les études dobservation en épidémiologie hélène carabin dmv phd dpt infectious disease...
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Les études Les études d’observation en d’observation en
épidémiologieépidémiologie
Hélène Carabin DMV PhDHélène Carabin DMV PhDDptDpt Infectious Disease Epidemiology Infectious Disease Epidemiology
Imperial College School of MedicineImperial College School of Medicine
Objectifs Objectifs immédiatsimmédiats
Distinguer les types d’étude Distinguer les types d’étude épidémiologiqueépidémiologique Comprendre les avantages et Comprendre les avantages et inconvénients de chaque type inconvénients de chaque type d’étuded’étude Associer chaque type d’étude à Associer chaque type d’étude à un type de mesure et de un type de mesure et de conclusion épidémiologiqueconclusion épidémiologique
Objectifs à long Objectifs à long termeterme
Être capable de reconnaître le Être capable de reconnaître le type d’étude employé lors de la type d’étude employé lors de la lecture d’articles scientifiqueslecture d’articles scientifiques
Être capable de juger de Être capable de juger de l’utilisation appropriée de mesures l’utilisation appropriée de mesures d’association selon le type d’étude d’association selon le type d’étude employé dans ces articlesemployé dans ces articles
Étapes de la maladie & Étapes de la maladie & préventionprévention
Initiation duInitiation duprocessusprocessusétiologiqueétiologique
Initiation duInitiation duprocessusprocessus
pathologiquepathologique
Détection deDétection dela maladiela maladie
ConséquenceConséquencede la maladiede la maladie
PériodePériode
PréventionPrévention
LatenceLatenceInductionInduction PromotionPromotion ExpressionExpression
PrimairePrimaire SecondaireSecondaire TertiaireTertiaire
Types d’études Types d’études épidémiologiquesépidémiologiques
essa i random izé
expérim enta le quasi-expérim enta le
éco log ique transversa le
descrip tive
cohorte fe rm éecohorte ouverte
cohorte cas-tém oins
ana lytique
O bservation
études épidém io logiques
AU MOMENT ”t”AU MOMENT ”t”
Étude transversaleÉtude transversale
Mesure de l’issueMesure de l’issue# de cas prévalents# de cas prévalents
Mesure de l’expositionMesure de l’exposition# d’exposés & non exposés# d’exposés & non exposés
Étude transversaleÉtude transversale
M1M1M0M0
E1E1
M1M1M0M0
E1E1
Population Population d’origined’origine
Population Population étudiéeétudiée
Figure adaptée de: Walker AM. Observation and inference. An Introduction to the methods of Epidemiology. Epidemiologic Ressources Inc. Ed. Newton Lower Falls MA. 1991
Étude transversaleÉtude transversaleGiardiaGiardia
++Bon Bon étatétat
MauvaisMauvaisétatétat
100100 500500
2525 375375
600600
400400
125125 875875 10001000
PrévPrév
RPr =RPr =
16,67%16,67%
6,25%6,25%
2,672,67
RPr: rapport des prévalencesRPr: rapport des prévalences
GiardiaGiardia --
Étude transversaleÉtude transversale
TempsTemps
Pers
onne
Pers
onne
XX
X
X
X
X
X
X
X X
X
+
+ ++ +
+
+++
Pr (E) = 2/9Pr (E) = 2/9Pr (pas E) = 1/14Pr (pas E) = 1/14
RP = 2x14/1x9 = 3RP = 2x14/1x9 = 3,11,11
Pr (E) = 4/8Pr (E) = 4/8Pr (pas E) = 4/12Pr (pas E) = 4/12
RP = 4x12/4x8 = 1,50RP = 4x12/4x8 = 1,50
tt11 tt22
Étude transversaleÉtude transversale AvantagesAvantages
rapiderapideéconomiqueéconomiqueémettre hypothèsesémettre hypothèses
InconvénientsInconvénientsle tempsle tempsordre des événementsordre des événementsdurée et incidencedurée et incidence
Étude écologiqueÉtude écologique
ExploratoireExploratoire
Comparaison de groupesComparaison de groupes
Tendance temporelleTendance temporelle
Comparaison temporelle et Comparaison temporelle et de groupesde groupes
Étude écologiqueÉtude écologique Issue (Taux d’incidence)Issue (Taux d’incidence)
NumérateurNumérateur cas incidents si possiblecas incidents si possible définition constantedéfinition constante
DénominateurDénominateur même population que numérateurmême population que numérateur population à risquepopulation à risque
ExpositionExposition supposée égale pour toussupposée égale pour tous
AssociationAssociation RégressionRégression
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
0 20 25 35 40 46
% chèvre laitière
% C
AE
Étude écologique - Biais écologiqueÉtude écologique - Biais écologique
Niveau d'expositionNiveau d'exposition
Tau
x d
'inci
dence
de l'is
sue
Tau
x d
'inci
dence
de l'is
sue
pentepente
.. ...... .... ....... .
.. .....
......... .
...
Niveau d'expositionNiveau d'expositionTau
x d
'inci
den
ceTau
x d
'inci
dence
de l'is
sue
de l'is
sue
pentepente.. ... .. .. .. ..... .... ... . ...... .... ...... .... ... . ...... .... ..
