enterobakterie, pseudomonády, acinetobakte ři,...
TRANSCRIPT
Enterobakterie, pseudomonády, acinetobakteři, aj.
Jaroslav Hrabák
Ústav mikrobiologie LF UK a FN v Plzni
Enterobakterie – čeleď Enterobacteriaceae
- Gramnegativní, nesporulující, fakultativněanaerobní tyčky
Celosvětové rozšíření:
- Půda- Voda- Normální flóra:
- člověka- zvířat
Enterobakterie
Virulence bakteriíP
očet
pot
enci
ální
ch p
atog
enů
Úrove
ňim
unity
Fakultativní patogeny
„nepatogenní“mikrobi
Obligátnípatogeny
Enterobakterie
Klinicky nejvýznamn ější enterobakterie- Escherichia coli
- Klebsiella pneumoniae (K. oxytoca)
- Enterobacter cloacae (E. aerogenes)
- Citrobacter freundii
- Morganella morganii
- Proteus mirabilis (P. vulgaris)
- Salmonella enterica
- Shigella sonnei (S. dysenteriae, S. flexneri)
- Yersinia pestis
- Yersinia enterocolitica, (Y. pseudotuberculosis)
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Virulence Factors
- Endotoxin- Pouzdro- Antigenní mimikry- Imunomodulace
- Rezistence k antibiotikům- Klebsiella pneumoniae- Escherichia coli- Serratia marcescens
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Onemocnění
Centrální nervový systém:- E. coli (meningitidy novorozenců)
- M. morganii- Klebsiella spp.
Netypické infekce: – problém neurochirurgických oddělení– nosokomiální infekce
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Onemocnění
Dolní cesty dýchací:- Klebsiella spp.- Escherichiaspp.- Enterobacterspp.
Gastrointestinální trakt:- Salmonella enterica- Shigellaspp.- Escherichia coli- Yersinia enterocolitica- Y. pseudotuberculosis
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Onemocnění
Močové infekce:- Escherichia coli !!!- Proteusspp.- Klebsiella spp.- Morganella morganii
Infekce krevního řečiště:- Escherichia coli- Klebsiella spp.- Enterobacterspp.
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– OnemocněníEPEC – EnteropatogenníE. coli
- novorozenecké průjmy
ETEC – EnterotoxigenníE. coli- průjmy (inkubační doba 24-48 hodin)- nausea- zvracení
- A-B toxiny (teplotně labilní i stabilní)- nutnost vysokého inokula pro infekci
- endemické v oblastech s nižšími hygienickými návyky
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– OnemocněníEHEC – EnterohemoragickáE.coli
- hemoragické kolitidy- bolesti břicha- krvavá stolice- horečka
- hemolyticko-uremický syndrom (HUS)- renální selhání- trombocytopenie
- velmi nízká infekční dávka
- často v mase
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Onemocnění
EIEC – Enteroinvazivní E. coli- příbuzná s rodem Shigella
- vodnaté stolice- křeče, krvavá stolice- horečka
EAEC – EnteroagregativníE. coli - chronické průjmy
Enterobakterie
Salmonella enterica– Onemocnění
- Enteritida- horečka- průjem (může být i krvavý), křeče- bolesti hlavy- nausea- zvracení
- Bakteriemie
- Hnisavý zánět v kloubech
Enterobakterie
Salmonella typhi, paratyphi– Onemocnění
- Břišní tyfus (angl. typhoid fever)- Paratyfus
- bakterie rozšířeny do jater, sleziny, kostní dřeně- inkubační doba: 10-14 dní
- horečka- bolesti hlavy- myalgie- anorexie
- kolonizace žlučníku
Enterobakterie
Salmonella typhi, paratyphi– Léčba
První volba:
- fluorochinolony- ceftriaxon
Alternativa:
- chloramfenicol
Očkování
Enterobakterie
Shigellaspp. – Onemocnění
Bacilární dysenterie:
- křeče
- průjem (stolice může obsahovat krev,hnis, hlen)
- horečka
Enterobakterie
Yersinia pestis– Onemocnění
- Typická zoonóza
- Sídlištní mor- Rezervoár: krysy
- Lesní mor- Rezervoár: myši, kočky,
prasata, potkani
- Vektor: krysí blecha Xenopsylla cheopis
Enterobakterie
Yersinia pestis– Onemocnění
Bubonický mor:- po kousnutí infikovanou blechou- bolestivé „bubo“ – lymfatické uzliny- horečka- bakteriemie se 75% úmrtností
Pneumonie- vdechnutím původce- horečka, malátnost, pneumonie- vysoká mortalita - 90%
Enterobakterie
Yersinia pestis– Léčba
První volba:
- gentamicin- streptomycin
Alternativa:
- doxycycline
Enterobakterie
Enterobacteriaceae– Diagnostické metodyKultivace:
- stolice- krev- likvor- sputum- …
- použití selektivních médií
- detekce toxinů
- serotypizace (salmonely: O-antigen, H-antigen, Vi-antigen)
Serologické testy:- Widalova reakce(Salmonellaspp.)
