Kako napisati i objaviti naučni rad

THE dos AND donts OF MEDICAL PUBLISHING:How to get your papers published. Kassirer JB, World Congress of Nephrology 2004.

Editorial manuscript handling. Drüeke TB, WCN 2004.

LITERATURA

Kako napisati naučni rad? Mostarica Stojkovic M, Tribina 2003.

Alexandrov AV. How to Write a Research Paper.Cerebrovasc Dis 2003; 18: 135-137

Kallet RH. How to Write the Methods Section of a Research paper.Respir Care 2004; 49: 1229-1232

Hess DR. How to write an Effective Discussion. Resp Care 2004; 49: 1238-1241

Durbin Cg. How to come up with a good research question: framing the hypothesis. Respir Care 2004; 49: 1195-1198

Formulisanje hipoteze Planiranje istraživanja Eksperimentalni rad - Prikupljanje podataka Analiza podataka Zaključivanje

Pisanje rada

FAZE ISTRAŽIVAČKOG RADA

Planiranje istraživanja

Materijal? Bolesnici/izbor slučajeva (kriterijumi) Određivanje veličine uzorka

Randomizacija

Merenja? Očekivani rezultati Vremenski raspored

Izvodljivost? Finansijski aspektiLaboratorijske metodeEtički aspekti

Značaj? Da li rezultati mogu biti objavljeni

A scientist‘s life would be a happy one if he had only to observe and never to write.

Charles Darwin, 1809-1882

I Introduction

M Material & MethodsR Resultsa andD Discussion

Delovi naučnog rada: IMRaD-Struktura

Apstrakt se može napisati na početku ili nakon završetka IMRaDsekvence

Title

References

Algoritam za pisanje rada (I)

Prikupiti podatke

Izabrati naslov (ko-)autore, časopis

Kopirati apstrakt ili napisati kratak prikaz studije (IMRaD)

Pretražiti ili dopuniti literaturu

Organizovati podatke u tabele i grafikone

Napisati prvu radnu verziju

Kako izabrati NASLOV?

SADRŽAJ

Neskrativi skup pojmova koji tačno opisuju sadržaj rada

Proveriti:

– Da li naslov sadrži pojmove pomoću kojih se Vaš rad može lako naći prilikom on-line pretraživanja ?

Naslov “prodaje” rad !!!

VRSTE

Indikativni

Informativni

Kako izabrati časopis (1) ?

Do koje publike želite da doprete ? Da li časopis štampa radove iz Vaše naučne oblasti

? Da li su već “prezasićeni” radovima ? Kakav je “impact factor” ? Da li mediji preuzimaju članke iz tog časopisa ?

Kako izabrati časopis (2) ?

Impact factor – Nephrology journals 2001 Broj citata / broj članaka koji su štampani po jedinici

vremena (2 godine) u određenom časopisu

1) JASN 5.7 8) PDI 1.82) Kidney Int 4.4 9) Nephron 1.83) AJP-Renal 4.1 10) Exp Nephrol 1.84) AJKD 3.7 11) Clin Nephrol 1.65) Contrib Nephrol 2.4 12) Kidn BP Res 1.46) Semin Nephrol 2.3 13) Blood Purif 1.37) NDT 2.1 14) Am J Nephrol 0.9

Sadržaj i struktura:

Glavni aspekti rada dati u 150-250 reči po sledećem redosledu: svrha/cilj rada, materijal i metode, glavni rezultati i osnovni zaključci

Stil: Prošlo vreme

Kako pisati APSTRAKT ?

– Da li je dobro strukturisan ?

– Da li su do sada poznate činjenice i ciljevi dobro istaknuti ?

– Metode : Kratke i precizne ?

– Rezultati : Koncizni ? Lako razumljivi ?

– Zaključci : Sadrže glavnu poruku (“take-home messsage”) ili hipotezu ?

Kako recenzent procenjuje APSTRAKT ?

Kako pisati UVOD (1) ?

Sadržaj:

Kratak pregled prirode i značaja problema, pregled relevantne literature sa naglaskom na nepoznatom, pitanje koje se postavlja odnosno radna hipoteza, postupci koji su primenjeni.

Stil: Sadašnje vreme za opšte, prihvaćene istine, prošlo vreme za sve ostalo

Kako pisati UVOD (2) ?

U trećem pasusu definišite pitanje koje će te u radu istražiti. Učinite to jasno, jer prikaz rezultata treba da obezbedi podjednako jasne odgovore.

Proširite ga činjenicama iz radova drugih autora uključujući i radove mentora. Pretražite literaturu i objasnite šta se već zna u toj oblasti. Ne citirajte svaki rad iz oblasti; izaberite ključne reference, jer je za publikovanje rada bolje imati ih manje nego više.

