informe tÉcnico-financiero...

INFORME TÉCNICO-FINANCIERO FINAL

Convenio INVEMAR- Secretaría General de la Organización de Estados Americanos (SG/OEA):

Donaciones para digitalización de datos Red Temática de Especies y Especímenes de IABIN

Santa Marta, 29 de noviembre de 2007

Instituto de Investigaciones Marinas y Costeras “José Benito Vives De Andréis”

Vinculado al Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial

Convenio INVEMAR – Secretaría General de la Organización de Estados Americanos (SG/OEA): Donaciones para digitalización de datos Red Temática de Especies y Especímenes de IABIN

DIRECTIVOS DEL INVEMAR FRANCISCO A. ARIAS ISAZA Director General CARLOS A. PINILLA GONZÁLEZ Subdirector de Recursos y Apoyo a la Investigación JESÚS A. GARAY TINOCO Subdirector de Coordinación de Investigaciones GABRIEL R. NAVAS SUÁREZ Coordinador (E) Programa Biodiversidad y Ecosistemas Marinos (BEM) LUISA F. ESPINOSA DÍAZ Coordinadora Programa Calidad Ambiental Marina (CAM) MARIO E. RUEDA HERNÁNDEZ Coordinador Programa Valoración y Aprovechamiento de Recursos Marinos Vivos (VAR) PAULA C. SIERRA CORREA Coordinadora Programa Gestión para la Investigación de Zonas Costeras (GEZ) GEORGINA GUZMÁN OSPITÍA Coordinadora Programa Geociencias Marinas (GEO)

Cerro Punta de Betín Santa Marta – COLOMBIA Apartado Aéreo 1016 http://www.invemar.org.co

INFORME TÉCNICO FINAL

GRUPO DE INVESTIGADORES ERIKA MONTOYA-CADAVID ADRIANA GRACIA CLAVIJO ANDREA POLANCO FERNÁNDEZ GABRIEL NAVAS SÚAREZ JULIÁN PIZARRO PERTUZ JULIO BOHÓRQUEZ NARANJO LEONARDO ARIAS ALEMÁN LUZ MARINA MEJÍA LADINO MARTHA DÍAZ RUÍZ MIGUEL MARTELO LÓPEZ MILENA BENAVIDES SERRATO PAOLA FLÓREZ ROMERO TIBISAY POSADA PALACIO TOMÁS LÓPEZ LONDOÑO

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RESUMEN EJECUTIVO

Convenio INVEMAR-SG/OEA: Digitalización de datos REyE de IABIN 1. Titulo:

Difusión del conocimiento de la biodiversidad marina y costera colombiana. 2. Fecha de ejecución:

29 de marzo 2007- 29 de octubre 2007 3. Entidades participantes

• INVEMAR – Museo de Historia Natural Marina de Colombia (MHNMC) • Secretaria General de la Organización de Estados Americanos (SG/OEA) – Departamento

de Desarrollo Sostenible. 4. Área de influencia

Caribe-Pacífico colombianos 5. Recursos

Valor total del acuerdo: US $20,451.00 5. Objetivos:

a. Ingresar en el Sistema de Información sobre Biodiversidad Marina (SIBM) 10000 registros geo-referenciados de especimenes que se encuentran en el MHNMC acorde a los estándares de la Red Temática de Especies y Especímenes (REyE) de IABIN.

b. Implementar herramientas que permitan el acceso público en diferentes niveles al Sistema de Información del MHNMC en un ambiente controlado a través del INTERNET.

c. Apoyar la iniciativa institucional para el desarrollo del Sistema de Información de Metadatos que permita a los usuarios determinar la relevancia de un grupo de datos dependiendo de sus necesidades.

RESUMEN Entre marzo y octubre del 2007 se llevó a cabo el acuerdo entre la Secretaría General de la Organización de Estados Americanos y el INVEMAR, mediante el cual se pretende difundir el conocimiento de la biodiversidad marina y costera de Colombia a través de la Red Temática de Especies y Especimenes de IABIN (REyE). Con el desembolso de los recursos establecidos el 5 de mayo se dio inicio a la ejecución del proyecto, en cuya primera etapa se validaron los datos disponibles por medio de la búsqueda de información secundaria y la asesoría de expertos y curadores. El proceso permitió digitalizar 10000 registros biológicos, de los cuales 3382 son peces, 3364 moluscos, 967 crustáceos, 884 equinodermos, 691 cnidarios, 410 anélidos, 183 algas, 91 esponjas, 25 aves y 3 mamíferos; se georreferenciaron 350 nuevas estaciones; se complementó el diccionario con 1327 nombres científicos y 1236 nombres comunes en español e inglés. Paralelamente, en el Sistema de Información sobre Biodiversidad Marina (SIBM) se crearon mecanismos que facilitan la consulta de registros biológicos a través de búsquedas avanzadas en 50 atributos relacionados, y permiten también la documentación de datos de la hoja de vida de los autores que contribuyen con información. Adicionalmente, se implementó la herramienta CASSIA para la documentación de metadatos alimentándola con 180 conjuntos de datos. A partir de la primera semana de diciembre la información estará acoplada totalmente al portal de IABIN para su libre consulta a través de la REyE. Los objetivos y actividades previstos en el marco del acuerdo fueron cumplidos a cabalidad.

