instytut biologii molekularnej i...

41
Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii dr hab. Piotr Ziółkowski Przegląd prac dyplomowych w Zakładach Instytutu Biologii Molekularnej i Biotechnologii www.ibmib.amu.edu.pl

Upload: others

Post on 20-Mar-2020

8 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Instytut Biologii Molekularnej

i Biotechnologii dr hab. Piotr Ziółkowski

Przegląd prac dyplomowych

w Zakładach Instytutu Biologii Molekularnej i

Biotechnologii

www.ibmib.amu.edu.pl

Page 2: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologii IBMiB

Finansowanie badań

Page 3: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

BIOLOGIA

MOLEKULARNA

BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA

Z. Genetyki Molekularnej

Człowieka

Z. Biochemii

Z. Biologii Obliczeniowej

Z. Ekspresji Genów

Z. Biochemii

Z. Biotechnologii

Z. Ekspresji Genów

Z. Biologii Molekularnej i

Komórkowej

Z. Genetyki Molekularnej

Człowieka

Z. Biotechnologii

Z. Bioenergetyki

Z. Eskpresji Genów

Page 4: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://www.molcell.amu.edu.pl

Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek

Page 5: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://www.molcell.amu.edu.pl

Skład osobowy:

dr hab. Krzysztof Leśniewicz

dr hab. Michał Rurek

dr Anna Kasprowicz-Maluśki

Lokalizacja

Pokoje: 1.105-1.107

Kontakt

tel. 61 829 5968

[email protected]

Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Przemysław Wojtaszek

Page 6: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://www.molcell.amu.edu.pl

Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Tematyka badań: słowa kluczowe

Page 7: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://www.molcell.amu.edu.pl

Zakład Biologii Molekularnej i Komórkowej Przykładowe tematy prac dyplomowych

Udział kompleksu gamma-sekretazy w regulacji endocytozy zwierzęcych receptorów

błonowych

Lokalizacja tkankowa wybranych roślinnych nukleaz S1/P1

Transformacja genetyczna organelli- osiągnięcia i perspektywy

Page 8: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska

Page 9: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

prof. dr hab. Artur Jarmołowski

dr Andrzej Pacak

dr Katarzyna Kruszka

dr Dorota Raczyńska

dr Izabela Sierocka

dr Aleksandra Świda-Barteczka

dr Marcin Pieczyński

dr Dawid Bielewicz

dr Michał Taube

dr Jakub Dolata

Lokalizacja

Pokoje: 1.109-1.113

Kontakt

tel. 61 829 5953

[email protected]

Laboratorium Ekspresji Genów Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Zofia Szweykowska-Kulińska

http://zeg.amu.edu.pl/

Page 10: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://zeg.amu.edu.pl

Laboratorium Ekspresji Genów Tematyka badań: słowa kluczowe

Page 11: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Ekspresji Genów

Rola splicingu w regulacji poziomu mikroRNA znajdujących się w egzonach i

intronach

Oddziaływaniami wiążących RNA w regulacji biogenezy mikroRNA

Nowe elementy genetyczne odpowiedzi ziemniaka na stres suszy

Badania nad mechanizmem regulującym alternatywny splicing.

http://zeg.amu.edu.pl

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Page 12: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

dr Ewa Stępniak-Konieczna

dr Agnieszka Piasecka

dr Patryk Konieczny

Lokalizacja

Pokoje: 1.109-1.113

Kontakt

tel. 61 829 5958

[email protected]

Kierownik Laboratorium: dr hab. Krzysztof Sobczak, prof. UAM

Laboratorium Terapii Genowej

Page 13: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

dr Ewa Stępniak-Konieczna

dr Agnieszka Piasecka

dr Patryk Konieczny

Lokalizacja

Pokoje: 1.109-1.113

Kontakt

tel. 61 829 5958

[email protected]

Laboratorium Terapii Genowej Kierownik Laboratorium: dr hab. Krzysztof Sobczak, prof. UAM

Nasze badania koncentrują się głównie na biologii i patologii rozmaitych cząsteczek RNA. Poznajemy molekularny patomechanizm chorób genetycznych

