kaiken takana on loinen
DESCRIPTION
Esitys lukiolaisille LUMA-keskuksen Dyna-miittiin. 2.10.2013TRANSCRIPT
Kaiken takana on loinen
Tuomas AiveloBiotekniikan instituutti,Helsingin yliopistoDyna-miitti 2.10.2013
Kaikilla maailman eliöillä on loisia.
Yli puolet maailman eliöistä on loisia.
Mitä on loiset?Lä
heis yys+
-
Mutualismi
Kommensalismi
Sym
bi oo
si
Saalistus / laidunnus
ParasitoidismiUlkoloiset Sisäloiset
Loiselämä
Ongelma:
Loisen pitäisi käyttää niin paljon isäntää hyödyksi kuin pystyy vaarantamatta omaa lisääntymiskykyä.
TRAGEDY OF COMMONS!
Virulenssi
• Kuinka suurta haittaa kelpoisuudelle tauti aiheuttaa?
• Trade-off: Jos tapat uhrisi nopeasti, sinun pitää myös siirtyä seuraavaan uhriin nopeasti.
?
Tautien eri taktiikat
• Sukupuoliteitse• Vektorin välityksellä• Pisaratartunta• Yms.
Miksei taudeista päästä koskaan eroon?
John Tenniel
http://www.mpg.de/19341/Computational_disease_models?page=3
Monista taudeista on päästy eroon!
• Isorokko – > rokotukset
• Guineamato– > hygienia
• Malaria Suomessa– > elintason nousu
Monet taudit ovat vaikeita
• Zoonoosit:– Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä• Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenssat
– Taudit liikkuvat enemmän toiseen suuntaan!
• Antibioottiresistenssiä:– Sairaalabakteerit: MRSA, VRE jne.– Malarialoisiot
Madagaskar Madagaskar
eristyneenä viimeiset n. 85 miljoonaa vuotta
Ihmisasutus vakiintui n. 1500 vuotta sitten
Merkittävä määrä eläimiä kuollut sukupuuttoon viimeisen 1000 vuoden aikana
Alkuperäisestä metsäalasta jäljellä noin 15 prosenttia
Ranomafanan kansallispuisto
• Itäisen Madagaskarin vuoristosademetsä
• Perustettu 1990• Kansainvälisen tason
tutkimusasema, Centre Valbio
Madagaskarin eläimistö
• Neljä endeemistä nisäkäsryhmää:– Makit, puoliapinoita– Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä– Madagaskarinrotat, jyrsijöitä– Falanukit, kissamaisia
• Tulokaslajeja:– Mustarotta, hiiri– Koira, kissa– Ihminen, zebu
• Puoliapinoita• Pitkäikäisiä, jopa 10
vuotta luonnossa• Pieniä• Suhteellisen
pysyvät reviirit• Monenlaisissa
elinympäristöissä• Aktiivisimmillaan
lokakuussa (tää on vaan bonus)
Hiirimakit
Makit
• Puoliapinoita• Yleisesti naarasdominantteja
• Mallieläin Alzheimerin taudille?• Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa• Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivisia• Tulevaisuuden suunnitelmat sekvenoida
Kenttätyö• Syyskuulta joulukuulle• Ansat öisin silmien
korkeudelle• Sisälle banaania
Punkit ja täit:Ulkoloisten määrä
Mikrosiru yksilöt
Karvanäyte genetiikka
Morfometriikka-Paino-Hännän, hauiksen ja reiden ympärysmitta
Ulostenäyte:-Hormoonit-Sisäloiset-Ruokavalio
Vaginan ja kivesten kokoLisääntymistilaSukupuoli
Hammasvalos ikä
Persoonallisuus
Ansan sijainti ja aika
Opportunistista ulosteenkeräystä
Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä
Isoja makeja voi seurata ja kerätä ulosteet
Sukkulamadot
• Prevalenssi lähes 100%• Helppo eristää• Paljon tutkittuja, mutta…
Pyrosekvensointi
• Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin (ribosomin pieni yksikkö) perusteella
• Yhdessä näytteessä 0-1500 toukkamuotoa
Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen sekvenssin kanssa?
Alustavia tuloksia
• Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka eroaa hiirimakeista
• Hiirimakien loisia myös mustarotilla– > tulokaslaji lisää loistaakkaa?
• Horrostaminen tappaa sukkulamadot suolesta
Kysymyksiä?
Lisätietojahttp://twitter.com/aivelo http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml
http://fifi.voima.fi/blogit/tekija/tuomas-aivelo
http://blogs.helsinki.fi/t-retki/author/aivelo/
https://peda.net/oppimateriaalit/e-oppi/lukio/biologia/symbioosi2/1pje/haastattelu
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/bioteknologia/hiirimakien-loisten-tutkimus-perustuu-dnan-sekvensointiin
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/perinnollisyys/tutkijan-kommentti-perinnollisyyden-opetus-kaipaa-paivittamista