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Initiation à la recherche clinique et épidémiologique
(Les différents types d’enquête)
Initiation à l’analyse de données(Comment présenter les données ?)(Pourquoi a-t-on besoin des tests ?)
Dr Benoît Lepage ([email protected]), Dr Vanina Bongard ([email protected])Département d’Epidémiologie, Economie de la Santé et Santé PubliqueUniversité Toulouse III – Paul Sabatier
Master de Santé Publique, Toulouse III
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I) Les outils statistiques- Description de données- Sondages, échantillons, inférence- Estimations- Tests
II) Les principaux types d’enquêtes- Essais cliniques- transversales- Cohortes- Cas témoins
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• Unités statistiques : éléments faisant l’objet de l’étude : personnes, temps de mesures, département, …
• Variables statistiques :
Paramètre pouvant prendre différentes valeurs d’une unité statistique à l’autre
• variable qualitative = variable catégorielle– variable qualitative nominale (sans relation d’ordre)– variable qualitative ordonnée (relation d’ordre)
• Variable quantitative– variable quantitative discontinue = discrète– variable quantitative continue
I. Outils statistiques
Comment présenter les données ?
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• Tableaux de fréquence• Fréquence absolue : nombre de cas• Fréquence relative : pourcentage
Sexe, n (%) hommes femmesTabagisme, n (%) non fumeurs anciens fumeurs fumeurs
80 (53,3 %) 70 (46,7 %)
77 (51,3 %) 28 (18,7 %) 45 (30,0 %)
N = 150
a. Représentation synthétique d’une variable qualitative
Variable booléenne,
dichotomique, binaire, à 2 modalités
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• Diagrammes en secteurs
Distribution des sérodiagnostics de la toxoplasmose dans un laboratoire en fonction du type de patient
(CAMEMBERT)
Nouveaux-nés20%
Sida6%
Suspicion clinique4%
Femmes enceintes70%
Graphiques => faire ressortir une vision synthétique (mais souvent moins précise que les tableaux)
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• Diagrammes en barres
Distribution de la profession (diagramme en barres)
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
Nurse Physician Resp therapist
Occup therapist
Physiotherapist
Psychologist Other
profession
frequence
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• Histogrammes (variables discrètes)
0
5
10
15
20
25
30
35
Pourcentage
0 1 2 3 4 5
Nombre d'enfants
Distribution du nombre d'enfants par femme dans l'échantillon
b. De la variable qualitative à la variable quantitative
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• Histogrammes
0
5
10
15
20
25
30
35
Nombre de cas
Pression artérielle systolique (mm Hg)
Distribution de la pression artérielle systolique dans l'échantillon
80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 19070
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• Courbes de distribution
Nombre de cas
Pression artérielle systolique (mm Hg)
Distribution de la pression artérielle systolique dans l'échantillon
70 90 110 130 140 1600
10
20
30
40
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• 1. Paramètres de position ou de tendance centrale– moyenne arithmétique et géométrique – médiane – mode
• 2. Paramètres de dispersion – variance – écart type, erreur standard – quantiles – intervalle interquartile– Extrêmes, étendue
c. Représentation synthétique d’une variable quantitative
POSITION
DISPERSION
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0
10
20
30
40
50
60
70
80
0
5
10
15
20
25
30
35
Distribution gaussienne:
Nb de cas
Nb de cas
La moyenne correspond aux valeurs les plus fréquentes
Distribution non gaussienne:
bon indicateur de tendance centrale
La moyenne ne correspond pas aux valeurs les plus fréquentes
mauvais indicateur de tendance centrale
Moyenne arithmétiqueN
xm
N
ii
1
1. Paramètres de position
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• Médiane : plus adaptée si distribution asymétrique• Valeur centrale séparant l’échantillon en deux moitiés
• 50 % des valeurs sont au dessus• 50 % des valeurs sont en dessous• rang de la médiane :
• (n + 1) / 2 si n est pair• n/2 si n est impair
• Mode• Valeur la plus représentée (variables quantitatives discrètes +)
1. Paramètres de position
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Exemple médiane (1)
Poids en Kg d’une série de 80 sujets (après classement par ordre croissant)45 50 55 58 60 63 64 64 65 66 67 67 67 67 68 68 68 68 68 68
70 70 71 71 71 71 72 72 72 72 73 73 73 73 73 73 73 73 73 73
74 74 74 74 74 74 74 74 74 75 75 75 75 76 76 76 76 77 77 77
77 78 79 79 79 79 80 80 80 80 80 81 81 81 82 82 83 84 84 86
Moyenne de la 40ème et 41ème valeur
Médiane = (73+74)/2 = 73,5 kg
(ne nécessite pas de connaître toutes les valeurs)
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Exemple médiane (2)
• Une série de 7 sujets :
45 50 55 58 60 63 64
Ici, n est impair, la médiane est la valeur de rang (n+1)/2
= la valeur de rang 4
La médiane est 58
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0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0,9
1
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0,9
1
Dispersion
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• Variance
i = 1
n
(X i - ) 1n
2 =2
• La variance est la moyenne des carrés des écarts des valeurs par rapport à la moyenne.