Page 14: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Kontakt

tel. 61 829 5855

[email protected]

Laboratorium Systemów Ewolucyjnych Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Borys Wróbel

http://www.evosys.org/pl/

Page 15: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Kontakt

tel. 61 829 5855

[email protected]

Laboratorium Systemów Ewolucyjnych

http://www.evosys.org/pl/

Wykorzystanie sztucznych sieci genowych w robotyce ewolucyjnej

Wykorzystanie analizy czynności elektrycznej mięśni w rehabilitacji

Zastosowanie analizy sieci złożonych w badaniach społecznych

Stworzenie oprogramowania pozwalającego na analizę czynności elektrycznej mięśni

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Page 16: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Kontakt

tel. 22 597 0750

[email protected]

Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej Kierownik Laboratorium: prof. dr hab. Janusz Bujnicki

http://bid.amu.edu.pl/

Page 17: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Rozwój i zastosowanie metod komputerowego modelowania struktur kompleksów białek i kwasów nukleinowych

Zastosowanie potencjałów statystycznych do modelowania struktur kompleksów białkowych

Rozbudowa narzędzia do wizualizacji zgodności modeli kompleksów makromolekularnych z więzami doświadczalnymi

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Kontakt

tel. 22 597 0750

[email protected] http://bid.amu.edu.pl/

Laboratorium Bioinformatyki Strukturalnej

Page 18: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://ibmib.amu.edu.pl/index.php/pl/bioenerg-start

Zakład Bioenergetyki

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz

Page 19: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

prof. dr hab. Hanna Kmita

dr Nina Antos-Krzemińska

dr Andonis Karachitos

dr Olgierd Stobienia

dr Małgorzata Wojtkowska

dr Andrzej Woyda-Płoszczyca

Lokalizacja

Pokoje: 1.73-1.96

Kontakt

tel. 61 829-5881 [email protected]

Zakład Bioenergetyki Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wiesława Jarmuszkiewicz

Page 20: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Bioenergetyki Tematyka badań: słowa kluczowe

Page 21: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Bioenergetyki

Nadekspresja CuZnSOD w komórkach drożdży Saccharomyces cerevisiae

pozbawionych funkcjonalnego białka VDAC1

Ocena statusu energetycznego komórek drożdży Saccharomyces cerevisiae

pozbawionych funkcjonalnego białka YVDAC

Ocena przepuszczalności błony zewnętrznej izolowanych mitochondriów drożdży

Saccharomyces cerevisiae w warunkach braku funkcjonalnego białka YVDAC2

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Page 22: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://ibmib.amu.edu.pl/index.php/pl/biochem-start

Zakład Biochemii

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Mikołaj Olejniczak

Page 23: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

dr Aneta Piechalak

dr Joanna Wojtera

dr Arleta Małecka

dr Zuzanna Wróblewska

Lokalizacja

Pokoje: 1.119-1.121

Kontakt

tel. 61 829 5907

[email protected]

Zakład Biochemii Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Mikołaj Olejniczak

http://www.biochem.amu.edu.pl

Page 24: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Biochemii Tematyka badań: słowa kluczowe

http://www.biochem.amu.edu.pl

Page 25: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Biochemii

Mechanizm działania niekodujących RNA bakterii w regulacji translacji mRNA

wybranych genów reporterowych u E.coli

Przygotowanie konstruktów reporterowych do badań regulacji translacji białek

błonowych przez niekodujące RNA bakterii

Klonowanie, nadekspresja i oczyszczanie bakteryjnych białek opiekuńczych

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Page 26: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://ibmib.amu.edu.pl/index.php/pl/biotech-start

Zakład Biotechnologii

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Jan Sadowski

Page 27: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Lokalizacja

Pokoje: 1.90 i 1.101

Kontakt

tel. 61829-5964

[email protected]

Kierownik Laboratorium: dr hab. Agnieszka Ludwików

Laboratorium Inżynierii Białek

kinazy-MAP kinazy-MAP kinazy-MAP system-dwuhybrydowy kaskady-sygnałowe

http://ibmib.amu.edu.pl

Page 28: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Lokalizacja

Pokoje: 1.90 i 1.101

Kontakt

tel. 61829-5964

[email protected]

