jigsaw asam nukleat - home group 10
TRANSCRIPT
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
1/14
BLOK II. ILMU BIOMEDIK DASAR 1 (MAC 103)
Jigsaw Asam Nukleat
OlehHome Group 10Seksi B :
Christianti / 2012 060 165
Hans Christian / 2012 060 22
!"hanes #eni Briant" / 2012 060 2
$unike %"sasih / 2012 060 2&
!"'ita ("tama / 2012 060 2&)
*i+hael Sie Shun ,ing / 2012 060 2&-
Angeli.ue *eiiawati Bura / 2012 060 256
"mm / 2012 060 25-
Jemm (unawan / 2012 060 262
Juliana a3agukguk / 2012 060 26&
4in+entius Henr Sunah / 2012 060 265
$raim erinan"s Jam7"rmias / 2012 060 266
*elania 8l"na 8n'i"lata nan" / 2012 060 26-
#"sen 9engamu Asam Nukleat :
#ra; ,ies %; ,AS %$#O%$AN
>N84$S8AS %AO,8% 8N#ON$S8A A*A JA!A
JA%AA2012
Jigsaw Asam Nukla!
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
2/14
1; *"lekul Asam Nukleat
a; Jelaskan m"lekul?m"lekul em7entuk asam nukleat;
7; Aa er7eaan antara nukle"sia an nukle"tia @
+; Jelaskan 3uga +ara enamaanna;
Jawa7 :
*"lekul?m"lekul em7entuk asam nukleat aalah untaian sangat an3ang ang
ihu7ungkan "leh ikatan "s"iester ang tersusun "leh nukle"tia; Nukle"tia tersusun
atas k"m"nen aitu asam "sat= gula ent"sa an 7asa nitr"gen;
Nukle"tia ter7entuk ari ikatan antara nukle"sia engan gugus "sat= seangkan
nukle"sia meruakan ikatan antara gula ent"sa engan se7uah 7asa nitr"gen;
Nama?nama nukle"tia isingkat men3ai k"e emat?huru stanar; Huru ertama
7erua huru ke+il an menanakan 7ahwa nukle"tia ang iertanakan aalah
se7uah ri7"nukle"tiar atau
e"ri7"nu+le"ti ; Huru ke?2
menanakan nukle"siaang
7erhu7ungan engan nukle"7asa:
(: (uanin
A: Aenin
: imin
C: Sit"sin
>:>rasilhana teraat aa NA
Huru ke? an ke?& menanakan
an3ang ari rantai "sat ang terikat
*"n"?= #i?= ri? an ke7eraaanse7uah "sat 9;
2; %"m"nen (ula #NA an NA
a; (ula aa sa3a ang meruakan k"m"nen ang mem7entuk #NA an NA @7; (am7arkan struktur siklikna an en"meranna;
Halaman " ari 1#
http://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ribonukleotida&action=edit&redlink=1http://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleobasahttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleosidahttp://id.wikipedia.org/wiki/Nukleobasahttp://id.wikipedia.org/wiki/Urasilhttp://id.wikipedia.org/w/index.php?title=Ribonukleotida&action=edit&redlink=1 -
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
3/14
Jawa7 :
#NA an NA memunai susunan gula ent"sa masing?masing; (ula NA aalah
ri7"sa; Sum7er gula ri7"sa alam sintesis 7i"kimia urin an irimiinna aalah 5?