Enterobakterie
Nefermentující gramnegativní tyčky
- Oportunní patogeny rostlin, zvířat a lidí
- Složitá taxonomie
- Pouze omezený počet klinicky významných druhů:
- Pseudomonas aeruginosa- Acinetobacter baumannii- Stenotrophomonas maltophilia- Burkholderia cepacia
Gramnegativní nefermentující tyčky
Nefermentující gramnegativní tyčky
Pseudomonasspp.– taxonomie, fyziologie
- Striktn ě aerobní gramnegativní nesporulující tyčka
- Obvykle pohyblivá
- Oxidáza pozitivní (kromě P. luteola, P. oryzihabitans)
- Běžně rozšířena v prostředí (růstová teplota 4 – 36 °C)
- Např. P. putida v půdě, vodě, na květinách, …
Nefermentující gramnegativní tyčky
P. aeruginosa –epidemiologické charakteristiky
- Hydrofilní povrch – afinita nap ř. k:- umyvadlům (nemocniční prostředí)- zelenině
- Může přežívat v desinfekčních prostředcích!
- Požití bakterií nevede u zdravých jedinců ke kolonizaci GIT
Nefermentující gramnegativní tyčky
P. aeruginosa –epidemiologické charakteristikyKolonizace jedince
- P. aeruginosanení považována za součást normálníflóry (Pouhá kolonizace však nesmí být důvodem k eliminaci a zahájení ATB terapie!)
- Ke kolonizaci dochází tehdy, pokud je normální flóra poškozena antibiotiky (např. neutropeničtí pacienti)
- Díky alteraci epiteliálních buněk může kolonizovat:- horní cesty dýchací(u pacientů s umělou plicní ventilací)
- močové cesty
Nefermentující gramnegativní tyčky
P. aeruginosa –epidemiologické charakteristikyNejvíce ohrožení jedinci
- Neutropeničtí pacienti (hematoonkologická onemocnění)
- Ventilovaní pacienti
- Pacienti s popáleninami
- Pacienti s cystickou fibrózou
Nefermentující gramnegativní tyčky
P. aeruginosa –faktory patogenity
- Pouzdro -adheze, ATB rezistence, inhibice fagocytózy- Pili - adheze- Lipopolysacharid - endotoxin- Pyocyanin - imunomodulace, poškození tkání
- Exotoxin A - inhibuje syntézu proteinů (poškození tkání)- Exotoxin S - atakuje membrány eukaryotických buněk- Elastáza - destrukce tkání- Proteáza - destrukce tkání
- Antibiotická rezistence
Nefermentující gramnegativní tyčky
Onemocnění způsobenáP. aeruginosa
- Pneumonie (nekróza parenchymu)
- Močové infekce (v souvislosti s katetrizací a poškozením epitelu)
- Kožní infekce (popáleniny)
- Otitidy (různý stupeň závažnosti infekce)
- Bakteriémie
- Infekce očí (poškození rohovky)
Nefermentující gramnegativní tyčky
Onemocnění způsobená ostatními pseudomonádami
- P. fluorescens - izolovaná od pacientů s cystickou fibrózou, septikémie
- P. putida - nosokomiální infekce – pneumonie, bakteriémie, močové infekce, atd.
