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  • La relacin de la Qumica conotras disciplinas cientficas

    y tecnolgicas

    Carlos Miranda29 de abril de 2009

    I CURSO DE DIVULGACIN

    LOS AVANCES DE LA QUMICA Y SU IMPACTO EN LA SOCIEDAD

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica enCiencias Medioambientales

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica en Toxicologa

  • BIOLOGABiologa celularMicrobiologa

    AnatomaFisiologaGentica

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    La Qumica, la ciencia central

    QUMICA

    FSICAFsica atmica y nuclear

    Mecnica cunticaEspectroscopa

    Ciencia de materialesBiomecnica

    BIOQUMICABiologa molecular

    InmunologaEndocrinologa

    Ingeniera gentica

    MEDICINA y CC. SALUDFarmacologa

    NutricinQumica clnica

    Radiologa

    QUMICANUCLEARRadioqumica

    Medicina nuclear

    CIENCIAS DE LASPLANTAS

    BotnicaAgronoma

    CIENCIASMEDIOAMBIENTALES

    EcologaEstudios de contaminacin

    GEOLOGA

    ASTRONOMA

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica en Biologa:Secuenciacin del ADN

    Walter GILBERT Frederick SANGER

    Premio Nobel de Qumica (1980)

    Determinacin de la secuencia de bases de los cidos nucleicos

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Aspectos estructurales de la molcula de ADN

    La molcula de ADN es un polinucletido = polmero de nucletidos

    Qu es un nucletido?

    NUCLETIDO Pentosa(Azcar de 5 t. de C)

    Base nitrogenada Grupos fosfato(de uno a tres)

    = + +

    nuclesido

    nucletido monofosfato

    PURINA

    PIRIMIDINA

    NH

    N

    O

    O

    RUracilo

    ARN

    nucletido difosfato

    nucletido trifosfato

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Aspectos estructurales de la molcula de ADN

    En los seres vivos est constituida por dos cadenas antiparalelas, formando la conocida doble hlice

    Interacciones por enlaces de hidrogeno por pares A=T y C=G=

  • El grupo OH en posicin 3 del anillo de desoxirribosa es fundamental para la polimerizacin de la molcula de ADN

    : :

    O

    HO

    HH

    HH

    PO

    O-

    O-

    O

    HO

    HH

    HH

    PO O-

    Base

    Base

    O

    HOH

    HH

    HH

    O Base

    O

    P-O O-

    O-

    5

    3

    O

    HOH

    HH

    HH

    OPO

    O-

    O

    POP-O

    O

    O-

    O

    O-

    Base

    O

    HO

    HH

    HH

    PO

    O-

    O

    O-

    O

    HO

    HH

    HH

    PO O-

    Base

    Base

    O

    HO

    HH

    HH

    O Base

    PO O-

    O

    HOH

    HH

    HH

    O Base

    O

    P-O

    O-

    5

    3

    OP-O

    O-

    O

    OHP

    O-

    O

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Mecanismo de polimerizacin del ADN

    ADN Polimerasa

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasSecuenciar el ADN:Planteamiento del problema

    El nucletido es el bloque fundamental

    Cmo conocer el orden de los nucletidos?

    El OH en posicin 3 es el responsable de la polimerizacinNUCLETIDO

    Grupo OH (3)

    Hebra de ADN

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasSecuenciar el ADN:Mtodo de terminacin de la cadena

    Se puede separar ADN en funcin del tamao

    Distinta longitud?

    SParando la elongacin de la cadena

    Cmo?

    Neutralizando el punto de crecimiento

    Electroforesis Poliacrilamida-Urea(Resolucin: 1 nucletido)

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasSecuenciar el ADN:Didesoxinucletidos trifosfatados

    DESOXINUCLETIDOS (dNTP) vs DIDESOXINUCLETIDOS (ddNTP)

    ddATPdATP

    Ausencia del grupo OH en posicin 3 del anillo de ribosa

    No se puede formar el enlace fosfodister

    Terminacin qumica de la cadena de ADN

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Identificacin de los fragmentos

    polimerasa

    muestra ADNdATPdCTP

    dGTP

    dTTP

    ddATPddCTPddTTPddGTP

    3

    5

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Identificacin de los fragmentos

    Fsforo radiactivo (32P y 33P)

    MARCAJE

    SOLUCIN:

    5aAAATCAATTCTGTGAACGATAATCCAGTCATTGATGTTGCCAGAGACAAAGCT 3'

    pequeos

    grandes

    TAM

    A

    O F

    RA

    GM

    EN

    TOS

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasMarcaje de los nucletidos de terminacin

    Marcaje con colorantes fluorescentes

    NB

    NF F

    CH3

    CHS

    CHR

    Bodipy-FL-510[abs (max) = 502 nm; em (max) = 510 nm]

    R6G [abs (max) = 525 nm; em (max) = 550 nm]

    Bodipy-650[abs (max) = 630 nm; em (max) = 650 nm]

    ROX[abs (max) = 575 nm; em (max) = 602 nm]

    VENTAJAS:

    Una sola reaccin de secuenciacin Fcil automatizacin

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasMarcaje de los nucletidos de terminacin

    Separacin de fragmentos por electroforesis capilar

    ..

