filogenia – Árboles filogenéticos. filogenia filogenia – Árboles filogenéticos filogenia y...
TRANSCRIPT
![Page 1: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/1.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
![Page 2: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/2.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia
![Page 3: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/3.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia y genealogía
![Page 4: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/4.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
La filogenia reproduce la trayectoria evolutiva del taxón
![Page 5: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/5.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Un árbol evolutivo es una hipótesis
![Page 6: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/6.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia basada en la morfología
![Page 7: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/7.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenética
![Page 8: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/8.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árbol basado en caracteres morfológicos
![Page 9: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/9.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Datos moleculares vs. datos morfológicos
![Page 10: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/10.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Análisis filogenético
![Page 11: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/11.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticosUn árbol filogenético es un gráfico bidimensional que muestra
relaciones evolutivas entre organismos o, en el caso de secuencias, entre determinados genes de diversos organismos.
Árbol filogenético
Gene tree
Species tree
![Page 12: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/12.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
¿Para qué se puede utilizar la filogenética?
![Page 13: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/13.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
The tree of life vs. the web of life
![Page 14: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/14.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
![Page 15: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/15.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Terminología (1)
![Page 16: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/16.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Terminología (2)
![Page 17: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/17.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticosLos nodos terminales
(hojas) representan a los distintos taxa. Todos ellos
son contemporáneosCada una de las
unidades filogenéticas representadas en el árbol es un taxón (plural taxa)raíz
Estructura de un árbol filogenético (1)
Nodos terminales
(hojas)
La raíz representa al “último ancestro común” del que
derivan todos los taxa representados
en el árbol
![Page 18: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/18.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Nodos internos
Las relaciones entre los distintos taxa se indican mediante nodos y ramas
Cada nodo es una bifurcación de la
ruta evolutiva que da lugar a dos
especies distintas.
De cada nodo surgen dos ramas (árbol binario), que evolucionarán de forma
distinta.
ramasLa longitud de cada rama representa el número de
cambios producidos antes de llegar a la
siguiente bifurcación
Estructura de un árbol filogenético (2)
![Page 19: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/19.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Estructura de un árbol filogenético (3)
![Page 20: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/20.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El grupo externo y los clados
raíz
Grupo externo
Clado (equinodermos)
Ancestro común del clado
![Page 21: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/21.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Clados y cladogramas
Un clado es un conjunto de especies emparentadas
(que comparten un antepasado común). Su
representación gráfica se denomina cladograma.
Varios clados se pueden agrupar en un clado de
orden superior
![Page 22: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/22.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticosUn cladograma se puede
representar de muchas maneras. Lo único que importa es el orden en el que se suceden las diversas
bifurcaciones, es decir, su topología. Todos los cladogramas de esta figura son equivalentes.
Topología del árbol
![Page 23: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/23.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticosLa forma del árbol y
las bifurcaciones que contempla constituyen
su “topología”.
Estos cuatro árboles son equivalentes. Se puede rotar cualquier nodo interno sin que cambie la topología
porque esta operación no cambia el
agrupamiento de las especies.
Topología del árbol (2)
![Page 24: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/24.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
![Page 25: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/25.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
La flecha del tiempo
![Page 26: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/26.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Cladogramas y filogramas
![Page 27: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/27.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
En un cladograma, la longitud de las ramas no contiene
ningún tipo de información. Sólo indican en qué orden se
sucedieron las ramificaciones.
En un filograma, la longitud de las ramas es proporcional a la divergencia. Suelen incluir una escala que indica los cambios
acumulados con el tiempo.
Cladogramas y filogramas
![Page 28: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/28.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Con moléculas: la hipótesis del reloj molecular
![Page 29: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/29.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El citocromo c es un reloj molecular
![Page 30: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/30.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Inconvenientes de la hipótesis del reloj molecular
![Page 31: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/31.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El registro fósil es el mejor reloj evolutivo
![Page 32: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/32.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Filogenia con escala temporal
![Page 33: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/33.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El registro fósil ayuda a construir o modificar árboles filogenéticos
![Page 34: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/34.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Tipos de árbol
![Page 35: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/35.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles con raíz y sin raíz
![Page 36: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/36.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Anatomía de los árboles filogenéticos
5 nodos terminales (OTU)
Nodos internos
Ramasn externas
(n-2) internas
nn-1
2n-2 2n-3
nn-2
n externas
(n-3) internas
![Page 37: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/37.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles con raíz
Un árbol evolutivo con raíz muestra las
relaciones evolutivas que hay entre
secuencias que proceden de un mismo
ancestro y el orden cronológico en que tuvieron lugar las
diversas ramificaciones. También puede mostrar qué especies presentan una velocidad evolutiva
elevada.
![Page 38: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/38.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles sin raíz
Un árbol evolutivo sin raíz también muestra
las relaciones evolutivas que hay entre las diversas
secuencias pero no especifica la ubicación
del último ancestro común ni el orden temporal en que
tuvieron lugar las diversas
ramificaciones. La longitud de cada rama
es proporcional a la distancia evolutiva.
![Page 39: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/39.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles escalados y sin escalar (1)
![Page 40: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/40.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árboles escalados y sin escalar (2)
![Page 41: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/41.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Posibles combinaciones
![Page 42: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/42.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Bosques filogenéticos (1)
![Page 43: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/43.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Bosques filogenéticos (2)
![Page 44: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/44.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
Árbol verdadero y árboles inferidos
![Page 45: Filogenia – Árboles filogenéticos. Filogenia Filogenia – Árboles filogenéticos Filogenia y genealogía](https://reader033.vdocuments.mx/reader033/viewer/2022061500/5665b45a1a28abb57c90c869/html5/thumbnails/45.jpg)
Filogenia – Árboles filogenéticos
El formato Newick