la ricerca bibliografica 2013_2014... · 2014-06-27 · le riviste elettroniche cos’e’ una...

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La ricerca bibliograficaLa ricerca bibliografica

Francesco Francesco [email protected]@unina.it

OBIETTIVI DELLA RICERCA OBIETTIVI DELLA RICERCA BIBLIOGRAFICABIBLIOGRAFICA

La ricerca bibliografica ha il compito di far:� conoscere;� accedere;� valutare;� usare;le fonti di informazione per la chimica disponibili in letteratura scientifica.

Quali sono le fonti di informazione utili per le attività professionali?

Ogni lavoro scientifico presuppone: 1) La ricerca bibliografica: attraverso la quale si individua il materiale in formato

o cartaceo on line relativo all’oggetto della propria ricer ca.2) La ricerca di dati e informazioni.

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Riviste scientifiche

Brevetti

Raccolte di dati• Enciclopedie• Dizionari• Atlanti di spettri• Indici

Le fonti di informazioneLe fonti di informazione

FONTEFONTE PRIMARIAPRIMARIA == forniscefornisce lala risposta,risposta, ilil datodato:: èè inin pochepoche paroleparole unun documento,documento, lalapubblicazionepubblicazione originale,originale, lala descrizionedescrizione dettagliatadettagliata didi unun esperimentoesperimento oo didi unauna proprietàproprietà

FONTEFONTE SECONDARIASECONDARIA == nonnon dàdà unauna risposta,risposta, mama forniscefornisce ilil mezzomezzo (riferimenti(riferimentibibliografici)bibliografici) perper accedereaccedere adad unun documentodocumento (la(la fontefonte primaria)primaria)..

Le fonti di informazioneLe fonti di informazione

RIVISTE SCIENTIFICHERIVISTE SCIENTIFICHE

i resoconti delle nuove ricercheresoconti delle nuove ricerche sono quasi sempre pubblicati sono quasi sempre pubblicati come articoli in riviste scientifichecome articoli in riviste scientifiche

LIBRILIBRI

non riportano nuove ricerche o scoperte, ma non riportano nuove ricerche o scoperte, ma riprendono informazioni già consolidate, cioè riprendono informazioni già consolidate, cioè conoscenze già pubblicate (nelle riviste scientifiche)conoscenze già pubblicate (nelle riviste scientifiche)

FONTI PRIMARIE FONTI PRIMARIE

FONTI SECONDARIE FONTI SECONDARIE

Scoperta della struttura a doppia elica del DNA da parte di Watson e Crick

Pubblicata originariamente (1953) in: Nature, vol. 171(4356), p. 737

Oltre l’80% dell’informazione chimica Oltre l’80% dell’informazione chimica originale originale mondiale è pubblicato in mondiale è pubblicato in

articoli o brevettiarticoli o brevetti

Fonte: Fonte: ChemicalChemical AbstractsAbstracts ServiceService

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TIPOLOGIE TIPOLOGIE DIDI LAVORI PRESENTI NELLE LAVORI PRESENTI NELLE RIVISTE SCIENTIFICHERIVISTE SCIENTIFICHE

ARTICOLOARTICOLO ((paperpaper oo articlearticle))èè ilil resocontoresoconto didi unouno studiostudiocompletocompleto ee originale,originale, conconstrutturastruttura benben definitadefinita eecostantecostante:: rappresentarappresenta ilil puntopuntofinalefinale didi unauna ricercaricerca..

COMUNICAZIONECOMUNICAZIONE ((communicationcommunication))testotesto didi lunghezzalunghezza ridotta,ridotta,generalmentegeneralmente senzasenza datidatisperimentalisperimentali.. E’E’ unun documentodocumentopreliminarepreliminare concon cuicui l’autorel’autorecomunicacomunica allaalla comunitàcomunità scientificascientificaciòciò didi cuicui sisi stasta occupandooccupando.. PuòPuòessereessere seguitaseguita dada articoliarticoli veriveri..