    Pol. lquido

    ATTGC A

    Laser

    Prisma

    Detectores

    -

    VentanaReaccin Secuencia

    Capilar

    ....

    Pol. lquidoPol. lquido

    ATTGC AATTGC A

    LaserLaser

    PrismaPrisma

    DetectoresDetectores

    --

    VentanaVentanaReaccin SecuenciaReaccin Secuencia

    CapilarCapilar

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Proyecto GENOMA HUMANO

    Febrero de 2001

    Science 291,1304-1351 (16 February 2001)

    Nature 409, 856-859 (15 February 2001)

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Qumica en Medicina

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica y Medicina:Contrastes radiolgicos

    RADIOGRAFA

    Distinguen tejidos blandos por diferencia de opacidad frente a rayos X

    CONTRASTES RADIOLGICOS

    Sustancia susceptible de ser empleada en exmenes mdicos de rayos X

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica y Medicina:Contrastes radiolgicos

    Contrastes densos

    Basados en compuestos qumicos que contienen tomos pesados

    Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X

    FUEN

    TE R

    AYO

    S X

    Plac

    a fo

    tose

    nsib

    le

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica y Medicina:Contrastes radiolgicos

    Contrastes densos

    Sulfato de Bario Compuestos de yodo

    Iohexol

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica y Medicina:Contrastes radiolgicos

    Contrastes densos

    Contrastes hipodensos

    Basados en compuestos qumicos que contienen tomos pesados

    Ofrecen una mayor opacidad a los rayos X

    Basado en el uso de un gas o de aire

    Presentan una menor opacidad

    FUEN

    TE R

    AYO

    S X

    Plac

    a fo

    tose

    nsib

    le

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicasQumica y Medicina:Medicina Nuclear

    Radioistopos ms empleados

    Henri Danlos (fsico frances) en 1901 emple radio para tratar heridas de piel producidas en enfermos de tuberculosis

    Empleo de istopos radioactivos para dianstico clnico y tratamiento de enfermedades: Algunos tipos de cncer

    Enfermedades cardiovasculares Desrdenes neurolgicos

    Radioistopo Smbolo Radiacin Vida media Uso

    Tritio 12.32 aos Trazador bioqumico

    Sodio-24 14.95 horas Circulacin sangunea

    Fsforo-32 14.28 das Terapia anti-leucemia

    Cobalto-60 , 5.27 aos Terapia cancerosa

    Arsnico-74 + 17.8 das Localizacin tumores cerebrales

    Tecnecio-99 6.01 horas Escner cerebral

    Yodo-131 8.04 das Terapia tiroidea

    H13

    Na1124

    P1532

    Co2760

    As3374

    I53131

    Tc4399m

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    Tomografa por emisin de positrones

    Tcnica de anlisis en tiempo real no invasiva

    En combinacin con TAC(tomografa axial computerizada)

    imagen de PET TAC cuerpo entero

    Imagen tpica PET cerebral

    Informacin y diagnsticos MUY PRECISOS

  • La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    PET: Radiotrazadores

    Administrado por va intravenosa, va oral o va respiratoria imagen PET TAC de cuerpo entero

    Medicin de la

    ACTIVIDAD METABLICA

    Se acumula en los rganos con afinidad por el radiotrazador

    Emisin de radiacin gamma en los rganos donde se localiza

    La relacin de la Qumica con otras disciplinas cientficas y tecnolgicas

    PET: Radionuclidos

    Istopos de vida media corta:

    Se incorporan en molculas que sabemos como utiliza nuestro cuerpo

    Desintegracin por emisin de positrones

    11C, ~20 minutos13N, ~10 minutos15O, ~2 minutos18F, ~110 minutos

    0

    10

    20

    30

    40

    50

    60

    70

    80

    90

    100

    0 1 2 3 4 5 6 7 8

    Periodo de semidesintegracin

    n de periodos

    % ra

    diac

    tivi

    dad

    11 C613 N7158 O

    18 F9

    B11513 C6157 N

    18 O8

    + + + e + 0.45 MeV

    + + + e + 2.22 MeV

    + + + e + 2.85 MeV

    + + + e + 1.66 MeV

    + = e+

  • La relacin de la Qumica con otras dis