• L’unité de la variance est l’unité de la variable étudiée au carré.
• Ecart Type, déviation standard, SD
• L’unité de l’écart type est identique à l’unité de la variable étudiée.
= 2
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68%
95%
- 1DS- 2DS + 1DS + 2DS
Moy ± 1ET contient 68% des observations
Moy ± 2ET contient 95% des observations
Moy ± 3ET contient 99% des observations
Si une variable suitune distribution normale :
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• Quantiles• (k – 1) valeurs séparant l’échantillon en k zones comportant le
même nombre d’observations• k = 3 : tertiles • k = 4 : quartiles• k = 10 : déciles• k = 100 : centiles ou percentiles
• Un intervalle entre deux quantiles correspond à un intervalle interquantile
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Exemple : quartiles
Poids en Kg d’une série de 80 sujets (après classement par ordre croissant)
45 50 55 58 60 63 64 64 65 66 67 67 67 67 68 68 68 68 68 68
70 70 71 71 71 71 72 72 72 72 73 73 73 73 73 73 73 73 73 73
74 74 74 74 74 74 74 74 74 75 75 75 75 76 76 76 76 77 77 77
77 78 79 79 79 79 80 80 80 80 80 81 81 81 82 82 83 84 84 86
1er quartile = (¼,¾) = 69 kg
2ème quartile = Médiane = 73,5 kg
3ème quartile = (¾,¼) = 77 kg
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• Population cible : ensemble des individus auxquels on s’intéresse
• Population source : ensemble des individus à partir desquels on effectue le tirage au sort
• Echantillon : ensemble des individus effectivement étudiés
Notion d’inférence = tirer une conclusion au niveau d’une population inaccessibleà partir d’observations faites sur un échantillon
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Un sondage est un procédé qui consiste à n’observer qu’une partie de la population étudiée (échantillon) et à tirer de cette observation des informations sur la population entière.
N sujets
n sujets n < N
Population source représentative de la population cible
Echantillon
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Fluctuations d’échantillonnageMalade
Non malade
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AVANTAGES d’un sondage :
Le sondage est plus rapide, moins cher et plus facilement réalisable qu’une enquête exhaustive sur la population cible.
INCONVENIENT d’un sondage :
Incertitude de l’extrapolation à la population cible des observations faites sur l’échantillon.
CONTRAINTES d’un sondage :
L’échantillon doit être représentatif de la population cible.
L’échantillon doit être composé d’unités statistiques en nombre suffisant.
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Il faut bien distinguer un biais des fluctuations normales
d’échantillonnage
erreur systématique erreur aléatoire
Conduit à définir un intervalle de confiance du paramètre à estimer
Estimation biaisée
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Déformation des faits due au hasard de l’échantillonnage :
erreur non systématique due au hasard (fluctuations
d’échantillonnage )
Estimation précise et non biaisée
Estimation peu précise mais non
biaisée
Déformation des faits due à un biais :
erreur systématique allant toujours dans le même
sens (biais)
Estimation précise mais biaisée
Estimation peu précise et biaisée
Biais et erreurs aléatoires
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Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une population à partir des paramètres observés sur un échantillon
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Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une population à partir des paramètres observés sur un échantillon
1. Valeur observée valeur inconnue de la population
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Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une population à partir des paramètres observés sur un échantillon
1. Valeur observée valeur inconnue de la population
2. Valeur observée proche de la valeur inconnue si échantillon représentatif
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Estimation : Définition (1)
• Tenter de définir les paramètres d’une population à partir des paramètres observés sur un échantillon
1. Valeur observée valeur inconnue de la population
2. Valeur observée proche de la valeur inconnue si échantillon représentatif
3. En répétant l’échantillonnage, autres valeurs proches les unes des autres
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Valeur observée (échantillon) Valeur exacte (population générale)
Estimation : Définition (2)
• Incapable de connaître la vraie valeur !!!
