www.grid.org.tr

Kullanıcı Pratik Eğitimi

Kullanıcı Arayüzüne Erişim• Kullanıcı arayüzüne ssh ile bağlanın

ssh –l egitim(1-20) somon.ulakbim.gov.tr

• .globus dizininin varlığını kontrol edin

ls –laR .globus

.globus:total 16drwxr-xr-x 2 root root 4096 Aug 15 13:57 .drwx------ 31 root root 4096 Feb 10 15:32 ..-rw-r--r-- 1 root root 0 Mar 14 2006 usercert.pem-rw-r--r-- 1 root root 1322 Mar 14 2006 usercert_request.pem-rw------- 1 root root 963 Mar 14 2006 userkey.pem

• Pratik eğitim için gerekli örnek dosyaları kullanıcı dizininize açın:

cd ~tar zxvf /home/egitim.tar.gz

Çalışabileceğiniz Kaynakları Görüntülemek• Herhangi bir sanal organizasyon için o an geçerli çalışabileceğiniz kaynakları görüntülemek için:

lcg-infosites –vo <VO>

komutunu kullanabilirsiniz.

• sgdemo sanal organizasyonunda çalışılabilecek işlemcileri görmek için:

lcg-infosites –vo sgdemo ce

• sgdemo sanal organizasyonunda veri saklama alanını görmek için:lcg-infosites –vo sgdemo se

• Sorgulanabilecek diğer özellikleri görmek için:

Lcg-infosites –list-attrs

Kullanıcı SertifikanızBir X.509 sertifikası şu bilgileri içerir:

Kullanıcı açık anahtarı;

Kullanıcı hakkında bilgi;

Sertifika otoritesi bilgisi;

Geçerlilik süresi;

Sertifika otoritesinin imzası

Sertifikanızı incelemek için:openssl x509 –in usercert.pem –text

veya

grid-cert-info

Açık AnahtarAçık Anahtar

Subject: C=TR, O=TRGrid, Subject: C=TR, O=TRGrid, OU=TUBITAK-ULAKBIM, OU=TUBITAK-ULAKBIM, CN=Onur TemizsoyluCN=Onur Temizsoylu

Issuer: C=TR, O=TRGrid, CN=TR-Issuer: C=TR, O=TRGrid, CN=TR-Grid CAGrid CAValidityValidity Not Before: Feb 5 Not Before: Feb 5 10:05:58 2007 GMT10:05:58 2007 GMT Not After : Feb 5 Not After : Feb 5 10:05:58 2008 GMT10:05:58 2008 GMT

Sertifika Otoritesi İmzasıSertifika Otoritesi İmzası

Globus Grid Security Infrastructure (GSI)• GSI PKI kullanarak ortakatman yazılımları için bir güvenlik standardı oluşturur.

• Önemli bazı özellikler getirir:

• “Single sign-on”: Her seferinde şifre girmek gerekmez.

• Atama: Servisler kullanıcı adına çalışabilir.

• Proxy sertifikaları sayesinde çalışırlar.

GSI Çevre DeğişkenleriKullanıcı Sertifikaları:

Açık Anahtar: X509_USER_CERT ($HOME/.globus/usercert.pem)Özel Anahtar: X509_USER_KEY ($HOME/.globus/userkey.pem)Proxy: X509_USER_PROXY (/tmp/x509up_u<id>)

Sunucu Sertifikaları:

Açık Anahtar: X509_USER_CERT (/etc/grid-security/hostcert.pem)Özel Anahtar: X509_USER_KEY (/etc/grid-security/hostkey.pem)

Sertifika Otoriteleri: X509_CERT_DIR (/etc/grid-security/certificates)

Proxy Oluşturmak

• Çalışmak için proxy oluşturun:

voms-proxy-init --voms sgdemo

• Oluşturduğunuz proxy hakkında bilgi edinin

voms-proxy-info -all

• Oluşturduğunuz proxy’i yok edin

voms-proxy-destroy

İşinizi Çalıştırmadan Önce

• Bilmeniz gerekenler:

• Hangi programlar gönderilecek?

• Hangi veriye erişilecek, veri program ile birlikte mi gidecek?

• Herhangi bir işletim sistemi, kütüphane bağımlılığı var mı?

• Gönderdiğiniz uygulama:

• Bilinmeyen bir sistemde çalışabilmeli

• Çalışma dizini dışında yer alacak şekilde sabit olarak belirlenmiş dizinler ve dosyalar içermemelidir.

Grid Dünyasının Dili - JDL

• Job Description Language (JDL)

Condor ClassAd dili standardında geliştirilmiştir

• Bir JDL dosyası niteliklerle oluşturulur:

<nitelik> = <anahtar>;

• # ile JDL içine açıklama satırları yazılabilir.

• Nitelikler temel olarak ikiye ayrılabilir:

• İş nitelikleri, işin kendini tanımlar

• Kaynak nitelikleri, işe uygun kaynakların bulunmasını sağlar.