TIPOLOGIE TIPOLOGIE DIDI LAVORI PRESENTI NELLE LAVORI PRESENTI NELLE RIVISTE SCIENTIFICHERIVISTE SCIENTIFICHE

REVIEWREVIEWèè un’estesaun’estesa raccoltaraccolta didi informazioniinformazioni concernenticoncernenti unun ristrettoristretto campo,campo, valevale aa diredire fafa ilil puntopunto delladellasituazionesituazione susu didi unun precisopreciso argomentoargomento esaminandoesaminando ee vagliandovagliando criticamentecriticamente ii lavorilavori originalioriginali pubblicatipubblicatifinofino aa quelquel momentomomento.. AlleAlle spallespalle delladella reviewreview nonnon c’èc’è unun lavorolavoro originaleoriginale sperimentalesperimentale..

FONTI SECONDARIE FONTI SECONDARIE

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I lavori pubblicati nei periodici scientifici offrono garanzia di I lavori pubblicati nei periodici scientifici offrono garanzia di validità, originalità, scientificitàvalidità, originalità, scientificità

LE RIVISTE SCIENTIFICHE LE RIVISTE SCIENTIFICHE E IL SISTEMA DEI REFEREEE IL SISTEMA DEI REFEREE

C’è un controllo di qualità formalizzato da parte della comunità scientifica che affida il C’è un controllo di qualità formalizzato da parte della comunità scientifica che affida il vaglio dei contenuti, la certificazione e la legittimazione della qualità alvaglio dei contenuti, la certificazione e la legittimazione della qualità al

SISTEMA DEI REFEREESISTEMA DEI REFEREE

Gli autori inviano la loro Gli autori inviano la loro ricerca originalericerca originale alla rivista in cui desiderano che sia pubblicataalla rivista in cui desiderano che sia pubblicata

Il comitato di redazione fa esaminare il lavoro a Il comitato di redazione fa esaminare il lavoro a due o più esperti due o più esperti della stessa materia della stessa materia

((peerpeer reviewerreviewer))

Sulla base del giudizio dei Sulla base del giudizio dei peerpeer reviewerreviewer la rivista decide se la rivista decide se pubblicare l’articolo o rigettarlo o pubblicare l’articolo o rigettarlo o richiedere agli autori modifiche, integrazioni, pre cisazionirichiedere agli autori modifiche, integrazioni, pre cisazioni

L’articolo è il cardine della comunicazione scientifica. Serve per:L’articolo è il cardine della comunicazione scientifica. Serve per:

comunicarecomunicare alla comunità scientifica la scoperta. La comunità è così in grado di verificarne la alla comunità scientifica la scoperta. La comunità è così in grado di verificarne la scientificità (sperimentabilità, ripetibilità, verificabilità);scientificità (sperimentabilità, ripetibilità, verificabilità);

stabilire una stabilire una prioritàpriorità della scoperta;della scoperta;

permettere ad altri di ottenere nuove scoperte, nuovi risultati partendo da quanto comunicato nel permettere ad altri di ottenere nuove scoperte, nuovi risultati partendo da quanto comunicato nel lavoro;lavoro;

A CHE SERVE PUBBLICARE UN LAVORO? A CHE SERVE PUBBLICARE UN LAVORO?

Le scoperte scientifiche devono avere i requisiti di Le scoperte scientifiche devono avere i requisiti di

Sperimentabilità, verificabilità, ripetibilità

GliGli articoliarticoli entranoentrano nelnel dettagliodettaglio dell’esperimentodell’esperimento inin modomodo cheche ununricercatorericercatore indipendenteindipendente possapossa ripetereripetere lele procedureprocedure eded ottenereottenerel’identicol’identico risultatorisultato

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Quali tipi di riviste scientifiche esistono? Quali tipi di riviste scientifiche esistono?