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EXECUTIVE SUMMARY

Convenio INVEMAR-SG/OEA: Digitalización de datos REyE de IABIN

1. Project title:

Disseminating knowledge on Colombian Marine and Coastal Biodiversity 2. Duration:

29 de marzo 2007- 29 de octubre 2007 3. Institutions:

• Marine and Coastal Research Institution of Colombia INVEMAR – Colombian Marine Natural History Museum (MHNMC)

• General Secreteriat of the Organization of American States (SG/OAS) – Department of Sustainable Development.

4. Influence Area: Colombian Caribbean-Pacific

5. Resources: Total Cost of agreement: US $20,451.00

5. Objetives:

a. To include 10000 geo-referenced records of important marine specimens held in the MHNMC into the Colombian SIBM following the IABIN standards for the Species and Specimens Thematic Network (SSTN)

b. To implement tools that allows public access to the MHNMC information system at several levels in a controlled environment through the INTERNET.

c. Partially support the institutional initiative to deploy the Metadata Information System in order to offer a mechanism that allows the users to define the relevance of a group of data, depending of their needs.

SUMMARY Between March and 0ctober of 2007 an agreement between the General Secretariat of the Organization of American States and INVEMAR was carried out to disseminate the knowledge of Colombian marine and coastal biodiversity through the Specimen and Species Thematic Network of IABIN (SSTN). The project started with the first payment in May 5. During the first stage available data were validated through an exhaustive search of secondary information and the advice of experts and curators. The process allowed the digitalization of 10000 biological registries from which 3382 are fishes, 3364 mollusks, 967 crustaceans, 884 echinoderms, 691 cnidarians, 410 annelids, 183 algae, 91 sponges, 25 birds y 3 mammals. Similarly, 350 new stations were georeferenced; 1327 scientific names and 1236 common names in Spanish and English were included as complement of species dictionary. At the same time, in the Marine Biodiversity Information System (SIBM) were created mechanisms to facilitate the search for biological registries through advanced searches in 50 related attributes. It was established the possibility for documentation of data from authors that contributed with information and the Cassia tool was implemented for metadata documentation adding 180 new data sets. From the first week of December the information will be free access for IABIN web through the SSTN. According to the agreement, the objectives and activities proposed were completed.

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METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES


El proyecto se desarrolló en dos etapas, en la primera se realizó la búsqueda de información secundaria, validación y digitalización de datos; y posteriormente se llevó acabo la adecuación y acople de la información a través del portal IABIN. A continuación se detallan las actividades: 1. Georreferenciación de las estaciones y validación de coordenadas de los registros biológicos almacenados en el sistema. Se verificaron un total de 806 estaciones y se le asignaron coordenadas geográficas a otras 350. Para ello, se recopiló la información necesaria a partir de los informes finales de proyectos realizados por el INVEMAR u otras instituciones, de artículos científicos, tesis y demás publicaciones relacionadas. Con este mismo objeto fueron revisadas 3580 fichas de especies del MHNMC. La georreferenciación para estaciones de las cuales no se tenía información puntual de sus coordenadas, se realizó por medio del programa Google Earth y ArcGIS 9.0 (sistema de coordenadas WGS-1984), basándose en los datos de localidad, profundidad y hábitat de las especies colectadas en dicha estación; para este procedimiento se contó con la asesoría de un ingeniero catastral. 2. Corrección de inconsistencias y digitalización de los registros biológicos faltantes. Se revisaron en total 13758 registros del MHNMC, distribuidos en 2200 moluscos, 1520 equinodermos, 308 cnidarios, 5190 peces, 2300 crustáceos, 350 poríferos y 1900 algas. A partir de este material se detectaron los registros sin documentar de 1260 peces, 1890 de algas, 600 de crustáceos, 160 de moluscos y 40 de equinodermos. La información correspondiente a estos registros biológicos faltantes fue complementada y corregida, con el objeto de cumplir con el estándar mínimo de documentación para el ingreso en el SIBM, el cual es compatible con los estándares de la REyE. Adicionalmente se verificó la existencia y ubicación física dentro de la colección del museo de 6200 lotes de especimenes. 3. Identificación de material. Material de peces, moluscos y anélidos que no había sido ingresado al MHNMC, fue identificado al nivel taxonómico más bajo posible con la ayuda de los curadores respectivos; se le realizó el proceso de curaduría estándar, se catalogó e ingresó a la colección del Museo. 4. Digitalización nuevos registros. La información de nuevos registros biológicos fue digitada en matrices de EXCEL diseñadas con los campos de ingreso requeridos por el SIBM y que son compatibles con los requerimientos para la documentación de especies y especímenes de IABIN (REyE), cada matriz incluye los siguientes datos: nombre del proyecto donde se obtuvo el material, número de catálogo, número consecutivo en la colección del MHNMC, sección a la que pertenece, identificación de la especie al nivel taxonómico más bajo posible, número de ejemplares en el lote, modo de adquisición, entidad de donde proviene la muestra, lugar de captura (georreferenciado), profundidad, fecha de colecta, persona o entidad que colectó, fecha de identificación, persona que identificó, estado del material al colectarse, método de captura, técnica de identificación, modo de preservación y tipo de material.