Za najveći broj tema uvod podeljen u tri pasusa je dovoljan. U prvom pasusu definišite problem.

– Da li je prikaz teme savremen ?- Da li rad ima za cilj dobijanje nove informacije ili

predstavlja novi pristup već poznatim činjenicama ?- Da li sadrži koncizan i nepristrasan prikaz kontroverznih

podataka ?

– Da li su istaknuti glavni ciljevi studije ?

Kako recenzent procenjuje UVOD ?

Kako pisati MATERIJAL I METODE (1) ?

SADRŽAJ

Dati jasan i precizan opis načina na koji je izveden eksperiment i razlog za primenu specifičnih eksperimentalnih postupaka. Na osnovu informacije sadržane u Materijalu i metodama (1) eksperiment se mora u potpunosti ponoviti i (2) na taj način proveriti naučna zasnovanost rezultata i zaključaka.

Kako pisati MATERIJAL I METODE (2) ?

Osnovni elementi:

Subjekti ispitivanja Etički aspekti Dizajn studije Merenje i izračunavanje rezultata Obrada podataka

Kako pisati MATERIJAL I METODE (3)

STRUKTURA

1. Opisati subjekte ispitivanja (ispitanici, eksperimentalne

životinje), ili materijal (ćelijske kulture) koji je korišćen u

studiji

2. Opisati eksperimentalni dizajn

3. Opisati primenjene eksperimentalne postupke

4. Prikazati statističke metode koje su primenjene u analizi

podataka

Kako pisati MATERIJAL I METODE (4)

STIL

Eksperimentalni protokol, pripremu materijala i merenja opisati po hronološkom redosledu

Upotrebiti podnaslove

Prošlo vreme

– Dizajn studije ?

– Pravilan opis učesnika studije ?

– Slabosti metodologije (Br. ispitanika / eksperimenata)?

– Metode nedostaju ?

– Neadekvatna statistička obrada ?

– Etički aspekti ?

Kako recenzent procenjuje MATERIJAL I METODE ?

SADRŽAJ:

Prikazati ključne rezultate istraživanja, koji sledelogiku sadržanu u hipotezi, pomoću teksta i ilustracija (tabela i slika: grafikona, fotografija, shema,etc). Tekst je sumarni i kritički prikaz nalaza koji prati ilustracije i poziva se na njih.

I tekst i ilustracije moraju sadržati dovoljno podataka da se razumeju nezavisno jedni od drugih. Treba prikazati i negativne rezultate.

Kako pisati REZULTATE?

Prošlo vreme

Upotreba podnaslova

Tabele i slike moraju imati naslov (tabele iznad, slike ispod) i legendu

Tabele i slike se obeležavaju posebno i to redom kojim se pojavljuju u tekst

Stil

Kako pisati REZULTATE?

– Originalni ?

– Optimalno prikazani ?

– Neusaglašeni sa metodama ?

– Prekratki ili predugački ?

– Tabele : opis učesnika/eksperimentalnog modela

– potpune koliko je to neophodno

– ali i koncizne koliko je moguće

– Grafikoni : glavni rezultati +++

Kako rezenzent procenjuje REZULTATE?

Total

(n=280)

Non-Diabetics

(n=199)

Diabetics

(n=81)

Control

(n=300)

CRP mg/dl 1,62 2,45 1,29 1,72 2,44 3,55 0,18 0,40

Fibrinogen g/l 4,16 1,24 4,03 1,17 4,47 1,34 2,73 0,55

Albumin g/dl 4,27 4,0 4,32 0,38 4,14 0,42 4,69 0,28

Apo B mg/dl 127,4 40,4 125,9 38,2 131,2 45,3 98,6 22,6

Apo A-1 mg/dl 138,0 28,9 140,2 26,8 132,6 33,3 163,5 25,2

Cholesterol mg/dl 201,9 46,6 201,4 44,4 203,2 52,0 186,2 31,2

LDL-Cholesterol mg/dl 114,9 40,9 115,8 39,9 112,6 44,0 99,3 27,5

HDL-Cholesterol mg/dl 43,4 17,6 44,4 16,5 40,8 20,0 56,6 13,7

Triglyceride mg/dl 230,3 144,9 222,6 140,2 249,3 155,2 160,4 113,3

Lp (a) mg/dl 25,5 34,9 25,4 36,1 25,9 32,2 9,1 13,2

Testtabela (1)

Journal of Unreproducable Results 2003;13:0815-0820

Total

(n=280)

Non-Diabetics

(n=199)

Diabetics

(n=81)

Controls

(n=300)

