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Estructura de proteínas
Jerarquías estructurales
Estructura primaria
Experimento de Anfinsen
Variabilidad Secuencial
Enlace peptídico
Diagrama de Ramachandran
Estructura Secundaria: hélice alfa
Momento dipolar
NH2 terminal
COOH terminal
Estructura Secundaria: hoja beta plegada
Período: 7 A
Período: 6.5 A
Conexiones entre elementos de estructura secundaria
Loops
Bends
(beta turns, reverse turns or hairpin)
Estructura terciaria
Motivos estructurales
Dominios
Estructura cuaternaria
Alfa globina
Beta globina
Hemoglobina
Mioglobina: MB + O2 MBO2
Superficies y cavidades
Superficies
O2 ?
Superficie
(amarillo)
Surcos
(fucsia)
Los surcos conducen a cavidades...
Plegamiento de proteínas
Para describir la posición de un átomo en el espacio uno necesitadefinir 3 coordenadas
Para una proteína de 100 aminoácidos necesitamos 6000 coordenadas (consideramos que un AA contiene en promedio 20
átomos)
Si cada una de esas coordendas puede tomar al menos 2 valoresdistintos tendríamos que el espacio conformacional de la proteína
sería de 26000
Si cada transición entre cada una de éstas conformaciones distintasrequiere de un tiempo de por ejemplo 110-13 segundos….
…plegar una proteína requeriría
25987 segundos!!!
Relación Estructura Función
E. Fischer, 1894
D. Koshland, 1958
Mirsky and Pauling 1936
C. Anfinsen (1960-)
Relación Estructura Función
Monod, Wyman and Changeux, 1965
Fred Karush, 1950
Proteínas desestructuradas