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5. Complementación y actualización de Archivos de Autoridad Taxonómica (nombres científicos faltantes). Para que el SIBM reconociera el ingreso de los nuevos registros fue necesario documentar el nombre de las especies con su respectivo autor en los diccionarios de los diferentes grupos. Para ello se consultaron las más confiables bases de datos especializadas para cada grupo, se complementó la información con las autoridades taxonómicas respectivas y los curadores realizaron la validación final. De modo general se usaron las bases de datos Catalogue of Life 2007 Annual Checklist (http://www.catalogueoflife.org/annual-checklist/search.php), Integrated Taxonomic Information System - ITIS (http://www.itis.gov), Smithsonian National Museum of Natural History (http://acsmith.si.edu/emuwebizweb/pages/nmnh/iz/DtlQuery.php), The European Register of Marine Species, MarBEF Data Systems-ERMS (http://www.marbef.org/data/) y Universal Biological Index and Organizer uBIO (http://www.ubio.org/). Consultas más específicas fueron realizadas como se describe a continuación: *Para Crustáceos a nivel suprafamiliar se siguió a Martin y Davis (2001) y para los géneros y especies se consultó la base de datos del Flandes Marine Institute of België (http://www.marinespecies.org/aphia.php?p=search) *En el caso de los moluscos se siguió a Abbott y Boss (1989) y las bases de datos MALACOLOG 4.1.0 (http://www.malacolog.org/), CEPHBASE (http://www.cephbase.utmb.edu) y OBIS Indo-Pacific Molluscan Database (http://data.acnatsci.org/obis/find_mollusk.html). *Para Echinodermata se siguió la clasificación de Mortensen (1928-1977), Deichmann (1930), Paul y Smit (1984) Baker et al. (1986), Messing y Dearborn (1990), Clark y Downey (1992), Hendler et al. (1995). *Para corales se usó Hexacorallians of the World (http://hercules.kgs.ku.edu/Hexacoral/Anemone2/), Octocoral Research Center (http://www.calacademy.org/research/izg/orc_home.html). *Para peces la clasificación fue hecha acorde a lo propuesto por Nelson (2006) y los catálogos en línea de California Academy of Sciences Ichthyology (http://www.calacademy.org/research/ichthyology/catalog/fishcatsearch.html) y Fishbase (http://www.fishbase.org/search.php). *Para anélidos se siguió la clasificación propuesta por Rouse y Fauchald (1997). 6. Enriquecimiento del archivo de nombres vernaculares. El ingreso de nombres vernaculares tanto en español como en inglés se llevó a cabo con base en la información consultada tanto en bases de datos mencionadas, como en los artículos científicos y los Libros Rojos de Peces e Invertebrados de Colombia. 7. Acople información desde el SIBM al portal de IABIN.

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Durante la última semana de noviembre fueron culminados los ajustes requeridos por la herramienta usada como conector, los cuales estuvieron a cargo del equipo técnico de la REyE, con ello se dio


inicio al acople de información entre el SIBM y el portal de IABIN, este proceso estará completo para la primera semana de diciembre y cuando IABIN lo estime conveniente estará disponible para su libre consulta en la Internet.

RESULTADOS PROGRAMADOS Y ALCANCES

Objetivo 1: Ingresar en el Sistema de Información sobre Biodiversidad Marina (SIBM) 10000 registros georreferenciados de especímenes que se encuentran en el MHNMC acorde a los estándares de la Red Temática de Especies y Especímenes (REyE) de IABIN.

Resultado: A partir de 31 proyectos llevados a cabo por el INVEMAR y otras instituciones, cuyo material se encuentra depositado o referenciado en el Museo de Historia Natural Marina de Colombia (MHNMC), se obtuvo información que permitió digitalizar 10000 registros biológicos, de los cuales 5674 son documentados por primera vez y 4326 corresponden a registros cuya información fue complementada y/o corregida con el objeto de cumplir con el estándar mínimo de documentación, ajustándose así al criterio de “nuevo dato” establecido por la REyE. Del total de registros 3382 son peces, 3364 moluscos, 967 crustáceos, 884 equinodermos, 691 cnidarios, 410 anélidos, 183 algas, 91 esponjas, 25 aves y 3 mamíferos. El proceso implicó entre otras actividades, la identificación, catalogación e ingreso en el MHNMC y el SIBM de material de peces, moluscos y anélidos correspondiente a 520 registros biológicos; así como la actualización en el diccionario de 380 nombres y la inclusión de 1044 nuevas especies, 192 géneros, 53 familias y otros 38 epítetos correspondientes a diferentes categorías taxonómicas tales como Clase, Orden y Subphylum, entre otras. De manera complementaria fueron ingresados 1236 nombres comunes (en español e inglés) de peces e invertebrados y se actualizaron 200 referencias bibliográficas. Toda la información fue validada por los curadores y expertos de los respectivos grupos en el MHNMC, así como por el administrador del SIBM y el Coordinador de bases de datos del Sistema de Información.

Objetivo 2: Implementar herramientas que permitan el acceso público en diferentes niveles al Sistema de Información del MHNMC en un ambiente controlado a través del INTERNET.

Resultado: En el marco del proyecto, se realizaron tareas orientadas a facilitar el acceso a los registros biológicos avalados por evidencia conservada en el MHNMC, mediante el desarrollo e incorporación de mecanismos de búsqueda y representación de la información. Específicamente, el usuario tiene opción de efectuar búsquedas avanzadas utilizando criterios para seleccionar valores en alrededor de 50 atributos del registro biológico. También es posible ver una rápida representación espacial de la distribución de la información filtrada. Como servicio adicional se establecieron mecanismos que permiten la navegación en ambas direcciones entre el Catálogo de Especies y los datos relativos a los Registros Biológicos almacenados en el sistema. A fin de fomentar la participación de investigadores en la iniciativa SIBM, es posible ahora obtener datos concretos de la hoja de vida de aquellos que contribuyen con información. El mecanismo promueve

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el reconocimiento de los derechos de autor y aumenta la visibilidad en el ámbito científico de los investigadores.


Objetivo 3. Apoyar la iniciativa institucional para el desarrollo del Sistema de Información de Metadatos que permita a los usuarios determinar la relevancia de un grupo de datos dependiendo de sus necesidades. Resultado: Para la generación de metadatos se instaló y configuró la herramienta CASSIA, desarrollada por el Instituto Alexander von Humboldt, para la documentación de conjuntos de datos de interés para el análisis de la biodiversidad. Al momento se han documentado 130 nuevos conjuntos de datos correspondientes a imágenes provenientes de sensores remotos y 50 conjuntos de datos derivados de proyectos de información adelantados por el SIBM.

LECCIONES APRENDIDAS, PROBLEMAS Y SOLUCIONES VIABLES Tiempo de ejecución de la propuesta. En el caso particular del presente convenio, se comprometió la sistematización de un volumen de información adecuado para los siete meses contemplados de ejecución del proyecto; sin embargo, debido a que se consideró como fecha de inicio el momento de la firma del convenio y no la fecha del primer desembolso, se presentó una recarga de trabajo no presupuestada dado que ya habían transcurrido casi dos meses del plazo estipulado al iniciar actividades. Por esto se recomienda en futuras negociaciones, establecer los plazos de ejecución tomando como punto de partida de las actividades la fecha del primer desembolso de recursos. Herramientas técnicas. Aunque es claro que a la fecha la REyE aún se encuentra en proceso de desarrollo y optimización de las herramientas de digitalización y conectores que deben usarse para la documentación de información en IABIN, es importante que en lo sucesivo los proveedores de datos cuenten con dichas herramientas desde el inicio del proyecto, a fin de que el equipo técnico de ambas partes (proveedores y REyE) puedan hacer los ajustes a que haya lugar con suficiente tiempo y evitar retrasos al final de los proyectos. Informes técnicos. Sería conveniente replantear el tiempo estipulado para entrega del informe de progreso. En nuestro caso IABIN solicitó dicho informe para el octavo mes de ejecución, es decir a un mes de finalizar el convenio. Se considera que si el primero se entrega aproximadamente a la mitad del tiempo de ejecución, permitiría evaluar mejor el progreso de las actividades establecidas.

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