Kierownik Laboratorium: dr hab. Agnieszka Ludwików

Laboratorium Inżynierii Białek

Page 29: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Mechanizmy degradacji kinazy kaskady MAP- MAPKKK18 przez proteasom 26S

Rola modyfikacji potranslacyjnych w regulacji stabilności białek

Charakterystyka procesu formowania łańcuchów poliubikwitynowych

http://ibmib.amu.edu.pl

Laboratorium Inżynierii Białek

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Page 30: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Kierownik Laboratorium: dr hab. Piotr Ziółkowski

Kontakt

tel. 61829-5966

[email protected]

Lokalizacja

Pokoje: 1.92 i 1.99

Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji

http://ibmib.amu.edu.pl

Page 31: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Kierownik Laboratorium: dr hab. Piotr Ziółkowski

Kontakt

tel. 61829-5966

[email protected]

Lokalizacja

Pokoje: 1.92 i 1.99

Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji

MMR MMR QTL QTL QTL CRISPR/Cas9 CRISPR/Cas9 CRISPR/Cas9 CRISPR/Cas9

http://ibmib.amu.edu.pl

Page 32: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Edycja genomu przy wykorzystaniu techniki CRISPR/Cas9 do pozyskania mutantów w genach związanych z rekombinacją mejotyczną

Mapowanie czynników kontrolujących częstość rekombinacji mejotycznej u Arabidopsis thaliana

Antyrekombinacyjna funkcja genów systemu MMR (mismatch repair)

http://ibmib.amu.edu.pl

Przykładowe tematy prac dyplomowych

Laboratorium Remodelowania Chromatyny i Rekombinacji

Page 33: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://dhmg.amu.edu.pl/

Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen

Page 34: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

Prof. UAM dr hab. Joanna Wesoły

dr Katarzyna Kluzek

dr Adrian Paul Silesian

Lokalizacja

Pokoje: 1.116-1.118

Kontakt

tel. 61 829 5832 [email protected]

Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Hans Bluijssen

http://dhmg.amu.edu.pl/

Page 35: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://dhmg.amu.edu.pl

Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka Tematyka badań: słowa kluczowe

Page 36: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

http://dhmg.amu.edu.pl/

Zakład Genetyki Molekularnej Człowieka

Podstawy genetyczne pierwotnego nadciśnienia tętniczego

Ekspresja genów STAT i SOCS u pacjentów z pierwotnym nadciśnieniem tętniczym

Mutacje w guzach jasnokomórkowego raka nerki

Przykładowe tematy pracy dyplomowych

Page 37: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Biologii Obliczeniowej

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wojciech Karłowski

http://rhesus.amu.edu.pl/fg/

http://bioinformatics.amu.edu.pl

Page 38: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Skład osobowy:

dr Maciej Szymański

dr Marek Żywicki

dr Andrzej Zieleziński

Lokalizacja

Pokoje: 1.95-1.98

Kontakt

tel. 61829-58-41 [email protected]

Zakład Biologii Obliczeniowej

Kierownik Zakładu: prof. dr hab. Wojciech Karłowski

http://www.combio.pl

https://www.facebook.com/bioinformatyka

Page 39: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

Zakład Biologii Obliczeniowej

Wykorzystanie technologii nowej generacji do analizy transkryptomów

Identyfikacja genów uzyskanych na drodze Horyzontalnego Transferu

Biologia strukturalna cząsteczek RNA

Wizualizacja i przetwarzanie danych w biologii

http://www.combio.pl

Przykładowe tematy pracy dyplomowych

Page 40: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

PREZENTACJE ZNAJDZIESZ: http://www.ibmib.amu.edu.pl

Page 41: Instytut Biologii Molekularnej i Biotechnologiiibmib.home.amu.edu.pl/wp-content/uploads/2016/10/ibmib.2016.pdf · BIOTECHNOLOGIA BIOCHEMIA BIOINFORMATYKA Z. Genetyki Molekularnej

NOWA STRONA IBMiB: http://ibmib.home.amu.edu.pl