Le riviste scientifiche sono caratterizzate da unaLe riviste scientifiche sono caratterizzate da unaPERIODICITA’ VARIABILE PERIODICITA’ VARIABILE (settimanale, quindicinale, (settimanale, quindicinale, mensile…mensile…) ) e da un e da un AMBITO DISCIPLINARE PIU’ O MENO RISTRETTOAMBITO DISCIPLINARE PIU’ O MENO RISTRETTO

ParteParte delledelle rivisteriviste scientifichescientifiche contengonocontengono siasia paperspapers cheche communicationscommunications ee reviewsreviews

AltreAltre rivisteriviste sonosono dedicatededicate soprattuttosoprattutto aa reviewsreviews(es(es.. ChemicalChemical ReviewsReviews,, NatureNature ReviewsReviews DrugDrug DiscoveryDiscovery))

AltreAltre contengonocontengono solosolo communicationscommunications((ChemicalChemical CommunicationsCommunications,, TetrahedronTetrahedron LettersLetters))

Journal Journal ofof the the American American ChemicalChemical SocietySociety Journal Journal ofof OrganicOrganic ChemistryChemistry Journal Journal ofof CombinatorialCombinatorial ChemistryChemistry

Struttura di un articoloStruttura di un articolo

titolo e autorititolo e autori

abstractabstract

parole chiaveparole chiave

�� INTRODUZIONEINTRODUZIONE

�� MATERIALI E METODIMATERIALI E METODI

�� RISULTATIRISULTATI

�� DISCUSSIONE E CONCLUSIONEDISCUSSIONE E CONCLUSIONE

�� BIBLIOGRAFIA (BIBLIOGRAFIA (referencesreferences))

L’articolo vero e L’articolo vero e proprioproprio

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Il riferimento bibliograficoIl riferimento bibliografico

OgniOgni articoloarticolo èè seguitoseguito dada unauna bibliografia,bibliografia, cioècioè unun elencoelenco didi riferimentiriferimenti bibliograficibibliografici((referencesreferences)) relativirelativi aa lavorilavori cheche gligli autoriautori hannohanno consultato,consultato, utilizzatoutilizzato ee aa cuicui hannohannofattofatto riferimentoriferimento nelnel corsocorso delladella ricercaricerca..

IlIl RIFERIMENTORIFERIMENTO BIBLIOGRAFICOBIBLIOGRAFICO èè unun insiemeinsieme didi informazioniinformazioni cheche permettonopermettono didiidentificareidentificare UNIVOCAMENTEUNIVOCAMENTE unun documentodocumento (articolo,(articolo, libro,libro, brevettobrevetto eccecc..))

E’ la citazione formalizzata di un documentoE’ la citazione formalizzata di un documento

Gli elementi che lo formano Gli elementi che lo formano hanno una sequenza ed una struttura standardizzatahanno una sequenza ed una struttura standardizzata: :

GliGli stilistili deldel riferimentoriferimento bibliograficobibliografico possonopossono variarevariare dada rivistarivista aa rivistarivista (uso(uso diversodiverso deldelcorsivocorsivo oo deldel grassetto,grassetto, delladella punteggiatura)punteggiatura) mama gligli elementielementi fondamentalifondamentali perperl’identificazionel’identificazione ee lala localizzazionelocalizzazione deldel lavorolavoro sonosono sempresempre presentipresenti

MaugerMauger, A. B. , A. B. J. J. OrgOrg. . ChemChem. . 19811981, , 4646, 1032, 1032--1035. 1035.

autore titolo rivista anno volume pagine

Un esempio molto diffuso di riportare i Un esempio molto diffuso di riportare i riferimentioriferimentio bibliografici bibliografici è quello presente in tutte le riviste del gruppo ACS.è quello presente in tutte le riviste del gruppo ACS.

Lo stile ACSLo stile ACS

Cognome autore, nome autore abbreviato; cognome autore,nome autore abbreviato Titolo rivista abbreviato anno , volume,pagine.

Titolo rivista: in corsivoanno: in grassetto

Takashima, Y.; Kawaguchi, Y.; Nakagawa, S.; Harada, A. Chem. Lett. 2003, 12, 1122-1123

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LE RIVISTE ELETTRONICHELE RIVISTE ELETTRONICHE

COS’E’ UNA RIVISTA ELETTRONICA?

