juan pedro laclette

Upload: karolin-chimoy-valle

Post on 07-Jul-2018

221 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    1/25

    Ómica y Parásitos en ICOPA XIIIcon referencia a Taenia solium

    Dr. Juan Pedro LacletteInstituto de Investigaciones Biomdicas

    !niversidad "acional Aut#noma de $%ico

    &' de A(ril )*&'

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    2/25

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    3/25

    Genoma +constituido ,or D"A- es el con/unto de genes

    Transcriptoma, es el con/unto de 0"A mensa/eros de genes.

    Proteoma,  es el con/unto de todas las ,rote1nas 2u

    e%,resan en un momento en un ti,o celular o enorganismo.

    Metaboloma,  es el con/unto de los meta(olitos en uncelular o en un organismo3 estos meta(olitos ,ueden

    una diversa naturale4a 2u1mica.

    ¿Cómo se definen? (ejemp

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    4/25

     Algunas fec5as6

    7 &89' Primera iniciativa ,ara secuenciar los :)** millones de nucdel genoma 5umano.7 &88* se inici# el Proyecto del ;enoma

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    5/25

    $na reolución Cient!fico"Tecnoló#ica en c

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    6/25

    Palabra clave Número de artículos en PubM

    Genomic 1 097 374

    Genomic y Medicine 370 456

    Genomic y Analysis 520 097

    Genomic y Parasite 12 543

    Esta reolución cient!fica se refleja en las public

    Acumulado de los proyectos de genomas eneucariotes

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    7/25

    Pareek et al! " Appl

    %eolución tecnoló#ica en la secuenciación del &'

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    8/25

    Plataforma Producción on#itud Calidad Costos &plicaciones Posibles *uentes de error 

    Comparación costo+eficiencia entre diferentes plataformas de secuenciació

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    9/25

    =sta revoluci#n ciient1ficotecnol#gica tam(in lleg# a la Parasitolog1a;enomas de ,rotistas en la (ase de datos del "CBI +&-

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    10/25

    ;enomas de gusanos redondos +"ematoda- en la (ase de datos d

    2

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    11/25

    Mauinaria -ioló#ica del Par.sito

    M/todos de 'ia#nóstico

    0dentificación de

    ueos *.rmaco%elación Hu/sped"Par.sito

    Entender su &dapta

    Transfección 1Manipulación de G

    Perspectias en la 2mica de Par.sitos

    Mol/culas0nmunomoduladoras

    3acunas

    Genoma,Transcriptoma,Proteoma de

    Par.sito

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    12/25

     "ature ?8 ': +*? A,ril )*&:- 

    #$%s de Taenia solium reportadas en la &ase de datos d

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    13/25

    #$%s de Taenia solium reportadas en la &ase de datos d

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    14/25

    Identificaci#n de los ,rocesos (iol#gicos +&-

    Gene 4ntolo#1

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    15/25

    0dentificación de los procesos moleculares (5)

    Gene 4ntolo#1

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    16/25

    E1as $eta(#licas identificadas +F=;;- en Taenia soliu

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    17/25

    Gra(a/os directamente relacionados al estudio de ;enoma de Parásitos.

    1 Mec+anism o, attenuation in Babesia -accine t+roug+ genomic and transcri2. Blastocystis . A Parasite Associated /it+ Gastrointestinal ealt+

    3 'eglected %ropical iseases #merging %rematodiases in *ndia t+e present s4 isco-ery and animal studies o, ne/ antigiardiasis drugs5 (+aracteriation o, t+e complete mitoc+ondrial genome o, Setaria digitata ,

    &ualo in (+ina6 %ransgenesis and ,unctional genomics o, sc+istosomes mediated &y mamm

    retro-iruses

    . ;enomics of a colom(ian strain of Leishmania Viannia panamensis.8 A /e&&ased analysis plat,orm ,or comparati-e ,unctional genomics and pro

    eukaryotic pat+ogens Trichomonas vaginalis as an e:ample9 ;+at +elmint+ genomes +a-e taug+t us a&out parasite e-olution10%+e genome o, t+e sparganosis tape/orm Spirometra erinaceieuropaei isol

    &iopsy o, a migrating &rain lesion11%+e /+ip/orm genome and dualspecies transcriptomics o, an intimate +os

    interaction12(omparati-e genetics a lens t+roug+ /+ic+ to clari,y t+e genomes! t+e tran

    +istory! and t+e reproducti-e &iology o, Trichinella spp

    13

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    18/25

    16An integrated multiomics approac+ ,or studying +elmint+ in,ections17Pan'ematoda comparati-e genomics /it+ emp+asis on Trichocephalida spec18*nter and intra species comparati-e genomics o, Entamoeba.19.Schistosome e:ome se>uencing

    20(omparati-e genomics o, parasitic /orms %+e elmint+ Genome *nitiati-e21A &ird?s eye -ie/ on Trichomonas vaginalis -ast annotated proteome

    ICOPA XIII $%ico Agosto )*&?

    1 )iological ,unctionality and immunogenicity o, proteins pro+i&itin 1 and 2 in Lmajor 

    2 Proteomics o, t+e Taenia solium cysticerci in t+e skeletal muscle and in t+e cener-ous system o, naturally in,ected pigs

    3 A /e&&ased analysis plat,orm ,or comparati-e ,unctional genomics and proteeukaryotic pat+ogens Trichomonas vaginalis as an e:ample

    4 #:pression o, recom&inant Trypanosome antigens in Leishmania tarentolae5 etermining t+e lasmodium viva! &lood stage protein repertoire6 @irulence ,actors in /ild strain proteomic map and e:pression o, pero:iredo:

    o, Trypanosoma cru"i ,rom t+e $tate o, io de "aneiro! )rail7 (omparison o, e:traction met+ods ,or t+e mass spectrometry analysis o, Schi

    mansoni8 An antio:idant response is in-ol-ed in resistance o, #iardia duodenalis to al&e

    Prote#mica

    CO

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    19/25

     Algunas iniciativas 2ue se ,resentaron en ICOPA XIII acerca de la gen#mica dGremátodos +&-

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    20/25

    Iniciativa ,ara caracteri4ar '* ,arásitos 5elm

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    21/25

    Bases de datos de genomas de ,arásitos (acterias y virus ,at#genos del se

    B d D t d l @ I tit t

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    22/25

    Base de Datos del @anger Institute

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    23/25

    !n esfuer4o similar en ,arásitos ,rotistas ,at#genos del ser 5umano

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    24/25

     A manera de resumen

    7 Eivimos en una era de grandes descu(rimientosen los enfo2ues integrales moleculares +Hmicas- de los sevivos.

    7 Los organismos ,arásitos no son la e%ce,ci#n al res,ecto

    encuentran en desarrollo im,ortantes iniciativas de #micacom,arada. ICOPA XIII fue un foro donde se anali4aron einiciativas

    7 =s de es,erarse una serie de nuevas a,ortaciones en eldiagn#stico tratamiento y ,revenci#n de varias enfermed,arasitarias.

  • 8/18/2019 Juan Pedro Laclette

    25/25

    ;racias