.... .... ... . ...... .... ..
.... ....... . ...... .... ..
.... .... ... . ...... .... ..
.... .... ... . ...... .... ..
.. ...... .... ....... .
.. .....
......... .
... .. ...... .... ....... ... .
....
......... .
...
.. ...... .... ....... .
.. .....
......... .
... .. ...... .... ....... ... .
....
......... .
... .. ...... .... ....... ... .
....
......... .
...
Étude écologiqueÉtude écologique AvantagesAvantages
Grandes populations (puissance Grandes populations (puissance statistique)statistique)Coût-efficacitéCoût-efficacitéBase de donnéesBase de donnéesIdentification d’agrégatsIdentification d’agrégats
InconvénientsInconvénientsBiais écologiqueBiais écologiqueMesure de l’expositionMesure de l’expositionFacteurs de confusionFacteurs de confusionHypo individuellesHypo individuelles
Études analytiquesÉtudes analytiques Études de cohorteÉtudes de cohorte
cohorte ferméecohorte fermée
cohorte ouvertecohorte ouverte
Études cas-témoinsÉtudes cas-témoins
Cohorte ferméeCohorte fermée DéfinitionDéfinition
Individus suivis de tIndividus suivis de too à t à t11 pour pour déterminer les cas incidents de Mdéterminer les cas incidents de M
SuppositionsSuppositions Individus sans M à tIndividus sans M à too Exposition définie à tExposition définie à too Aucun individu ne peut entrer ou Aucun individu ne peut entrer ou sortir de la cohorte après tsortir de la cohorte après too Âge moyen augmente avec le Âge moyen augmente avec le suivisuivi
Cohorte ferméeCohorte fermée
xx11xx
00
cascastt11
nn11
nn00
tt00TempsTemps
Population étudiéePopulation étudiée
PopulationPopulation
d’origined’originex1 / n1x1 / n1
x0 / n0x0 / n0==
EE11
EE00
Risque relatifRisque relatif
Figure adaptée de: Walker AM. Observation and inference. An Introduction to the methods of Epidemiology. Epidemiologic Ressources Inc. Ed. Newton Lower Falls MA. 1991
Cohorte ferméeCohorte fermée Mesure de l’expositionMesure de l’exposition
Individu, environnement, Individu, environnement, comportementcomportement Catégorielle ou continueCatégorielle ou continue Quantitatif et qualitatifQuantitatif et qualitatif DuréeDurée Séquence temporelleSéquence temporelle BiaisBiais
Cohorte ferméeCohorte fermée
Mesure de l’issueMesure de l’issue Membres à risque de Membres à risque de développer la maladiedévelopper la maladie
Même méthode de suivi pour Même méthode de suivi pour tous les individustous les individus
Même durée de suivi pour tousMême durée de suivi pour tous
Cohorte ferméeCohorte ferméeToxo Toxo
++
Petits Petits animauxanimaux
Animaux Animaux de la fermede la ferme
5050 100100
2525 100100
150150
125125
7575 200200 275275
RisqueRisque
RR =RR =
33,3333,33%%
20%20%
1,671,67
Toxo Toxo --
Cohorte Cohorte ferméefermée AvantagesAvantages
Mesure de l’expositionMesure de l’expositionExposition rareExposition rarePlusieurs maladiesPlusieurs maladiesMinimiser pertes au suiviMinimiser pertes au suivi
InconvénientsInconvénientsissues raresissues raresduréeduréetravailtravailbiais d’informationbiais d’information
Cohorte dynamique Cohorte dynamique vs ferméevs fermée
Exposition varie avec le tempsExposition varie avec le temps Pas de fin précise de l’étudePas de fin précise de l’étude Entrée et sortie des individusEntrée et sortie des individus Aspect dynamique de la population Aspect dynamique de la population et de l’expositionet de l’exposition Expérience de l’exposition Expérience de l’exposition mesurée en fonction du tempsmesurée en fonction du temps Interprétation au niveau du groupe Interprétation au niveau du groupe et non plus de l’individuet non plus de l’individu
xx11
xx00
Personne-temps Personne-temps étudiésétudiés
cascasPersonne-temps Personne-temps
d'origined'origine
PTPT11
Mesure d'association (étiologique)Mesure d'association (étiologique)Rapport des taux d'incidenceRapport des taux d'incidence
RTI = RTI = xx 11
xx00
PTPT 11PTPT 00//
//
Cohorte ouverteCohorte ouverte
PTPT00
Figure adaptée de: Walker AM. Observation and inference. An Introduction to the methods of Epidemiology. Epidemiologic Ressources Inc. Ed. Newton Lower Falls MA. 1991
Cohorte ouverteCohorte ouverte Mesure de l’expositionMesure de l’exposition
Variable dans le tempsVariable dans le tempsTemps passé dans chaque groupe Temps passé dans chaque groupe à risque s’accumule pour les à risque s’accumule pour les animaux sans Manimaux sans MSi l’animal développe M, plus Si l’animal développe M, plus compté dans les animal-tempscompté dans les animal-tempsBien planifier le suivi de l’EBien planifier le suivi de l’E
Mesure de l’issueMesure de l’issue
Étude transversaleÉtude transversalePr EPr E11 = 1/6 = 1/6Pr EPr E00 = 1/6 = 1/6RPr = 1,00RPr = 1,00
Temps de l'étude
Indi
vidu
O
O
O
O
O
t t0 1
XX
X
XX
XX
X
t
Cohorte ferméeCohorte fermée
Temps de l'étudeTemps de l'étude
Indi
vidu
Indi
vidu
O
O
O
O
Ot t
0 1
XX
X
X
X
X
XX
RERE11 = 2/2 = 2/2RERE00 = 3/7 = 3/7RR = 2,33RR = 2,33
Cohorte ouverteCohorte ouverte
Temps de l'étudeTemps de l'étude
Indi
vidu
Indi
vidu
O
O
O
O
Ot t
0 1
XX
X
X
X
X
XX
250
300
300300
100
15020075
20040100150
8575
175125
10040
TITI11 = 6/1260 = 6/1260TITI00 = 2/1465 = 2/1465RTI = 3,49RTI = 3,49
Cohorte ouverteCohorte ouverte
MM PTPT
EE11
EE00
413413 2365123651
460460 1938619386
873873 4303743037
TITI
RTI =RTI = 0.740.74
17 / 1000 17 / 1000 enfant-joursenfant-jours
24 / 100024 / 1000enfant-joursenfant-jours
Population en équilibrePopulation en équilibre
TempsTemps
ImmigrationImmigrationnaissancesnaissances
immigrationimmigrationnaissancesnaissancesmortsmortsémigrationémigration
mortsmortsémigrationémigration
xx11
xx00
guérisonsguérisons
cascas
PTPT11
PTPT00
cascas
guérisonsguérisons
Cohorte ouverteCohorte ouverte AvantagesAvantages
Exposition peut changerExposition peut changerPertes au suiviPertes au suiviExpérience cumuléeExpérience cumuléeEffet de E sur plusieurs MEffet de E sur plusieurs M
InconvénientsInconvénientsDuréeDuréeTravailTravailQualité du suiviQualité du suiviTrès onéreuxTrès onéreux
Étude cas-témoinsÉtude cas-témoins
Mesure de l’issueMesure de l’issue cascas témoinstémoins
Mesure de Mesure de l’expositionl’exposition
cascas témoinstémoins
cascas
témoinstémoinsTempsTempsPopulation Population
d’origined’origine
Odds ratioOdds ratioOR = OR = xx11yy11
xx00yy00
////
Étude cas-témoinsÉtude cas-témoinsEE11
EE00
tt11tt00
xx11xx00
yy11yy00
Animal-temps Animal-temps d'origined'origine
xx 11
yy 11
xx00
yy00
Animal-temps Animal-temps étudiésétudiés
cascas
témoinstémoins
Étude cas-témoinsÉtude cas-témoins
Odds ratioOdds ratio
RC = RC = xx11yy11
xx00yy00
////
Étude cas-témoinsÉtude cas-témoinsMM11 MM00
EE11
EE00
2626 5454
1717 9696
4343 150150
OddsOdds
OR =OR = 2,722,72
1,531,53 0,560,56
Étude cas-témoinsÉtude cas-témoins AvantagesAvantages
foyers d’infectionfoyers d’infectionissues raresissues rareslongues périodes de latencelongues périodes de latencemoins $ que cohortemoins $ que cohorteissue avec cause multipleissue avec cause multiple
InconvénientsInconvénientspopulation d’origine (témoins)population d’origine (témoins)biais d’information sur Ebiais d’information sur E
RéférencesRéférencesToma B, Dufour M, Sanaa M, Bénet JJ, Ellis P, Moutou F, Toma B, Dufour M, Sanaa M, Bénet JJ, Ellis P, Moutou F, Louza A. Épidémiologie appliquée à la lutte collective Louza A. Épidémiologie appliquée à la lutte collective contre les maladies animales transmissibles majeures. contre les maladies animales transmissibles majeures. AEEMA. Paris. 1992AEEMA. Paris. 1992
Kleinbaum DG, Kupper LL, Morgenstern H. Kleinbaum DG, Kupper LL, Morgenstern H. Epidemiologic research. Principles and quantitative Epidemiologic research. Principles and quantitative methods. Van Nostrand Reinhold Ed. New York. 1982.methods. Van Nostrand Reinhold Ed. New York. 1982.
Rothman KJ & Greenland S. Modern Epidemiology. Rothman KJ & Greenland S. Modern Epidemiology. Lippincott – Raven 2nd Ed. Philadelphia. 1998.Lippincott – Raven 2nd Ed. Philadelphia. 1998.
Walker AM. Observation and inference. An Introduction Walker AM. Observation and inference. An Introduction to the methods of Epidemiology. Epidemiologic to the methods of Epidemiology. Epidemiologic Ressources Inc. Ed. Newton Lower Falls MA. 1991Ressources Inc. Ed. Newton Lower Falls MA. 1991