expresie genica

Upload: ancuta-ciocan

Post on 13-Oct-2015

52 views

Category:

Documents


0 download

DESCRIPTION

curs

TRANSCRIPT

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    1/39

    1

    EXPRESIGENIC

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    2/39

    2

    Date generale

    dou procese corelate funcional:

    transcripiai translaia;

    necesit: un sistem de transferal informaiei genetice

    din nucleul celulei n citoplasm;

    un cod genetic.

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    3/39

    3

    Date generale

    Replic

    are

    ARNm

    Transcripie

    ADN

    Translaie

    PROTEINE

    Expresia genic este supus unui control riguroscare regleaz:

    tipul de celul n care are loc sinteza proteinei, momentul, cantitatea si ritmul

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    4/39

    4

    Date generale

    Transfer general:ADN ADN= replicare;ADN ARNm= transcripie

    ARNm

    proteine= translaie;

    Transferspecial:ARN ARN - replicarea unor virusuri;

    ARN ADN(transcripia invers) celule

    infectate cu retrovirusuri.

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    5/39

    5

    Date generale

    Transferul informaiei ADN proteine:

    transcripiaformare ARN mesager precursor;

    formareaARNm matur;

    transportulARNm din nucleu la ribosomi;

    translaiasinteza proteine;

    procesarea post-translaional;

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    6/39

    6

    Transcripia

    1. Diferene ADN ARN

    2. Formarea ARNm precursor

    3. Maturarea ARNm

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    7/39

    7

    Transcripia1. Diferene ADN ARN componenta glucidic pentoza - este

    r iboza, n loc de deoxiriboz;

    n ARN, timina din ADN este nlocuit deuraci l, astfel cele patru baze azotate aleunei molecule de ARN sunt: adenina,guanina, citozina i uracilul;

    moleculele de ARN sunt monocatenare.

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    8/39

    8

    ARN= polimer de ribonucleotide:[PRN]n

    ARN ADN:

    riboz, uraciln loc de timin, micropolimer, monocatenar.

    ARN: codant= ARNm necodant( gene ARN) cu roluri multiple: - n translaie(ARNr i

    ARNt);

    - n reglare(ARNmi; ARNsi; ARNa);- n procesareaaltor molecule ARNsn),- parazit(retrovirusuri; retrotranspozoni)

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    9/39

    9

    Transcripia2. Mecanismul transcripiei

    copierea unui segment limitat din molecula deADN.

    transcripia se face pe o singur caten amoleculei de ADN..

    catena transcris are ntotdeauna o polaritate 3' 5'.

    catena transcris = matri pentru ARNm (TA,GC, CG, AU).

    molecula de ARNm polaritate i secvennucleotidic identic cu catena de ADNnetranscris.

    catena netranscris= caten sens, catena transcris= caten antisens.

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    10/39

    10

    5'...ATGTTACGACGT... 3' catena "sens"

    3'...TACAATGCTGCA... 5 catena "antisens"

    (transcris)

    Transcripie

    5'...AUGUUACGACGU... 3' ARNm

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    11/39

    11

    U.M.F IAI

    FORMAREA ARNm PRECURSOR

    Expresia genicpresupune mainti decondensarea regiuniidin ADNcare conine gena /genele ce vor fi transcrise

    prin: acetilarea histonelor din

    nucleozomice reducecondensarea filamentului cunucleozomi;

    repoziionarea nucleozomilor.Ambele mecanisme sunt

    implicate n REGLAREAexpresiei genelor

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    12/39

    12

    Transcripia3. Formarea preARNm Iniierea transcripiei - regiunea promotor

    a genei, prin fixarea factorilor proteici detranscripie.

    gene cu exprimare specific tisular fixare TBP(TATA-bind ing pro tein) nregiunea TATA a promotorului atragereaaltor factori proteici complex ADN-proteine fixare ARN-polimeraz IIlaaproximativ 25 pb n aval de situsul TATA

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    13/39

    13

    Transcripia3. Formarea preARNm

    fixarea ARN-polimerazei II fixare ADN-helicaz

    scindare legturi de hidrogen. creterea catenei de ARNm n direcia 5 3

    formare de legturi estericentre riboza i acidulfosforic.