"s"ri7"sil ir""sat 999= ang 7erasal ari D?#?ri7"sa?5?"sat; (ula ini itemukan i
seluruh m"lekul NA; Seangkan gula #NA aalah E?#?2F e"ksiri7"sa; (ula ini 7erasal
ari rantai E?#?ri7"sa imana hir"ksil ?OH i "sisi ke?2 igantikan "leh hr"gen ?H;
Se+ara 7i"kimia= r"ses ini aat ter3ai engan enGim ri7"nukle"tia reuktase ang
mengu7ah ri7"nukle"sia i"sat alam reaksi reuksi kimia ari 2F OH men3ai 2F H;
*enurut sistem enamaan struktur kimia= teraat 7e7eraa aturan alam menentukan
en"meran; Jika gugus OH 7eraa i se7elah kanan= ikatakan 7entuk atau k"nigurasina
aalah # eter= an 7ila 7eraa i se7elah kiri ise7ut 7entuk atau k"nigurasi , le'"us;
Aturan lainna aalah at"m C1 ang men3ai C kiral sehingga mem7entuk is"mer 7aru=
7er7ea alam hal letak/ "sisi ?OH lakt"l terhaa +in+in ang ter7entuk; 8s"mer ang
7er7ea alam hal letak/ keuukan gugus ?OH lakt"l ini= i atas atau i 7awah +in+in
inamakan an"mer; An"mer 7eta aalah untuk keuukan i atas= seangkan an"mer ala
aalah untuk keuukan i 7awah; Selain itu= gula enusun NA ise7ut ri7"sa karena
aat mem7entuk struktur siklik 7erangg"ta lima & at"m C an 1 at"m O;
;
%"m"nen Basa Nitr"gen
#NA an NA
a; Se7utkan 7asa nitr"gen= 7aik urin mauun irimiin ang meruakan
k"m"nenem7entuk#NA an NA;
7; (am7arkan struktur m"lekulna serta tulis en"m"ranna;
Jawa7 :
Halaman 3 ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
4/14
%"m"nen 7asa nitr"gen 9urin ang mem7entuk #NA aa Aenine A an (uanine
(= seangkan aa 7asa nitr"gen 9irimiin teraat Ct"sine C an hmine ; 9aa
NA= em7entuk k"m"nen 7asa nitr"gen 9urin sama engan #NA akni Aenine A an
(uanine (; Namun aa 7asa nitr"gen 9irimiin teraat Ct"sine C an >ra+il >;
9er7eaan inilah ang men3ai salah satu er7eaan antara #NA an NA 7erasarkan
k"m"nen em7entukna; 9er7eaan antara hmine an >ra+il hana aa hmine ang
memiliki kel"m"k metil;
(am7ar struktur m"lekul an en"m"ran 7asa nitr"gen masing masing seerti i 7awah ini:
a; 9urin
1; Aenine A
2; (uanine (
7; 9irimiin
1; Ct"sine C
2; hmine
Halaman # ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
5/14
; >ra+il >
&; 8katan %imia *"lekul #NA
a; Jelaskan +ara ter7entukna ikatan kimia ang aa aa struktur m"lekul #NA;7; Se7utkan 3uga nama ikatan terse7ut;
+; #ari ikatan?ikatan terse7ut= ikatan ang mana ang mene7a7kan keua rantai #NA
7erilin satu sama lain; Aakah ikatan ini meruakan ikatan hir"il atau hir""7@
Jawa7 :
8katan ang ter3ai aa asam nukleat aa
tiga ma+am= aitu ikatan "s"iester= ikatan
hir"gen an ikatan glik"siik; 8katan
"s"iester meruakan ikatan k"'alen ang
menghu7ungkan nukle"tia ang satu engan
nukle"tia lainna melalui gugus "sat ang
7eraa alam iester; 8katan ini menghu7ungkan
antara gugus hir"ksil OH aa "sisi 5F gula
ent"sa an gugus hir"ksil aa "sisi F gula
ent"sa nukle"tia 7erikutna; Jai rantai "linukle"tia ihu7ungkan engan ikatan"s"iester;
8katan glik"siik aalah ikatan ang ter3ai antara gula ent"sa engan 7asa nitr"gen;
8katan ini sama engan ikatan ang ter3ai aa m"n"sakaria ang mem7entuk 3em7atan
"ksigen; 8katan hir"gen aalah ikatan ang ter3ai antara 7asa nitr"gen ang satu engan
7asa nitr"gen lain ang setara; C"nt"hna guanin an sit"sin memiliki tiga ikatan hir"gen
seangkan aenin an timin memiliki ua ikatan hir"gen; >3ung ang 7erua gugus "sat
Halaman $ ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
6/14
meruakan u3ung 9 atau u3ung 5; Seangkan u3ung lainna 7erua gugus hir"ksil ang
terikat aa gula ent"sa sehingga inamakan u3ung OH atau u3ung ;
Struktur #NA 7erilin karena 7entukna ang antiaralel imana aa rantai se7elah
kiri u3ung atasna aalah gugus "sat 5 seangkan ang rantai kanan atasna aalah gugus
hir"ksil ; Hal ini 7erhu7ungan engan aana "larisasi an "sisi keseim7angan ang
mana akan mem7entuk 7entukan heliks; Aaun tulang #NA ang tersusun ari "sat an
gula ent"sa meruakan k"m"nen engan siat hir"ilik seangkan ikatan 7asa nitr"gen
meruakan k"m"nen hir""7ik;
5; 8katan Basa Nitr"gen #NA
a; Jelaskan +ara em7entukan ikatan antara A an serta ( an C;
7; *engaa 7asa?7asa aa #NA tiak aat 7erikatan engan 7aik aa double helix
3ika urin 7erikatan engan urin atau irimiin engan irimiin;