CRP 1,62 2,45 1,29 1,72 2,44 3,55 0,18 0,40

Fibrinogen g/l 4,16 1,24 4,03 1,17 4,47 1,34 2,73 0,55

Albumin, g/l 42,7 40 43,2 3,8 41,4 4,2 46,9 2,8

Apo B 127 40 126 38 131 45 97 23

Apo A-1 138 29 140 27 133 33 164 25

Cholesterol 202 47 201 44 203 52 186 31

LDL-Cholesterol 115 41 116 40 113 44 99 27

HDL-Cholesterol 43 18 44 17 41 20 57 14

Triglyceride 230 145 227 140 249 155 160 113

Lp(a) 26 35 25 36 26 32 9 13

Testtabela (2)

JUR 2003;13:0815-0820

Data are given as mean +/- SD in mg/dl

Controls Nondialyzed CRF patients HD patients

Ccr (ml/min) >90 51-90 21-50 < 20

n 13 12 12 12 10

Age (years) 458.9a 5615.2 5712.9 5614.6 46.710.7

Gender (M:F) 7:6 6:6 5:7 7:5 4:6

Plasma proteins (g/L)

707.8 a 64.58.7 72.410.3 62.99.39 69.69.3

naslov

fusnote

oznake kolona

podaci

Primer tabele (1)

Table 1. Clinical characteristics of subjects

n - number of patients a values are the mean SD.

Primer tabele (2)

Naslov

Legendu

Oznaku x ose

Oznaku y ose

Fig 1. Glutathione peroxidase activity in plasma of healthy controls and chronic

renal failure patients. A. Enzyme activity in patients with different stages of chronic

renal failure. B. Correlation between plasma glutathione peroxidase activity and creatinine

clearance in nondialyzed chronic renal patients. Abbreviations: HD - hemodialysis.

Significance: * * p < 0.01 and * * * p< 0.001 vs. healthy subjects ; a- p<0.05 vs. patients

with Ccr<20

>90 51-90 21-50 <20 HD0

50

100

150

200

250

300

350

400

, a* * *

* * *

* * *

* *

A.

Glu

tath

ione

pero

xida

se (

U/L

pla

sm

a)

Creatinine clearance (ml/min)

0 10 20 30 40 50 60 70 80 90 1000

50

100

150

200

250

300

350

400

B. r = 0.712p < 0.001

Glu

tath

ion

e p

ero

xid

ase (

U/L

pla

sm

a)

Creatinine clearance (ml/min)

Grafikon mora da ima:

Prevalence of histological Prevalence of histological 2m amyloidosis 2m amyloidosis in haemodialysis (HD) patientsin haemodialysis (HD) patients

0

20

40

60

80

100

1- 24 25 - 48 49 - 72 73 - 156 > 156

%%

HD duration (months)HD duration (months)

Prevalence Prevalence ofof 2 2 2 2 microglobulinmicroglobulinamyloidosis amyloidosis amyloidosis amyloidosis (A(A(A(A 2m) in hemodialysis2m) in hemodialysis2m) in hemodialysis2m) in hemodialysis

Time on HDTime on HD 1-241-24 25-4825-48 49-7249-72 73-9673-96 97-12097-120 > 120> 120

((monthsmonths ))

N of patientsN of patients 1414 1515 66 99 22 88

M / FM / F 10/410/4 6/96/9 4/24/2 7/27/2 1/11/1 7/17/1

CTS(CTS( surgerysurgery )) 0/4 (0%)0/4 (0%) 0/15 (0%)0/15 (0%) 0/6 (0%)0/6 (0%) 0/9 (0%)0/9 (0%) 0/2 (0%)0/2 (0%) 2/8 (25%)2/8 (25%)

Age (Age ( yearsyears ))

meanmean 66.14 66.14 66.2666.26 51.3351.33 62.6662.66 56.0056.00 46.8746.87

± SD± SD 13.9913.99 9.059.05 15.2615.26 7.297.29 1.411.41 14.8314.83

N joints / pat.N joints / pat.

meanmean 2.712.71 2.672.67 3.173.17 2.672.67 55 2.752.75

± SD± SD 1.201.20 1.581.58 1.831.83 1.231.23 1.411.41 1.171.17

PrevalencePrevalenceof Aof A2m (%)2m (%) 2121 3333 3333 7777 100100 8787

Summary Summary Summary Summary :::: pathophysiology pathophysiology pathophysiology pathophysiology of Aof Aof Aof A2m2m2m2m

adsorptionadsorptionadsorptionadsorption

2m 2m 2m 2m serum levelserum levelserum levelserum level age age age age atatatat HD HD HD HD membranemembranemembranemembrane timetimetimetime

HD HD HD HD onsetonsetonsetonset typetypetypetype onononon

dialysisdialysisdialysisdialysis

residualresidualresidualresidual

GFR (+) ? GFR (+) ? GFR (+) ? GFR (+) ? biocompatibilitybiocompatibility biocompatibilitybiocompatibility

porosityporosityporosityporosity« « silentsilent  » A» A2m 2m depositiondeposition AGEsAGEs

macrophages macrophages macrophages macrophages cytokinescytokines cytokinescytokines

joint joint collagencollagen

symptomaticsymptomaticsymptomaticsymptomatic AA AA2m2m2m2m????