    copiere exoni + introni t ransc r ipt pr imar saupreARNm. n momentul n care ARNpol ntlnete situsul de

    terminare a transcripieiAATAAA(aval de ultimulexon) se semnaleaz clivarea 3 a transcriptului

    primar; ARNm precursor va fi secionat(de nite

    nucleaze) n dreptul situsului de poliadenilare la18-20 pb n aval (zon bogat n pb GC)

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    14/39

    14

    Transcripia3. Maturarea preARNm n regiunea 5 a moleculei este adugat un

    rest de 7-metilguanin rezisten laaciunea ribonucleazelor din citoplasm;

    o ribonucleaz secioneaz preARNm la11-30 de nucleotide n aval de situsulAAUAAA fixare poliA-polimeraza ataarea mai multor nucleotide cu adenin

    (50-250) "coad poliadenilic stabilizare preARNm n timpultransportului din nucleu n citoplasm

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    15/39

    15

    Transcripia3. Maturarea preARNm Matisare

    secionarea capetelor intronilor + eliminareaintronilor racordarea exonilor;

    la nivelul sp l iceosomi lor(organite citoplasmatice)- ribonucleoproteine mici de tipul snRNA fixarepe balizele dinucleotidice ale intronilor: GU iAG;

    Secionare enzimatic;

    Excludere introni; Racordare exoni.

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    16/39

    16

    TRANSCRIPIA INVERS

    ADN ARN

    transcripie invers

    T. Invers = transcrierea unei molecule de ARNmonocatenarntr-o caten de ADNc, care va deveni apoibicatenar (prin sinteza unei catene complementare).

    Realizat de ctre transcriptaza invers / reverstranscriptaz (H. Temin i D. Baltimore, Pr. Nobel, 1975).

    Utilizatde: virusurile ARN; retrotransposoni, telomerazprecum i n tehnologiile ADN, pentru obinerea de gene

    U.M.F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    17/39

    17

    Translaia

    1. Aparatul de translaie

    2. Codul genetic

    3. Etapele translaiei

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    18/39

    18

    paratul de translaie1. ARNm matur

    2. Ribosomii

    3. ARN transfer

    4. Proteine

    5. Surse energetice

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    19/39

    19

    paratul de translaie1. ARNm matur 2 zone netranslate laterale

    1 regiune central translat

    5UTR Secvena translat 3UTR

    7-CH3-G AUGUAA---AAAAA

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    20/39

    20

    paratul de translaie2. Ribosomi

    (Palade, Pr. Nobel, 1974) = platformele de asamblarea AA n Pr;

    complexe macromoleculare (ARNr + proteine)

    asamblare la debutul translaiei

    subunitate mic (30S) + subunitate mare (50S) ribosom activ (70S): situs de fixare ARNm;

    situs aminoacil situs peptidil

    situs de ieire

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    21/39

    21

    paratul de translaie3. ARNt 40 de tipuri,

    80 de nucleotide,

    dou funcii:

    fixare specific aminoacid

    recunoate codonul corespunztor aminoacidului

    dou situsuri funcionale: aminoaci li

    ant icodon

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    22/39

    22

    paratul de translaie4. proteine

    Factori reglatori:

    factori de iniiere specifici(IFinitiation factor),

    factori de elongaie(EFelongation factor)

    factori de eliberare (RFrelease factor).

    Enzime:

    aminoacil-ARNt-sintetaze, peptidil transferaza

    translocaza,

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    23/39

    23

    paratul de translaie5. Surse energetice

    acidul adenozin-trifosforic (ATP)

    acidul guanozin-trifosforic (GTP)

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    24/39

    24

    Codul genetic

    sistem de coresponden ntre oanumit succesiune de nucleotide dinstructura unei molecule de ARNm i unanumit aminoacid din structura peptideisintetizat pe baza informaiei geneticea moleculei de ARNm

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    25/39

    25

    Codul genetic Proprieti:

    t r iplet ;

    fr echivoc

    degenerat

    are o serie de codoni special i : AUG; UAA, UAG, UGA

    lipsit de semne de punctuaie nesuperpozabil universal

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    26/39

    26

    U.M.F IAICunoaterea codului genetic nelegerea mecanismelor mutaiilorSubstituia unui nucleotid

    AUG UGU AAA CCAMet cis lys pro

    MUTAIE SILENTIOAS(silent m.) MUTAIE CU SENS GRESIT(missens m .) MUTATIE NONSENS(nonsens m.)