Jawa7 :
8katan ang ter7entuk aa Aenin?imin an (uanin?Sit"sin ise7a7kan "leh aana
ikatan hir"gen= aitu 2 ikatan hir"gen aa A? an ikatan hir"gen aa (?C; Cara
em7entukan ikatan ini terlihat saat relikasi #NA; Setelah #NA rantai gana iutus ikatan
hir"genna men3ai rantai tunggal menggunakan enGim helikase= na"limerase ang akan
mem7entuk untaian #NA tunggal lainna; %emuian keua rantai ini akan isatukan
menggunakan #NA ligase; 9em7entukan #NA rantai gana akan mem7entuk ikatan
hir"gen antara gugus kar7"nil engan gugus amina an 3uga gugus amina engan gugus
amina ang ise7a7kan "leh keelektr"negatian at"m O aa gugus kar7"nil an at"m N
aa gugus amina;
Halaman % ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
7/14
9urin an irimiin se+ara sesiik ise7a7kan "leh strukturna ang miri engan te"ri
kun+i an gem7"k alam em7entukan ikatan hir"genna= sehingga akan ter7entuk ikatan
ang +uku kuat an sta7il; Seangkan 7ila aa #NA= urin 7erikatan engan urin an
irimin engan irimiin= tiak akan ter7entuk ikatan hir"gen ang sta7il karena
ketiak+"+"kan aa strukturna terse7ut imana ikatan hir"gen antara gugus kar7"ksil
engan gugus amina tiak aat ter7entuk; 9eristiwa ini ise7ut 3uga mismat+h an 7iasana
akan segera ier7aiki "leh rNA;
6; antai 9asangan Struktur antai #NA
a; Jelaskan 7agaimana urutan 7asa ari rantai ang satu memengaruhi urutan 7asa
rantai asanganna aa struktur #NA;
7; Jika urutan 7asa aa salah satu rantai #NA aalah: 5F?A(ACC(AAAC?F=
7agaimana urutan 7asa aa rantai asanganna@
Jawa7 :
#NA memunai struktur "u7le heli ang meruakan ita siral ang saling
7erilin; Bentuk utas gana itu tersusun "leh 2 rantai "linukle"tia ang saling 7erilin aa
aksis ang sama; (ugus gula "sat meruakan kerangka ari m"lekul an teraat aa
7agian luar; Basa nitr"gen aa untaian nukle"tia 7erikatan engan 7asa nitr"gen untaian
lainna melalui ikatan hir"gen;
Basa nitr"gen urin akan 7erikatan engan 7asa nitr"gen irimiin= sehingga (
guanin akan selalu 7erikatan engan C sit"sin= an A aenin akan selalu 7erikatan
engan timin; Hal terse7ut mene7a7kan urutan 7asa nitr"gen untaian ang satu
menentukan urutan 7asa nitr"gen untaian ang selan3utna an keuana 3uga saling
melengkai;>rutan 7asa aa rantai asangan #NA 5F?A(ACC(AAAC?F aalah F
?AC((AC(? 5F;
); Struktur antai #NA an NA
a; Jelaskan tiga er7eaan struktur #NA an NA;
Jawa7 :
Halaman & ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
8/14
Struktur #NA an NA memunai er7eaan= walauun sama?sama memunai
eran enting alam kehiuan manusia; 9er7eaan utama mereka terletak i gula
enusunna= aitu 7agian ent"sa; Bagian gula ent"sa NA aalah ri7"sa= seangkan gula
ent"sa #NA aalah e"ksiri7"sa; Selain itu= salah satu er7eaan ang +uku signiikan
aalah 7entuk m"lekul #NA aalah heliks gana= seangkan 7entuk m"lekul NA 7erua
rantai tunggal ang terliat; 9er7eaan antara #NA an NA lainna aalah g"l"ngan
irimiin NA ang menganung sit"sin an urasil= 7er7ea engan #NA= g"l"ngan
irimiinna menganung sit"sin an timin;
I; ie NA
Jelaskan mengenai struktur= k"m"sisi enusun= serta ungsi ari:
a; mNA
7; tNA
+; rNA
Jawa7 :
Halaman ' ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
9/14
mRNA
*essenger NA atau NA uta NA aalah tie NA ang mem7awa in"rmasi
genetik ari inti #NA ke sit"s"l= imana akan igunakan se7agai template/ +etakan untuk
sintesis r"tein; mNA meruakan N!A ang urutan 7asana k"mlementer 7erasangan
engan salah satu urutan 7asa rantai #NA; NA 3enis ini meruakan "linukle"tia
7er7entuk ita tunggal linear an isintesis "leh #NA i alam nuklues; #alam NA= mNA
hana teraat sekitar 2?5 sa3a an aling heter"gen 7aik alam ukuran= sta7ilitas= an
urutan 7asa enusunna; Aa7ila mNA mem7awa in"rmasi gen le7ih ari satu= maka
inamakan "lisistr"nik; Namun= aa7ila hana satu gen= maka inamakan m"n"sistr"nik;
Se7agaimana teraat aerah translasi r"tein= mNA teriri ari aerah ang tiak aat
itranslasi aa u3ung 5F an u3ung F; %arakteristik struktural khusus aa mNA sel
eukari"tik termasuk urutan an3ang 7erua &0 200 aenin nukel"tia ek"r "l?A aa
u3ung F rantai NA= itam7ah se7uah KkealaL aa u3ung 5F ang teriri ari m"lekul )?