• Objectif de l’estimation en statistique => calculer des bornes où se trouve la valeur inconnue du paramètre (avec une confiance suffisamment grande)
= Intervalle de confiance +++
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Estimation d’une moyenne inconnue (1)
• On sait calculer la moyenne observée d’une variable quantitative sur un échantillon
• Problème: Estimer la moyenne inconnue de la population d’où est extrait l’échantillon
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Estimation d’une moyenne inconnue (2)
• Utiliser un échantillon représentatif de la population (obtenu par tirage aléatoire)
• Estimation de à partir de l ’échantillon 1 : est estimée par m1 = (xi) / n1
– où xi = {x1, x2, … , xn1} les n1 valeurs de X dans l ’échantillon 1
– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
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Estimation d’une moyenne inconnue (2)
• Échantillon représentatif de la population (obtenu par tirage aléatoire)– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 2ème échantillon (par tirage aléatoire)– m2 proche de m1
– m2 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
![Page 35: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/35.jpg)
Estimation d’une moyenne inconnue (2)
• Échantillon représentatif de la population (obtenu par tirage aléatoire)– m1 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 2ème échantillon (par tirage aléatoire)– m2 proche de m1
– m2 observée inconnue
– Mais à quelle distance, de quel côté de ?
• 3ème échantillon : idem...
![Page 36: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/36.jpg)
Estimation d’une moyenne inconnue (3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons possibles tirés de la population générale
![Page 37: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/37.jpg)
Estimation d’une moyenne inconnue (3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons possibles tirés de la population générale
• On obtiendrait une moyenne m pour chaque échantillon
![Page 38: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/38.jpg)
Estimation d’une moyenne inconnue (3)
• Si on dispose de la totalité des échantillons possibles tirés de la population générale
• On obtiendrait une moyenne m pour chaque échantillon
Fluctuations d’échantillonnage de la
moyenne
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Estimation d’une moyenne inconnue (3)
• L’estimation m de la moyenne inconnue est une variable aléatoire puisqu’elle varie d’un échantillon à l’autre
Fluctuations d’échantillonnage de
l’estimation de la moyenne
Distribution de la variable Xdans la population Distribution
des moyennes de X dans chaque échantillon
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Estimation d’une moyenne inconnue (3)
• L’estimation m de la moyenne inconnue est une variable aléatoire puisqu’elle varie d’un échantillon à l’autre
Distribution de la variable Xdans la population
On peut estimer la moyennede l’estimation de la moyenne
Et la variance de l’estimationde la moyenne
![Page 41: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/41.jpg)
Estimation d’une moyenne inconnue (4)
m1
m2
m3
m4
m5
m6
m7
m8
m9
…
mk Moyenne de la population
Si on calcule l’intervalle de confiance auprès
d’un très grand nombre d’échantillons, la vraie moyenne de la population est comprise dans 95 %
des intervalles de confiance
Dans un échantillon,on sait calculer un intervalle de confiance à 95%
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Intérêt des tests
• Les tests servent à extrapoler les résultats observés sur des échantillons à l’ensemble des populations dont ils sont issus +++
– Échantillon : image ponctuelle
• Intérêt majeur des tests :– Économie de moyens +++– En permettant de déceler des différences sur un
nombre réduit d’observations
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Principe des tests de comparaison
• Principe général : Regarder si la différence qu’on observe dans un échantillon est due au hasard ou si au contraire cette différence est telle qu’il est fort peu probable de l’observer par hasard
• 2 hypothèses sont posées :– Hypothèse nulle = « il n’y a pas de différence »– Hypothèse alternative = « il y a une différence »(dans la population à laquelle on veut généraliser le
résultat)
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Principe des tests de comparaison
• Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il vous tend une pièce.
– Hypothèse nulle H0 : la pièce n’est pas faussée, et j’ai une chance sur deux de gagner P(joueur 1 gagne) = P(joueur 2 gagne)
– Hypothèse alternative H1 : la pièce est faussée, un des joueurs à une probabilité plus élevée de gagner que l’autre joueur : P(joueur 1 gagne) P(joueur 2 gagne)
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Principe des tests de comparaison
• Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il vous tend une pièce.
– Au premier essai, vous perdez Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette
fois ci, vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la mise.
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Principe des tests de comparaison
• Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il vous tend une pièce.
– Au premier essai, vous perdez Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette fois ci,
vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la mise.