Ormai ogni rivista scientifica ha una sua versione in linea .Nella maggior parte dei casi non è altro che il riversamento in formato elettronico deicontenuti della versione su carta , cioè la copia fedele dell’originale cartaceo, con latradizionale suddivisione in volumi e fascicoli

Articolo in formato elettronico

In formato html quindileggibile e fruibile avideo (collegamentiinterni ed esterni)

In formato pdf , idealeper salvataggio estampa

LaLa ricercaricerca bibliograficabibliografica oggioggi haha unun caratterecarattereprevalentementeprevalentemente legatolegato all'all'informaticainformatica..

GliGli archiviarchivi susu basebase elettronicaelettronica sonosono ii mezzimezzi piùpiù validivalidiperper ottenereottenere risposterisposte esaustiveesaustive allealle proprieproprie esigenzeesigenze..

Come eseguire la ricerca bibliografica?Come eseguire la ricerca bibliografica?

COS’E’ UNA BASE COS’E’ UNA BASE DIDI DATI BIBLIOGRAFICA?DATI BIBLIOGRAFICA?

È un archivio elettronico di riferimenti bibliografici (con abstract) interrogabili viaterminale; in campo scientifico i riferimenti bibliografici rimandano nella gran parte deicasi a lavori su riviste.

Da dove partire?

cognome dell’autoreuna o più parole significative (parole chiave/keyword )formula o nome chimico

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Esempi di basi di datiEsempi di basi di dati

Via WEB

Copertura temporaleCopertura temporale

CCOOPPEERRTTUURRAA TTEEMMPPOORRAALLEE

FFRREEQQUUEENNZZAA AAGGGGIIOORRNNAAMMEENNTTII

CChheemmiiccaall AAbbssttrraaccttss oonn CCDD

dal 1976 ad oggi

mensile

BBeeii llsstteeiinn dal 1772 ad oggi trimestrale

GGmmeell iinn dal 1771 ad oggi trimestrale

IInnssppeecc dal 1969 ad oggi settimanale

WWeebb ooff SScciieennccee dal 1986 ad oggi settimanale

SSccii ff iinnddeerr SScchhoollaarr dal 1907 ad oggi giornaliera

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UN ESEMPIO UN ESEMPIO DIDI BANCA DATI BANCA DATI BIBLIOGRAFICA DEL SETTORE MEDICO BIBLIOGRAFICA DEL SETTORE MEDICO

Banca Dati bibliografica prodotta dallaBanca Dati bibliografica prodotta dallaNational National LibraryLibrary ofof Medicine Medicine

Tipologia: fonte bibliografica di tipo secondario con rimando, cioè, alle fontiprimarie.

Settori di interesse: medicina, infermieristica, odontoiatria, medicina veterinaria,sistema sanitario, scienze precliniche.

Contiene circa 15 mln di citazioni di articoli scientifici dagli anni ’50 ad oggi. Gliabstract sono presenti per il 76% degli articoli.

In alcuni casi permette l’accesso ai full text gratuitamente on line, negli altri casicollega direttamente al sito della rivista.

Riviste indicizzate: circa 4600 tra quelle pubblicate negli USA (52%) ed in altri 70paesi.

Anno di inizio: 1966- solo citazioni, dal 1975- citazioni ed abstracts.Aggiornamenti: settimanali con un incremento di circa 7000 nuove citazioni.

PRIMA DEL DOVE..IL COMEPRIMA DEL DOVE..IL COME

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Come condurre la ricerca bibliograficaCome condurre la ricerca bibliografica

Inventore degli operatori booleaniInventore degli operatori booleani

OPERATORI BOOLEANI O OPERATORI LOGICIOPERATORI BOOLEANI O OPERATORI LOGICI

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OPERATORE “AND”OPERATORE “AND”

SupponiamoSupponiamo didi volervoler conoscereconoscere qualiquali antibioticiantibiotici possonopossono essereessere adoperatiadoperati nellanella terapiaterapiadell’otitedell’otite..L’operatoreL’operatore “AND”“AND” consentiràconsentirà didi visualizzarevisualizzare unicamenteunicamente ii recordrecord cheche contengonocontengonoentrambientrambi ii terminitermini

OPERATORE “OR”OPERATORE “OR”

Per esempio, se si stanno cercando articoli sugli antibiotici, si può decidere che anche gliarticoli contenenti il termine sinonimo “agenti antibatterici” possono essere importanti aifini della ricerca.Usando nella ricerca “antibiotic OR anti-bacterial agents”, stiamo cercando gli articolicontenenti sia la parola “antibiotic”, sia la parola “antibacterial agents”, sia entrambe liconcetti

* Il primo cerchio rappresenta tutti i record contenenti la parola“antibiotic.”* Il secondo cerchio rappresenta tutti i record contenenti la parola“antibacterial agents”* La parte sovrapposta rappresenta i record contenenti entrambi i concetti.

