gate y la experiencia cubana e-infrastructure shared between europe and latin america henry ricardo...
TRANSCRIPT
![Page 1: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/1.jpg)
Gate y la experiencia Cubana
www.eu-eela.org
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
Henry Ricardo MoraCUBAENERGIA –- CUBAForo sobre Tecnologías GRID aplicadas al Clima y a la Biomedicina Octubre 2007
La aplicación GATE y la experiencia Cubana
![Page 2: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/2.jpg)
2Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin AmericaGATE
GATE Es la aplicación para la tomografía por emisión basada en GEANT4
La idea surge en el año 2001 durante un Workshop en Paris al cual asisten numerosos grupos interesados en la utilización del método de Monte Carlo para la simulación en el campo de la medicina nuclear.
![Page 3: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/3.jpg)
3Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin AmericaGATE
Se llegó al consenso de crear una herramienta con las bondades de los programas dedicados y los de propósito general.
Punto de partida: GEANT4 una aplicación para el análisis del paso de las partículas a través de la materia
•Lausanne PET instrumentation group
•Geant4 Low Energy Electromagnetic Physics working group,
• Clermont-Ferrand corpuscular physics for life science group,
• Ghent medical image and signal processing group.
4 Grupos de trabajo
![Page 4: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/4.jpg)
4Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin AmericaGATE
Año 2002 • Primera demostración en vivo
de la aplicación
• Se funda la OpenGate Collaboration con el fin de mejorar, documentar, probar la aplicación con vistas a una distribución pública
Año 2004• Primera distribución pública
![Page 5: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/5.jpg)
5Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
PROPOSITOS
• Diseño de nuevos dispositivos de imágenes
• Implementación de nuevos algoritmos de reconstrucción de imágenes
• Optimización de protocolos de escaneo
• Planificación de tratamientos de radioterapia - - Electron
- - photon- - Electron- - photon
![Page 6: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/6.jpg)
6Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
CARACTERISTICAS DEL CODIGO
• Utilización del método de Monte Carlo
• Basado en las bibliotecas del GEANT4 (toolkit desarrollado para la simulación en el área de las interacciones de las partículas con la sustancia)
• Uso de scripts (Macro lenguaje) para la descripción de la simulación
• Instalación en los nodos de trabajo de un cluster
![Page 7: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/7.jpg)
7Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
Necesidad en CUBA
Calculation ofdeposit dose on the tumor
(~1mn):A treatment plan is
developed using the images
• Varios hospitales con servicios de medicina nuclear• Adquisición de nuevos equipamientos• Inversiones en este campo
![Page 8: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/8.jpg)
8Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
ASIMILACION - INSTALACION
• VALENCIA
- Filosofía General del software
- Instalación y configuración
• CUBAENERGIA
- Instalación en los nodos de trabajo- Corrida de casos de prueba
![Page 9: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/9.jpg)
9Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
Detector : Sistema PhoswitchPhantom : Cilindro de agua
Fuente : Oxígeno 15 Adquisición Dinámica: 18 frames of 1 second
Sistema CylindricalPET para imagenes de animales pequeños
![Page 10: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/10.jpg)
10
Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
SPECT BENCHMARK
Camara : 4 cabezas a 90°Phantom : Cilindro agua
Fuente : Tc-99m (energía: 140 keV) Actividad: 30 kBq Adquisición Dinámica: Mobil source
![Page 11: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/11.jpg)
11
Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
Fichero ROOT de salida
![Page 12: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/12.jpg)
12
Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
ETAPA ACTUAL
Preparación de los casos reales para realizar las pruebas en el sitio GRID local
Scanner slices DICOM format
Matrice binaire codée en 16 bits regroupant les n- coupes scanner
An
on
ymis
atio
n
Concaténation
512
512
n-co
upes
Planificación del tratamiento
utilizando el GATE
![Page 13: Gate y la experiencia Cubana E-infrastructure shared between Europe and Latin America Henry Ricardo Mora CUBAENERGIA –- CUBA Foro sobre](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022051515/552d051f550346df7a8b45b2/html5/thumbnails/13.jpg)
13
Gate y la experiencia Cubana
E-infrastructure shared between Europe and Latin America
Preguntas