– Au deuxième essai, vous perdez à nouveau Vous pensez que vous n’avez vraiment pas de chance, vous ne
remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la mise.
![Page 47: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/47.jpg)
Principe des tests de comparaison
• Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il vous tend une pièce.
– Au premier essai, vous perdez Vous pensez que vous n’avez pas eu de chance cette fois ci,
vous ne remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la mise.
– Au deuxième essai, vous perdez à nouveau Vous pensez que vous n’avez vraiment pas de chance, vous ne
remettez pas en cause l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée, et vous acceptez de refaire une partie en espérant rattraper la mise.
– Vous continuez à jouer, vous perdez 5 fois de suite. Vous commencez à avoir de sérieux doute et à remettre en
cause la validité de l’hypothèse nulle selon laquelle la pièce n’est pas faussée
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Principe des tests de comparaison
• Illustration : vous pariez à pile ou face avec un ami, il vous tend une pièce.
– Au bout du 10ème essai, vous avez perdu 10 fois de suite, vous décider d’arrêter de jouer,
la probabilité que la pièce ne soit pas faussée (que l’hypothèse nulle soit vraie) est trop faible : vous rejetez cette hypothèse et acceptez l’hypothèse alternative H1 (la pièce est faussée)
vous prenez le risque de vous fâcher avec votre ami (le risque de se fâcher alors que la pièce était en réalité normale est devenu beaucoup trop faible).
Il y a un seuil à partir duquel, on décide de rejeter l’hypothèse nulle
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2éme Exemple :
La prévalence du diabète est-elle supérieure chez les sujets en surcharge pondérale par rapport aux sujets de poids normal ?
Sondage dans la population cible pour obtenir un échantillon représentatif.
Exemple d’utilisation d’un test
Principe général des tests de comparaison : Regarder si la différence qu’on observe dans un échantillon est due au hasard ou si au contraire cette différence est telle qu’il est fort peu probable de l’observer par hasard
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Hypothèse nulle H0 :
La prévalence du diabète dans la population cible est identique parmi les sujets de poids normal et parmi les sujets en surcharge pondérale.
P1 = P0 ou D = P1 – P0 = 0
Hypothèse alternative H1 :
La prévalence du diabète dans la population cible est différente parmi les sujets de poids normal et parmi les sujets en surcharge pondérale.
P1 P0 ou D = P1 – P0 0
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Si l’échantillon est de taille suffisante et représentatif :
- sous H0 : d = p1 – p0 devrait être petite
- sous H1 : d = p1 – p0 devrait être grande
On réalise un test statistique pour savoir si d peut être considérée comme grande (significativement différente de 0).
Autrement dit on réalise un test statistique pour savoir s’il est vraisemblable de rejeter l’hypothèse nulle.
![Page 52: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/52.jpg)
Population cible
échantillon
Conclusion vraie Conclusion fausse
Conclusion vraieConclusion fausse
absence de différence
D = 0
existence d’une différence
D 0
d petite
d grande
Il y a toujours un risque de se tromper dans notre conclusion => risque d’erreur
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Risque de première espèce ( seuil de significative p) :Probabilité de rejeter à tort l’hypothèse nulle (probabilité de conclure à tord à l’existence d’une différence entre les groupes).
Risque de seconde espèce :Probabilité de conserver à tort l’hypothèse nulle (probabilité de conclure à tord à l’absence de différence entre les groupes).
Puissance du test :Probabilité de mettre en évidence une différence qui existe vraiment entre les groupes : Puissance = 1 -
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Population cible
échantillon
Conclusion vraie
1 -
Conclusion fausse
Conclusion vraie
1 -
Conclusion fausse
absence de différence
D = 0
existence d’une différence
D 0
d petite
test non significatif
d grande
test significatif
Un test significatif permet de conclure à l’existence d’une différence.
Un test non significatif ne permet pas d’exclure l’existence d’une différence.
Le classement en « d petite »ou « d grande » se fait à partir de la p-value (degré de signification) du test :Si p < , on considère que d est petite
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II. Principaux types d’enquêtes
Une enquête est une opération qui consiste à recueillir de l’information, puis à l’analyser en vue de résoudre une ou plusieurs questions spécifiée(s) à l’avance.