    AUG UGC AAA CCAMet cis lys pro

    AUG UGG AAA CCAMet trp lys pro

    AUG UGA AAA CCAMet Stop................

    Inseria sau deleia unui nucleotidAUG UUU AAA GUU UCGMetPheLysVal Ser

    Mutaii f rameshi f t(mutaii cu decalarea cadrului)

    AUG UUU GAA AGU UUC GMetPhe GluSerPhe

    AUG UUU AAG UUU CGAMetPhe LysLeuArg

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    27/39

    27

    Mecanismul translaiei Iniiere

    aminoaci l -ARNt-sin tetaza + ATP

    act ivarea complexelor am inoacid -ARNt;

    f ixarea com plex metion i l -ARNt la

    subunitatea mic a ribosomului (40S);

    deplasare spre captul 3 al ARNm

    codonul iniiator AUG

    ataare subunitate mare ribosom (60S) situsuri funcionale: aminoacil, peptidil i

    de ieire

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    28/39

    28

    Mecanismul translaiei Elongaie

    fixarea n situsul peptidil, a complexuluiaminoacid2-ARNt;

    Peptidiltransferaza transfer metionin pe

    aminoacid2 formare dipeptid ataat lasitusul peptidil;

    Translocaza deplasare ribosom activ treinucleotide, n direcia 53:

    Dipeptid situs aminoacil; Situs peptidil liber fixare aminoacid3

    Repetare ciclu de elongaie

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    29/39

    29

    Mecanismul translaiei ncheiere

    situs peptidil codon stop fixarefacto r de el iberare;

    desprindere complexul peptidil-ARNt

    trecere n citoplasm dezasamblare eliberare peptid;

    Dezasamblare ribosom 40S + 60S

    Distrugere ARNm

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    30/39

    30

    U.M.F IAI

    AMPLIFICAREA SINTEZEI DE PROTEINE

    O celul poate produce cantiti mari dintr-o anumit proteinpebaza informaiei unei singure gene.

    Un plasmocit 2000 molecule identice de anticorpi pe secund

    Explicaiileamplificrii:

    Prin transcripie se pot produce copii multiple a unui ARNm; Fiecare ARNm poate fixa zeci de ribozomi copii multiple protein

    Aceste procese presupun o reciclarerapid a materialelor folosite:ARN, ribozomi, enzime etc

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    31/39

    31

    Reglare expresie genic Proces complex > niveluri de reglare:

    Reglare global: semnalizarea localizat dependent de poziia celulei,

    amprentarea genetic,

    recombinrile somatice

    competiia pentru activator/inhibitor

    Reglare transcripional; Reglare posttranscripional:

    Uniti transcripionale multigenice;

    Matisarea i poliadenilarea alternativ;

    Modificarea secvenei nucleotidice a ARNm;

    Reglare translaional Reglare posttranslaional:

    Modificri chimice posttranslaionale;

    Clivarea posttranslaional a peptidelor

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    32/39

    32

    U.M.F IAI

    REGLAREA EXPRESIEI GENELOR

    Toate celulelecorpuluiposed aceeai informaiegenetic(rezult prin mitoze succesive din zigot).

    Expresia genelor este ns diferit, datorit unor

    mecanisme complexe de reglare a expresiei genice. Unele gene (constitutive) exprimate continuu, n toate tipurile

    celulare produc proteine permanent necesare metabolismuluicelular.

    Alte gene (autorizate) au o expresie limitatla anumite esuturispecifice difereniere celular. Expresia genelor autorizates se exprime poate fi limitat temporal

    (stadii diferite ale dezvoltrii) i adaptat la stimulii extracelulari(ex).