(-) ?(-) ?(-) ?(-) ?

(-) ?(-) ?(-) ?(-) ?

(-) ?(-) ?(-) ?(-) ? (-)(-)(-)(-)

(-)(-)(-)(-)

Acidosis Acidosis Acidosis Acidosis

2m 2m age at age at HD membrane HD membrane time time

serum levelserum level HD onset HD onset type type on HDon HD

Summary : pathophysiology of ASummary : pathophysiology of A2m2m

macrophagesmacrophages

« silent » A« silent » A2m deposition2m deposition

symptomatic Asymptomatic A2m2m

Sažet prikaz zaključaka istraživanja bez ponavljanja

pojedinačnih rezultata

Objašnjenje značaja zaključaka, zašto su važni

Poređenje rezultate istraživanja sa rezultatima drugih istraživača

Alternativno objašnjenje rezultata

Klinički značaj rezultata

Ograničenja studije

Pravac budućih istraživanja

Ključni zaključak, koji sadrži glavnu poruku rada

Kako pisati DISKUSIJU (1)?

Kako pisati DISKUSIJU (2)?

Ukažite na to šta je novo u Vašim rezultatima i da li su oni u saglasnosti sa rezultatima drugih istraživača iz te oblasti. Ne pozivajte se na svaki rad iz oblasti, vešto izaberite najvažnije radove.

Započnite diskusiju rečenicom :” U ovoj studiji smo pokazali da ...” i dajte sažetak glavnih nalaza istraživanja. Ne ponavljajte uvod, ne ponavljajte kompletan prikaz rezultata.

Kako pisati DISKUSIJU (3)?

Opišite da li se Vaši nalazi razlikuju od rezultata drugih istraživača. Ponudite alternativno objašnjenje rezultata uzimajući u obzir sugestije mentora/koautora. Izbegnite generalizaciju koja nije podržana podacima. Ne sugerišite rešenje problema koji nisu direktno povezani sa Vašim istraživanjem.

Opišite ograničenja studije.

U poslednjem pasusu dajte sažet zaključak istraživanja i njegov značaj u istraživačkoj i kliničkoj praksi.

– Odgovarajući prikaz najvažnijih rezultata ?

– Adekvatno poređenje sa prethodno publikovanim rezultatima?

– Integrisanje novijih podataka drugih istraživača u celinu?

– Prihvatljiva sinteza ? Razumna hipoteza ?

– Pregled literature ?

– Odgovarajući zaključci ?

Kako rezenzent pregleda DISKUSIJU?

Proučiti pažljivo uputstvo za autore i slediti ga !

Kako pisati LITERATURU?

– Pravilan stil i prezentacija ?

– Odgovarajući broj referenci ?

– Ravnoteža između novih i starijih citata ?

– Da li ima pravopisnih grešaka ?

Kako rezenzent procenjuje LITERATURU?

Jednostavne, kratke reči Bez žargona Bez suvišnih reči („prošla istorija, potencijalni rizik“)

Kratke rečenice sa subjektom i predikatom Ne koristiti potencijal umesto glagolskih oblika kao što su perfekat i prezentPisati rečenice kraće od 40 reči

Pasusi koji se nadovezuju jedan na drugi Opšti aspekti pre specifičnih aspekata Pogodni prelazi (zbog toga, međutim, naime, nedavno, nešto specifičnije, slično, . ..)

Kako izabrati bolje reči, rečenice i pasuse ?

Algoritam za pisanje rada (II)

Sačekajte 1- 2 sedmice

Popravite i dopunite rad uz pomoć mentora (1-3x)

Pošaljite E-mail rada koautorima

Popravite prema sugestijama, pribavite pismenu saglasnost

Napišite propratno pismo

Poslednju verziju pošaljite uredniku poštom ili elektronskim putem

Zloupotrebe u naučnom radu

Greške u proceni: neadekvatan dizajn pristrasnost neodgovarajuće statističke metode

Prekršaji: manipulacija podacima isključivanje podataka previđanje nepobitnih činjenica

Prevare: fabrikovanje falsifikovanje plagiranje rezultata