JDL Dosyası

• Bir JDL dosyası en azından aşağıdaki nitelikleri içerir:

• Çalışacak uygulamanın adı

• İşin standart çıktısının ve hatasının yazılacağı dosyaları

• Gerekli ise iş için gerekli argümanları

• Girdi ve çıktı torbalarında yer alacak dosyaları

ornek1.jdl

Executable = “ls”;StdError = “stderr.log”;StdOutput = “stdout.log”;Arguments = “-al”;OutputSandbox = {“stderr.log”, “stdout.log”};

JDL NitelikleriJobType Normal (basit, seri iş), Interactive, MPICH, Checkpointable

Executable – Çalıştırılacak komut

Arguments – Komuta verilecek argümanlar

StdInput, StdOutput, StdError – Standart girdi, çıktı ve hata dosyaları

Environment – Çevre değişkenleri

InputSandbox – Kullanıcı arayüzünden çalışacağı siteye gönderilecek dosyalar

OutputSandbox – İş bitiminde alınacak dosyalar

Requirements – Gerekli kaynak nitelikleri

Rank – Bulunan kaynakların sıralanması

JDL Dosyasıornek2.jdl

[ Executable = "/bin/sh";

Arguments = "HelloWorld.sh";

Stdoutput = "stdoutput";

StdError = "stderror";

InputSandbox = {"HelloWorld.c","HelloWorld.sh"};

OutputSandbox = {"stdoutput","stderror"};

Requirements = (other. GlueHostOperatingSystemName == “linux") && (other.GlueCEPolicyMaxWallClockTime > 10000);

Rank = other.GlueCEStateFreeCPUs;]

Bir İşin Hayat HikayesiLFCLFC

UIJDL

LB

WMS (RB)WMS (RB)

İş Göndermeİş GöndermeServisiServisi

SESE

CECE

BDIIBDII

İş Durumu

Veri Bilgisi

VOMS

İş G

önd

erme

İş S

orgulam

a

İş D

urum

u

Girdi torbası

Girdi torbası + Planlam

a Bilgisi

Globus RSL

Çıktı Torbası

Çıktı torbası

İş Durumu

vom

s-pr

oxy-

init

Exp

and

ed J

DL

SE & CE Bilgisi

İşi göndermeden önce• JDL dosyasında yer alan niteliklere göre işin çalışabileceği siteleri görebilirsiniz.

glite-job-list-match <job.jdl>

• İşinizin belli bir sitede çalışması için Requirement satırıekliyebilirsiniz.

Requirements = other.GlueCEUniqueID == "ce.ulakbim.gov.tr:2119/jobmanager-lcgpbs-sgdemo";

İş Göndermekglite-job-submit [-vo <VO>] [-o <dosya_ismi>] <job.jdl>

-vo Sanal organizasyon, proxy oluşturulurken tanımlandı ise gerek yoktur

-o Oluşacak JobID bu dosyaya yazılır

glite-job-status –i <dosya_ismi> (veya jobId)

-i İş gönderilirken verilen dosya ismi burada kullanılabilir

İş Göndermek glite-job-submit testJob.jdl

**** Warning: UI_VOMS_OVERRIDE ****The Virtual Organisation name "dteam" you have specified with the UI conf file will be overriden by thedefault VO in your proxy credentials: "sgdemo"

Selected Virtual Organisation name (from proxy certificate extension): sgdemoConnecting to host wms.ulakbim.gov.tr, port 7772Logging to host wms.ulakbim.gov.tr, port 9002

********************************************************************************************* JOB SUBMIT OUTCOME The job has been successfully submitted to the Network Server. Use glite-job-status command to check job current status. Your job identifier is:

- https://wms.ulakbim.gov.tr:9000/2n33HIg63quJXLKgHG2m-A JobID

*********************************************************************************************

İş Göndermekglite-job-cancel <jobid>

Belirtilen işi iptal eder

glite-job-status <jobid>

İş hakkında bilgi verir

glite-job-output <jobid>

İşin çıktı torbasını getirir

glite-job-logging-info <jobid>

İş hakkında detaylı bilgi verir, hata gidermek için yararlı bir komuttur

İş Durumları

DurumDurum Anlamı

SUBMITTED LB tarafından iş kabul edildi

WAIT Kaynak planlaması yapılıyor

READY Seçilen sitenin CE sunucusuna iş gidiyor

SCHEDULED Seçilen sitenin iş kuyruğunda iş bekliyor

RUNNING İş seçilen sitede çalışıyor

DONE İş başarı ile tamamlandı

CLEARED İşin çıktı dosyaları alındı

ABORT Orta katman tarafından iş iptal edildi

Olası İş Durumları

İnteraktif İşlerİnteraktif iş, standart girdi, çıktı ve hataları iş gönderilen istemciye yönlendiren iş tipidir:

• Kullanıcı JobType niteliğini interactive olarak ayarlamalıdır.

• Bir interaktif iş gönderildiğinde glite-job-submit komutu arka planda bir gölge konsol işi başlatır.

• Konsolun kullanacağı port, ListenerPort niteliği ile değiştirilebilir.

• DISPLAY çevre değişkeni düzgün ayarlanmalı veya –nogui parametresi kullanılmalıdır

• OutputSandbox niteliğini tanımlamaya gerek yoktur. İnteraktif pencereye çıktılar gelecektir.

MPICH İşleriParalel iş koşturmak için birçok kütüphane vardır. gLite orta katmanında MPICH tercih edilmiştir.

Kullanıcı JobType niteliğini MPICH olarak ayarlamalı ve NodeNumber niteliği ile gerekli işlemci sayısını ayarlamalıdır.

Bir sitede MPICH işi çalışması için sitenin uygun şekilde düzenlenmesi dışında:

• Sitenin MPICH desteklediğinin işaretlenmesi gerekmektedir

• İstenen işlemci miktarı sitedeki mevcut işlemci sayısından az olmalıdır

MPICH İşleri[JobType = “MPICH";Executable = "cpi";NodeNumber = 2;StdOutput = "test.out";StdError = "test.err";InputSandbox = {"cpi"};OutputSandbox = {"test.out","test.err"};]

• NodeNumber işin çalışacağı işlemci sayısını belirtir.• İşlemci sayısı arttıkça işin kuyrukta bekleme süresi de artacaktır