metilguan"sin tri"sat ang melekat ke 7elakang 5F5F ang 7erekatan engan 2F?O?
Halaman ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
10/14
metil ri7"nukle"sia aa 5F?hir"ksil?na melewati sam7ungan tri"sat; *"lekul ini
teraat 6?metilaenil an 2F?O?ri7"sa metil nukle"tia; MkealaF ini 7erungsi untuk
engenalan mNA aa translasi an mensta7ilisasi mNA engan men+egah serangan
enGim 5F?e"nuklease;
!RNA
ranser NA aalah tie NA engan ukuran terke+il &S ari ketiga tie NA
ang 7erlaku se7agai m"lekul Maat"rF ang mem7awa asam amin" sesiik ke temat
sintesis r"tein; NA 3enis ini i7entuk i alam nukleus= tetai menematkan iri i alamsit"lasma; tNA meruakan NA terenek an 7ertinak se7agai ener3emah k""n ari
mNA;Baik sel eukari"t mauun r"kari"t= tNA i keuana i7entuk ari m"lekul
se7elumna ang an3ang an harus im"iikasi; eraat aling tiak satu tie sesiik ari
sekitar 50 m"lekul tNA untuk setia ari 20 3enis asam amin" aa r"tein; tNA ini
teraat aa NA se7anak sekitar 15?20; *"lekul tNA 7erisi 7asa ang tiak 7iasa an
memunai r"ngga antar rantai enusunna an asangan antar 7asa; tNA ini melekat
aa u3ung F se+ara k"'alen; Setia m"lekul tNA memiliki 7agian untuk menemel untuk
setia asam amin" aa u3ung F; 9aa gugus kar7"ksil asam amin" ialah sam7ungan ester
Halaman 10 ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
11/14
engan F?hir"ksil ari 7agian ri7"sa aa aen"sin nukle"tia; Amin" a+i ang menemel
engan tNA ikatakan terakti'asi; Selain itu= tNA 7erisi urutan 7asa nukle"tia
antik""n ang mengenali k""n sesiik aa mNA; %""n itu mem7antu
mensesiikasi enisian ke rantai asam amin"; eraat & lengan aa tNA= aitu lengan
enerima= lengan # ihir"ura+il= lengan C seu"ura+il= an lengan ekstra ang
mem7antu mensesiikan tNA;
RNA
i7"s"mal NA itemukan alam kumulan ari 7e7eraa r"tein se7agai k"m"nen
ari ri7"s"m ang meruakan sruktur k"mleks ang mem7antu se7agai temat sintesis
r"tein;NA ini 7erua ita tunggal= tiak 7er+a7ang= an leksi7el; Jai= ungsi ari rNA
ini seniri se"lah "lah men3ai Ma7rikF untuk sintesis r"tein; rNA ter7entuk ari sintesis
m"lekul se7elumna ang an3ang ang ise7ut reri7"s"mal NAs; 9aa sel r"kari"tik=
unit ri7"s"m se7esar )0S memiliki 2 su7unit 7esar 50S an ke+il 0S; *asing masing
Halaman 11 ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
12/14
su7unit teraat er7eaan ukuran= ari su7unit 7esar 2S an 5S an ari su7unit ke+il
16S; Seangkan aa sel eukari"tik= unit ri7"s"m se7esar I0S ang tere+ah men3ai 2
su7unit= akni su7unit 7esar 60S an ke+il &0S; Su7unit 7esar tere+ah men3ai 2IS=
5;IS= an 5S an su7unit ke+il men3ai 1IS;
>kuran untuk 7erat m"lekular an 7entuk senawa iakai satuan unit S'e7erg S;
Su7unit 7esar 7erungsi unutk mengkatalis em7entukan ikatan etia; Seangkan= su7unit
ke+il untuk mengikat mNA mem7entuk "lis"m an 7ertanggung 3awa7 aa keakuratan