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OPERATORE “NOT”OPERATORE “NOT”

Si adopera per restringere la ricerca. Se, ad esempio, siamo interessati ariferimenti bibliografici riguardanti l’otite, ma nei quali non si parli di terapiaantibiotica, potremmo scrivere “otitis NOT antibiotic”

OPERATORI BOOLEANI “NEAR E FAR”OPERATORI BOOLEANI “NEAR E FAR”

Sono più potenti dell’operatore AND nel restringere il campo della ricerca.Oltre a ricercare documenti che contengono entrambe le parole, specifica chei due termini si devono trovare entro un certo numero di parole di distanzal'uno dall'altro.

• Esempi di ricerca combinata

(Italia AND pizza) OR spaghetti

Italia AND (pizza OR spaghetti)

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Pubmed è un servizio accessibile gratuitamente, offerto dal National Centerfor Biotechnology Information (NCBI), istituito dal 1988, presso la NationalLibrary of Medicine (NLM) di Bethesda.

MODALITÀ MODALITÀ DIDI ESECUZIONE ESECUZIONE DELLA RICERCADELLA RICERCA

Ricerca libera : assenza di controllo linguistico ed informatico.Spesso si ottiene un eccessivo “effetto rumore” o “effetto silenzio”

Parole tratte dal linguaggio scientifico naturale.

QUANDO SI USA UN TERMINE LIBERO CONSIDERARE SEMPRE: QUANDO SI USA UN TERMINE LIBERO CONSIDERARE SEMPRE:

•Sinonimi•Plurali•Inglese/americano

Esempio:

BACK PAIN or BACKACHE

PET or Positron Emission Tomography

CANCER or CANCERS or TUMOR or TUMOUR or NEOPLASM

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Ricerca tramite Thesaurus: ricerca mediante termini controllati ricavati da un THESAURUS (dizionario)

In PUBMED le parole chiave sono individuate con il termine MeSH (Medical Subject Headings)

esempio: esempio:


Si ottengono 922 records! (dei quali 125 review e solo 165 articoli disponibili in formato full text)

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(1)


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Si ottengono 360 records (dei quali 41 review)

IL RISULTATO DELLA RICERCAIL RISULTATO DELLA RICERCA

Le citazioni sono visualizzate nel formato “summary” E’ possibile utilizzare altri formati cliccando sulla relativa finestra

Quest’altra finestra permette di selezionare il numero di citazioni che si desidera visualizzare

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Il formato “text” da accesso alla lettura dell’abstract. L’opzione “file” consente il salvataggio dei risultati della ricerca.


L’opzione “clipboard” consente di registrare direttamente sul server di

Pubmed per otto ore la ricerca eseguita.

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LIMITARE LA RICERCA LIMITARE LA RICERCA ––FUNZIONE “LIMITS”FUNZIONE “LIMITS”

Permette di RESTRINGERE la ricerca ad alcuni campi:Permette di RESTRINGERE la ricerca ad alcuni campi:

adad esempioesempio ilil tipotipodidi pubblicazionipubblicazioni(solo(solo articoli,articoli, senzasenzareviewreview,, metanalisimetanalisi,,studistudi clinici,clinici, etcetc..))

L’etàL’età

La linguaLa lingua Il sessoIl sesso

ULTERIORI OPZIONI ULTERIORI OPZIONI DIDI PUBMEDPUBMED

History : permette di visualizzare le ultime strategie di ricerca, che sonoautomaticamente salvate dopo 8 ore di inattività.

Clipboard : si possono conservare temporaneamente le citazioni utili trovate finoad un max di 500.