Enquêtes exhaustives (sur l’ensemble de la population)
Enquête sur échantillon (obtenu par sondage)
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Principaux types d’enquêtes
descriptives enquêtes transversales cohortes non comparatives
analytiques enquêtes transversales enquêtes cas - témoins enquêtes de cohorte(« exposés - non exposés » ou « longitudinale »)
L’exposition n’est pas contrôlée par l’investigateur
Enquêtes d’observation
L’exposition est contrôlée par l’investigateur
Enquêtes expérimentales
randomisées essais cliniques phase III
non randomisées
essais cliniques phase I et II enquêtes avant - après
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La vie du médicament
découverte d’une molécule
études pré-cliniques (animal)
phase I (volontaires sain)
phase II (volontaires malades)
phase III (volontaires malades : essais comparatifs)
Autorisation de Mise sur le Marché (A.M.M.)
Phase IV
(pharmacovigilance, pharmaco-épidémiologie, pharmaco-économie)
pharmacologie clinique
8 –
12 a
ns
Essais cliniques
Principaux types d’enquêtes
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Essais cliniques
Essais non randomisés :
- Phase I : étude de la première administration chez l’homme- volontaires sains, - évaluation des effets indésirables => sécurité - et effets pharmacodynamiques
-Phase II : étude de l’efficacité pharmacologique- volontaires malades- pharmacologie (posologie efficace, dose-effet)- pharmacocinétique
Principaux types d’enquêtes
![Page 59: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/59.jpg)
Principes méthodologiques des essais de phase III
1. principe de comparaison
par rapport à un placebo
ou par rapport à un médicament de référence
indispensable pour distinguer l’efficacité du médicament de l’évolution naturelle de la maladie
Principaux types d’enquêtes
Objectif : évaluer l’efficacité thérapeutique d’une intervention
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2. principe du tirage au sort (randomisation)
La répartition des sujets dans chaque groupe se fait par tirage au sort.
indispensable pour assurer la comparabilité des deux groupes
les groupes sont comparables en tout point, sauf pour l’attribution du traitement
Principaux types d’enquêtes
Principes méthodologiques des essais de phase III
![Page 61: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/61.jpg)
3. principe du double aveugle
Le patient ne sait pas s’il prend le placebo ou le traitement testé.
Le médecin ne le sait pas non plus.
indispensable pour maintenir la comparabilité des groupes au cours de l’étude
Principaux types d’enquêtes
Principes méthodologiques des essais de phase III
![Page 62: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/62.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation transversale
temps
Exposition ?
Maladie ?
Au moment de l’enquête, on recueille au même moment les informations sur la présence d’une exposition et la présence d’une maladie
Souvent : un échantillon représentatif d’une population et n’est pas sélectionné en fonction de l’exposition
ou de la maladie
![Page 63: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/63.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation transversale
Estimation de la prévalence d’une maladie
Proportion de sujets atteints d’une maladie dans une population à un instant donné t.
P = M
M + NP : prévalence de la maladie dans la population à l’instant t
M : nombre de malades dans la population à l’instant t
N : nombre de non malades dans la population à l’instant t
effectif total de la population à
l’instant t
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Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale = Enquête de cohorte
Les sujets sont suivis dans le temps (on connaît les dates des évènements mesurés)
tempsExposition ?
Maladie ?
Début d’étude : Recueil prospectif
Début d’étude : Recueil rétrospectif (cohorte « historique »)
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Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale = Enquête de cohorte
Parfois l’inclusion des sujets au départ se fait en fonction d’une exposition dichotomique : enquête « exposé – non exposé »
tempsExposition ?
Maladie ?
Début d’étude : Recueil prospectif
Début d’étude : Recueil rétrospectif (cohorte « historique »)
![Page 66: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/66.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale = Enquête de cohorte
On peut estimer l’incidence d’une maladie
Vitesse moyenne de production de nouveaux cas d’une maladie dans une population pendant un intervalle de temps [t; t+t].
TI = nombre de nouveaux cas sur [t; t+ t]
effectif moyen des sujets à risque sur [t; t+ t]
TI : taux d’incidence de la maladie dans la population pendant [t; t+ t]
Effectif moyen des sujets à risque sur [t; t+ t] :2
Nt + Nt+ t
![Page 67: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/67.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale = Enquête de cohorte
On peut calculer le risque relatif (RR) : comparer les taux d’incidence entre différentes expositions
Le risque relatif d’une exposition (par rapport à l’absence d’exposition) :
exposénon
exposés
incidence
incidenceRR
![Page 68: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/68.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête d’observation longitudinale = Enquête de cohorte
On peut calculer le risque relatif (RR) : comparer les taux d’incidence entre différentes expositions
- Si RR > 1 : le risque de maladie est augmenté chez les sujets exposés
- Si RR < 1 : le risque de maladie est diminué chez les sujets exposés
- Si RR=1 : le risque de maladie est le même chez les sujets exposés et non-exposés
![Page 69: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/69.jpg)
exposés
non exposés
% de malades ?
