mgr. P. Lysková, PhD.
Doc. RNDr.Z.Bílková,Ph.D Mgr. M.Slováková,Ph.D. RNDr. L.Korecká,Ph.D.
Doc.MUDr.Z.Červinková,CSc. MUDr.V.Mužáková,Ph.D. Mgr.T.Roušar, Ph.D.
RNDr. M. Bunček, PhD. RNDr. D.Královcová, Ph.D.
Biochemie
Mikrobiologie Imunochemie
Fyziologie
Genetika
Vědecko-výzkumní pracovníci Mgr.B.Jankovičová Mgr. Zuzana Svobodová Mgr. Jana Kučerová Mgr. Lenka Brůčková
![Page 33: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/33.jpg)
Věda a výzkum na katedře KBBV
• Lidská krev od rizikových pacientů – HCV, HBV, HIV, apod.
• Vysoce nebezpečné mikroorganismy – viry, bakterie, plísně, jejich toxiny, geneNcky
modifikované organismy klasifikované stupněm rizikovosN 3
Vyžaduje vytvoření podmínek pro bezpečnou práci s nebezpečným biologickým materiálem.
![Page 34: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/34.jpg)
Mimořádné požadavky práci v laboratoři BSL-‐3
• Izolace vnitřního prostředí od okolí • Režim vstupů a výstupů personálu, materiálu, odpadu, kontaminovaného vzduchu, kanalizačních odpadů
• Hygienická smyčka pro personál
• Prokládací autokláv • Vzduchotechnika – filtrace přicházejícího i odcházejícího vzduchu, regulace teploty, vlhkosN, udržování podtlaku
• Osobní ochranné pomůcky
![Page 35: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/35.jpg)
![Page 36: Máme na to? Aneb nebojme se Evropy! - doc. Bílková - SpinUp 2013](https://reader034.vdocuments.mx/reader034/viewer/2022042614/55a071ee1a28ab3f498b45cd/html5/thumbnails/36.jpg)
Děkuji za pozornost