Cubby : spazio personale in cui è possibile immagazzinare le ricerche effettuatefrequentemente , che si possono riutilizzare in futuro. Per accedere al serviziooccorre registrarsi.

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E’ la maggiore base di dati della letteratura e documentazione diambito chimico e biochimico. E’nata come versione elettronica delChemical Abstracts, pubblicato dal 1907 dal Chemical AbstractService (una divisione della American Chemical Society) unarassegna analitica che assicura la copertura totale dellaproduzione mondiale di documenti scientifici e tecnici nei settoridella biochimica, chimica inorganica e e organica, chimica fisica,etc.Copertura: 22 milioni di riferimenti bibliografici e di 43 milioni disostanze .

SciFinder®SciFinder®

La ricchezza della banca dati, la sua natura multidisciplinare e comprensiva dimolte risorse la rendono un strumento privilegiato per recuperare velocementedati e informazioni.Racchiude contenuti riguardanti un secolo di ricerca scientifica (dal 1907 adoggi) che permettono di verificare evoluzione dei principi scientifici.

Per accedere alla consultazioneoccorreva prima scaricare sulproprio pc il relativo software

Connessione via WEB

https://scifinder.cas.org/scifinder/login.jsf

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SciFinder®SciFinder®

SciFinder è strutturata inmodo da aggregare inun’unica risorsa banchedati di diverse tipologie

Explore referencesExplore references–– RESEARCH TOPICRESEARCH TOPIC

Scegliamo ExploreExplore referncesrefernces byby researchresearch topictopic perper cercarecercare unouno specificospecificoargomentoargomento

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ExploreExplore –– RESEARCH TOPICRESEARCH TOPIC

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ExploreExplore –– RESEARCH TOPICRESEARCH TOPIC

IL PRIMO GRUPPO

I RISULTATII RISULTATI

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Possiamo poi elaborare i risultati selezionati: la sezione Analysis e Refinepermette di:1.Elaborare i risultati della ricerca: ad es. trovare la distribuzione degli articoli per annodi pubblicazione, vedere quanti riferimenti sono stati pubblicati in un determinatoperiodico o da un certo autore oppure provengono da una specifica istituzione;2.Restringere il numero dei risultati introducendo nuovi criteri di ricerca: nuove parolechiave, un intervallo temporale, etc.


La funzione Get related permette di recuperare i documenti collegati: questisono citazioni

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ExploreExplore –– AUTHOR NAMEAUTHOR NAME

Scegliamo ExploreExplore byby AUTHORAUTHOR NAMENAME perper recuperarerecuperare ii riferimentiriferimenti inserendoinserendo ililnomenome dell’autoredell’autore.. LaLa bancabanca datidati estendeestende lala ricercaricerca aa formeforme alternativealternative deldel nomenome(varianti(varianti tipografiche,tipografiche, inizialiiniziali deldel nomenome didi battesimobattesimo autore)autore)..

ExploreExplore –– AUTHOR NAMEAUTHOR NAME

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Explore Substances Explore Substances –– Molecular FormulaMolecular Formula

Scegliamo ExploreExplore substancessubstances byby MOLECULARMOLECULAR FORMULAFORMULA perper trovaretrovare unaunasostanzasostanza inin basebase allaalla formulaformula brutabruta..

ExploreExplore –– MOLECULAR FORMULAMOLECULAR FORMULA

sulla beuta

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ExploreExplore –– EXACT STRUCTUREEXACT STRUCTURE

Scegliamo ExploreExplore byby EXACTEXACT STRUCTURESTRUCTURE perper trovaretrovare unauna sostanzasostanzadisegnandoladisegnandola..

ExploreExplore –– REACTIONREACTION

Scegliamo ExploreExplore byby REACTIONREACTION perper individuareindividuare specifichespecifiche reazionireazioni chimichechimiche

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ExploreExplore –– REACTIONREACTION

Substance identifierSubstance identifier

Il comando substance identifier è predisposto per la ricerc a puntuale di unasostanza inserendo il loro nome chimico

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Il comando JOURNAL permette di scorrere gli indici degli art icoli dei periodicicontenuti nella banca dati.

Explore references Explore references –– JOURNALJOURNAL

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