% de malades ?
étude exposés - non exposés
Principaux types d’enquêtes
Exemple dans une enquête exposés – non exposés, avec la même durée de suivi pour tout le monde :
![Page 70: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/70.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Estimation d’un risque relatif de maladie
a b
c d
exposés
non exposés
malades non malades
m1 m0
n1
n0
RR = Re / Rne = Ie / Ine = (a/n1) / (c/n0)
Exemple dans une enquête exposés – non exposés, avec la même durée de suivi pour tout le monde :
![Page 71: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/71.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
On va comparer la fréquence de l’exposition antérieure chez des malades (cas) et des non-malades (témoins)
tempsExposition ?
Maladie ?
Début d’étude : Sélection des malades et témoins
Recueil rétrospectif de la présenced’une exposition antérieure
![Page 72: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/72.jpg)
cas =
malades
témoins =
sains
% d’exposés ?
étude cas - témoins
% d’exposés ?
Principaux types d’enquêtes
Enquête cas - témoins
![Page 73: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/73.jpg)
Enquête cas - témoins
Principaux types d’enquêtes
Dans une enquête de cohorte ou une enquête transversale, la sélection ne dépend pas de la présence de la maladie :
Les exposés et non-exposés dans l’échantillon sont représentatifs des exposés et non-exposés de la population
on peut estimer le risque d’être malade chez les exposés et non exposés et calculer un risque relatif
Dans une enquête cas témoins le pourcentage de malades est choisi arbitrairement par l’investigateur :
on ne peut pas estimer le risque dans la population ni le risque relatif, il faut calculer un odds ratio (OR) = rapport de cote
![Page 74: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/74.jpg)
Principaux types d’enquêtes
Estimation d’un odds ratio de maladie
OR = [e1/(1-e1)] / [e0/(1-e0)] = ad / bc
avec e1 et e0 fréquences de l’exposition chez les malades et les non malades :
a b
c d
exposés
non exposés
malades non malades
m1 m0
n1
n0
OR = [Re/(1-Re)] / [Rne/(1-Rne)]
Enquête cas - témoins
![Page 75: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/75.jpg)
Indispensable ++++Avant la mise en place d’une étude : quelque soit le schéma
Toujours commencer par l’écriture du protocole d’étude :- Contexte- hypothèses à évaluer- l’objectif précis- les méthodes à mettre en œuvre :
- population (critères d’inclusion, d’exclusion)- critères de jugement- variables d’exposition- autres variables à prendre en compte- méthodes de mesures des différentes variables- calcul de l’effectif nécessaire pour répondre à l’objectif- méthodes statistiques envisagées
![Page 76: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/76.jpg)
• Prendre en compte la variabilité +++– Variabilité biologique (entre-sujet et
intra-sujet)– Variabilité instrumentale (expérimentale,
liée à l’instrument lui-même)
variabilité biologique inter-sujet + variabilité biologique intra-sujet + variabilité instrumentale+ variabilité inter- et intra-examinateur…_____________________________
= Variabilité totale
Dernier point important pour les sciences de la vie :
la notion de variabilité
![Page 77: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/77.jpg)
• Variabilité biologique inter-individuelle– Durée de la gestation, taille à l’âge adulte, poids
de naissance
• Variabilité biologique intra-individuelle– Cortisol, glycémie, urée, tension artérielle
• Variabilité liée à la méthode de mesure– TA chez l’obèse, mesure sur une échographie
(liée à l’appareil et au clinicien)
• Variabilité liée à l’expérimentation– Effet centre, effet placebo, environnement
Variabilité : exemples
![Page 78: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/78.jpg)
• Rechercher une différence :
Variabilité : conséquences
Facile de montrer une différence entre les deuxmoyennes
Difficile de montrer une différence entre les deuxmoyennes
![Page 79: Initiation à la recherche clinique et épidémiologique (Les différents types denquête) Initiation à lanalyse de données (Comment présenter les données ?)](https://reader036.vdocuments.mx/reader036/viewer/2022062307/551d9d7f497959293b8b80e2/html5/thumbnails/79.jpg)
• Rechercher une corrélation :
Facile de montrer une corrélation entre les deuxvariables
Difficile de montrer une corrélation entre les deuxvariables