aa translasi engan men3amin asangan 7asa engan 7enar antara k""n i mNA an
antik""n i tNA; 9aa NA seluruhna= rNA teraat )0?I0; Be7eraa rNA
7erungsi se7agai katalis alam sintesis r"tein;
-; Struktur 9rimer an Sekuner
a; Jelaskan mengenai struktur rimer an struktur sekuner #NA;
7; Jelaskan mengenai struktur rimer an struktur sekuner NA;
Jawa7 :
Struktur rimer #NA aalah struktur ang
memerlihatkan aana m"n"mer ? m"n"mer asam
nukle"tia ang teriri ari "sat= gula ent"sa= an
7asa nitr"gen; Basa nitr"gen aat 7erua urin
atau irimiin; Struktur rimer #NA
memerlihatkan se+ara 3elas ikatan ? ikatan ang
ter3ai seerti gam7ar i saming;
Struktur sekuner memerlihatkan aana 7entukan "u7le heliks imana gula ent"sa an"sat men3ai tulang terluarna seangkan 7asa nitr"gen men3ai ikatan tengahna; Heliks
gana terse7ut tersusun ari ua untai "linukle"tia se+ara antiaralel arah 5F F saling
7erlawanan= 7erutar ke kanan an melingkari suatu sum7u; erlihat seerti gam7ar kiri i
atas;
Struktur 9rimer NA teraat se7agai utas tunggal an meruakan rantai ri7"nukle"tia
memiliki tulang unggung gugus ri7"sa an asam "sat se+ara 7ergantian; Sama halna
engan #NA= NA 3uga memiliki 7asa nitr"gen urin an irimiin ang terikat engan
gugus ri7"sa; 8katan "s"iester menghu7ungkan gugus hir"ksi aa nukle"tia ang
Halaman 1" ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
13/14
satu engan gugus hir"ksi 5 aa nukle"tia lainna; 9aa asarna 7asa nitr"gen ang
imiliki #NA an NA aalah sama namun er7eaanna aalah aa NA tiak itemukan
timin melainkan urasil; %anungan aenin tiak sama engan kanungan urasil= 7egituula
kanungan guanin an sit"sin; 9er7eaanna engan struktur rimer #NA aalah gula
ent"sa NA aalah ri7"nukleat seangkan #NA aalah 2?e"ksiri7"nukleat= an aa NA
teraat urasil seangkan alam #NA teraat timin;
Struktur sekuner NA ter7entuk aa7ila struktur rimerna meliat iri sehingga
mem7entuk utas rangka namun tiak mem7entuk heliks;
10; 9er7aningan Basa Nitr"gen
a; Jelaskan mengaa 3ika #NA ihir"lisis= er7aningan antara A : an ( : C selalu
menekati 1 : 1;
Jawa7 :
9aa saat #NA ihir"lisisakan terlihat selalu er7aningan antara A engan serta C
engan ( aalah sekitar 1:1 sesuai engan hukum Charga; Hal ini aat ter3ai karena
#NA memiliki gugus "u7le heliks ang imana aa setia nukle"tia #NA teraat
seasang 7asa nitr"gen aitu aen"sin engan timin an sit"sin engan guanin= maka ari itu
er7aningan A? an C?( akan selalu menekati 1:1; Seanaina ter7entuk ikatan
nukel"tia ang tiak sesuai= #NA segera akan mengatasina engan 7er7agai +ara
tergantung keaaanna aitu= mismatch reapir, bas excision repair, nucleotide excision repair
andouble strand break repair.
Halaman 13 ari 1#
-
7/25/2019 Jigsaw Asam Nukleat - Home Group 10
14/14
DA*+AR ,US+AKA
1; Har'e A= errier #; ,iin+"ttFs illustrate re'iews= 7i"+hemistr; &th e;9hilaelhia: