Luis SilióDepartamento de Mejora Genética Animal, Madrid

Genética y mejora del cerdo Ibérico

II Master en Mejora Genética Animaly Biotecnología de la Reproducción

Valencia, 26 de Marzo de 2010

Guión de temas a tratar

1. Singularidad genética del Cerdo Ibérico

2. Producción of Cerdos Ibéricos y Norma de Calidad

3. Selección para Caracteres Reproductivos

4. Selección para Crecimiento y Rendimiento en PiezasNobles

5. Riesgos de la selección: Calidad de Carne y Grasa

6. Marcadores Genéticos: herramientas para selección y trazabilidad

Diversos análisis basados en microsatélites (PigBioDiv) han puesto de manifiestoque la raza Ibérica está bien diferenciada genéticamente respecto a otras razas de cerdos (locales y universales)

Razas Internacionales Razas Locales

Singularidad Genética: distancias microsatélites

No introgresión de genes Asiáticos en su acervo genético

SWB4-5 D6

IB17 D4 D1

L2 IB26 D3 LR1 P1 B

IB15 D2

IB8 MG

SWB1-3 SWB7 D7 DDB

IB23 SWB6

IB22 IB24

IB1-2 IB20 IB9 IB14 IB16

IB18 IB25 IB4 IB5-7 IB10 IB13 IB19

IB3 IB12 IB11 IB21

SwWB ItWB

LW2 P2

D5 LW1 SJ

LR MS1-2

MS6366

71

99

63

51

5099

77

European mtDNA

• Alelo IGF2 g.3072A no presente en cerdos Ibéricos

• Alelo MC1R*2, característico de cerdos negros de origen asiático, ausente en cerdos Ibéricos negros

Asian mtDNA

Singularidad Genética: genes mitocondriales y nucleares

Origen y Conformación del Cerdo Ibérico

• Raza desarrollada en ausencia de un prototipo racial definido y de un gruporeducido de criadores

• Conformación basada exclusivamente en su adaptación durante siglos a lascondiciones ambientales extremas del SO de la Peninsula Ibérica

• Ejemplo de genotipo Ahorradorla abundancia de grasa intramuscular y subcutánea es un mecanismoadaptativo de los cerdos Ibéricos a las oscilaciones de alimentación y climatípicas de la dehesa (ecosistema de Quercus)

Singularidad del Cerdo Ibérico: Genotipo Ahorrador

Obesidad por resistencia a leptinaSingularidad fisiológica de la raza de cerdos Ibéricos

Con exceso de alimento, el genotipoAhorrador da lugar a obesidad pordisfunción de las rutas de regulación de apetito y equilibrio energético

Atribuible a resistencia a Leptina(incapacidad de que niveles altos de leptina reduzcan el consumo voluntariode alimento)

La resistencia a Leptina de los cerdos Ibéricos puede explicarse pormutaciones en el gen del Receptor de Leptina (LEPR) con alta frecuencia en esta raza y efectos sobre apetito, crecimiento tardío y engrasamiento

Comparados con razas porcinas magrasLos cerdos Ibéricos tienen un mayor potencial de consumo de pienso y de acumulación de tejido adiposo (Nieto et al., 2001) compatible conmayores valores de leptina en suero (Fernández-Fígares et al., 2007)

Censo de reproductoras Ibéricas

Grancrisis

Recuperación Censo Expansión

Y relocalización

Crisis actual (2009/2010)• Oferta de productos Ibéricos ampliamente superior a la demanda• Reducción estimada de cerdas Ibéricas ≈ 30%

► Notable volumen de producción: 4 x 106 cerdos sacrificados anualmente(2008) ≈ 10% de la producción porcina nacional con importante valor añadido

► Producción de cerdos pesados (≈160 kg) orientada a la elaboración de productos curados de alta calidad y cotización

► Productos diferenciados en el mercado, etiquetado: origen genético, sistema de producción

► Reciente expansión a nuevos productos (carne, loncheados etc) y exportación a mercados extranjeros (asiáticos?)

Produccion de cerdos Ibéricos

• 900.000 cerdos Ibéricos/año engordados en extensivo(montanera) con 14-18 meses de edad y dirigido al segmento de élite• 3 millones de cerdos Duroc x Ibérico engordados en cebadero y sacrificados con 8-9 meses

Cruzado + Intensivo Puro + Intensivo

Extensivo Montanera

Coste por kg 1.24 € 1.43 € 1.94 €

Coste por cerdo 198 € 229 € 310 €

Enero 2007 Enero 2009

Intensivo Extensivo Montanera

DO Extensivo Montanera Intensivo Extensivo

MontaneraDO Extensivo

Montanera

Precio por cerdo 288 € 416 € 527 € 157 € 260 € 330 €

Reducción 45% 37% 37%

Sistemas y Costes de Producción

Norma de Calidad

La Norma de Calidad regula la producción y etiquetado de los productos de acuerdo con:

• origen racialIbérico (cruce de verraco Duroc y cerda IbéricaIbérico Puro (from purebred Iberian parents included in the Herd Book)

• tipo de engorde finalMontanera (bellota y hierba)

Cebo (pienso comercial)Recebo (mezcla de ambos)

Uso obligatorio de cerdas Ibéricas purasDeterminante en la definición de objetivos de esquemas de selección

Importante para ´producción de puros y de cruzados• Uso obligatorio de cerdas Ibéricas de reducido tamaño de camada y aptitud maternal• Caracteres reproductivos no correlacionados con calidad de carne y grasa

Selección para Caracteres Reproductivos

Cruzados

Puros

Selección para caracteres reproductivosEvaluación Genética

► Abundante informaciAbundante informacióónn disponibledisponible al realizar la evaluación genética de sucesivos partos de cerdas emparentadas con los candidatos/as.

Por Ejemplo:

• Madre (1)

• Hermanas de Madre (2)

• Hermanas de Padre (3)

• Abuelas (2)

• Etc

► Modelo Animal con RepetibilidadModelo Animal con Repetibilidad Y = Xβ + Zu + Wp + e

Registros

Efectos Fijos(Ordinal de Parto, Estación etc.) Valores Mejorantes

Efecto de ambiente permanente

6 7

5 8

7 7

6 8

7 9 9

5 6

5 7 8

7 8 9

► SelecciSeleccióón en Nn en Núúcleo: cleo: no disponibles grandes bases de datos

Respuesta Acumulada en G10RG10 = +1.6 lechones/camada

Consanguinidad AcumuladaF10 = 16%

Varianza Respuesta y Riesgo del programa CV(RG) ≈ 14%

Selección para caracteres reproductivosResultados de simulación de un núcleo

► Modelo Animal con Repetibilidad► Registros de sucesivos partos de madre & cerdas emparentadas

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

1.2

1.4

1.6

1.8

0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10Generación

Aum

ento

lech

ones

por

cam

ada

0

0.05

0.1

0.15

0.2

0.25

Con

sang

uini

dad

Respuesta Esperada

Consanguinidad Esperada

24 M x 240 H

240 M 480 H

Efecto estimado de un ΔF de 10% ΔF cerda ΔF camada

Nº lechones/camada -0.098 -0.072

Nº lechones vivos/camada -0.051 -0.131

Peso camada 21 d, kg -0.983 -1.023

Peso lechón 21 d, kg -0.072 -0.098

Peso lechón 50 d, kg - -0.507

Peso 120 d, kg - -1.175

Peso 240 d, kg - -1.970

Control SimultControl Simultááneo de Riesgo Programa y Depresineo de Riesgo Programa y Depresióón Consangun Consanguííneanea

Recomendable → Moderada aversión al riesgo CV(RG) ≈ 10%◙ Tamaño de Núcleo: 400-1000 cerdas (Núcleo & Granjas de Producción)◙ Alto número de padres (30-40 verracos)

• Fuerte influencia del Ordinal de Parto sobre ambos caracteres• Aumento del nº de destetados limitados por la pobre aptitud maternal • Aconsejables modelos multicarácter de evaluación genética considerando caracteres distintos los registros obtenidos en diferentes ordinales de parto

NBA piglets/litterLitter Weight at 21d

Tamaño de Camada y Aptitud Maternal

Parámetros Genéticos para NBA y LW21d en partos sucesivos de cerdas Ibéricas Torbiscal

Number of born alive piglets per litter (NBA)

Litter Weight at 21 d (LW21)

• Moderada Correlación Genética entre Tamaño de Camada al Nacimiento (NBA) y Aptitud Maternal (LW21)

• Posible mayor ponderación de los partos tardíos para mejorar la baja persistencia de los caracteres reproductivos

Modelo Simplificado: Parámetros Genéticos para NBA y LW21d en cerdas Ibéricas Torbiscal

Selección para Crecimiento

0

30

60

90

120

150

180

0 3 6 10 12 15

Months

Kg Intensively fed

crossbred pigs

Extensively fed purebred pigs

Montanera

• Requisitos de Montanera• Optimo Crecimiento GMD ≈ 0.75 kg/d

GMD > problemas calidad ↓ C18:1GMD < dificultad para alcanzar peso final

EDAD PESO

12 m 100 kg

15 m 160 kg

Bellota y Hierba

% en Canal DU x IB IBJamones 18.6 17.2

Paletas 11.9 11.4Lomos 3.8 3.1

GIM, % 5.3 6.1

La principal deficiencia productiva de los cerdos Ibéricos puros es supobre confomación

El aumento del peso de Paletases relevante pues con < 6 kg se descartan para curación

Distribución de Peso Paleta

Selección para % Piezas Nobles

% Piezas Nobles y Calidad de Carne

DATOS Cerdos Ibéricos Puros de Esquema AECERIBER

Crecimiento Diario (GMD) en Montanera, g/d (n =4,600 animals)% en Canal (n ≅ 6,000)► Jamones► Paletas► Loins

% IMF in longissimus (n = 4,100)% C14:0, C16:0, C18:1 & C18:2 en grasa subcutánea (n = 1,495)

Moderado antagonismo entre % GIM y % Jamones y Paletas

Mean GMD JAM PAL LOMOS GIMGMD 590 g/d 0.46 0.00 -0.03 -0.04 -0.05JAMONES 16.53% 0.40 0.69 0.59 -0.19PALETAS 11.00% 0.48 0.36 0.07LOMOS 2.49% 0.43 -0.23GIM 9.61% 0.37

Datos de 3948 cerdos de esquema AECERIBER

Media h2 GMD JAM PAL LOMO %GIM

C16:0, % 21.4

10.3

52.4

9.4

0.31 0.07 -0.29 -0.45 -0.05 -0.08

C18:0, % 0.41 0.04 -0.25 -0.47 -0.11 -0.06

C18:1, % 0.30 -0.13 0.18 0.33 0.00 0.09

C18:2, % 0.29 0.07 0.43 0.57 0.31 -0.06

% Piezas Nobles y Calidad de Grasa

Heredabilidades de AG y Correlaciones Genéticas con otros caracteres

Correlación positiva con C18:2

Riesgo de aumento indeseable de contenido en linoleico (C18:2) correlacionado con mejora del % de Piezas Nobles

Recomendación

Uso de chips, lectores electrónicos e impresoras de códigos de barras para identificar animales, canales y piezas

Trazabilidad de parto a sacrificio-despiece-muestreo

Problemas de registros de Calidad

Recomendación

Uso de NIRS

Costes analíticos de %GIM y AG

Problemas de registros de Calidad

La mayor parte de las asociaciones SNP/caracteres productivos descritas en cerdos ‘Blancos’ no son útiles en Ibéricos

• SNPs IGF2:g.3072G>A o ESR1 Pvu I no segregantes en la razaIbérica• Efectos no detectados de FABP3 y FABP4 sobre % GIM• Efecto detectado de SNP MC4R Asp298Asn sobre % Piezas Nobles poco útil por la baja frecuencia

Plazo Corto

Utilidad de ciertos SNP (LEPR, MC4R, FABP4, etc) para elegir verracos Durocadecuados para cruce

Largo Plazo

Selección Genómica de cerdos Ibericos para Aptitud Maternal o % GIM

Marcadores Genéticos: herramientas para selección

Función hipotalámica de proteinaLEPR dependiente de:

nivel de señal /circulación LEP engrasamiento

Un ejemplo basado en genotipo Ahorrador

Utilidad de LEPR SNP c.2002C > T para elección de verracos Duroc

Y medio = Sexo + LEPR + COV (P medio) + Departamento + e

Efectos significativos en fases tardías de crecimiento/engrasamiento

Efectos SNP LEPR sobre Apetito y Crecimiento en Duroc x Ibéricos

El efecto + de LEPR c.2002C > sobre el consumo de pienso se refleja en efectos importantes de la sustitución C → T sobre diversos caracteres productivos

y = Sexo + COV (LEPR + EDAD / PVIVO / PCANAL) + Animal + e

+ -

Efectos SNP LEPR sobre Crecimiento y Composición Corporal

El efecto + sobre apetito / espesor de grasa subcutánea conlleva efectos notables sobre la calidad de carne y grasa:+ 1,5% GIM- Pérdidas por Cocinado+ Terneza+ SFA (C16:0 y C18:0) en GIM y Subcutánea- PUFA en GIM y Subcutánea

Efectos SNP LEPR sobre Calidad de Carne y Grasa

Efectos gen MC4R sobre Caracteres de Crecimiento y Calidad en Cerdos Ibéricos

SNP MC4R Asp298Asn asociado en cerdos intensivos a◙ crecimiento/engrasamiento◙ composicion de la canal

Posible selección para SNP MC4R Asp298Asn en Cerdos Ibéricos

Alelo A(Asp298)

+ GMD

- Rendimiento piezas nobles (jamones)

+ GRIN ??

Selección cerdos ibéricos ??

Puros

G? A?Cruzados

A?

Efectos de Haplotipos de mtADN sobre calidad de carne en cerdos ibéricos

Cadena transportadora de electrones/fosforilación oxidativa

Síntesis proteica mitocondrial

Región D-Loop

13 genes síntesis de proteínas

22 genes 22 tRNAs

2 genes rRNAs mitocondriales

Contenido en Proteína y Grasa Intramuscular en Longissimus dorsi

Importancia funcional genes mitocondriales

¿ ?

Efectos de Haplotipos de mtADN sobre calidad de carne en cerdos ibéricos

MATERIAL 319 animales de línea Torbiscal con genealogía completa

permite identificar linajes maternales de cerdas fundadorasfacilita análisis variabilidad mtADN

HAP

LOTI

POS

1430

9

1471

7

1474

0

1526

4

1554

4

1555

8

1557

8

1571

4

1571

5

1574

1

1575

8

1612

7

1613

9

1614

1

SSJ002189 G G C A G A _ T T C T A A A

H1 Ervideira A A . . A . . . C . C G G G

H2 Puebla . A T . . . . C . . C G G G

H3 Caldeira . A . . . . . C . . C G G G

H4 Cam (268, 274, 291) . A . . . . A C . . C G G G

H5 Cam 270 . . . . . T . C . T C . . .

H6 Cam 272 . A . G . . . C . . C . G G

Cyt B D-Loop

Efectos de Haplotipos de mtADN sobre %GIM y %Proteina

%% PPrrootteeiinnaa m, % Media Moda D. T. Intervalo 90% MDP

Heredabilidad, h2 − 0.33 0.33 0.11 0.41 / 0.91 Contraste con haplotipo H2 , %

H1 5.33 0.09 0.09 0.23 -0.29 / 0.46 H3 10.66 -0.49 -0.50 0.18 -0.78 / -0.20 H4 7.21 0.16 0.15 0.23 -0.22 / 0.54 H5 10.03 -0.08 -0.08 0.19 -0.38 / 0.24 H6 25.39 0.05 0.04 0.13 -0.38 / 0.24

Efecto H3 ≅ - 0.41 a – 0.65 % proteina ≅ 2 a 3 % de la Media

%% GGIIMM m, % Media Moda D. T. Intervalo 90% MDP

Heredabilidad, h2 − 0.67 0.68 0.13 0.46 / 0.88 Contraste con haplotipo H2 , %

H1 5.33 -0.17 -0.16 0.76 -1.40 / 1.09 H3 10.66 1.17 1.16 0.61 0.17 / 2.18 H4 7.21 0.35 0.37 0.79 -0.94 / 1.67 H5 10.03 0.08 0.06 0.61 -0.93 / 1.10 H6 25.39 -0.09 -0.11 0.46 -0.87 / 0.66

Efecto H3 ≅ +0.81 a 1.25 % GIM≅ 11 a 18 % de la Media

Posibles mutaciones causales de efectos sobre %GIM y %Proteina

Presentes en H3 y ausentes en los restantes haplotipos mtDNA

SubunidadSubunidad III de III de CitocromoCitocromo OxidasaOxidasa12S RNA12S RNA

Diversos tests genéticos se han propuesto para la autentificación del origengenético (puro o cruzado) de animales y productos frescos y curados

• alelos exclusivos de un pequeño nº de genes• paneles de microsatélites• paneles de 48 SNPs con frecuencias divergentes (dif > 0.80) entre

Duroc e Ibérico

Trazabilidad de origen maternal Ibérico

Frequency of 3 linked diagnosis mtDNA markers for maternal breed identification determined in Iberian and Duroc populations:

Gene SubstitutionPotentialmarker

Iberian(n = 96)

Duroc(n =91)

ATPase6 m.7998C>T C 0.719 0.000

COIII m.9111T>C T 0.719 0.000

Cyt B m.14719A>G A 0.719 0.000

Marcadores Genéticos: herramientas para trazabilidad

Agradecimientos

- AECERIBER- CIA ‘Dehesón del Encinar’, Oropesa, Toledo

- Carmen Rodríguez Valdovinos, Almudena Fernández, Cristina Ovilo, Estefania Alves & Ana Fernández (INIA)

Genética y mejora del cerdo IbéricoDiversidad genética y heterosis entre líneas

II Master en Mejora Genética Animal y Biotecnología de la ReproducciónValencia, 26 de Marzo de 2010

Luis SilióDepartamento de Mejora Genética Animal

< 1960, raza porcina más importante en España (> 600,000 cerdas)

Bien adaptada al aprovechamiento de rastrojeras y de los recursos de la dehesa (bellota y hierba)

Largo ciclo de producción: 16-18 m

Elevado peso de sacrificio:14 @ ≈ 160 Kg

Canales grasos destinados a abasto carne y chacinería local

Antecedentes de la producción de cerdo Ibérico

► Producción orientada a la industria transformadora> 3 x 106 cerdos sacrificados /año en 2007

mayoritariamente con engorde a pienso y en zonas no tradicionales

► Productos diferenciados respecto a procedentes de otras razasOrigen genético, sistema de producción, calidad y precio

► Extensión a nuevos productos (carne, loncheados al vacío)

Recuperación de la producción de cerdo Ibérico (> 1990)

Coexistencia de diversas variedades negras y coloradas de ámbito comarcal

Tardía definición de prototipo racial y LG

Diferencias productivas asociadas a diferencias morfológicas

RubioManchado de Jabugo

Negros lampiños

Retintos

Diversidad genética entre variedades tradicionales

Diversidad entre y dentro de razas porcinas locales e internacionales

AnAnáálisis de 55 razas porcinas Europeas lisis de 55 razas porcinas Europeas basado en 50 microsatbasado en 50 microsatééliteslites

SWB4-5

D6 IB17 D4

D1 L2

IB26 D3 LR1 P1 B IB15

D2 IB8

MG SWB1-3

SWB7 D7 DDB

IB23 SWB6

IB22 IB24

IB1-2 IB20 IB9 IB14 IB16

IB18 IB25 IB4 IB5-7 IB10 IB13 IB19

IB3 IB12 IB11 IB21

SwWB ItWB

LW2 P2

D5 LW1 SJ

LR MS1-2

MS6366

71

99

63

51

5099

77

Arbol filogenético de 56 haplotipos de jabalíes y cerdos domésticos de tipos Asiático y Europeo determinados a partir de secuencias Cyt B y D-loopen mtADN

Europeo

Asiático

Evidencia de diversidad genética mitocondrial en cerdos Ibéricos

• Notable variación genética intra-raza en Ibérico• No hay evidencia de introgresión de razas Asiáticas en el cerdo Ibérico

► Censo: Reducción drástica debido a◙ Peste Porcina Africana◙ Depreciación de grasa animal◙ Importación de razas de cerdos magros

► Estructura: cruces no controlados con razas de capa oscura (Duroc, Large Black) ⇒ dependencia de un pequeño nº de ganaderías suministradoras de Ibéricos puros

► Variedades amenazadas (Rubio, Negros lampiños) por su bajo rendimiento productivo

Crisis del cerdo Ibérico (1960-1990)

x IB

IB x IB

DU x IB

1/4DU ,3/4IB

x IB

Oropesa ( Toledo )

Diferencias entre variedades de Cerdo IbéricoEstudios en el Centro de ‘El Dehesón’ (1944-1974)

Dourado AlentejanoErvideira

RetintoCaldeira Negro Lampiño

Puebla

Negro Lampiño Campanario

SWB4-5

D6 IB17 D4

D1 L2

IB26 D3 LR1 P1 B IB15

D2 IB8

MG SWB1-3

SWB7 D7 DDB

IB23 SWB6

IB22 IB24

IB1-2 IB20 IB9 IB14 IB16

IB18 IB25 IB4 IB5-7 IB10 IB13 IB19

IB3 IB12 IB11 IB21

SwWB ItWB

LW2 P2

D5 LW1 SJ

LR MS1-2

MS6366

71

99

63

51

5099

77

Europeo

Asiático

Diversidad genética mitocondrial en estirpes fundadoras

D-Loop Citocromo B

Hap

loti

pos

Posiciones nucleotídicas 15

544

1555

8

1557

8

1561

5

1569

4

1571

4

1571

5

1571

7

1574

1

1575

8

1612

7

1613

9

1614

1

1426

4

1430

9

1471

7

1474

0

1501

7

1526

4

AJ002189 G A - T C T T C C T A A A T G G C T A H1 Ervideira (52, 136), LV A . . . . . C . . C G G G . A A . . . H2 Puebla (214), MR . . . . . C . . . C G G G . . A T . . H3 Caldeira (1) . . . . . C . . . C G G G . . A . . . H4 Campanario (268, 274, 291)

CO, DB1, EP . . A . . C . . . C G G G . . A . . .

H5 Campanario (270) . T . . . C . . T C . . . . . . . . . H6 Campanario (272), IJ1, DB2 . . . . . C . . . C . G G . . A . . G H7 MA, MRS . . . . T C . . . C G G G . . A . . . H8 JCR, JS . . . . . C . . . C . G G . . A . . . H9 IJ2 . T . . . C . . . C G . . C . . . . . H10 AB . T . C . C . . . C G . . . . . . . . H11 CA . . . . . C . T . . G . . . . . . . . H12 TG . . . . . C . . . . G . . . . . . . . H13 AC . . . . . C . . T C G . G . . A . . . H14 FV . T . . . C . . . C G . . . . . . . .

H2 Puebla

H3 CaldeiraH4 Campanario

H5 Campanario

H6 CampanarioH1 Ervideira

Heterosis entre variedades de Cerdo IbéricoEstudios en un Cruce Dialélico Completo (4 x 4)

P1 C12 C13 C14

C21 P2 C23 C24

C31 C32 P3 C34

C41 C42 C43 P4

Heterosis = Diferencia Cruzados (C) – Puros (P)

Ervideira Campanario Caldeira Puebla

Cruce DialélicoCrecimiento entre destete y 95 Kg de cerdos de estirpes puras y de sus cruces

con alimentación restringida (R) y próxima a apetito (A)

DATOS

◙ 14.037 registros de peso de 1.274 animales en Ensayo R

◙ 3.280 registros de peso de 450 animales en Ensayo A

Cruce DialélicoCrecimiento entre destete y 95 Kg de cerdos de estirpes puras y de sus cruces

con alimentación restringida (R) y próxima a apetito (A)

ANALISIS YRESULTADOS

50 100 150 200 250 300 350 400 450 500

Days

0

20

40

60

80

100

120Weight (kg)

A Trial R Trial

Crossbred Purebred

Ensayo P120d GMD

Apetito 12,1 % 10,9 %

Restringida 14,1 % 14,6 %

Heterosis (h) en % de Media

Mayor heterosis en condiciones adversas (alimentaciMayor heterosis en condiciones adversas (alimentacióón restringida) n restringida)

Modelo Animal: Y = Xβ + Zu + Wc + e

Registros

Efectos Fijos(Banda, Sexo, Heterosis) Valores Mejorantes

Efectos de ambiente camada

Estirpe materna

Estirpe paternaErvideira

(48)Caldeira

(54)Campanario

(48)Puebla

(58)Total(208)

Ervideira (8) 64 31 31 30 156Caldeira (7) 29 70 18 28 145Campanario (9) 26 24 71 29 150Puebla (8) 18 18 25 67 128Total (32) 137 143 145 154 579

Cruce DialélicoCrecimiento en montanera de cerdos Ibéricos de estirpes puras y de sus cruces

ANIMALES

50

80

110

140

170

200

340 390 440 490días

peso

x14 M

yij= ai + bi xij

y

Cruces

Líneas Puras

Caracteres analizados: P14M y GMD

Cruce DialélicoCrecimiento en montanera de cerdos Ibéricos de estirpes puras y de sus cruces

DATOS

Parideras 3Animales en genealogía 980Animales con datos crecimiento en montanera 579

Machos 287Hembras 292Con 1 pesada 71Con 2 pesadas 2Con 3 pesadas 278Con 4 pesadas 252

Edad media comienzo de montanera (días) 356Edad media al sacrificio (días) 461Peso medio al sacrificio (kg) 156

0 8 13 19 24 29 37 46

M IIb

M IIc

M IIa

-0.09 -0.01 0.03 0.07 0.11 0.19

M IIbM IIc

M IIa

GMD (GMD (kgkg/d)/d)PP14M14M ((kgkg))

h = 10 -16% de media h = 6 -10% de media

Cruce DialélicoHeterosis (h) para Ganancia Media Diaria en montanera y Peso a 14 meses

RESULTADOS

Resumen de valores de Heterosis para diferentes caracteres de Crecimiento estimados en el Cruce Dialélico entre 4 estirpes tradicionales

HeterosisCarácter Media D.T. Unidades % de Media Peso final recría, kg 77,67 10,80 10,22 kg 14,7 % Peso final ceba, kg 165,20 17,18 15,44 kg 10,1 % Peso canal, kg 135,10 15,00 14,55 kg 11,8 % GMD en recría, g/dia 229 30 29 g/dia 14,2 % GMD en ceba, g/dia 651 79 44 g/dia 7,1 %

•• Valores notables de heterosis entre estirpesValores notables de heterosis entre estirpes

•• InterInteréés productivo del cruce entre ls productivo del cruce entre lííneas de Ibneas de Ibééricorico

Cruce Dialélico entre estirpes fundadorasHeterosis (h) para tamaño de camada

Estirpe Estirpe Materna Paterna Ervideira Campanario Caldeira Puebla Ervideira 7,46 7,74 7,79 7,84 Campanario 7,62 7,09 7,56 7,73 Caldeira 8,08 7,22 7,21 7,41 Puebla 7,64 7,55 7,77 7,43 Heterosis (h) = Diferencia entre medias de cruces y líneas puras 0,56 lechones nacidos vivos por camada 0,49 lechones nacidos por camada

Análisis de registros de 2.768 camadas nacidas de 817 cerdas Ibéricas en los 16 cruces posibles entre 4 estirpes

Heterosis para tamaño de camada limitada al 2º parto y sucesivos

NBA1≥ Dam lines

Sire lines (a) (b) (c) (d)

(a) 5.11 5.19 6.65 6.20

(b) 5.23 5.87 6.66 5.97

(c) 5.71 5.52 6.35 6.08

(d) 5.51 5.77 6.39 5.97

Heterosis NBA1= 0.10 ± 0.15 NS

NBA≥2 Dam lines

Sire lines (a) (b) (c) (d)

(a) 7.00 7.65 7.70 7.64

(b) 7.41 6.92 7.58 7.74

(c) 8.10 7.66 6.96 6.88

(d) 7.22 7.48 7.76 6.75

Heterosis NBA≥2 = 0.65 ± 0.15 ***

NBA1 y NBA ≥2

Caracteres parcialmente controlados por diferentes genes ρG = 0.74

¿Diferencias productivas entre líneas actuales de Ibérico?¿Subsiste la heterosis entre ellas?

• Diversos estudios de comparación productiva entre lineas y variedades de cerdo Ibérico• Pocos de comparación de caracteres reproductivos y con estimas de heterosis

Estudios incluyendo la línea Torbiscal: sintética de Ervideira, Campanario, Caldeira y Puebla

Valores con distintos superíndices difieren estadísticamente al 5%

Crecimiento y características de canal en cerdos Torbiscal (TOR, n =40), Retintos(VAL, n =46; ROL, n =49) y Negro Lampiños (LRZ, n =47)

Diferencias productivas entre algunas líneas actuales de cerdos Ibéricos

* GUA = Guadyerbas, Negro Lampiño del GuadianaValores con distintos superíndices difieren estadísticamente al 5%

Crecimiento y características de canal en cerdos Torbiscal (TOR, n =23), Retintos (VAL, n =25; RSP, n =45) y cruces VAL x TOR (n =46), VAL x GUA* (n =46) y TOR x GUA (n =46)

Diferencias productivas entre líneas de cerdos Ibéricos y sus cruces

* NLS = Negro Lampiño de la Serena; RVM y RSP = RetintosValores con distintos superíndices difieren estadísticamente al 5%

Crecimiento y características de canal en cerdos Torbiscal (TOR, n =24), Retinto (VAL, n =24) y cruces VAL x NLS* (n =47), VAL x RVM* (n =39), TOR x RSP* (n =49) y TOR x NLS (n =43)

Diferencias productivas entre líneas de cerdos Ibéricos y sus cruces

Tipo Genético Nº de lechones Peso camada

Madre Total Vivos 21 d Nacim. 21 d

Valdesequera 9,3b 8,3 7,0b 12,1b 35,8b

Vald x Torbiscal 10,0a 8,7 7,2b 12,8a 38,6ª

Vald x Guadyerbas 9,9a 8,7 7,6a 12,6a 37,8a

Medias de los tres primeros partosValores con distintos superíndices difieren estadísticamente al 5%

Tamaño y Peso de Camada de cerdas Ibéricas de tres tipos genéticos

Heterosis maternal entre líneas actuales de cerdos Ibéricos

Detección de haplotipos de tipo Negro Lampiño (H4 y H6) o DouradoAlentejano (H1) en ganaderías de tipo Retinto

Flujo genético via materna con introgresión entre variedades tradicionales

¿Extrapolación a otras líneas actuales de Ibérico?Evidencia de mestizaje entre variedades tradicionales en el último período

Identificación de un cluster mayoritario de animales adscritos a las variedades Retinto, Lampiño y Entrepelado

Estratificación y mestizaje entre tipos genéticos tradicionales

Flujo genético entre variedades negras y coloradas

Presencia de alelos MC1R*3 (color negro) en poblaciones de cerdos Retintos y de alelos MC1R*6 (colorado) en Negro lampiños

◙ mtADN

◙ Análisis de subestructura basado en µsat

◙ Alelos de gen color de capa MC1R

Haplotipos tradicionales ADN mitocondrial compartidos por diversas variedades

D-Loop Citocromo B

Hap

loti

pos

Posiciones nucleotídicas 15

544

1555

8

1557

8

1561

5

1569

4

1571

4

1571

5

1571

7

1574

1

1575

8

1612

7

1613

9

1614

1

1426

4

1430

9

1471

7

1474

0

1501

7

1526

4

AJ002189 G A - T C T T C C T A A A T G G C T A H1 Ervideira (52, 136), LV A . . . . . C . . C G G G . A A . . . H2 Puebla (214), MR . . . . . C . . . C G G G . . A T . . H3 Caldeira (1) . . . . . C . . . C G G G . . A . . . H4 Campanario (268, 274, 291)

CO, DB1, EP . . A . . C . . . C G G G . . A . . .

H5 Campanario (270) . T . . . C . . T C . . . . . . . . . H6 Campanario (272), IJ1, DB2 . . . . . C . . . C . G G . . A . . G H7 MA, MRS . . . . T C . . . C G G G . . A . . . H8 JCR, JS . . . . . C . . . C . G G . . A . . . H9 IJ2 . T . . . C . . . C G . . C . . . . . H10 AB . T . C . C . . . C G . . . . . . . . H11 CA . . . . . C . T . . G . . . . . . . . H12 TG . . . . . C . . . . G . . . . . . . . H13 AC . . . . . C . . T C G . G . . A . . . H14 FV . T . . . C . . . C G . . . . . . . .

Detección de haplotipos de tipo Negro Lampiño (H4 y H6) o DouradoAlentejano (H1) en ganaderías de tipo Retinto

Flujo genético via materna con introgresión entre variedades tradicionales

Evidencia de subestructura genética subyacente a la aparenteDeterminada por BAPS con modelo de agrupamiento individual

Duroc (64) Entrepelado (27) Retinto (50) Lampiño (30) Torbiscal (31)Guadyerbas (32)

B C

AA47 Duroc

BB9 Duroc

CC8 Duroc

D D Pool 78 Ibéricos( 27 Entrepelado; 18 Lampiño; 33 Retinto)

EE32 Guadyerbas

FF31 Torbiscal

GG12 Lampiño

HH10 Retinto

II7 Retinto

AgrupaciAgrupacióón de 234 animales en 9 clusters genn de 234 animales en 9 clusters genééticos (A ticos (A -- I)I)

◙◙ EstratificaciEstratificacióón de variedades de Ibn de variedades de Ibééricorico◙◙ IdentificaciIdentificacióón de un cluster mayoritario de animales adscritos a n de un cluster mayoritario de animales adscritos a las variedades Retinto, Lampilas variedades Retinto, Lampiñño y Entrepeladoo y Entrepelado

Evidencia de mestizaje basada en 36 marcadores genéticosDeterminada por BAPS con modelo con mestizaje (M) entre poblaciones

Duroc (64) Entrepelado (27) Retinto (50) Lampiño (30) Torbiscal (31)Guadyerbas (32)

ProporciProporcióón de animales en los que el modelo M explicativo de su n de animales en los que el modelo M explicativo de su composicicomposicióón genn genéética es mtica es máás probable que el modelo sin mestizajes probable que el modelo sin mestizaje

0/64 12/27 13/50 0/32 13/30 0/31B C

Estratificación y mestizaje entre tipos genéticos tradicionales

Especialización de líneas de cerdo Ibérico

A REMARCAR

◙ Las líneas de cerdos Ibéricos presentan una diversidad genética importante para caracteres de interés económico◙ Esta variabilidad debería utilizarse cautelosamentecautelosamente para el desarrollo de las líneas actuales en lineas especializadas paternas y maternas◙ La utilización de cruces entre líneas de cerdo Ibérico es especialmente recomendable para la producción en montanera basada en Ibéricos puros