- P. veronii, P. monteilii, P. stutzeri, P. pseudoalkaligenes, P. luteola, P. oryzihabitans
Nefermentující gramnegativní tyčky
Identifikace Pseudomonasspp.- Produkce pigmentů:
- pyoverdin (fluorescein)- pyocyanin- pyorubrin- pyomelanin
(v současnosti nepříliš významné)
Nefermentující gramnegativní tyčky
Pseudomonas aeruginosau pacientů s CF- Adaptace kmene na chronickou kolonizaci plic
- ztráta faktor ů patogenity- rezistence k antibiotikům
Mutátory:S
chop
nost
přeži
tí
Frekvence mutací
Nefermentující gramnegativní tyčky
Pseudomonasspp. - shrnutí
- Významný nemocniční patogen
- Vysoký stupeň rezistence k antibiotikům
- Infekce jím způsobené jsou velmi závažné
- Zdraví jedinci nejsou takřka vůbec ohroženi
Nefermentující gramnegativní tyčky
Stenotrophomonas maltophilia
- Pro zdravého člověka nepatogenní
- Při nálezu v klinickém materiálu velmi obtížnáinterpretace klinického významu
- Kataláza pozitivní, oxidáza negativní, nepohyblivétyčky, schopné růst v širokém spektru teplot (i při 42°C)
Nefermentující gramnegativní tyčky
S. maltophilia- infekce
- Infekce ran ???
- Pneumonie ???
- Bakteriemie
- Močové infekce
- Kolonizace dýchacích cest u pacientů s cystickou fibrózou.
Nefermentující gramnegativní tyčky
Burkholderia cepacia
- Dříve řazeny k rodu Pseudomonas
- Příbuzné druhy zahrnují B. mallei, B. pesudomallei, B. multivorans, …
- Aerobní, nesporulující gramnegativní tyčky
Nefermentující gramnegativní tyčky
Burkholderia cepacia- epidemiologie
- Nalézány na rostlinách (cibule), ale i v půdě
- Některé kmeny mají antifungální, antiparazitární účinky
- Vysoký epidemiologický potenciál:- umyvadla- plavecké bazény- lázně- salátové bary
- nebulizéry
Nefermentující gramnegativní tyčky
Burkholderia cepacia– klinické aspekty
- Bakteriemie- Močové infekce- Septické artritidy- Pneumonie
Nejvíce ohrožená skupina:
- pacienti s cystickou fibrózou- pacienti s defektem imunity
Nefermentující gramnegativní tyčky
Ostatní rody příbuznéB. cepacia
- Ralstoniaspp.
- Pandoraeaspp.
- Cupriavidusspp.- Comamonasspp. - Delftia spp.- Acidovoraxspp.- Brevundimonasspp.
Velmi obtížnáidentifikace !!!
Nefermentující gramnegativní tyčky
Acinetobacterspp.– taxonomie, fysiologie
- Striktn ě aerobní, oxidáza negativní, gramnegativnínepohyblivé kokobacily
- Popsáno jejich grampozitivní charakter při přímém barvení z hemokultivačních lahviček
- Některé druhy jsou obtížně kultivovatelné
- Nejčastějším izolovaným druhem je A. baumannii
Nefermentující gramnegativní tyčky
Acinetobacterspp.– epidemiologie
- Běžně se vyskytuje v přírodě
- Významný nosokomiální patogen
- Druhá nejčastěji izolovaná gramnegativnínefermentující tyčka v klinickém materiálu
- Považován za nepatogenní u zdravých jedinců
Acinetobacterspp.– klinické aspekty
Nosokomiální infekce:
- infekce dýchacích cest- močové infekce
- endokarditidy- meningitidy- osteomyelitidy- artritidy
Nefermentující gramnegativní tyčky
Kazuistika I.
- 25letá žena přichází na ambulanci s:- bolestí v podbřišku,- udává pálení při močení, - moč červeně zabarvena.
1. Jaké mikroorganizmy mohou připadat v úvahu?
2. Jaké mikrobiologické testy budete indikovat?
3. Budete pacientku léčit empiricky nebo čekat na výsledek mikrobiologického vyšetření?
Kazuistiky
Kazuistika II.
- 45letý muž přichází ráno na ambulanci s:- průjmem,- večer požil tatarský biftek.
1. Jaké mikroorganizmy mohou připadat v úvahu?
2. Jaké mikrobiologické testy budete indikovat?
3. Bude pacient léčen antibiotiky?
Kazuistiky