    Multe alte gene sunt complet i permanent inactivate.

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    33/39

    33

    U.M.F IAI

    REGLAREA PRE-TRASNCRIPIONAL(EPIGENETIC)

    A EXPRESIEI GENELOR

    Vizeaz expresia spaiala anumitor genen anumiteesuturi i tipuri celulare: selecia unor genen celulele embrionare nedifereniatei

    meninerea expresiei lorla celulele descendente (difereniate).

    Se realizeaz prin modificarea configuraiei cromatinei(despiralizare) care permite accesul ARN pol + factorilor

    de transcripie la promotorulgenelor transcripie.

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    34/39

    34

    U.M.F IAI

    Modificrile conformaiei cromatinei

    NU intereseaz secvena denucleotide(informaia genetic) ise numesc modificri epigenetice: Acetilarea histonelor

    decondensareacromatinei

    expresiegenic; Dezacetilarea histonelor

    condensareacromatinei represiegenic;

    Metilarea ADN condensarea

    cromatinei represiegenic; ex.Amprentarea genomic una din

    genele alele de pe o pereche de

    cromozomi omologi este represat

    Inactivarea unui cromozom X

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    35/39

    35

    U.M.F IAI

    REGLAREA TRASNCRIPIONALA EXPRESIEI GENELOR

    Vizeaz reglarea activitii ARN polimerazei II(transcriptaza).

    Se realizeaz prin interaciunea

    unor FACTORI DE TRANSCRIPIE

    cu anumite SECVENE ALE PROMOTORULUI

    determin transcripiaanumitor gene n anumiteesuturi, ntr-un anumit momenti cu o anumitintensitate.

    U M F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    36/39

    36

    U.M.F IAI

    REGLAREA POST-TRASNCRIPIONALA EXPRESIEI GENELOR

    Vizeaz moleculele de ARN sintetizate printranscripie.

    Mai multe mecanisme din care importante sunt:Matisarea alternativ o gen produce mai multe

    molecule de ARNm diferite (prin selecia exonilor) maimulte proteine diferite; de ex, calcitonina i neuropeptidul

    nrudit cu calcitonina (v. cursul precedent);

    Interferena ARN (RNAi)A. Fire i C.Mello Pr. Nobel2006

    U.M.F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    37/39

    37

    U.M.F IAI

    INTERFERENA ARN

    ARNimecanismul prin care se inhib expresiagenic cu ajutorul unor molecule mici de ARNcomplementar intei: Genomul ARN al unor virusuri (HIV, polio, hepatita C etc)

    sau ARNm produs de genele virale Gene din genomul ADN al celulei.

    Rolul cheie n acest proces l au: ARNsi (small interfering RNA)acioneaz n citoplasm

    unde recunosc i cliveaz enzimatic moleculele de ARN

    int (virale); ARNmi (microRNAs) produs prin transcripia unor gene

    ADN reglatoriiacioneaz n nucleu i prin metilareblocheaz transcripia altor gene (n special n procesul dedifereniere celular)

    U.M.F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    38/39

    38

    U.M.F IAI

    MODIFICRILE POST-TRANSLAIONALEALE PROTEINELOR

    Determin funcia proteinelor Dup sintez se produc:

    Configuraia spaial,tridimensional specific;

    Modificri reversibile: fosforilareaserinei sau acetilarea lyzinei;

    Modificri permanente: Structurale: puni disulfidice;

    clivare enzimatic a unuiprecursor inactiv (pro-hormon;

    pro-ferment); Adiia unor grupri funcionale;

    ex., glicozilare, adugare de lipideetc

    Adugarea altor proteine

    U.M.F IAI

  • 5/23/2018 Expresie Genica

    39/39

    39

    REGLAREA EXPRESIEI GENICE: CONCLUZII

    Proces foarte complex care se realizeaza in fiecareetapa a fluxului informational:

    ADNARNmPROTEINA

    Regleaza expresia anumitor gene in anumite tesuturi; Genele autorizate se exprima in anumite momente

    ale dezvoltarii si in anumite etape ale ciclului celular ,

    cu o anumita intensitate, determinata de stimulii

    extracelulari